pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-6715b |
Genomic Coordinates | chr10: 112299612 - 112299688 |
Description | Homo sapiens miR-6715b stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-6715b-3p | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | 46| CUCAAACCGGCUGUGCCUGUGG |67 | ||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | GTF2A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | TF2A1, TFIIA, TFIIA-42, TFIIAL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | general transcription factor IIA subunit 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_015859 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_201595 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on GTF2A1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of GTF2A1 (miRNA target sites are highlighted) |
>GTF2A1|NM_015859|3'UTR 1 AGAGTTGCTTTTTTTCTTTTATAAATAAAAGAAACTTAAAAAAAATGTAAAGCGGACAGTTTGAAACTTGGGGCATATGC 81 CAACCAAAACTTCGTTTCTGCATGTCAGAAAAGTGCAGTAGAAGCAAAGCTACTGGAACAAAGATAGACCTTGACAACAT 161 AGACACTACTTACTGGCAAGCCATGGAACTGTAGCACCTAGGGTTTTTGGGTGGGAGGGTTGGGGTTTTGTGTAGGAAAA 241 CCATAATTGTTGATTTTAAATACAGGTACCTGCCACCGGTAATTAGCATGTAAAGCTTTGTCTATATTCCTTCCTCCAAC 321 TTGGGTTCAATCAGAAGATACTTGTTGGAATGAACTGAAGAAACTTCCCTTTTGATAGATTGAACTGAAACTGCTTATTG 401 TATGTGGTTATATTTGGTAAAAGTTGCGTGTGAGCTTTTTACAAAAGGGTAAGAATTGTGTTGAATTTTAATTCACTTGT 481 ATAAGAAAACAATTTAAAACTCTCATAATAGGTCTTAAATATTTTTACTTGCTATTCTCCCTCAGTGATATATACCTCTT 561 CCTTTCCAGCTTTATGAAACATCTATTTAAGATTTAAAGTTATCAGTGATCATAGTTTGGAGATAAAATTTGACCCAGGA 641 ATGAATATTTATTTTAATTAGGTTTTCATACTTATTAAATGTAATTAAAGACTTGGGTCTTGTCTGAGTTCAGTGGAATT 721 GAAACCACAACTTTAATTTCCTTACAGAAAAACTTAATTTGTTTCTTTTAGTGCCACACCTTAAAAAGAAACCCCAAACT 801 AGCTCCTCAGGAATATAGTTTTATTTTGCAAGCATACCATCTAGCTGAAATTGTATACACATGAATATATGTAGACTTTT 881 CCTGTTGGGCTGAAGTGTGTGCTTATAAATGTGTTTAGTTTTTAAGCTAAACATTCAGTTAACAGTCTGTGCATTGATTA 961 GCATAGGGCAGGTGGTGAGGACCTGGATTTTTATTAAACAGTTTAGTAATTATAAAAGTTTCTTGTGTTTACTAGTAAAG 1041 AATTTTAAAAATCTATTCTAATTCAACAAGTTTTTAAAATCAACTTTGTAATTTGAGGGGAAAATTTGGGGGGAAGAGGT 1121 GGGTGGGCCACTAAGTTACCTCTCTTTCATTTGGTGGCCCTTCCAGGCCATTGAAAATAAAGACGTTGGCTCCAGTTTGC 1201 ACATTGGGAAGAAAGCATAGAAATTTGACTTGTATATTAAAAATAATAGAAATGTAATATGTATATTAAGAATGCATAGG 1281 TCTGTATTCTGTAAGGGGCTCTGAAGAACAATATGGCACTGCTGTGTTCAGTGTGAATTCACTGCCTGGGAGAACTGCAG 1361 GAATGCTTGTCTTCACCATTGTGTTCTTACAACGAATTCAACTTTCCATGGTTTATCTTGACAAAATTTACATGTGTTTA 1441 GGTTACTTGTATATTGATATATTTTTTTAATCTTCAGTTTTTGTCTTCCTTTTGCCTTTGTGTTTTCAGAAGTAACACAT 1521 GAACACTTTTTAAAGTACATTACAGAGAAGAAAACTGTGAGCTATTATATAGTGTTTCTTTTTTAACACAAATCTTTTAA 1601 CTTTAAAAAAAGGCAAAAATTTTTTTTTTCTACTTCCCACCCAGCTTACCACCTTGATCTCTTTAACTTATGTTCTAAAC 1681 TTTGGTGTTAATGGTGGTGTCTAGCATGCTAGTAGTTAGATTTTATTTAGATGCCATAACTGGTAATACAGCTTTTATTT 1761 TGACTATATTAATTTAGTTTTTTGAGGGGAAGTTTGTTTATTCTGTGACTCTCAAAGCACACAGAGGTTTTAAAATATAT 1841 ATTATTAAGACTGAGAGAAGAGGAAATGGGAGGGAGTAACATCACAGAAGTGCTGTTGTTCAACTGTTCTTCAATATAGT 1921 TGCTAGTAGGTTTGTATTTACTCAGTAAGGAAGTCAGTGACCTGAACTACCTATAAAAATTCAGCAGTGCTGCAGTGTTG 2001 CTTAAGTGAAACCCTTTGGCTATCTAGTAGTTTTTATGCTACTGAAACTTGGATTACTGTATGATATTCAGCTTGTCTTG 2081 GGCCCTCTATGTAGACAAACATTCATATTCATAGTAGTGTTGTATACTGGCCTGTTTTTATAACTTTATTTTTCAAATAT 2161 TAACAACCACTGCTTTCAGAGTGGTTATTTTGTTATTTTTGAAGCAGGAAATAACCATTTGTATTTGCACCTGCGTATTG 2241 CATATGAATTATGGTATACTTGGCAAATGCTTTTCTTTTACCTGTGAAAATTCTGAAAGCTGGTCCAAGCTACATTGCAT 2321 ACCAAATTGTGCTCTTATATATTATTTGCATCGTGTCCTTTTTAATCAAATAGCATGTTTTAGTTTTATTATAGTAGCTT 2401 TTGCTGTAAGAATGTCACTTGCTTATCTTTTATTGTACTTGAATTCTTAATCATGCTTTTAACATTGTATTTAACAAATC 2481 ATTTCGTATTAGGTTCCATTAAAATGTCATTCCTTTGAAAAGGCAAGGGATTTCCACTTTCAGAATTTGAAAATGAAAGT 2561 AGCATGTTTATCTAAAGGCAGAAAATAGTTCGGACTTGGTATTATGAAAATAAGTAATGGTTTCTGGAGAGGATTTGTTT 2641 AGATTTGCACAGATGGCGATGGCACCTTTTACTTAAATTAACATTAATCAACAGTGCTAAGGAAAATTTACACAAAATTA 2721 CAAGATAAAACATGGAAATGTGTGCCTTTCAGTATACAAACTCTTGCTTGGTGGCCATTTGGGTAATCAGACCATTTGAA 2801 TGCCTGAGAGCATGTTTAATTTCTGTGGAGTGCCACATATGGCTAAAACAACTCTTTAATGTGCAATTAATTTCTAGAGT 2881 AAAATGTCTGTTATGTGAGGGGGATCTTTATGTTGGGCTTTTCTATTTTTTAAATGTTCACATTTCTTTCTGTTAATTAA 2961 AATGCCATCATAATGTCACATTTACACTGTTGCCTCTTTTAAAAGCAAAGCCACTTTCTTGTTCTAAGATTACATCAAGA 3041 CTTGAGCAGTGTGTAGTAATTAAAATGTGTGCTTAATGAGCATAATAGATTCTGGTTTTAGGAAATAACATATAGCTTTT 3121 ATATGAATATTTTCTTTTGCTATAATGAAAGTCACAGATTTTTTTTTTCCTGGCTTTTATGGAGGAATGAAAAGAGTTGT 3201 CTCCCTCTAAGAGTATACTATTTTTGATTCTCATAGCAATAATGTCACCATTCTTATCAGAGGGTAAATACCCCTTGTAT 3281 AGGAAAACAGACATAATTTCCTCTTGGGAGTTCTCTTTATGACTTAGCATTTTCTTCTACTTGAGAAAATTCCTGTTTTT 3361 CCGATTATTTCATCTTGAACTTTCTTTTTTTTAAGCTTTTGTGCAATGTAATAGTTTGTTGATCCATCTTTGTACATTTT 3441 CATTTTATTTCATGTCTTTCTCTCACCTACCTGTCAGAATCAGCTATAGCAGATTTTGAATTCTTTAGTTAAAAAATAGT 3521 TGCTTTACTTGTTTCCTCATGAGTTTGTTAAATAGCTTTGCATTTTAGTCCTCTATTATGCTATGAAAATTATTACGAAG 3601 TTTATATTGTTCCCTTTTTAAGCCTGCCTTACTCTTGTCTTTTGTCATTGTCTATGGTTTAATGAAGAACACACCAAACT 3681 AACATTTTTGTTTATTTTGAGGAACAAAAAAACTTTTCTCTTTTAAGGGAAGTTACTACACATTGAGTTAGTAACTACTC 3761 TTTCAGTCAAGGTTCCTTAATCAGTCCAGTCTACATCAGGACTATGACTTGGGGGGCGGGGCTAATCCTTTTTGCTGTTC 3841 TGAGCTACTATTGTCAACTGCTGTTGTACATACTGTTATGTGTAATGGCGTAAATATATTTATTATGTTTGTAAAATTCA 3921 TTGCAGATCAAGGTTGCTCTTCTGTGATATATGGGATATTATGTTTTAAAGACCATCTTGGAATACAATTAGAGAACTTA 4001 GTATTTTGATGTACTAAGACCTATTTTAAGTTTAATATTCTACTTTGCAAAAACTTTAATTAAAGATGTTATTTAAAAAA 4081 AAATGTTGCTTGCTTTGCTTACTAGTATATGGCATTGTTATAGATAATTGAATAAAATACAATTTAGAAAGGAAAATGCT 4161 TTACATTGTTAATGAGAATTCCATTTAACAACAACAAAAAGATGCTAAATTCTGTACCTTAAAGATAAGTAGATTGAGAT 4241 GTCAATTTGAATTAGTAAACTGTGTTACAAATGATTAATACTAGCTTTTAAAAAGTTGTATTTTCCAGGCACACAGGAAT 4321 TTAGGTTGGGCGAATTCACACTAACAAATTATAACTAAAAATTGGTATAATTAACATTGTTTTTCAAAATAAAGATTACT 4401 CCTTGTGAAATATTAATAATTAACATATTGTATTAAATAAGTATTTCTACTCCAAAGTATAGATTACTTAGGATAAAAAC 4481 ATTGTTATTTCTCTGTTTAGTCAAACCACTTCCTCTTAGTTCAGAGGTTATAAATAATTGCATATTAGGAGAATTGGATT 4561 ACTGAGGTTTGTATTGCGTATTGAATATATTTTGTGTTATTTTAGAAGATAATAATTAGCAGGTATTTTAATTTTATAGT 4641 TAATTCAGCTGAATCATTAAGAAGCTCGCCTTTTTGTATTTTTTTATCCTGTTAACAGACTATCTAGAAAACATGCAAAT 4721 TTTAACTATTAACATAATCATAATAAAGATATCTTATTTATTGCCAGCAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293 |
Disease | 2957.0 |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
"PAR-CLIP data was present in GSM714644. RNA binding protein: AGO2. Condition:completeT1
"PAR-CLIP data was present in GSM714645. RNA binding protein: AGO2. Condition:completeT1
... - Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al., 2011, Nature methods. |
Article |
- Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al. - Nature methods, 2011
Cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) is increasingly used to map transcriptome-wide binding sites of RNA-binding proteins. We developed a method for CLIP data analysis, and applied it to compare CLIP with photoactivatable ribonucleoside-enhanced CLIP (PAR-CLIP) and to uncover how differences in cross-linking and ribonuclease digestion affect the identified sites. We found only small differences in accuracies of these methods in identifying binding sites of HuR, which binds low-complexity sequences, and Argonaute 2, which has a complex binding specificity. We found that cross-link-induced mutations led to single-nucleotide resolution for both PAR-CLIP and CLIP. Our results confirm the expectation from original CLIP publications that RNA-binding proteins do not protect their binding sites sufficiently under the denaturing conditions used during the CLIP procedure, and we show that extensive digestion with sequence-specific RNases strongly biases the recovered binding sites. This bias can be substantially reduced by milder nuclease digestion conditions.
LinkOut: [PMID: 21572407]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM714644 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / completeT1, repA |
Location of target site | ENST00000553612.1 | 3UTR | AAACUUGGGGCAUAUGCCAACCAAAACUUCG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 21572407 / GSE28865 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM714645 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / completeT1, repB |
Location of target site | ENST00000553612.1 | 3UTR | AAACUUGGGGCAUAUGCCAACCAAAACUUCG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 21572407 / GSE28865 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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75 hsa-miR-6715b-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT080245 | SMAD4 | SMAD family member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT142553 | TNRC6A | trinucleotide repeat containing 6A | 2 | 4 | ||||||||
MIRT384667 | MARCH9 | membrane associated ring-CH-type finger 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT446660 | MXI1 | MAX interactor 1, dimerization protein | 2 | 4 | ||||||||
MIRT463754 | YTHDC1 | YTH domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT476873 | FEM1B | fem-1 homolog B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT478429 | DAZAP2 | DAZ associated protein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT495237 | SPRY3 | sprouty RTK signaling antagonist 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT495945 | ANKRD52 | ankyrin repeat domain 52 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT497116 | TYW3 | tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT497344 | RPP25L | ribonuclease P/MRP subunit p25 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT498133 | KLHL3 | kelch like family member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT502306 | GNA13 | G protein subunit alpha 13 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT510854 | RAN | RAN, member RAS oncogene family | 2 | 8 | ||||||||
MIRT513323 | KCNMB1 | potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 1 | 2 | 6 | ||||||||
MIRT523995 | DTX4 | deltex E3 ubiquitin ligase 4 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT525837 | FAR2 | fatty acyl-CoA reductase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT527506 | MYD88 | myeloid differentiation primary response 88 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT527668 | CIT | citron rho-interacting serine/threonine kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT527996 | NDNF | neuron derived neurotrophic factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT528052 | MRS2 | MRS2, magnesium transporter | 2 | 2 | ||||||||
MIRT528257 | GPRIN2 | G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT529401 | ICK | intestinal cell kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT529558 | SNRNP48 | small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 48 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT530323 | TNFRSF10D | TNF receptor superfamily member 10d | 2 | 2 | ||||||||
MIRT532230 | KLF2 | Kruppel like factor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT534220 | SLC35G1 | solute carrier family 35 member G1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT536195 | MAML2 | mastermind like transcriptional coactivator 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT538093 | DEPDC1 | DEP domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT543159 | GTF2A1 | general transcription factor IIA subunit 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT545840 | ZNF264 | zinc finger protein 264 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT546401 | SRP9 | signal recognition particle 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT550643 | SLC39A7 | solute carrier family 39 member 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT558648 | CNKSR3 | CNKSR family member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562208 | HMGN2 | high mobility group nucleosomal binding domain 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT562886 | NACA2 | nascent polypeptide associated complex alpha subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT566786 | MKL2 | MKL1/myocardin like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT567508 | FOXC1 | forkhead box C1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570235 | CPNE5 | copine 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT576823 | Tgfbr3 | transforming growth factor, beta receptor III | 2 | 2 | ||||||||
MIRT610704 | GPX6 | glutathione peroxidase 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT611141 | CRISP1 | cysteine rich secretory protein 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT618100 | PPP5D1 | PPP5 tetratricopeptide repeat domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT619086 | OMA1 | OMA1 zinc metallopeptidase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT619716 | FCF1 | FCF1, rRNA-processing protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT620953 | POLR2D | RNA polymerase II subunit D | 2 | 2 | ||||||||
MIRT624645 | ASXL3 | additional sex combs like 3, transcriptional regulator | 2 | 2 | ||||||||
MIRT624655 | ARMC10 | armadillo repeat containing 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT630778 | KLHL42 | kelch like family member 42 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT635596 | ATP9A | ATPase phospholipid transporting 9A (putative) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637122 | MKX | mohawk homeobox | 2 | 2 | ||||||||
MIRT645527 | ZWINT | ZW10 interacting kinetochore protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT647249 | PTGDR2 | prostaglandin D2 receptor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT651508 | WNT9A | Wnt family member 9A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658721 | ELK4 | ELK4, ETS transcription factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT658804 | EFNA5 | ephrin A5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT659319 | CSRNP3 | cysteine and serine rich nuclear protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT664605 | UGT3A1 | UDP glycosyltransferase family 3 member A1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT666047 | STON2 | stonin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT672228 | PDE7B | phosphodiesterase 7B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT683243 | WFDC6 | WAP four-disulfide core domain 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT686565 | TPM3 | tropomyosin 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT697560 | ZBTB10 | zinc finger and BTB domain containing 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT699294 | SLC5A3 | solute carrier family 5 member 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT707134 | TRA2B | transformer 2 beta homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT712255 | PTPRN2 | protein tyrosine phosphatase, receptor type N2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT713896 | IGF2R | insulin like growth factor 2 receptor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT716186 | UBN2 | ubinuclein 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT716525 | KSR2 | kinase suppressor of ras 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT716968 | CNOT6 | CCR4-NOT transcription complex subunit 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717154 | LRRC3C | leucine rich repeat containing 3C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT718669 | LSM10 | LSM10, U7 small nuclear RNA associated | 2 | 2 | ||||||||
MIRT722100 | PTBP3 | polypyrimidine tract binding protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT723569 | GEMIN4 | gem nuclear organelle associated protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT724703 | CRAMP1L | cramped chromatin regulator homolog 1 | 2 | 2 |