pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-500b |
Genomic Coordinates | chrX: 50010672 - 50010750 |
Description | Homo sapiens miR-500b stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-500b-3p | ||||||
Sequence | 51| GCACCCAGGCAAGGAUUCUG |70 | ||||||
Evidence | Experimental | ||||||
Experiments | Illumina | ||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | PHC3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | EDR3, HPH3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | polyhomeotic homolog 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_024947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on PHC3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of PHC3 (miRNA target sites are highlighted) |
>PHC3|NM_024947|3'UTR 1 CAGGAACATGAAGCCTTGATAAAACAGCAGTTTTACTTTTCTCACAAAAACTTGTAAGGTAAAGGCCTAACTTGGTCTAG 81 AATATGACACTTATTGTGGTGGATAGCCAAGCACATTGGGATCTCCACATCAAATACTGACATTTCTTCTACAGGTATAA 161 TAATTCATCATGCATTTTCATAATTAATAAACATTGGTAAAATTAATTTTACAGGTTACATGAAACATTGAAAGACTTGT 241 TACAGAGGGCCATGATATTTTTCAAAGAAATGTGTTATACTAGATAATTTTTTTAAAGGTGATGTTTATCATTAATATAA 321 AGAATCCTTTTAAAAGTAATTTAATGATTTACATTTCTCCTCTTTTGATTCAATTTTCTTATACATTTTTTCTACCCTAT 401 TAGTTTTCTAAAGGTTGTCATGAGAGGTATATTATGGAATAATTTAGTAGTCCAGTGACAGAATCGTATGAAATCAGTGT 481 ACATTTTAAAAAACATGTCTTTTAGACATATGCTTTATCTATAAAAAAGGAATTGTGTTCTAGTATGAACAATACTGATC 561 TGGAAGTGAGAAGAGTTAGTTTCTATTCCAAACTTGACCAAGAATTTGGTTTGACTGAGAACGTTTTCCTCTCAGTTTTT 641 GTACATTTATTTAGAGCAGTGGTTCTCAGTGGAGGTCAGTTTTGATCGCCAGGGGACATCTGGCAATGTTGAGACATTTT 721 GGTTGTCACAGCTTGGGGGTGGGTTCAGGGGAGGGTTGCTACTGGTGTCTAGTAGTTAGAAGCCAGAGATGTTTCTAAAC 801 ATCTTATAATGCACAGGACAGCACCCCTCCACTGTAAAGAATTATTGGTTCAAAAATATCGGTACTGCCAAGGTTGAGAA 881 ACTCTGATATAGAAGGAGTGATAAATATTGTTTTCACCCAAAGGAATACTTTTAAAGGATGAAGCTTACTAAACATATAT 961 GATGGAAGTATTATTCAGATAACATTAATATTCTGCTGAATAATTTTTTCTAGTTTAATCATACTAGAAAAAGAAAAAAA 1041 ATCTACAAATTGTCCTATAAAATAAGGACAAACATGCAAATAATTTAACTCTCAGAAAGTACTAATTCATTCTGATTATC 1121 TTTCATACCTCTGTGCTCCTCTGCACTGACGAAGACATAATATGATTATACCTATGAACTAGTGCACAGCCTTTTCTGGC 1201 AAGAAAATAGTTTGTAGCAGATACGTGGTTGCTCTTTGGATTTTTTTCTATTGTTGAACATGCTGGGACTAGCTAGAATG 1281 CACATTCCTACTTCCTTTACCAAACGTTTGCATGCTTCCTGCAAAGCACTTACCAAGTGATTTCTCTTGAACCATCGGAT 1361 ATAATTTTGTATGTACATGTTTGAGGAAAAAAATGTAAAGCAAAACCTTTTACTGAACAGTGTTCTATAGAATTATGACA 1441 CTAAAACAAAATTGTTTGTGGAAGCCCTGAAAGCTTTATAGTCCTGGACATCAAAAATTTTATTTGAGATGATGAATGTT 1521 TTGTTTTCATCTTTTCTTATATTACCACAATTGAGATATTTTAGTAATTGAAGGAACATACACAGATATTTGGCAGAAGT 1601 CGAGTAAGGAGGGGAAAAAAAGAGTCCGTGAGTTTCAGTCATTTTCACTGCTCTTTTCAAAAAGATTGTGTTGAGCTGGT 1681 AGAAGACTAAAGATGTCACTGAAGACATCACAGATACTATATTTATCTTTTGGCTTTGTGTACATTAGAGAATGTTGATT 1761 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TATGAGAGAGTGGTGGGGTGTCTAGTCATTAGTGAAGTTAAACATCAACCTGTTTTAGAAAGAATTTTTTAGTCTTGCCT 6241 AAAGTAAACCAGAAGTGTCTAGTGTTTAAATCTTTATTTAGAATGCTTCTCTTAAAAGTATTTTTTGTTTTGGGTAGTAT 6321 TAAATAATCAGTAAATAATCTATTTCAGTAGTAAATAATGAATTAAGATGATGATGAATGAGGATTAACACACTGGTCTG 6401 GAGACTGGGGTTTTATTTCAGTGGGTTAGCTGTGTGTGACATGTTGGGCAATTACTCAGCTGTTTTAACAGCTTCCAGAT 6481 ATGCAGTATGGTGCCTGTACTACTCAAAAGTTGATTTTGGTTTAATTCATCTTTAAGGTACCTCCCAGCTCTAAAACTAT 6561 GATTCTAGGCTGTGTAATGGGGTTATTCCTACTTTATTCTCTTTCCTTTTTTAAGGGTTCATTTTATACTTAATAAGCAT 6641 CCATTTCTTGGGTCACCTACAGTCTTTGTTCTCCTAAGGATTAAAATAGAAAATTCATACATAACAAGCAAATGATGACA 6721 TTTTCCTAAATGCTCCTTATTGGTTAACCACTGAATATATGAACACATATGAATATTGTCATTCATGTACTTAAATTCAT 6801 TTAGCAAACTATTTGAACACTTACATGTGCAGTGTTTGGTGAACATGACATGAGGAACTAGTAGTAAGTAAAATCTTCCC 6881 CCCAAAATTCATTGTGGCTTAAATAAATATGAACATAATCATTACTACTTAATATACTGAGAGGGAATCTTAATAAACTT 6961 GGAACTGGGAGGGAATATTTGTATACATTGGGTAAAGGGTTAGGCTAGATGACATCTAAGGGGTCTGAGTGAATCATATC 7041 ATAATTTTTATAACACATTTCACATACTAAACATCAGTTGGCCCCATACCTGATTAAGTTACAAAATTTAGGAGACTTAA 7121 CATTAAGGACTTACAGGTTGAGACAGCCCGTATTTCACAACATTATTTTGACACTTGACTCTATTCCAGAGTTGTTGCTA 7201 TACAAGGCATGTGGCAGAACAAAAAAAAAGCTGGTGTTGATATAAGAGCTTTTTACCCAGTATTGACAGTGAGCAACTTT 7281 CTTTCTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGTTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAGTGGTGCGA 7361 TCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCGGGTTGAAGCGATTGTCTTGCCTCAGCCTTCCAAGTAGCTGGAATTACAGGT 7441 GCCCGCCGCCACACCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGCTTCACCATGTTGGCCAGGCTAGTCTCGAACT 7521 CTTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTTGGCCTCCCTAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACACCTGTCCGACAG 7601 TGTAGCAACTTTCTAAAACTGAAAAATCTCAAAGGAGATCATTGGAACTGACTTGTTCATTTATTTTTTGTTTTTAAATT 7681 AAGAAAGATTACACAAAATAAGTGTTACTGTACTTTAAGCTATTACAAATATCCAACTTTTAAAGATATGTAAGAATCAG 7761 TAATATTCTAGAAAGCACATATATAGTAAAAGGGCATCCTTTAAATGTAGAACGGGTAAACATGAAACAGTTCCATGCTT 7841 GAATTGTTAAGTATCTAGGGGGTAAACATTGAATGGGAGAATCATTTATTGGGTTAAGGTCCCTTCCTTGTCATTCTGGG 7921 ATCTGTGAATCACATTGTAATTCCTGTTGACAAAGCTTTACTTGTTAACATCAGTTGATACTGACATTCTCCATAAAGAT 8001 ATAGAATGAAAATATCTATTAAAAATAGTTTATCATTGTTTTAGCTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGAGACAGAGTCTCAC 8081 TGTCACCCAGGCTTGAGTGCAGCGGTGTGATCTTGGCTCAATGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAATAGATTCTCCCACC 8161 TTGGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACTGGCATGCACCACTATGCCTGGCCAGTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGT 8241 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGACTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCCGGGATT 8321 ATAGGCATGAGCCACTGCGCCTAGCCTGTTGCAGCTTTTTAAAGCAGGAAAATATCCATATAAACTGTTGGGTTAGAATC 8401 TATATTAGAATCTTTCAAACTAATTGAAAACAGGAAGACTATCATCTAAGTAGCCAGATAATCTGGGTTTCAAAAAGTTA 8481 TTCCATGGTACTGGTTTAAAAAATACTTTTCAAGTGTTTTAATTTTTAAAGTGTAACTAATTCTTCAAATATGTTATGCT 8561 GTTAAAATATGTATTCCATAAGTACTTTTTGTATATGTATTCTTAAATTTTAAAAAGTCAACTGAATGCGCAAAGATGAT 8641 ATAATTTTGGATGTAGACATTTAAACTAGATTCCCAGTCCTCTCCTTCAAAAGCTTGGTCTTTGTTTTTCCTATAGGGAA 8721 AAAAGTCAAAATAAGTTCCAAAAACTATCCTCAAAGTAGTATTGTGCTTGTAGTAAATGAAGGTTGGATGGATGGATACT 8801 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Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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