Gene Symbol |
MBOAT2
|
Synonyms |
LPAAT, LPCAT4, LPEAT, LPLAT 2, OACT2 |
Description |
membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 |
Transcript |
NM_138799
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on MBOAT2 |
|
3'UTR of MBOAT2 (miRNA target sites are highlighted) |
>MBOAT2|NM_138799|3'UTR
1 TCGGGAAGGCTCTGAGGGCTGTTTTTTTTTTTTGATGTTAACAGAAACCAATCTTAGCACCTTTTCAAGGGGTTTGAGTT
81 TGTTGGAAAAGCAGTTAACTGGGGGGAAATGGACAGTTATAGATAAGGAATTTCCTGTACACCAGATTGGAAATGGAGTG
161 AAACAAGCCCTCCCATGCCATGTCCCCGTGGGCCACGCCTTATGTAAGAATATTTCCATATTTCAGTGGGCACTCCCAAC
241 CTCAGCACTTGTCCGTAGGGTCACACGCGTGCCCTGTTGCTGAATGTATGTTGCGTATCCCAAGGCACTGAAGAGGTGGA
321 AAAATAATCGTGTCAATCTGGATGATAGAGAGAAATTAACTTTTCCAAATGAATGTCTTGCCTTAAACCCTCTATTTCCT
401 AAAATATTGTTCCTAAATGGTATTTTCAAGTGTAATATTGTGAGAACGCTACTGCAGTAGTTGATGTTGTGTGCTGTAAA
481 GGATTTTAGGAGGAATTTGAAACAGGATATTTAAGAGTGTGGATATTTTTAAAATGCAATAAACATCTCAGTATTTGAAG
561 GGTTTTCTTAAAGTATGTCAAATGACTACAATCCATAGTGAAACTGTAAACAGTAATGGACGCCAAATTATAGGTAGCTG
641 ATTTTGCTGGAGAGTTTAATTACCTTGTGCAGTCAAAGAGCGCTTCCAGAAGGAATCTCTTAAAACATAATGAGAGGTTT
721 GGTAATGTGATATTTTAAGCTTATTCTTTTTCTTAAAAGAGAGAGGTGACGAAGGAAGGCAGGAATGAAGAAGCACTGCG
801 TGGCCTCCGGTGGAATGCACGGGGCACAGCCGCGACTCTGCAGGCAGCTTCCCCCCCATGCCAGGGCTCTGCGCCGTCAT
881 GTGAGACTTAAAAAAAAAGTTGAATGACTTCGTGATACTTTGGACTTCTAAATTAAATTTATCAGGCATAAATTATGTAG
961 AATTAGAGGCTTTGAAAATAATACTGGTAGGTTGCTCAAAGGTTTTGAAAGAGAAATCGCTAGGTAGGTTACTATCTGGC
1041 TAATCCATTTCTTATCCTTGACAATTTAATTCATATTTGGGAAACTTTTAGGGAAATGAAAAATAAAAGTCACTGAGTCT
1121 GGGTGACATTTTTTAAGAATAATATAAATTCAGTTTCAAACTCTTCTCACATTAAAATTTTGCTGTGAACTCTTACTAAA
1201 ATGAGTTTTAGGTTCTGTAAGTGGAAAAATGTGCTTTTATTTTATGGGCCATTTTTACCACAACTAATCTTGCCTTGGAT
1281 TACTAAGCATCTCCTGCGATCCCACAGAGGACTGTGGTGGCCACAGGAGCTGAAAGCAGAAGAGTGGGATTTGATGCCAG
1361 GCAGTGGAGTGGCCTCAGCCCCAGATTGTACCTCCTGCCCTGTAGGAGGGGAGGGGGCAAAGCCTTCTGACTTCACCTTT
1441 GTTTGACCTATGTATGGAACTTACTTTTACTTTTTGCCTTAAATTTTTAATGAAATGCAAATTTTCTGTGATGGGGTTCT
1521 CTCTCTCTTTTTTTCGGGGGGTGGAGTCACTAATAAATTTGCAAATGAAGTTAAAGACAAGGCAACCATCTGGCTTATGC
1601 TATATAATACTTCATTTAAAGAAGAAAGGAAAAGCAAATGCACTTGCAGCTTTTGAGGTCTCAGCAAAAATGGGCATGTG
1681 TCTTTTTTGAAGTTTAGAAATATCCTAATCTATTTTTATTTATCTAAAAGTAAGTGTTTTCCGGCTGATAAGGCTAACCC
1761 TACCCAGGAAAGGATTGATAACTAAATAAATTTCCTCTGTTTTCCCATGCATTGAAATTATGTTGGCTGAGCATGGTGGC
1841 TCACACCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCA
1921 ACGTGGTGAATCCCCGTCTCTACTGAAAACACAAAAATTAGACGGGCATGGTGGCGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTG
2001 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTAAAATTGTGCCACTGCACTCCAGCC
2081 TGGGTGACAGAGGAAGACTCCGTCTCACAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAATTATGCCAGCTGTTTAATGTGAGAGAAT
2161 AGAAAGAATGTTCATGGAATGTACCTGCCCTGTAAAATGTTTGATCATTTTCATTAATGTTGCAGAGAATCCGACTGCTA
2241 TTAAGAGAAAGTGAACAAATTAAGAATTTAAAAGACAGGTTCAGGCATGTCATAAGTGAAAACAAGAAGGCTTAATACAA
2321 ACTTGTTGGGTTTTGTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTTGGTTCAGCCTATCTAGCCACCTACAA
2401 ATAATCACATTTCTGTTACCTGAATTTATTTCTCAGCCTGTAAACCTTAGTCACTGTTACCTGTTTCTTGCTCAGTGAAT
2481 ATGATCTTGGCACTGTCATCTAGAAAGCAAGATATTTGATTGGTTTTCTGGTTCCTTCGAAGATAATAATTCCATATCCA
2561 GTTTGACTGATTTTCATACCCCTGAATCAACTAGTTATTTTCATGAAATGGTTTTTGGATATCTCTCCTCTAGTTTGGAG
2641 AAGTAATAATCACAAAGATTAATATTTTGCTTCTAGTACTTACAGTAGAAGAATTTTAAACTGGTACGTCTACTCCTGTT
2721 AAATAGAAAGGGGATTCGTTGTATTATGTGCTTGCTTTTTTTTAATCAATAGAATAAGATTCAATGCATATTTATGTTTT
2801 ATATTTTCCACTATTCAGGTATCATGAAATCACTCTAGAGATGATCAATCAACATCATATTTATACTTTTGGTTAATTAT
2881 ATACTACTCAGGGAAAAAATGAACAAAAATAACTACTCATCCTTCAATTTCATTTTCTTGAAACAGTAAGAGTATAATTT
2961 GGTATGCCTCAGCTGTCACCATTTTATAAGTGGCTCATTCTGTTCTTAAAGTAAGTATTTTTATTGGAACTCAGGGTAAT
3041 TGGGGGAATTTATTTAGCTTCTAAAATATCCGGCAGGATAGAGAAGATTTATTTGGCTTCAAAAATGTCTGGTGACCACT
3121 TCTCTTATTAGCCACTACTGCCCATTTGCTTCAAAAATATATTTATTGGTCTCCACCATGTGTGACACACACAGGATTTC
3201 CAAACATACCACTTTTGAGAAAAATGTGCAGTAAAAAGGAGGTTTCTAGAAAGTGACAGTAACTCACATTTAAGCACTAG
3281 CTGACCTAGGAGGAGACCTGGATCTTCATTCTGGTTCTGCCTTTCATGAGACTTAAGACTTGGAGGAGCCACCTGTCCTG
3361 TAGACCCCAAGTTCCTCAGCCATAAGCAAACGGGTTAATCCTAAGAGTTCAGGACCAGTTGGGTGTCGTGAACGGAGCCA
3441 TTAGCAAGGTCTGTAGGATTCAAGGACTTGGGCACATTCACAGTCCACACTATTGTCATGGTCATTGACTTACTACTTGA
3521 GCTCAAAGCCCTGACATTTCAAAAGGTTGTCATGATAACAGTGAAACCTCTGAATCCCTTAAATCAGAAGGCATGGCAAC
3601 ATACTTTTTCTACTGGCAATAGCTCTTACAATGAGTGTTTCATAATGAAATAGTCTCTGCTGAAGAAAACATGTTTTCCT
3681 TTTGCTCTCTCTGCTTTGTTGGTTTCTGTGCTGTGTGGAATTGGAGAAGATATATGCTCTGAAATATTTTATACAGATTA
3761 CTGACTACTGGACAGGGTTTACCACTATATAACATCTCAAAGTTATTCAAGGATATTTAAAGCATATTTAGTTTAGTTAC
3841 ACCTTATTTTAAACCGCAGAAAACAATAGCTTTAAAATTTTTGCCATTAAAATAATTATAAATTTATACTTTTACTCAAG
3921 GACTAGATCACAGTTTTAGGACAAAAATCTCTCCTATTTAAAGTTCATACCTTGTAAGTATTTAGTTTGTATATTCATGA
4001 ACAAATCTGGACATTTATACTTTTTTTGTTTCCTTATCAACTGTTCACAATTATTAGTTAATTGGTCTTAACAGTTCTAC
4081 ATTATAATTGAAAGAAAAATTACTTGAGAAAATAATTGTTTCAGAATAGTGCCTACTATATCTGTGTCAGCTAAAAATTT
4161 GTCCAGAGTTTTAGATATAAGCTAGTATTTTGTGGAGTTTTATCCAGGCGTTAATAGTTCTTCCTGGCTGAAATTTAATA
4241 TAGGTGCAGAATCCTAAATAACACTGTGAGATGTAATCTTAACTGCCCTCAATACCTTATAAAACTGCTGCATTTAACCC
4321 AGTGTGCATTTAATGAGTGGCTGGTCGTTGATACACTCATCTTAGATGCTGAAATTTCTGTTTTCTCCAGCCCTTGTAAA
4401 AGTGGGTTTCTTGATGAACGCGTGCTCCCAATGCTGAAGCAAAAGATTTGCATTTAAGGAGAGAAATACACCCTGAAATT
4481 TGAGTTTGAAAGATTAGAACATAGAGGGTCTCTACAGTGTTTTTCTGCAACACCAAGTAGTCAAATCTATTTATAGAAAC
4561 TCTGATTACAACAGAAATTTTAAAATGAAATTTTCCACATCGGTATTTTGTAGGAAAGCTCTTATAATCAATGCTTAAGC
4641 TGCTTTTTGAGGCTTTTCTTGTACAGAGGTTGCAGCCAATTACATTTTAATTGGTAGGCTGCTGAATAATGTTTTTGTAT
4721 GTTTTAAAATAATATTTATTTTAATAGGTTTTTTAACATTATGCAAATCCCAATAAAGAACTGACACGTTCCATAGGCCA
4801 TTGACTGGGAAATTTTGTGAAACACAGCCTAAATACACAGTTTTTACACCAACTAATTTGTCTTGCCTTTAAAACTGATT
4881 ATAACTCTTCTTTAAGTACAACTTTTATAAAGAAAAAATACAACACTAAGACTGTATGTTCTGTAAATTATAGTGTGATG
4961 ACCCATGCAGAACCGCTGTCTGAAGCTTACTCAGCGATTCATAGCCATCTCCAGCCATGTTTTATCAAATCACACACTAA
5041 AAATAAATGGAAATGCTACAGTGAAAAACCAAAAGTTACAGAGCAACATAAGTAAAATGACTAGGCAGTTTCTTAGTAAC
5121 ATGTTTGAAATGGGAAAGGTGACTGACTGCCTTTCACCAGAGTCTTAGCTGTTTCACGTTCACTATTTTAGGTTAATTTT
5201 CTTGGGAAATCAATTTGAATATTCCCCCCTGTCCTTTTGCATTAAAGGACGAAAATATATGTTGAGAGTTTGACAGACTT
5281 TTTAAATATGCCTCTTTCCCAATTTTATGTATTTTTGGTTCTGCGCACACAGATTTATCAATGAAGTACATTTGCCTCTG
5361 GCTTTATCACAAGGAAAAAGGAATCAAACATTGAACACAAATGTGTTCCAAACCAGTCTTGTCCATCTTGTCACTTTTAT
5441 GTGACTGCTCCTCTGAACCAGAAGGGGCACGATAGAAGGCCATAGGAATGAAAGTAAATCATTCAGGTGAAGTGAGAAAT
5521 TCTTCCATATACAGAGTGAAAATGTGTGATTTCATTCCTGCCTTCCTTTAAACGTTGTCTTGATCTCTGCCTAGTAGTAG
5601 TTGAGCCCTCAGTCGCCCAAACATGAGGAGAGACCCAACTCCAGCAGCCAGAATTTAGTATTTACATTTGCCTTCCCAAG
5681 TTGAGAATAGAATGTGGTGTTCTGTGCTTTCTGTTTTTATTATTCCAAAATATTTTTTTAAAGAAGTGTTATTTTTCAAC
5761 AGATTCATAAATTAGTTCCTGATGTACGGTAAATTAAAACTCCCACTGTGTCAGTCAAACTGAGATGTGCTCATTTCATA
5841 ACCACTCATTTCTAGTCTGTCAGAGCTGCACTGGTGGCTTATTGCTGGTTTTTAAAGGTGTTTTTAACTTACATGTAACA
5921 TGTTTAGGACATGTTTTTTTTTTCTAATTTGTGTGTCTTTACAACTGATTAAACAGTAGTTTAAAAATAAAAAAAAAAAA
6001 AAAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' ucgaCAAGGACGACUu 5'
|| :|||||||
Target 5' aataGTCTCTGCTGAa 3'
|
3649 - 3664
|
148.00 |
-13.90 |
2
|
miRNA 3' ucgacaagGACGACUu 5'
|||||||
Target 5' ttggtaggCTGCTGAa 3'
|
4691 - 4706
|
140.00 |
-11.10 |
3
|
miRNA 3' ucGACAAGGACGACUu 5'
||| :||||||
Target 5' ccCTG---TTGCTGAa 3'
|
272 - 284
|
127.00 |
-10.60 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|