pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4491 |
Genomic Coordinates | chr11: 111347757 - 111347824 |
Description | Homo sapiens miR-4491 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4491 | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | 46| AAUGUGGACUGGUGUGACCAAA |67 | ||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | CA8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CA-RP, CA-VIII, CALS, CAMRQ3, CARP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | carbonic anhydrase 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_004056 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on CA8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of CA8 (miRNA target sites are highlighted) |
>CA8|NM_004056|3'UTR 1 CCAAAGAGGACAGGAACAAGTCTGTCTTCATGAGGGAGGAAGACAATGGTCCTATAATGCCCTTGGATAAGAAAAGGAAA 81 CTTTTGAGCTGCACCTTCAGTTTATCCTCAAAGCCTGCGTTGTTTGTCTTCATCTAATCCAGCTTTGATGGACATCTGTG 161 ATGGTTGCCTGTACACTTGCTGAAATGAAATATTAGAAATGGCTGTATATTCCAAAGAAACCCTATATTATATATCCACA 241 TTACTGCTGCTAGGATTCATAGTTGCACATACTGTTTATTGCTTATGTGTAGAAGGAATGAAACTAGTTTCCAGAGTTGT 321 TATTAATATGAATATATATCATGTGTTAATATTGAGAAAGGAAAAATACATTCCCGGTGTTAGTAGTTCTTCATTTCCTG 401 TCTCCAACAGAAAATTCACTCATTTTAGAACTAGTGTAATTCTTGATAATAAAATAAGAGTTTTGATTAAGAACAGCATA 481 GAGCTTCAAAATGCAAAGTGAATGATTAGTAAAATTATGTCTCATTTTATTTTTTCAGCACCCATACCACAATTAATATT 561 AGGCTGGATTGCCATGGGAAACATTTTTTGGCATTAATGCAGCAACATAATACTCACTTTAGGTATTACTACATAGTTGA 641 AGGATTTAACTGAATGTATGGATCAAATTTATTTATTTGACATATTCGAAGCTGTGGTTTAATAGGAATTTGAGAAAGGT 721 GTAAGAAATAGGATAAAAAGAAGGTCAGCACCATGTACCAGGAATAGCTTTACTTTCCATACATAGAAATATAAATTTAG 801 TGGTATCCTATATTACTTTAGTGTCGTACGCTTTGTAAGACTTAAATATTTTATTCTATTGATTCCACTACTTTGGTATG 881 TTAAGACATTTCTTTAAAGATGACCAACAATATCCTTATTTTAGGTGCCACTAGCAGATGTAAGCGTATACTTAGTTGCC 961 GTTAGATGTGACAGAATGAGATAATTTATGTAAAGCAGTAGAGTACCTGGCACAAAGCAAACAATAAATATTATTGTTAT 1041 TGTTGTTATAATTGTAAAATGAATGACTTCAAAAACATAGTCCCAGTTTGGAGGGATTTTGTGATGCAGAATATCTAAGT 1121 CATAGAAATAGAAGACAGGTGGAATAAGTATATGTTCAGAGTTTTTAGATGTGTTGAGTAGAGACGGTAATAATGGAAGC 1201 ATTAAATACAAATGAAAATCACACCAGATATCCCTGAAATTCAAGCAAAGAAAGTTCATCATGTATTCTTGGGCAGCAAG 1281 AGAAAGGACTAGGGTTATGGCAATGTGTGGAAAAGTTGAGGCTTGCTAAGGGTTGAGATCTGTTGGTAGCCCTGGATCAC 1361 ATGGGGTCAGCACCAGGCAGTGCCTCTGAAAGCGGAGAGAGGTCCTGGACTTCCCTTGTGTATAACAGTTCCTAGTGTCC 1441 AACAATGAGGAAACGGTGAAGCATGGTTACAAAACTGTGACAAAAATATTTACATCTAGCACTGTTACCACTCACATGCC 1521 AAACATTGGCTGCACACGTGCAGCCTTATTTGTAATTAACATCAAAAGACTAGATCTGAAGCCTTCCATAAATGAGAGGC 1601 CATTCATATGGCATTCCTGGAACAAAACACTGCACAGGTACCAGCCTCTCCACTCCTGACCGGGTTGGTGCTGAACAGTC 1681 AGGGATTGTTCTTGAACTAGACTTCTGATGCTTCTTGCAATCTTCTTTCATCTTTCCCTGAAATACACAAAATAAACAAA 1761 TACAATAACAAATAGTAATTAAATGACTTTCAGGATAACATCTAGTTGTTCAGACTTCACCCTTCACAGGTGTGTGTGTA 1841 TGTGTGTTTATGTCTGTATATTGAAGCAATTTGAATTTATTTACTGTATATTTTCTGAGTAAAAGACTGAAATGAACTAC 1921 TTGGTTCAGATCATGGTGTCCATTGGTGACATTGTTTGGAGGCATAATATTCTTTATATGGAAAATCCTTTAATTCCACA 2001 GTTAGTTACCTCAGATTCAGAATATGAATACTGTTTATAATACGCTTTTGTAGGAATGAATTTGAAAGGTAGTTTGTCAG 2081 TAAACGAAAGCACAACAACTAATCTCAAATCTGTTTTGATGGTGTGATAGGAAAGAAAGTAAAACCTATGTGATGGACCC 2161 TGTAATTGGGGCAGGAATCTCCCAAAGAAAAAGGGGAGAATTAATGACAAATGTCATAGATCTTGAAATTTAATTTAGGG 2241 TGCATTTTGTTTATGAAACAATTTAATAAGGCAACAAAGTGAAATGATTTTTCATGTAGCTTATACACATGTAAGTGCCT 2321 CTGATTCATGGTAACTAACGTACCTGATGGTGTGTAAAGTAATACTGTTGTCAGAAGGTTTGCCAATTAAGATAATTTGA 2401 GTTTACTCTTTTTTTGTTGGTTAGTTTAGCTGAAGGCTTGTCAATTTTATTGATTTTTTTCAAGGAGCCAAAGTGGATTT 2481 TGGGGTTTTCTCTATTGTGTTTGTATTCTCTATGTCATCAAACTCTGCTCAAATCTTACAAAATAGTAAGATTAGTAAGA 2561 AAGCAGACTAACTTCTGCTTGCTTTGTATTTAGTTTGTGTCTTTTCCAGTATTTTAAGGTGGAAGGTTAGGTTATTGATT 2641 TGAATTCTTTTTTGAATAAAGGCATTAACAGTTATAAATTTTCCTCTGAGCATTGCTTTAGCTGCATCCAATAAGTTTTG 2721 GTATGCCATGTTTTTGTTTTCATTCATCTCAAGGTATTAGAAAATACTTTGCCTTTTAATTTCTTTTTGATGCAATGGTT 2801 ATTTAGGAGTACATTGTTTAATTTCCACATATTTATGAATTCCCAAATTTGTTATTGATTTATAATTTTTTTCTGTTGTG 2881 ATCAGAAAACATACTTTATATGATCTCAGTCTTAAATTTATCGAGGTTTGCTTTCTGGCTTAGCATATGGTTTATCCTGC 2961 AGAATAATCCATGTGTACTTAAGAGTATGTATTGTACTGTTGTTGGATGCTGTGTTCTATAGATAGATGGCTGTTAGGTC 3041 TATAGTGTTGGCCTGTTGTGTTGTTCAAGTCTTCTATTTCCTTGTTGATATGCCTATTTCTGTCTATTATGAAAGTAGTG 3121 TATTGAATTCTCTGACTGTTGTTGAATAATCTCTTCCTTCAATTCTGTCAGTTTTTTTCTACATTCATTTTGGGACTTTT 3201 GTCCTTCTTTATCTCTAGTAACATTTTTTTATTTTAATATATACTTTGTCAGATATTAATATAGCTGCCCCAGCTTTCTT 3281 ATAGTTGCTATTTGTATGATGTATCTTTTTTCATCTTTTCACTTTCAACTTATTTATATTTTTGAATCTAAAGTGTGTCT 3361 CCAACTTATAGTTGGATCTTGTTTTTTTTTGAAATCCAGTCTGACAGTCTCTCTGCCTTTTGGTTGGATTATTTAACCCA 3441 TTTGCACTTAATGTTATTGTTTATATAGTTGGATTTGTGTCTGCCATTTTACTTTTTGTTTTCCACATGTCTTGTATCTT 3521 TTTGTTGTTGTTCCTTTATTCCTCCTCTATTACTTTTTTTTTAATTAGGTGAATATTTTCTAGTATATTTCAATTGCTTT 3601 AATTATTTTTTTCATTTTTTTGAGTATATTTTCACAGTGGTTGCTAAAGGGCATATCATATACTTGTTAATTTATCAGAA 3681 TCTATTTCAGATTTATAATAACTTTATTACAGTGAGTTATTTAGTTACTACTAAATAGCTCTGAACTCTCTTCTCCCTTT 3761 TTGTGCTATTATTGTTATACATATTACATCTATACATGCTGTAAGCCCAACAATACATTGTTATATTTTTCCTGTAATTG 3841 TATGTATATTAAGCAAGCAGAGACTTGAGAACAAATTATATTTATAGAGTTTCTTCTAGTAAGCTTTTAATTTACCATTT 3921 CTGGTTATGTTCATTTTGTCTTGTAAATTTGAGTCACCATCTGGTGTGATTTCTTACTCCAGTACTACTTTGTTCTTATT 4001 TACCTCCTTTGTGTTGTCATTGTCAAATATGTCACATTTGTATATGTTCTGGGTCTAAAGCATAATTACATGATATTTTA 4081 TACAATTGCTCTTTAAGAGAAGGAAGAAATGCATTTATACTGTCTTTCATAATTACATAATTACATTTACCAGTGCCCTT 4161 TTTTTTTTGGAATGGATTCAAATTAGTATCTGGGGTCACTTCATTCCAGGCAGAAGTCCTTTTTTTAATATATTTTTATA 4241 TAAGGCAAATCTGATAGGGACAAATCTTTAGTTTTTGTTTATATGGGCTATCTTTATTTTACCTTCTTTGAGATAGTTTT 4321 GCTAAATATAAAACTCCTGGTGAAAAGTTTCTGTTTCTGTTTTTGTTTTCTCAGCATCTGCTGAGATGCCAGCTATAAAG 4401 CTTAATGAGGTTTCCTTCTACAAGACAAATCGTTTTTCTGTTTCTGCTTTCAAAAACAAATGGTTTCCCCCCTGCCCCAG 4481 ATTTCGTACTATGATGTATCTGGGTGTGAGTCTGTATTTATTCTGCTTGGAATTTGTTGAGCTTCTTGGGTATGTAGATG 4561 AATGATTTTTTTTAAGAAAAATATTAAATTTGGGATGTTTG Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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