pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4457 |
Genomic Coordinates | chr5: 1309310 - 1309377 |
Description | Homo sapiens miR-4457 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4457 | |||||||||||||||||||||
Sequence | 43| UCACAAGGUAUUGACUGGCGUA |64 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ARPP19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ARPP-16, ARPP-19, ARPP16, ENSAL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | cAMP regulated phosphoprotein 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_006628 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ARPP19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ARPP19 (miRNA target sites are highlighted) |
>ARPP19|NM_006628|3'UTR 1 TTAAGAGGCTGAACTGCATGAATCTGCTAAATCTCATTATTTCTCCTTAATATGTTACTTATCTACTTTTTATTTCCTTT 81 CATTCACTAGTCATTTGAGACTGACAGCTTTGCAGGTAGCAGTAGTGTGTGCTGCTATTGTGGAATATACGTGTGTAGAG 161 TTTTTGATTAGTTTAACAGTGCACTGGTGAAGAGGACATGTTAGAGCAACATAAGTAAACTACTTGAAAATAGTTGTATA 241 TATTACCTAACTTCTAGTGTAGTACTGGTTCTAACAAGTAACAAGCAAGTTTTAAAATTTTAATGTTTTGGCTTTCATTA 321 CTTCATCTTAATTATAGCTTTGTATGTTACTCTTATTTAATATAATCTCTATTGTATTGATTTCTTCTGTATTTACCTTT 401 TGGATTTTGTAAAACAGAAGTTTAAGACCACAAGTTAGAAGAAAGGTCACATATTTCAAACACAACTAGATGGGGCTCTG 481 AAAGATTTGTATCTCTGTGCTTGAACTTGAATGGCCTTAAACCTGTTTCAGCTTTAACAGTAGAATTTTACTTGGGCAAT 561 ATTTGCCCATTCTGGTGTAACTTATGTGACTCTAGTGCTTAACAGCTGCCGTTGAAGCTAATATTCAGTTCTGTAGAGTT 641 AGAATACCTTTTGTTGTTGAAGATGTGAATGAAGTATGCATGTGCATTAACTGTTGAATTCACTTTTGTGCCATTTTTGT 721 AAATACAGTAGTTTTGCACAACCTCTCACAAATGTCTGTATTAATTTCACATACTTAAAAAGTAGATAATGTGCCAACCA 801 GAAGCACAAGAGTTCCTACACAAAACTCTGTAAATCATTATAGCTTTTGTATAATAAGAGTAGTTTACAATCTCGGGCTT 881 ATAGAATACCAAACTGAAATCTTAGTTCAATCTGCCATAGACTTAAGCTTTTCATTTGTTACTAATATCCATGACATTCA 961 GTGGCCTTGTGCAAATACGATATGTTGCTTAGGCATATCTTTTGTCCTATGCAGAACCTTTCATTTTGATTTTTATGAAA 1041 GTTGCAATTCATGTAATTTATATAAACTTTTTAAATGTAGAAACTTTTTACTTCCACACTCAGTTTTGGAGACCCTAGAA 1121 TAAAAGGCTTCAATACTCTGCATTCCATGCCCTCTGCCACCTGCTTTTTTTTCCCCTTTGTTCTTTGACTCAAATGGTAT 1201 TGAGCTGTTTGTTGTATATGGAAGCATAGGTGTCTATATCCTTACTCTTTTATATAACACAATAATGGCGTTTTCCTTCT 1281 AATTTCTCAGTTGTTAACTTCTTTCTCTTTTTTTTTTAGGATAGGGCCTTGCTCTGTCACCTGAGCTCTAGTGCAGTAGT 1361 GCAATCACAGCTCACTGCAACCTTACTCCTAGGCTCAAGTTAACTATTCTTGATCCTTTATTATTACTAATATTCTACAA 1441 TTGTTTAAATAAAAGGAACTTTATAATGAAACGGTTCGGAATACTGGCTCAAGAACCTATGTCAAGATGAGCTGAATTTT 1521 GGTAAATTATTTTAGGAATTATGACAAGCTAATTGAATTAGGCTTGTGACAATTAGAGTAATTTACATGACAGGTAAAAC 1601 TCCTATTAAAAATGTTTAGATGTTTGCTTCTGTAGATGTCACTTTAGTAAAATACCAATTTAGTTTTACTTGTGGCTTAT 1681 CTAGTTAGAACTTAGCAGACTTTACTGGGACAAGTTTACTGCTCTTGTAGGAGCTCCTCTCACAAGTAGTTGTAATGCTG 1761 TAGCATGATACTCAGGATCAGTAGCTTGAGATGCTACTATTTTTCTCTTCATCTTTGACTTGCAGAGAGCCTCCCGTTTT 1841 TGGATCCAGGCATCTTTTCTGAATCCTGGTTCCATCAGTATACCTGCTCTCCTATGACCCCAAATCATAGTCAATGGTGC 1921 CTCAAACATAGCACCTTAAGTTAAAGGCTGCCTAGTGCTCTGAGGAAAGCTTGCTGATTATCTTCCTGATCTACTCACCC 2001 CAAAAGGCAGAAAAGCAACACAGTCACTGCTGTGGTCATTTGTAATGTAAAGATCAGTTATATATATATATTTGTAATGA 2081 GAGCAAGTATATACTCATTATAGAATCAATTTAAGAAGTTTAAAATAACCCAGAGTAGAATTTCTATATCTAGTCTTGGT 2161 TTTTTTCATGAATATTTGCAAGTAATTACCATTAAATTCACACATGAAAGATTAATCTGAAAGATCAGAGACCATGTTAT 2241 TCCTGACCACGATAGAACTGCTCCTGTGGTTTGGGACAAGTAATAAAACAACTGCTTGAGTTTTGTTTGTAAAATACATA 2321 ATTAATATTTGACCTACCTCAAAATGTATTGAGGATCTGTGAAATGCTAAGTGCCCAAAATAAAATATTGCTGATTGTCT 2401 TTTTATTAAAAGTAAATTTCCTCATTAAGCCAACCTGCCTTCTGTAAGTCACAGTGCTTAAATCTCAGGATTTTTCATTA 2481 GGAGAGACCTGTCGTTAAGGATTTGTAGGTATAATTGCTTAGCCTCCATTATTGGTGCTTGGGATAGAGAGGTTTTAGAT 2561 TTTTGTTTTTTTTTTGTTCTGCCTCAAAGCTCAGTTTATTGAAGACATTTGTAAGCTATTGGATCATCACTTGAATCAAG 2641 ATTTTGACTAGTGAGCTTAATTGTCCATTTCTTACAATTTCAAAGTTACAGTCTCAGAAATGGTTAATTTTAATAACTGT 2721 CCTATCATAAATTAATGTTGGAATAAATTGAAGTTGTTGATAAATACTTCATGAAAACTAAAGTCTGAAATAAATTACTT 2801 GTTTTATGTCCAATAGCTACTACATTTGATAGAACAGTTTTGAGGAACATTTCATTCTTGAACGCAGCATCTGACATGGT 2881 TCTCAGCAAGTTGGAATAGTAAGGATTATTGGCTTGTTTCGATGAGTGGAAGCGGCATGTTTGTAGCATACAAGTTATTC 2961 AATAATCTTGTGCTGATGACCTAAAAATATGTCTTAACTATTCATCAAGGAAAGCCTGGTGAAGCCTTTACTTGTTACTA 3041 CTTCAACAGTTGGAATTAGTTGCTCTTTTTACTTGATGAAACAAAACTATACCTCTGAATATTTATGGATACTTTTTACT 3121 AAATCAGGCTTGTGTTCTTAATCCAAATTAGTAAAGTTTTATGGAAGCTGAAATGTAATACAGTAGTCTCCCCTTATCTG 3201 TAAGAGATACATTCCAAGACCCCTAGTGGATGCCTGAAACCTCAGATAGTACTGAACCCTTTATCAACTATGTTTTTTCA 3281 GTCTGACAACCAAGGCGGCTACTAAGTGACTAAGGGGCAGGTAGTATACAGTGTGGATAAGCAGGACAAAGGGGTGATTC 3361 ACATCCCAGGCAGGACAGAGCAGGAGATCATGAGATTTCATCACTCAGGATGGCTTGTGATTTATTTTATTTTATTCTTT 3441 TTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTC 3521 CTGGGTTCAAGCAGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCGTCCGCCACCATGCCCAGCCAATTTT 3601 TGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACTCGCCT 3681 CGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGCATGCGCCACCATGCCCGGCCGGCTTATGATTTAAAACATGAATTGTTTATT 3761 TCTGGAATTTTCCACATAATATTTTTGGACCAAGGTTGCCTCAGGTAACAAACTACAGAAAGTGAAATTGCAGATAAAGG 3841 GGATTACTGCTCCTCTGCTCTAAAATTGGTGTTTGGGTGATCAGAAGCAGGTAGCCAATGGGAAGAGCACTTCTGAGTGA 3921 TAACTAAAGCAGTTTGGTGGCCTTTTCACATTCTCCAATGTTCAAACATATTTTCCACTTTCCATTTTCTCTTTCACCTC 4001 ATTTTGCCTCTCTATCCCCCATCCCTGCTTATTTCTTAAGCCCATTGATGGCACTCATTAAATTGTATTTAGGGCTAATG 4081 AGTCATTGTTCCTTAATATCGTTTTCAATATGCCACAATTTAGGACACATTTAAAATTTTCTAAAACAATATCCTAATCA 4161 ATATTGACTAATTTGAGCCACATTCCCAACTCTAACTCAGCACACACTGCCAGTCTTCCCCAATATCTGTCTCCTCTCAA 4241 TTCCCCACCACACCTTATAAAATTGTAATCAAAGATATCTCACTCTGTCATTGTTAATCTAAGAATAAAAACACTGACTT 4321 TAATACGGTTTTACTAAGTTTCAACCTTCTAATTAGGTAGGCCTCTAGGTATTCTGCAGATCACTGCTGGTCTTGATAGC 4401 CATTAATATATGTTTGTATTATGTTATTTTTCAACTAAATCGCAGTTGGAAAAAAACATATTTAATATTATGCCCTTGGA 4481 TCTGTTACTGCATCACTAGCACTTGTGATGCAATAGAACACTTCGCCTGTACTGAAAGGGCCAAGAGTAAATGCCTTGTT 4561 TTGTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCTTTTTGTTAAAACATGTCTATAGAGTTGGCAGTTAATGCTGAATTTGTCAAAT 4641 ACCCCTTCCAAAATTATACTTGTATTTAAAAAATAAATGGATCTACCTAATTTCTATTGATTTAATTTGCAGTTTTGTCT 4721 TATTAAAGTGGTATGTTTTTCAGTGTATTTTTTCTGAAGTTGATCTCTTTACATTTCAGCTATTACTGTATGCAGGAAGA 4801 AACTGACTTGTAATCTTTGATTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTGTAAAGGCTTTGTACTTAAGGTAGGATTAAATGTTTGC 4881 AGATTGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in GSM545216. RNA binding protein: AGO2. Condition:miR-124 transfection
... - Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al., 2010, Cell. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Hafner M; Landthaler M; Burger L; Khorshid et al. - Cell, 2010
RNA transcripts are subject to posttranscriptional gene regulation involving hundreds of RNA-binding proteins (RBPs) and microRNA-containing ribonucleoprotein complexes (miRNPs) expressed in a cell-type dependent fashion. We developed a cell-based crosslinking approach to determine at high resolution and transcriptome-wide the binding sites of cellular RBPs and miRNPs. The crosslinked sites are revealed by thymidine to cytidine transitions in the cDNAs prepared from immunopurified RNPs of 4-thiouridine-treated cells. We determined the binding sites and regulatory consequences for several intensely studied RBPs and miRNPs, including PUM2, QKI, IGF2BP1-3, AGO/EIF2C1-4 and TNRC6A-C. Our study revealed that these factors bind thousands of sites containing defined sequence motifs and have distinct preferences for exonic versus intronic or coding versus untranslated transcript regions. The precise mapping of binding sites across the transcriptome will be critical to the interpretation of the rapidly emerging data on genetic variation between individuals and how these variations contribute to complex genetic diseases.
LinkOut: [PMID: 20371350]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM4903833 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / CTL_TD_21_a |
Location of target site | NM_006628 | 3UTR | ACUAGCACUUGUGAUGCAAUAGAACACUUCGCCUGUACUGAAAGGGCCAAGAGUAAAUGCCUUGUUUUGUUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUUGCUUUUUGUUAAAACAUGUCUAUAGAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM4903837 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / 124_TD_21_b |
Location of target site | NM_006628 | 3UTR | ACUUGUGAUGCAAUAGAACACUUCGCCUGUACUGAAAGGGCCAAGAGUAAAUGCCUUGUUUUGUUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUUGCUUUUUGUUAAAACAUGUCUAUAGAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM4903838 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / 124_TD_21_c |
Location of target site | NM_006628 | 3UTR | GAUGCAAUAGAACACUUCGCCUGUACUGAAAGGGCCAAGAGUAAAUGCCUUGUUUUGUUUUUUUGUUUUGUUUUGUUUUGCUUUUUGUUAAAACAUGUCUAUAGAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 4 for dataset GSM545216 | |
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Method / RBP | PAR-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / miR-124 transfection |
Location of target site | ENST00000566423.1 | 3UTR | UUACUAAUAUCCAUGACAUUCAGUGGCCUUGUGCAAAUA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 20371350 / GSE21578 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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83 hsa-miR-4457 Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT098032 | SOBP | sine oculis binding protein homolog | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT202580 | PCMTD2 | protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 2 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT247137 | WEE1 | WEE1 G2 checkpoint kinase | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT349266 | PTBP1 | polypyrimidine tract binding protein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT363756 | EIF4EBP1 | eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT443586 | FAM84B | family with sequence similarity 84 member B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT452333 | EIF5AL1 | eukaryotic translation initiation factor 5A-like 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453864 | ZBTB40 | zinc finger and BTB domain containing 40 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT471486 | PDE4D | phosphodiesterase 4D | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT476290 | GMFB | glia maturation factor beta | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT479897 | CCDC117 | coiled-coil domain containing 117 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT484251 | ANK1 | ankyrin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT491473 | TMEM214 | transmembrane protein 214 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT493804 | GAN | gigaxonin | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT499252 | VAV3 | vav guanine nucleotide exchange factor 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT502271 | HNRNPA1 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT504651 | RPL9 | ribosomal protein L9 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT505211 | UBN2 | ubinuclein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT508952 | SNRPB | small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT512691 | POP1 | POP1 homolog, ribonuclease P/MRP subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT513320 | SCUBE3 | signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT513870 | HOXA5 | homeobox A5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517342 | ZNF529 | zinc finger protein 529 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT518947 | LSG1 | large 60S subunit nuclear export GTPase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT520867 | SUGT1 | SGT1 homolog, MIS12 kinetochore complex assembly cochaperone | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT528325 | GIGYF2 | GRB10 interacting GYF protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT531990 | SLCO1B3 | solute carrier organic anion transporter family member 1B3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT533298 | USP46 | ubiquitin specific peptidase 46 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545257 | TRIM36 | tripartite motif containing 36 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT547038 | POGZ | pogo transposable element derived with ZNF domain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556103 | MOAP1 | modulator of apoptosis 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558321 | DR1 | down-regulator of transcription 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558521 | CSRNP3 | cysteine and serine rich nuclear protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT560906 | TMED10 | transmembrane p24 trafficking protein 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT568448 | ARPP19 | cAMP regulated phosphoprotein 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570586 | OTUD7B | OTU deubiquitinase 7B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT572799 | SIGLEC14 | sialic acid binding Ig like lectin 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT573863 | C9orf78 | chromosome 9 open reading frame 78 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575058 | P2ry1 | purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 1 | ![]() |
![]() |
2 | 5 | ||||||
MIRT609931 | SLC38A1 | solute carrier family 38 member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT610836 | ZNF585A | zinc finger protein 585A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT611474 | P2RY1 | purinergic receptor P2Y1 | ![]() |
![]() |
2 | 7 | ||||||
MIRT613569 | YY2 | YY2 transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618626 | GREB1 | growth regulation by estrogen in breast cancer 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT620606 | SAP30 | Sin3A associated protein 30 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621017 | CLSTN3 | calsyntenin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT635314 | FAM179A | TOG array regulator of axonemal microtubules 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635919 | GLTSCR2 | NOP53 ribosome biogenesis factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT640598 | TM9SF4 | transmembrane 9 superfamily member 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT641784 | YWHAB | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT644067 | IQCE | IQ motif containing E | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT648288 | TRAPPC2L | trafficking protein particle complex 2 like | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT658085 | FOXR2 | forkhead box R2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT659077 | DEPTOR | DEP domain containing MTOR interacting protein | ![]() |
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MIRT665307 | ZBTB37 | zinc finger and BTB domain containing 37 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT665975 | SYTL4 | synaptotagmin like 4 | ![]() |
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MIRT666302 | SLC25A25 | solute carrier family 25 member 25 | ![]() |
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MIRT674906 | RASSF9 | Ras association domain family member 9 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT680086 | THAP1 | THAP domain containing 1 | ![]() |
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MIRT681488 | DIP2A | disco interacting protein 2 homolog A | ![]() |
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MIRT691244 | DFNB59 | pejvakin | ![]() |
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MIRT692362 | AGTRAP | angiotensin II receptor associated protein | ![]() |
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MIRT693035 | MB21D1 | Mab-21 domain containing 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT693837 | STAT5A | signal transducer and activator of transcription 5A | ![]() |
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MIRT694479 | LRTOMT | leucine rich transmembrane and O-methyltransferase domain containing | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT696070 | ZNF264 | zinc finger protein 264 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT696578 | TTC21B | tetratricopeptide repeat domain 21B | ![]() |
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MIRT696760 | MTFMT | mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT697307 | ZNF652 | zinc finger protein 652 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT700152 | RNF115 | ring finger protein 115 | ![]() |
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MIRT701056 | PARP2 | poly(ADP-ribose) polymerase 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT701198 | OTUD3 | OTU deubiquitinase 3 | ![]() |
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MIRT701335 | NSD1 | nuclear receptor binding SET domain protein 1 | ![]() |
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MIRT702656 | ITGA3 | integrin subunit alpha 3 | ![]() |
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MIRT703618 | FBXO45 | F-box protein 45 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT704673 | CHTOP | chromatin target of PRMT1 | ![]() |
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MIRT708894 | ZNF780A | zinc finger protein 780A | ![]() |
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MIRT711620 | DGKH | diacylglycerol kinase eta | ![]() |
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MIRT713745 | TMEM81 | transmembrane protein 81 | ![]() |
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MIRT719712 | CD101 | CD101 molecule | ![]() |
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MIRT720294 | DLGAP3 | DLG associated protein 3 | ![]() |
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MIRT722606 | CCDC152 | coiled-coil domain containing 152 | ![]() |
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MIRT724566 | ACSBG1 | acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 | ![]() |
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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