pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4760 |
Genomic Coordinates | chr21: 40212352 - 40212431 |
Description | Homo sapiens miR-4760 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4760-5p | |||||||||
Sequence | 10| UUUAGAUUGAACAUGAAGUUAG |31 | |||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | CREB1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CREB, CREB-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | cAMP responsive element binding protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_004379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_134442 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on CREB1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of CREB1 (miRNA target sites are highlighted) |
>CREB1|NM_004379|3'UTR 1 TTTGGGATTTAAATTTTCACCTGTTAAGGTGGAAAATGGACTGGCTTGGCCACAACCTGAAAGACAAAATAAACATTTTA 81 TTTTCTAAACATTTCTTTTTTTCTATGCGCAAAACTGCCTGAAAGCAACTACAGAATTTCATTCATTTGTGCTTTTGCAT 161 TAAACTGTGAATGTTCCAACACCTGCCTCCACTTCTCCCCTCAAGAAATTTTCAACGCCAGGAATCATGAAGAGACTTCT 241 GCTTTTCAACCCCCACCCTCCTCAAGAAGTAATAATTTGTTTACTTGTAAATTGATGGGAGAAATGAGGAAAAGAAAATC 321 TTTTTAAAAATGATTTCAAGGTTTGTGCTGAGCTCCTTGATTGCCTTAGGGACAGAATTACCCCAGCCTCTTGAGCTGAA 401 GTAATGTGTGGGCCGCATGCATAAAGTAAGTAAGGTGCAATGAAGAAGTGTTGATTGCCAAATTGACATGTTGTCACATT 481 CTCATTGTGAATTATGTAAAGTTGTTAAGAGACATACCCTCTAAAAAAGAACTTTAGCATGGTATTGAAGGAATTAGAAA 561 TGAATTTGGAGTGCTTTTTATGTATGTTGTCTTCTTCAATACTGAAAATTTGTCCTTGGTTCTTAAAAGCATTCTGTACT 641 AATACAGCTCTTCCATAGGGCAGTTGTTGCTTCTTAATTCAGTTCTGTATGTGTTCAACATTTTTGAATACATTAAAAGA 721 AGTAACCAACTGAACGACAAAGCATGGTATTTGAATTTTAAATTAAAGCAAAGTAAATAAAAGTACAAAGCATATTTTAG 801 TTAGTACTAAATTCTTAGTAAAATGCTGATCAGTAAACCAATCCCTTGAGTTATATAACAAGATTTTTAAATAAATGTTA 881 TTGTCCTCACCTTCAAAAATATTTATATTGTCACTCATTTACGTAAAAAGATATTTCTAATTTACTGTTGCCCATTGCAC 961 TTACATACCACCACCAAGAAAGCCTTCAAGATGTCAAATAAAGCAAAGTGATATATATTTGTTTATGAAATGTTACATGT 1041 AGAAAAATACTGATTTTAAATATTTTCCATATTAACAATTTAACAGAGAATCTCTAGTGAATTTTTTAAATGAAAGAAGT 1121 TGTAAGGATATAAAAAGTACAGTGTTAGATGTGCACAAGGAAAGTTATTTTCAGACATATTTGAATGACTGCTGTACTGC 1201 AATATTTGGATTGTCATTCTTACAAAACATTTTTTTGTTCTCTTGTAAAAAGAGTAGTTATTAGTTCTGCTTTAGCTTTC 1281 CAATATGCTGTATAGCCTTTGTCATTTTATAATTTTAATTCCTGATTAAAACAGTCTGTATTTGTGTATATCATACATTG 1361 TTTTCAATACCACTTTTAATTGTTACTCATTTTATTCACTAAGCTCGATAAATCTAACAGTTACTCTTAAAAAAAAAAAA 1441 AAAAGACTAAGGTGGATTTTAAAAATTGGAAACTGACATAATGTTAGGTTATAATTTCTCATTTGGAGCCGGGCGCAGTG 1521 GCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACCTGTGGTCAAGAGTTCAAGACCAGCCTGGC 1601 CATCATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCTGGCGCCTGTAATCCCAGCTACT 1681 CAGGAGGTTGAGGCAGCAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGGTTGCAGTGAGCCGAGATAGCACCATTGCACTCCA 1761 GCCTGGGCGACTCCATCTCAAAAAATAAAAATAAAAAAAATGTCTCATTTGGGAAGGAAATTCCTTTTAAAAAAGAGTTG 1841 AGACACTTAGAAAACTAATGTTTTATATTTAGTCAAGAGTTATTTAAGAAAGTCAAGCTTGTTTAACAACAAAATATGAA 1921 GATTTAAGTGTTAATTGCTGGATCCATTTTAAAATAAGATTTTAATTAACATTTGTAAATGGTATATTTTCGTTTGTAAC 2001 AAACCATTGTCTTTTTTCAAGGATGAACAGAGTTTATGAAGGAGCATCATTCTAAGAATTAAGTGATGTAGTCTTTATGT 2081 TTGGACAGTTCACCAGATTCTCAAGAAGGCTTTCAAACAACTATAAAGTTTGATGTTTGTCCTGCTGAGCTAATGGGGAA 2161 AGTTATAGCATAAAAATTGTGTAACCGCATAGATATGTCATTTTTAAAAACTGGTTTAACAGAAATCAAGCAAAGTCACA 2241 AATATGTTCACAAGTTGGAATTATTTATTGAGTCAAAATGTCGAATCGAACATTTTGAATGAAGTAAGTGTTATAAATGA 2321 AAAATTGCCTGATGTTTAGCAGTTTGTATTCTCTAAAGCTTTTTTTCAAAAGTTCAGGCTTTCTACTTACTGGGAAGTTG 2401 GTGGTCCTCTTAGTCCCTGATAAATCAAGGCAATCACATTCATGTGAGCTGGATGAATTTATAAGTTATAAAGACCTTAT 2481 CCTTCATACCTTGAGGATGATTGCACTGGTTTTGAAGTCAGTTGCTTAATGATGAGGTGAGAAATGTATCCTGTTGCTAA 2561 ATCTGTCTTAGACCCTTGGTGAAACTTGAAGATTTCAGTTTATAAAGATAAAATCAAGCATCTTTTGTGCAGTTTTCTTT 2641 TTTTAATGCAAGAATGGTGGGGAGGTTTGTTTGTAAGCATGAAACTTTGAGAATCTTTATTAAGAAAATGACATAATTTT 2721 TAAAAACCTTGTAGCCAAGAACATATGTGGCCACATTACCAGTAATAAATGTTTTTCTCTTTATATTGGCCAAAAGGGAA 2801 TAAAAATGTCATCATAGGAATTTGTACATATGCTACTGATTTGCCTAGAAAATAGCAAGTTTGATATTGCTCACTTTGCA 2881 AATATAGGGCCATGTGGCACTTTTATCTATAGGACAGATTAATAAAAATGAAGTGGGGAGGGGTTTATTTTTGATATATT 2961 ACTCTTATGAGTTTTCAAGCTTTGATAATGTTTAACTGAAAAGTGGCTTAGAAAGGGCTAGATCCAATGTGTTCATTATT 3041 AAATAATTGCTATCAGATACAATTTTAAGTTCATTCTTTTTCAAACTCAAGTACCATATTGGCAACCATAATATTGTCAT 3121 AGGTGCTCTCTTCATTTAGATATTCTTGGGGGGGGTGGCATTTGTATAATATATGTGTACATATATATATATATATATAT 3201 ATATACATACAGTATATAATCTAAAGCTCTGAGAGCTCTTAAGTCAGGAATGCTGAGTATTATAGTATATTGAGGTCAGA 3281 TGAAATTTTACATTTTTGTGTGTTCTGTTGCATTCCTTCTGGTAGTTTCTATGACTGCATTACTCCAGCACTCATGATTG 3361 ATTTTATCTTCTAATTTTCTTCCAAGTATTTTATTTTTTATTAGTTTTCTTTGGCTTGATACTTTTAAATATGTTACTAG 3441 TCACTTGAAAGCCTCTCCCCCAAAAGTATTTGGTTTGTATGCTTTGTCTGTGGCAGCTATAACAGTGGTAAGAACATTTT 3521 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TAGCCCAGTTAATTAAAAGACGGGCTCAAACCTTGTTTTATTCTTTTTCATCTTGGATGAAGATTGAAGGGAAAATAACT 4481 CAAGTGCATAATATTTATTTTCAATTTTTAATGAGACTTTATCCTCATCACAACATTAATACTGTACATAGTATGCCAAA 4561 ATATCCATTAATTTGTCTAGAATAGTACAAGACTTTTTAAAGCAATTGTCCTCACAGAGACCACATGTAATATACTGAAA 4641 TATGTTCATTTTTAATGGCTTTGTTAACATCAAAGAAATGCTGCCTAAATTTGATTTCAGATGAGGAAGGAGAAAGTAAA 4721 GTGTGCATAGTAAGGCTGTAGGTGAAGAGTTGTGAGATAAATAGTTCACTCAGTTGTACAAAGCACAACTAGAACTTTTT 4801 GTTGGGAGGCTTACATACATCTTGAATATTCTTAATGTAATAATGTTGACTATTAAGTTGGCTACACAGTCACTGTATGT 4881 ACTAGGAACTGGTTTCCTTGACATTCTAGAATCAATGGCTAGGAGAGGCATTAATCTTTGAGGGGCTGAACATATCATGA 4961 AGCTGAGTCAGTATGGAAAATTTTCAAATAAACAGGGTGCTGAAGTTCCATCTGTCTCATCTGCTTATGATAAGTTCTTA 5041 TTGATTAGTGAATGTAGCTTAAGCCTTTGTATGTGTCCTCAGGGGGCAGACCGACTTTAAGAGGGACCAGATAACGTTTG 5121 AATGGAGGGATTATATTTCAGGTGTTTTAGCTTGAAATTTATTTTTTAAAAAAAGAAAAATTTAAAAAATATATAAATAA 5201 AATAGAACAAAGCCGGTGATGCAAGTTGATATTATAAACAGGCAGTTTTAGCACAGAAAGAAAATACTGACCTGTCTGCA 5281 TTCTGGTACGGTGGGTGCAGGTCCCAGCTGGGTATGACATGATACATTTTTAATTATTCTCACCAGCAAGTAAAAGGAAA 5361 ATGAACAATCTTTTGGAATTGTCTTTGAAAAGGATCAAAGAGTAGGAAATTCACATTTGACCTAACATTACTTGCCTATA 5441 GAAGTATGGCATTTCCAAGCTTTTGTCTGAGGAGCATCTCAGAGAAGTGAGAGTAAATCTGAGTTAGCTTAAAAATTGGT 5521 AGGGAGGAAGAAAATCTCTGCAAATAATGATTTTATGTTTGTTGGCCAAGTGAAATGATCTATCATTGTGTTTGGGAGGT 5601 TTTATTTTCTTATGTTTTTAAAATTGGTAAATGCTTTATAGATGTATTTTTATCCAAGTGCCACTCCAATTTGTGTATGT 5681 AATAAAATTATTTATATTAAAAGTGGGAAATAATTGTCAACATTTTTTTTGAGTATAGATTTATTAGGGGTGGCAAAGAA 5761 GAGTGCTAGTTAGCAGTTTTCCATGTAAAGTTGTCCTTGACTGATTTGTCCACATGTCAGTTGTAACTCCCCCACTCCCT 5841 GCAAAAGGAATTATTTCTAACCCAGATGTATCACTTGAAACTTTTTAGAAGCAAAATAATCAGGGAAGTTCCTAGAAAGG 5921 TGTTTGGCTTTTTGGTTTTTGAGGGTTGGGGTAAAGAAGACTTCCCCCACAACTGTCAGCACAAAACAGGGTATTGATTT 6001 TTAACTCTGATGTTTCTATTGGAGTTGAATACTAAATAAATAACTATAATGAGGGAAATACATTTCTAATAAAATTCCCT 6081 ACATTCTAGAAACATCCCTGTTTTAATTTTTTTATCTAAATCTTTTTGTGCTTTATGTGTAAAGAAAAAAATGTACTGAG 6161 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GATATTGTTTCCTAATGATTATTAGGTATCTGCTAAGCAATTTTTATTAACTTATGTTGATTACTATTTTTATGTCAAAC 8881 TTTACAGTCTAGGCATTTTTTTCTGGAATTAAAATTAGAAGTGGCACAGACAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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