Gene Symbol |
PPM1L
|
Synonyms |
PP2C-epsilon, PP2CE, PPM1-LIKE |
Description |
protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L |
Transcript |
NM_139245
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on PPM1L |
|
3'UTR of PPM1L (miRNA target sites are highlighted) |
>PPM1L|NM_139245|3'UTR
1 ACCCTTCAGGGGTCTCAGCTGCCTTAGACTAAAGGACTTTCAACACACTGGTCTCTTTTAATTTAGTGAAAAGTGTGGGA
81 GTTGTAATTAGGATCATCCACCCCAGACATGGAATCCCCCCTCCCTGGTGGTCTTAGGTCTATAATCAGTGACGAACAGA
161 GGGTGCCCTTGGCCAATGTAGTTAAGAAACTGGAAAATGGTTTCTTCATGTTTTCCCAACTCTTTCATCCAGTGTCCAAA
241 ATATATAAGTAAATAGCTGTAGAGTCACATATATGAAGTGAATAGCATATGTGTCATTTAGTCTCCCTGAAGATTCTTTT
321 CAAGATCCTGTTCAGGGTCCTCCAGGCATCAGCTGTTGTGTCCTCTCTTTGTAACAGTGGACAGGACAGACCACCCAGTG
401 CTGCAGGAGACAGGCCACTGCGTCACCTGTGAGTGGTCAGGGGCTGATGTGGCAACACCCTCTGCCAAGAGACAGAGCTG
481 TCCTGAGAATGCTTTGTCCTTCTGAGCCCATGTTTTCTGCTCAGTAGCAGCTTGGAAGCAGATTTGGAATGGTTTACTAT
561 TTTGGCTGCTCTTGGGGACTGCGAGAAGCAGAGAGAATGAGAGACCAGTGGCAACTGCCTGCACAGCAGAGATAACCCTC
641 TTCCCTTGCTTCCTTTAATAGTTAAATAGACTTTGTATACCACCTGACCAGCCTTTGTGCATTTATCCTAATCATGCATG
721 ACCGTTAACCTTTTGCTTAGTCCTTACCATATGTAATAGGCAGCTGTTAAATTCACCAACAGATACCCTGATTTTTCATC
801 TTACGTGACCAAGAAACCACGTTAGGGGAAATGAAAAAAGCAAGCCACAATACCATGATTCCTTCCATTTTCAACAGTAG
881 ATGAAGGAAATGATACTGAATGAGTCACAGTGTTCCCTGGCAAGTAAGCTGTTTGCATTGAGAAAGGAGTGAGCTGGTGA
961 GGTTACCACCCTGAATTGAGCTCCAGCTGCCAGTTTTTGTGTTTTTCCTTGCCCCTTTCCAAGTGGTTTTCAAGTGTCAG
1041 GCAGTGTTCTGAGAAGCAGCAGCCTATAACTGTATGTGTGTTCCTTGAAGCCAGGTGCAGAGTTCCCAGCTACTGCAGCT
1121 TGGGATTTGGTGGGAAACTACTGGGATAAGCTTCTCCTTGACAATGGAAAGGCAGCAGTCTTCAACATTTGGTTGCAAAT
1201 CTCCATCCACATCAGGGAGCTTTCCCCAGGCAAATACAAACCGCCCCGTGGCCTGCAGGCCTGCAGGGGAGGCAGCAAAG
1281 GGACCTGGCAGTTGCAACACAGTAAGTCAGGAATTCAAGCGTGAACCCATATTGATAAGTGGGCCAGAATTATTTAGGGG
1361 CCTGGCTTGCTGCTCTCCATTTCCTGTATCGCTAATTTATCATTTTTCCAACCTTGGTATTTTATATTATTTAGAGAAAA
1441 TGCTGGGTCACTCTCTTTGCCTAAGGTGACTCAAACAGCCAAACGAAACTTCCGTTGCCTCCCAGCCCTCTGTATCCACC
1521 TGGTTTTGTTCTTTCCCTGTGAGCATTTGTGGTTATAGCTTCCCATATGCCACATTCACCGGCCACCTCCTCGCCGTGGA
1601 ACCCTGCCCTCTCCCCTCCTGCTGCTGTAGAGTTTTCCCAAAGCAGTGTCCAGGAGAGAATTTGAGAGAGTGAAGAAATT
1681 GCCTTGTAGATGTGGAGGGCTGCAATCTGTCTTGATTTCTCCAAGCACTTAACTTTCTTTGACTGCACTGAGAATTGCTA
1761 ATGATTTCCCATGAGATTTGCTTACTTTTGTATACTGTATTTTCCAGCATTACAGAACCTTGGTTATTGTTTTTTAGCCA
1841 TAGAATCTTCTAGTAAAAAATATCTGCCACCATTTTAGATTTAAGCATTTGCCTATGGGGAGACACTGAATATGTGGATG
1921 TGTGTATTAATATTTGGGGTGGGGACAGGGAAGGGAATGTGGAAAACAAATGCTGGCTGTGAGCAGTGCTGAGATGGCCA
2001 GGCCAGGCGGCTGAGTTTGCTTGGAAATTCAGGACATTCTGACTCCTAAGAGTTGCCCCCACCCACCATCAAACTGAAAT
2081 CAGCACCAATGGTGTCAGCACTTTACAGCCCATAGCCAACTTTCTTTATTTTTAACGTAGCACAAAAATGTATAATAGCA
2161 AGGAAAAGACATTTTTAAATTCCGGTTATTTTTATTGTCTAAAATGAAAGCAACAGTGTTTTGATAAAGATGAAAAAGAA
2241 AAGCTACTAAATTAGTAAATCAGTGGTTACGTGCCCTGCAGAATTTCTTAACAGATGGTGCTGAGTGCACGAGTTACATA
2321 ACTTTCTCTCTAATTGAGGTTCACAAGGCGTCTTCTAAATTTTGCTTTGTACAATTAATTCATTTCTGATGTTAACCAAA
2401 TAGAGTGTATATATCCTACTCCCATTACTGCCTCTTTCCCCCCTACTATGGCTTGTAGATTTTCAAAAGATAGAAGTTCT
2481 AGGCAAAACTGTAGCAGTTTCATTAATAGTTGTTAGGATAGTTATATCTAAAATCAGAGTATTTTGTTCCCTTCCTTCTG
2561 GAGCTCTCTCTCCCTAGCCCTTTTCCAGCTGTTGGGGATGTGCAGACATCACTCCTGGGGGTGCCCTATGGTACACTGGC
2641 TGCTCCCCAGGGACCTGGGAATGCTGAATCTAGCCATTAGGGAAATTGATTTGAGATGTTTGCATGTGAAGCTTCCCTAA
2721 GCAGCACTGCCAAAGCTTTGGAATTGTCACCCAAGGCTTCCTAGACTCCCTAGCTAGCTCGAGTTCGAATTGCCAATAGT
2801 CCCCATGGTGCCAAATTTTGGGATGGTTTTACAGTCTTTTAGAAATGAAGACAGGAATGGCCATGTGCTTCTGAGACCCC
2881 AGCACGATGCCAGGCCCAGGTCTCCATTAATGCAGTGCTCTGCTGCTGCTCCACTGGCAATTTGTACTCTTAACATAGGT
2961 TGGGGGAGGGACAGCTAGGGAAATTTTTTTTAATTAATTGTATCTAAAATTCTTTCATCATAGGAATAAACAACACATAT
3041 AGAAAGCTCCAAAGCTGTTCCCAAGACCTGTATTATTTATTTTATATGACCAACTTGCCCCAAGGCAATTAACTCTGAAT
3121 TGCTGTTCTAATGTGACATATCTGTGTACATATGTACATAGTACTGGTAACCAGTGGCTGCATTTTATTCCTTGCTGTGG
3201 ACTGAGGTATTGGCTTCTTGAATCTTGTATATGTCATAAGAATATTATACAGAGAGTGTTATAGTGAAGGATGTAAGCTG
3281 GATAATTTAAAACAGACCTTATTTCATACAAGTGTAATTATTACATCATTTTGGGTAAATGGCAAACAGGATTGCATGAG
3361 AGTGATGGCATCATCATTTCAATTGAATCTGAAGTGATTCTAGGAAATTGATTCCACTGTTGGATTCTAGGAAATTGAGT
3441 CCACTGTTTTCCTTTGCGTTTAATTTCCTTTGTGTTTAATTTGACCACAGAAACTTTTTTGAGTAGCACCTAGTAACATT
3521 GCAAGGAACTTGTGTATCAAGGTGTATCTTGATTATCCTGATTTTTTTTGTTCTCTAAGTTGTTGCCAGATCTCTCTTGC
3601 AACTGTGTCAATGAAAGGTCTGTGTTTAGAAAAGGCAGCATATCATTGTATATTTGAAACTATAGGAATATATACTTTGT
3681 ATAAAACTTTTCCAATGATTTCAGAAATTCTTTTTTCCTCCTTTTGACCCACAACTAGACTGTTCATACCCTAATAGTTC
3761 CCCAAAATTGCCTTAGCATGTCACACCAGCATTTGTCATCCAGCTCTGGAGAAATGACATGACTGTTAGATACTATGCCT
3841 GTTTAATTGCCTCTGGATTAAGTCATTGATAGCTAGACTTTTGAGCTAGTTAGCTGTAGAAATAATAGAATCCAGTGTTT
3921 CCCAAAGTGTGTTCCAAAGAACACAAGTTCCAAAGATGCTCTTCTAAATATAGGATTCTAGGATGAAATAAGTTTGGAAA
4001 ACACATACCATCTTAGAAAGTTAGTGAACATGAGCACATCAAAGGCTCTAATTTAAATGTCCTGTGAGGAGAGAAAAACA
4081 CAACAAATATCTACTGTCAGTTAGCCCAGTGTTTTCCAGATTAATTTGACCACAGAAACTTTTTTGAGTGGCACCTAGTA
4161 ACACTGCAAGGAACTTGTGTTCTAAAGAACACCCTTTGGGAAATTCTGGTATATTGAAATATTGCTGTGTTTTCATTCAC
4241 GATGACTCTTAGTAGCAGTACAATTTGCAACTTAGAAGCATGAGCCTTTCATATATGAAGCTGACTTGTTAATAAAAGCA
4321 GTGTTAAGAAGTAGTATGACTTAATATGACCAACAGCAGCCTCATATTGATAGCAGAACAATCCTACTTAAAGCTCTAAA
4401 CATCATCCCCCCCTTTTTTTTTTTAACGGAATCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAATGCCGTGGCGCAATGTCAGGTCAC
4481 TGCAAGCTCCGCCTCCCAGGTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTGGGACTACAGGCGGCCTCCACCA
4561 CACCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATATCCTGACCTTG
4641 TAATCCACCAGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCACCCGGCCATCCCTTTCTTTTATAT
4721 GAATAATGAGCAAGAGCCCTGCCATAGCTAAATATGTCTCAAATTCATTCCAAGATCTTTCCATTGCTTTTTTGCAGTTA
4801 CCTTTGCTTTTTGGGTTGAATCAAAATGAATATTTTTATATTTCATTACTATATGATATTTAAAAATATACAGAAAATCA
4881 CAGAAAAGGAAAAACAGAAATTTGATTTTAATTCACTTTTGAAATTTTAACGATTTTTAAAACTAATGATCTGTTATATA
4961 ATAACTGAAATGTAAACTATTAACAGTTATTTACTTTCTTTCCTTTATTGTCCTCTCTGGATTCAGTGAAATAATTTGAA
5041 ATCAATTAGAGCTCATACCTTCTAAAACTCCTGTCCCATATCATCCCACCTTTCATGTTTTATGTACATAGTTAAGTTTG
5121 GCATGTTATCTCTTGCCTAAAATGTGAGGCCTTCCTGTAGTTCCACAGTAGTTACTCTTGGCTGCAGAAATAGGTTTGGG
5201 AAGCTATGAGAGATTACCCCAAAGTCATGGATGAAACAAATCTAGTCGAAAACATGGTACAGAGTGAATTAAGGCAAAAG
5281 TCATTAACTTAAAATTACATCCAATATTTAGGAATAGCTCATCCTCTGCACATTATCCAAAATATTTTAAAAAACTAAAA
5361 GTAAGATCTCTTAGGCTAGGTGGCGGATTGCAAAGGGCAGGGGGCAGTTGATACCATGAAGCTTCCAATAGATGCATTTC
5441 TAAACATTTTTTCTAATATGTAAATTTGCTGATCCTTAGTAATGTTAATGCTTTGTCTATTTGTTATTTTTACCACTGTT
5521 GAACAGCAAACTGTTGAGGCTAGGGTTGATTATTGATAATTTTTATGTGTTTAGTAATAACCACAGCATCATACGTACAA
5601 CTGCTTTAATAAATCCAAGTTAAGGACTTTGAGGAGAGCATGTAGCAAGTATTCATTTTAACAAATCATCACAGACAGTT
5681 TCCCTGTTCAAAGCTCCACCAAAAAGCAAGCATGCAGCAAAGGCATAGACTGTATTTAGAGATGTGGTTTCATTTATTCT
5761 TGAAGTCCTATAACCTTGCATTATTTAAACACAAAATCCCACCTAACATTTGCCAAATCCAAGTTAATCTCAAAAACCTC
5841 CGAGGACATTGAGCACAAGCAGATTACTGTAAGGGCACTGGTGGCAGATTGTGGTGGAGAGAGGGCTGAGTGACCCAGAG
5921 CAAAGCCTGCCCGGGTTACTCGCTGCCACTTCAGGAGAGGGATTGTATCAGCTCTCATTACCTTTTGTCATGAGGCAGTT
6001 CATAAATTAAATATGATATCATGCATTATCTCAAAATATTTCTATATTAATTAGATAATTCACGATGTAAAACGTGTTCA
6081 TGCAGAAGCAAAGGCGGATGTAATAGTCAAGTATCAGGGAAAAACCCCTTTAGGATACCCAGACATTAAAAATGTAAAAA
6161 GTAGCTTATAAGAAATGTGGATTATCAGATTTTTACTATATATAGGTTGTGTTTAATAGTAATTTCTGACACCTGCACAT
6241 AGATGAAGAAAAGGCAGTTGTTACCACTTTTCACCATTCAAAAAATGGGCTTGTCTCTTAGAGTATTGGTTAATGCTTTG
6321 CTTATTTGTTAATGAAGACAGCATTTTAATTTTAAAGCTTCCTTTTGTAGGACTGATGGCACGGGCAGAATCACATTTAA
6401 GAAAAATGGTTTGGAACACTTTTTAATAAAAAATTGTAAAATCAGTTTCCAGTGTGGTCAAAATTAGAATGTAAAGGAAA
6481 GCATTTTTAAGAAAATACAGAAGCCCAAATCAAGGGAGAGTAATATAAAAGGAAATATTTTAAATTAAGAAAAGGAGGTG
6561 TTATAGTTTATTACATCATGAATTATGCTTTCTGTACTTACGCTCTTAGTGAAGGAGATAACATTGAAGTGAGAAAATGA
6641 ACATTCTCAGTTATTTGCGAAGTTAGTAAAATTGCAGTCCCTATTCCATTTTTTTCTGATGAAAATGGATACATGAGATC
6721 TCATTTATTGCTCTCCTCAACACCTTTACTGTCCCAGATTCCATTCACGTTCCAAATCGTGGACAGTAAAACTGAAGTCA
6801 GATAAACACAGTCACAGGTACAACTGGGAGCGAGTTTTAACATAGTGGTAATTTTGCAAATGCCAACATGAATACTAGTG
6881 AGTACTCAATTTACGACAGACAATTTCACAAAAACCAACCACAGAGTGATTTGATATTCTTGCTTCTTAGAGAGTTTTCT
6961 AATCCATATAATGCAATGGGTCAGGTTGCTCATATGATTAAAAAAATTAATCCTGTAGAAATGATGTATTAGACATCTCT
7041 AACCCAAGAAAAAGATGTCTTTTGTATAACTTTTAAATTCCCATTTGTCTATCTTAGGACAAATGATGACTTCTTCGTGT
7121 AGTAATGAAAACGTCTAAATCCTGCTCTGTGGAGAAAAGCTAGAACCATGGGACATTAAGCAAGAATACTCCTCTGATTT
7201 AGGCTCCCAGACTACAACTAACAGTCTTTATGTATTTATCATCTTGGTTATTGTTTTATCTCAAGCATATACAGTGTGCA
7281 GAAAGTAGAATAATGAATAAAATATGACCATGGAGAAAACCCATAACTTTTGCTTCTATTATAGAAAGCAGTGTTTGTTC
7361 TTTTTAATTTATTACATGTTCACATTGAAACATTAACATCTACAATATTGTCTTTCAGTTTACTCTTCAATTACTAAAGC
7441 AAATGATTTTGATTTATAGCACTTACACAACTGCAGTTCAGGTCACAGAATTGAAATCTATTTGATAATGTCTCAGCATT
7521 CTCATGGGCAGCCAGGAAAAAAAAAAAGAGAGAGAAAGACAAATAGAAATTTTAGTGGGTTCAGATAAATGATTATTCTG
7601 ACAAACCTGGAAAATAGTAATTAAACAGTTCATTCCAAAAGACCCCAATGTAAACTCTGCTCACATACATAATTTGTATA
7681 AGGAAAATGTATGAGTTTTTTTCTTAAAAATAAATAGAAGCATCATTGCATTTATAACAGATTGATCAATCTTATGAACA
7761 GATTACATTGGGAAAGTCACTATTATTGCTGTGTGTTTGTATATTTTATTCTTTCCTTTTTTGTGTGAGCATCTACTATG
7841 TGCCAGGCAGTGACTGTGTCTGAGTGAATGTATCCATGGTGAGCACTCAGGCGCCATCACTGCCTTCTTGGGGCTTACAC
7921 CCTATTGGGGTGTCAGAGATATTATAACACTCAATATTGACCCAATGGGATGAAAATTGTTATCTTCATGATTTCTTCCA
8001 ATGGGCTTAGATTTGTTGGGACAGGGCAGAATTAGAATAATTATTTCTCACATATAAGAGTAAGTGATATGAGATTGGGA
8081 ATTTCTTGCCAACACTCAAGCAAACTGCAGAAGATAATTACTCCATTTTACTAGCTCACCTAGTTTCTGAAGGATGGGGT
8161 GGGGAGTGAGACATGGAGCCTCTGGGGACAAGGATAGGGGGGTGGGACTGTCCCAGTGGAGGGTGCCACTGGAAGCCTCC
8241 ACCCAAGTGGGCCAGCAGCTGTGCAAGGGTGCAGCAGTAGGCTGGTGAAAGCCAGGTTGTCCAGATCTTTCTAGGGGAAG
8321 AGAAGGATTATAGAAAAGGAGAAAAGGGAGGAGCAAGAACATCTCTCCATGGCCTATTTTTATTTTTGTTCCCAAGAGAC
8401 TAGTGTAATAACCTTATGCCCCCAAAGACAGCCCAGAACTGAGTATCTTCAGTGTTCCTGAGTGTAAATCAGTGAATCTG
8481 TTATATAGAAAGTTAACATTTCAGGAGCACAATTATTTCCTGATTTCAAATATGAACAGAAGACTAAATGTCATTTTTTT
8561 AAATCATAAATTTGGTATCCATAGTTACTTTACACATTCCAGAGTCTAAGCATGGAATTTAAGTTTTGTATTTTGAACAA
8641 AAATAGCAACATCTGTTTTCTGTATGGCAAAGAAAAACTAAATCCCAGACTTTTATTTTTAACCACAGAAACCATCACTT
8721 CTTTCTAAATTATTTGCTTGCCTGCTCATTTCCCCTAAACATCTCTGTTTATGCCAATGGCTTTTTAAATCCAAATAATA
8801 CTAGTTATTGCCAAATTGCATTAGAATCCTATTGAATTAGAATAATTCATATACTTCATATACTAGGCAGTAAATGGTTA
8881 GAGACGGTAAAGATCTGATTGTGATCAAAAGTAGGGTTTTTGTTTTGTTTTTAATCATGAGCACATATAAAAGGAAATTC
8961 AAATGAAACCAAGCCAATTTCTGATTTAGTAAGATTAAAACCATAGATGGAGCTCAGTTATTAAGGATGGAAAGGAGGAA
9041 AGCACAGAGTGAGGAGAGAAAAAGGGGAAGGAAAAAAAGTAGTGTTTTTTTGGGGAACAGTATAATGTCTCAGAAGTTCT
9121 TCTCTCTTATCCTGCTGATGTTGAGACAGTGGCTTTGTATAAGCTTTTATTTATACCTATTTCAACATCATGAAAATTTT
9201 TCCATCAGCATTTTCTTGCAACTTTAAAAATCACAAGGGATTATTTGTTTATAAAGAGATACAGGATCTATAATTTATTG
9281 GCAATACTTTATTTTAGGAATCTTCAAATTGTACTTAATAAATAAATCACAGGTCAAAATGACTGTAAAATCAATCAGGC
9361 TTTCTCGTAAGTTATTTCCTGAAAACCATCCATGATAAATACAACAAGGCTTGGCGAAACCTCATTACTCTTGGAAGTCT
9441 TCAGAGGTTATTATACCTACTGATCTGTATTTGTCTCTAAGAGACATTTGAAACACAGTTACAATGTCAATTTGGTGTAA
9521 CATTACCTGTAGTAGAGCTCAGAGTATATGGCAGTGCACGGTCACTCAAGATGCATGGCGTGTCATTTGGGTCGCTTTGA
9601 TGGGTGCTCGGGTAGAATTAGCCTTGTAGAGACTAATGTGTTCATGCTATCTCTGATCCTGTGGTGTTGTATAAAAATGA
9681 ACAGCTAAAAATTTACCCATGACAAGATTAAAGCAAAAATAAACACAAAGTTGTTAGACTTTAAACATGAAAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' uacAGGGUGGGGG----UGAGGACa 5'
|| :|||::| |||||||
Target 5' agcTCATACCTTCTAAAACTCCTGt 3'
|
5050 - 5074
|
156.00 |
-18.80 |
2
|
miRNA 3' uaCAGGGUGGGGGUGAGGACa 5'
|| | : | :||||||||
Target 5' atGTGCAGACATCACTCCTGg 3'
|
2598 - 2618
|
155.00 |
-19.60 |
3
|
miRNA 3' uaCAGGGUG---GGGGUGAGGACa 5'
||:|||| ::||||:||
Target 5' taGTTCCACAGTAGTTACTCTTGg 3'
|
5158 - 5181
|
139.00 |
-19.20 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|