Gene Symbol |
RNF217
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Synonyms |
C6orf172, IBRDC1, OSTL, dJ84N20.1 |
Description |
ring finger protein 217 |
Transcript |
NM_152553
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Expression |
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Putative miRNA Targets on RNF217 |
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3'UTR of RNF217 (miRNA target sites are highlighted) |
>RNF217|NM_152553|3'UTR
1 AAAACAGAGAAAACGATCACGGACAGGTATGCACTGGTAACATGCAGATGATTTCATCCAGCTAAGCTGGTTGGAGTAGG
81 AGCGATACCAAAGGGTACACCCATCTGTGAGTCACATCTTGAAAAACACTGAGAGGAACCTTCTACCATCTCATCTCCCA
161 GTGATTCTCCGTGGGCCACAATGCCTCTAGCTATGGTGCACTCCCAACATGGTATCCTGTCCTTTCCCTAAACAAATTGC
241 TGCTGCTTTTAAAAAATGGTCACTTTCATAAACTATAAACATCTATATCATAACTCTGACCTTTGTGGTTCTTGGAAGAA
321 GATATTTTAAGAACCAGTTATCCTAAGAATTCTGAGCACGCCTCTTCTGAGAATTGCTTGGACTGTCTTTGAACTCTGCA
401 CCTCCTTCCAGGCCATCTTGTGAGACTTGGTGTTAATAGCTGAAGTCCTATCTGTACCAACAAGCAAGGCCACTTTTCAG
481 AAGATAAGAGTTCACTGAATGCACCTATTATAATCTGTGGCCCCAGCAGTATAATTCTTTTATCTTTCAAATGTTATAAT
561 TGCAAAAAATCTCAATGTCCAAAAGGGAATGAGTGAAACTAAATTAATGAGAAGAATATTAAGTTACTGAAGTGTATATG
641 CGTAGGGGCGTGAATGTGTGTGTATATAAATATGTATTAAAACTAGGCCCAGTAACCTTGTACTTACCCAGTTCCATGCC
721 GCTACACTATTTTTCCACATTTTCATAG ACCTATTGAAAGATGATGGCTCCTTTGTGGACATAATTTAGCAATGTATTAA
801 ATTAAAGTCAATGTAGACAACAGGCCATTTCGATACTGAACTTTTCTATTTCTTGCTCTTTCTTTTTGTCACACAAACAC
881 AGAAATTTGTGCAACGTCACCCCAAGGAGTATTAAGCTTTGTAAACTGACAAAACTGGCTGCTTTTAGGAAATTCTCAAG
961 ACACAAATATTCAGTCTTTTTAAAATTCTTACATTTTGGAAAACATGCTTCACTCTATAGATAGATCCTTCACATTGGGA
1041 TTATTTAATCCCAAAAACAAGTTTGCTGTAGACAACTGCTTAAGCCTTTAAAAAATTCCTATTCTGCTAATTTTTTAACC
1121 AACTTGTAATTATAGATAATTCTGCTTTAGGTCAAGGTCTTACATCATTTAATATCCTAACCTTGTTATCTCTTGCCTCC
1201 TCCTCTCTGTTTTTATTTGTTTTCAAGGTTTTTCATAAAAACAAATACTAGTTTTGAAGGATTTTTTCTTACATTTAACT
1281 GCTCAAACATAATATTTTTGGGGACACCTTCTTATGGAGGAGTTTGAAAACTTTTTATGTTCTTGAGTTTGTCCAATATC
1361 AGCTGCTTTTGGGAAAGGAAACAAAAAAGTGAAGGAAATATTTTCAGGAAGTTTTTCTCAACCTACAAAAGCTTTAAAAA
1441 TAAGAAATTGACAAGTAACTAGACTATGATATGCCTTTGCTTTCATCACAAAAGTTCATCAGCAAACAGGAAAAAAAAAG
1521 ACCCCTAAAAAGCCTAAAGCTTTAAATTGTCTCCAAATTCTTAAAATTAGTCATCTGTCTTAGATGTACATTTATTTGTC
1601 AGCAACCTTGTCTGATTTGAAATAGATGATATGATAAAACATGCATTAACATGAGTAGTTTATTTTTGTTGGGCTCCAGA
1681 GTGTAAGAATATTTTATTTTTTGTTTGACATAAAAAGTGAAGTTGACTTGCGTGAATAACAATCCAGCATGCTTTCATTC
1761 TTTCTGAATAACACAGAATAACTGTGCTACAGCTTCTGGATTAGTTGTCTATTTCCAGTTAGAGGAGTGTGTGACATTTA
1841 TGGTTTGGGAATAGCATATTTCTAAAGCATAATATAATACAAGAAATAGTGATGCTCTGTTTTCACAAATTTATCTTTTC
1921 ATTCACCCATCCATCCATTTAACAGATATTTATTGAGTGCCTATCTTAGGTGTAATAGTATTTAAGACTGAAAGAAGGAG
2001 AATTTCTAACCTGTCATAAGAGTAAGGTTTCGTAAATTCATCTTTCCTGAACTTAGGCATTAGTTTGGCAATATGTGAAT
2081 ATGATGAACTCTAAACCTAGCTGATCTGTATATGTATGATGTATATATGTCATATGTATGATATATATGAAATATTCCCA
2161 TAACTGCATATGAACACATATGCCATATACATATATACCAACGGGCTGAATAACATACTCTTTTGTCTTGGATAATCTGT
2241 TTTCTGGGTTATGTATCTGTTGTCTTTGGCCTACTCAGGGATTTTTATTTCTTTAAATAACTTATCTTTTGGACATATTT
2321 TTATATTATTTGGAAAACTTTCCAATATTCCTGTTACAAAGTGGTGTCTGTTTTCAGTGATGGCTATTTCATCAGTGCTT
2401 GAAATAGTGTGCACTGTGTTGCACAGGTTTTTCATTTTTCTATTGAGTAGATATTTTTAAATTAACATACACATTTTTCT
2481 CTTTAAAGGGTCATATCTATTAGGCCTTTCCCTGCTGGTAACTTAAAATGATTATTTGTGAATTTTTTACTAAGTTTCAT
2561 CAAGATCTTAAAAAGAGAGAAGAAAATAAAAAGTATTATTTATATGTCAGTGCCAACTTTGAAGGTAAAACAGTAGTAGT
2641 AACTTTTGGGAGAAATTCTAAAAACTACTTTAAAAAGAAGCGTGCACATAAAATAAATATCTTTCTATCCAAGGCTTGTC
2721 ATTTTATATGCTTTTATTGTAAATTTAATATATACTACTTTAAAAAATTGAACTATACAGAATTTATAAAATACAACTTT
2801 CTCTACTTACCCCACCTCTTATTTTCTAGGGGTAACCACTGTTAATGGTTTGGTATGTGTCCTTCCAGACACTTTCTACA
2881 AATATACAAATAAGTGTGTTTGTGTATGTGTCTGTGTGTGTATTCATTTTATACAAATAGAAAAATATTCTTACTGTGCT
2961 GTGACTCTTTGTCATTTTATTATATATTAATAGATACCTTTCCATAAGCGTTTAAATAGATTTACCTCATTCTTTTATAA
3041 ATTACTGCATAATCCATTGTAGGAGTATACTTTAACTTATTGAATTAGTCCCCTGTTGAATGGACTACAAGATTATTTTC
3121 ACTTCTCTATTACAAAGAAAGCAAGAGTGAAGACCCTTTTGCATATATTTTTGTCACCTTGCATGAACATATCCATAAGG
3201 TTGTACATTTGTTTTTTACAAGATCTTTGTAATAAACATTTTAATGTAATTTCAGGAGATGAGGTCATAGAGATAATATG
3281 AGACCCTTTTTTGGATAAAAAGAAAGATTGTACAGGAGTGCATAATTTTTAAAGAAAATCGTCTTTTGAAGGGTAATTTC
3361 CTTTCTGCCTGATTAGCCAAATAAATACCTTGCCAAAACTTACAATAGGAAATTTTTTTTCAATAAAAATAAAATTTGAG
3441 GAGATGTGTGTCAGATAATGTGAGAGAGATGAATTGACTTTTGGATTGCCTCATTTTAAAACTTGAGGGATTTAAATCAA
3521 ATACCCAAGCCAAATTGGTGATACTTTTCGCATTTTTAGTAACACTATCCACTTTTGTGTATGTTGCTTGACAGAGGAAC
3601 TTAATTATGCCATTGTGAAAAGTAGGAAAGAATATGTTGGCAATTATAAATGCCCACAGCAATTCCCAGAAAAATACATT
3681 AGATTATGTACGATTTAGTGATTTGGTGGGATAATTATAAATCGTGGAATAATTTATATATGTGGAGTAAGAAGAGAGGG
3761 GTCAAACCTTTTGGTACAAGCAACATCTTGTTGCCACCACCTTGATTTTCTCATAGGTGCTATTGTGTCCTAAGAGTAGA
3841 ACAGACAAGAAAACAAAGATAATTAAACACAAGTCAGGTTACAACATGATATCTTTAATTGTACTTTCTCTGCTGTGGTA
3921 TCAAGATTCAGTGGTGCTTGTCAGAAAATACCTTGTTCTGTGACTCTGACTATCTCTTGAGTCCCAAGGCTCCAATTGAG
4001 CCTTTATCTTTCAACCTTACCACCCAAGTATATGACCAACTGTTCTCCTAAAATACCTATGAACCACTGTAATCATTTCC
4081 AGTCCCTGATGCCCCTCTTCAACCTCATTTTTCTCCATACCTCTGCTATTCTAACTATTCCTCTTCACTGAAGGAGAAGA
4161 GGAGAGACAGGAGGGGCCTAAAAACTCACTCTGGTATGTGGGAAACATTAGAATTCCTTCCTGACCTTTGTCAAATGAGG
4241 GCACATCTGCCAAGACATCAGTCCAGCTTCTCCCTTGTTAAATGAAATTGTTTTTAACATTACACTTTTATACTGGCTGT
4321 TACATTAGAATTACAAAAAAGTTAGTGGCCTCTATAACCTTAATTGGCATACTTTACTACAAAAATAAGAAAATGTATGC
4401 CAAAAAACGTTTTTAGATTTTAATTTTATAAGCAACCTGCACATAAGCCTTAATGTGAGTCTTCACATTGGATTATATTT
4481 TTATTCTCCCATATTTGTGGCTGAAATCTCTCCCAACTATTGAGAGTGATCTTTCCCATGGTCTGCTTTATTGTTTTGTG
4561 TTAATATCTATTATAAATATAGCCTTAAAATTTTGTAATGCACTTTAAAATATTTGTGCCATTTAAATAATGACAAAGCA
4641 ATCAATGCATACATTTCAATGGAGACAGTATACAAAGTTAAAGCAACTGATACATATATTTCAGTGGAGACAGTAGGATA
4721 ACAGTGTTAGCAAATATGTGTCATCTCTTTAAATTTGGGAGGAATCAGAAGCTAAAGATTTAAAACAAATAAAACATACC
4801 TGAAGAAAAGTAGCAATTTCTGAAATTGTAGTAATCTTGGAATGGTTATCAAACCTAGCAAATAATACTTAATAAGTGTT
4881 ACCTAATATACCTAATTGGAATGTTTGTTTAAAATATTAAATTAATTTATACTGAAAGTTTTAACTGCAATTTCATAATT
4961 CATGAATTCTATAAAAGAAATCTCCCTCACTAAAAATATGATCAATCAAAACTACCAGTTTTGCACACCAATCCCAAGTT
5041 TAAGCATATTTTGTATTTAAAGTTATAATTTAATTATGATACTGTCCCCCTAATATGGAAAATAAGTTACAAAATTCTTT
5121 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGGTTCTCTCAATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCTTGGGCTCAAGCGATCC
5201 TCCCTCCTCTGCCTCTGGAGTAGCTGGGATTACAAGCACGTGCCTACTATGCCTGTCTTCAAAATCACATTGTTAATTTT
5281 TATAGCCACAATTATTAATTTGATAAAACAAATAATTTTATAGAAGCATTAAAGTATTATCAGAACAAAATCAGAGTTCC
5361 AAAATTTGGGGAGTATTTTAAGATTGTGAAATGTTACCTTTTGGATGCAAACCAATGATACAAATCTTTAAGAAAGAATT
5441 ACAGTGGGACTCCTTTGAAACTCTGATTTTGAAAATAGAACAAATACACATTTCATAGCCAAACTTTGTGTGGGACTTCT
5521 ATTGTTACTAATTGTAAGGCTGTAACTTTGGTTGACTTCATCCAAATCCAAGAAACAGAGTCACAGTAGTGAGACTATTC
5601 TCATTGCTTCTTTGGAGCATTAGCTGAAGCTTTACCATATCACATACCTTACAAAATCCCTATACATATTGCCAGTTTTA
5681 AAAGAATGTAATTATGCATGTTACAAACTATATATATCTTTTTGGCTAGAGAAGTGACTATTTTAGAATAACAGTATGAA
5761 TGTAAAAGGCAATAATTTTTTTTAAATACACAAAACATTGCCATTGCCCTTTTTTGTCACTTCCTTTTTTCTTCTAAAAA
5841 TTTTCATTTGGTGTATCTAACTTTGTATCACTTAAATTATTCAGACTTACTAAGATAAAAAATACTTTTTTTCAGTTCTG
5921 TGCTATATTCTGTCACTCTATTCCATTATTAATACTAAATGACTTTCCTTGTGAAATGATACCCACATACTACAACATCA
6001 AGCTCCTTTTTCTCTTAAATTTCCTAATTATCTTGATTTTTGCCTCTGCAGTCTTCTTCCCATCTTGGCCAAGTGTGGGA
6081 TAAATTCTGTCTCGCCCGTAACTCCTTTCACTGTAATGAAATGAATTCAACACTGAACGCACTCCAGAATTTAGCTCTGG
6161 TAGTGAGCATAATTTACCTTGGCTTATTTTATTTGTAAATGGAAATGTATCAGGAGTGCCTGGAACACTTTTCCCTCTTG
6241 ATAGGAGTTGGAGAACACTGCCTAGCCCTCTGCCAAGAAGTAAGTCAAGCAAATGAAGATACCAGTTGGATCAGAGGGCC
6321 TAATAATAGTCTAAAACCAAGCTTCAGAAATTGCTTCGTGACTGTTGTAAGATCAATATTGTGTTTGCGTATTAGTTGGA
6401 CAGAAAGCATGTGTGGACATTCATCCAACCTGACCCCAGGTCATTCATTCTCCATCCAAAAAGGGTTATAGGTATGGTTT
6481 ATGGTCTTTGTTTCAGCAAAACGTCCTACAGCTTGGACTTGGGGTGGATTTATATAGTGTAGCATTTGTATATAAGATTC
6561 AATTATGGATTCATGCTCTGTGAACATTGTTAGATTTTTAATAATCTAAAGTAGGTCACATTGAATGTAACTGATATTAA
6641 CCCTATTCTAGAGAAAACATTTGTCATTTGCAAGTGTTTGACTTTTTTATTGATATGATTTAGATATGCCACACTCAATA
6721 TATTTAGTATAGATTCAGTACATAACAGGAAAGAAAAAGGGAGAGACAGACTTGAGTGTTAAAGGACCCCAGAAATTGCT
6801 GAAATGTCCTTTTAGATTCTTGTGGCTGGCAAGCTATGCTGTCATTGGTTCTCTGCGAATCTGTGATGTGTTCACTTCGC
6881 CATGCCCCAGCTTGGGAAATATTCTTAGTAATCCAATCAAATCCTTAAAAACAGCATTTTTGTGAATGTATTACTTCTTC
6961 AATATCCCCATATATTTGTATTGTTTCAAGCCACTAGTATCTAAATTTTTGATATAAATATCTAAATTCTTTCATTTTAT
7041 AGAAAATTAGCATGCTTTATGTTTCTTTATAATGAAAAGTCTAGATAAAGTATCATAATTTCATTATCAGCTGACAAGAA
7121 ACCCTTCTAAGACCCATTTTTTTAAGTGTCATATGGCAACTCCTCAATAGCTTACTTTTATTATTTGATCATTTTCATCA
7201 CAATTGCAATCCTCTAGAGGGTATTTTAAAAAGTAGACCAACCTTATGTTTCACGTGAAACATAGAATAATAATTAGTTT
7281 GTATATATATAAAACCATTTACCTTGACAAGGACAATCTGTTACAGATTTTTAATATGAAAATTGACAATTTTGTTGCTT
7361 TTAGAAGCAATTAACATAGTAATTAGTAAATTCTGAGAGATGACAGAAATGATTTTCTGTAGAAGGAACACAACAGTGAT
7441 GTTAAAATGTTAACAAAGAACCAGTTGTTTTGATTCTATTTTAAACAAAATTGTAAGGCAATTTTATGAAACAAACATTT
7521 ATATCAATGTATATCTATTTCAAAACTGTGGGACAATTATTCATTCTTTTCCCAAATAGAGTAAAATATTAAAGAGAAAA
7601 AAATTCGAGTGTTTATCTGTTATTACTGTATATTCAGAAATTACAGTTCTAAGGAATTATTGTCATCCTCTAAGTATCAG
7681 AATGTATTCCATTTTAATTATATTCTCCTTAACAATAGAAAATTAGAAGAAATTTCTTGATCATAAGATGAATAGTAATT
7761 TGTACCAGATCTTGTCCATCATTTCATTAGATTGCATATTTTTAGTTTTCTATAAAATTTGCAGCCATTTTCCAAATAAA
7841 GTAAGTTATAATATTTTTCAAGTTTAAAATGGACCGGGTTGAAAAGAGATTTCATTGATTCTTTTTAATGATATTGGAAA
7921 ATATTTATGCAATTTTATTTTTTAACCTTTTCTCCATTTCATTAGTTATACTATTAACTTTGATAATCACAAAACTATGT
8001 GGAAGAAATCATTCTGATTATATTTTATGAAAGAGAGGGGTAGAGTAAATTTTTTAATTAGACAATGTTGATATGCAGAA
8081 ATCTCTCAAAAGAAATTGCAAAGGAAAAATTACGTTGAGATGAAATGTTGAGAAATAAGGAGTATCTTAAAAACCTAATT
8161 TCTTACACTTTTTAGAGCAATCAACTTATTTCCAAATTATTATTTCATGCTGTTGTTTCCATGAATTGTGTTTTTAGCAT
8241 AGTATATACTTTTCTACCACGTTAGCATTTACACTCTAATTACTGAAAATAAAGGAAGAAGTTGGTGAATAAAAGCCAGG
8321 GAAACTGGGTTTATTCTCATTTTCCAATAGCACTAATGTATAATCCCTTTAACCTTCCATATGGTGCTTTGTGTGATGAG
8401 TATATAACATTCATATACGTTATTAGTGCCTTATTTTTTTCACTTGACTTTATTTCTTATCTAAAGAGCCATATATTTTT
8481 TGTGAGTGTTCTTTGGTCCCTCTATTTAAAGTGCTAAGGAGAAAGCATATCTTTAGGGATGTATATAGGCTGCGTTTGCT
8561 ACCTTAATCTACTGTATTATCTCTAAAACAGGTTAGCCAATGTATTTTTCTTAAATTCATTGTTCATTTTTAAGCTAACC
8641 TATACAAATGGATATTAAACACCAGAAATTAAAGCCATTAAAATTGAATTGTACTTTAAAACCATAAAAAATGCTAATTA
8721 AGTTTAGAACAGGAGTTGAAATGACTCTCAGTTTTATCTATAGCTCCAATTAGGACAAAATTACTTTACAAAAAGCATTA
8801 AAAATAAAAGTAACTGTATGGTACTTCAGGAATTTGACCAGTTCCTTACAACTTATTCTTGGCAATATTTTGTCAGTAAT
8881 ATACTTTCATACAGATGCTAGAGAACCATGGTGTCTGCTATTTACATGTTATTTGTTCCCAGTGAGCTTTATCAACATCA
8961 ACCCTGTTTATATAATATGTTATTTTGCTCTTCTTGATCTGTGCCTTTTGTTTTAGCTTTATACAAAATGCTAGGTTTGT
9041 TATATTCTTTATGTATCATAATATATAATTCAACTTTTCCTGATGAATGTATGCTGAATAATTAAACTAAACCATGTGCT
9121 TAGAAAAGACAAAGACAGGTTGTATATGCAGTTATGTGTAAATATTTGACAAAGAAAAAAAAAGGAAAAGAATCTTCCTG
9201 CCAACAGGTAGGTCCTGCTGGACAGGACCTGAAAATTAAGAGATTTTTTTTTTTAAGCAGTGAAATTTAAAAATCTATTA
9281 CCTCAAGAATTTTCAGTCGATATGTCAATGTACTGTTCCTTCTCAGTAAGTACAGTGTCACATGCTGCTGGCGGTAAAAG
9361 CAACCCAAGTGTCAGATCACACAAATTTTAGGGACAAGTCTTTCAAAAGACGGACACCTTGTGATATTTTGGAGTCTAAT
9441 TTCCGACTTTTCGTAATGTCCCAATGACCTTTTGTTGTGGTTGGGCTTTTATAAAAAATTATTTTCGGTTGGTTGTTGTA
9521 GAATGGAAGAGTAATCTTAATTATGAAATCAGATTGCATGGAAGAATATAAAGACACTCACTCGGATGAAAACTATAACG
9601 GTTTTCAAACTATTTTGATGGTCATTGTACGAGCTATTGTATGGATTACTGTGGAGTGCTGTTTACCACATGATGTGTGC
9681 AATACATCATGCAATGTTATTTAGCAATGCGTAATAAAAGTTTTTAAAAGAGAAAAT
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' cgaGACGA-GUCU--UGAUGUGAg 5'
| |:| || : :|||||||
Target 5' accCAGTTCCATGCCGCTACACTa 3'
|
706 - 729
|
144.00 |
-12.50 |
2
|
miRNA 3' cgAGACGAGUCUUGAUGUGAg 5'
| | :|:| |:||||||
Target 5' atTGTTTTTAACATTACACTt 3'
|
4287 - 4307
|
139.00 |
-10.50 |
3
|
miRNA 3' cgAGACG----AGUC-UUGAUGUGAg 5'
||| | |:|| | :||||||
Target 5' ttTCTACCACGTTAGCATTTACACTc 3'
|
8251 - 8276
|
137.00 |
-11.50 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|