Gene Symbol |
CADM2
|
Synonyms |
IGSF4D, NECL3, Necl-3, SynCAM 2, synCAM2 |
Description |
cell adhesion molecule 2 |
Transcript |
NM_001167674
|
Other Transcripts |
NM_001167675
,
NM_153184
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on CADM2 |
|
3'UTR of CADM2 (miRNA target sites are highlighted) |
>CADM2|NM_001167674|3'UTR
1 GATGCAGGCCAAGATTCTGAGTTTTACTACCAGGCTGAATGCTGGAGAAAACTGGCTATCATCTTTCAGAAGTCATTTCT
81 ACCATCGTCTGCTACCCTTATTAACTCCCATACTGTACTGCTATCAGTAGCCAGTGTATACCAACAATCAGCTGTTGAAA
161 GCATCATTCTTTAATTACTGTACCATCCATAATGCAGGACATTTCTTACTGCCTAAATTTCACACCATTGCTCTTTTAAC
241 ATACAGTGCTTGAATATACAGCCTTAACAATGTTAATCATCTCCTTGGATCATTATATTGAGTGGTTTTT ATACATTAAA
321 AAATGTATGCAGAGTTTTTTTCCCCCATTTTTTCCCCTTTAAGTCATAGACCTTATCAGTTTGCCATTGGACAGCTTTCA
401 CAAGTAACAGGATTAGGGAAGGACATAATGTATTTAAGAATAAGTGAAGGTTAGAGGTTTACAATTAATGTTTTCTACAT
481 GTCTGTCTTCAAAGACAACATGCTTTGGAAACATATGTCCTAGAAAACATAAAATTAAAAAAAAACACTATAGTGTAGTT
561 TTTGGAATGTTGGAGATTATACTGGTAAAGCTGTATCGATTTGCTATTGAAATATAGTATTTGATACAGGAGCCATGTGT
641 ACGAATTGCAATCATGACATGGTATTTTCTATAATTATAGAGATCTTACTATTAGGATATTGTAGCTTCATTTACCAATA
721 AATTATTCCAAATGATTTACTGCTTTTGGAATCACAAATATTTAATTCATTTCTCTAATTTGATTCTATAATTTATTTGC
801 TTCATAAAGATTCACCTGCCTAAACAATATTGAAGTATCCATAGGGCACAATTTTCAGACATTTTAGTATCTGTATATAG
881 TGCATATAATAAATCCAATTAAACATTATTTGATACATATTTAACTTTTTTGGCTGTATGTAATTCAGTCATAAGTAAGC
961 ATTTTCTAACGTCCATTATATCCCTTTAGGTATTACTTAAACCAATATTATAAGTAGATAACATGTATTAGTATTTTTGT
1041 CTGTATGTCCTAGCACTGTTCAACAACAAATTTTTCTAGTTCTTGTTAATTTTTATTTGTTATACAATGGAAGCACAATG
1121 TTATAAGGAAAGGTAATTTTAAGCTAACAACCAGTGCACAGCCTCAGGTTTTAAATTACAACCACAGTTGAATAATAACC
1201 TAAAAATAAATTTTAGTTTGCTAAAAATTTACAAATTTTCATTTTGCAGTTCCAGAGCTGCTTACCTATGTTGGTTTGCC
1281 AAAAAGAAGTGTTTAAGATATGTTTTCTGTATAAATGAACTAATTCTTTATATTAAATTCCTGTCTATGCATTTTGTGAG
1361 GTACAAACTGATGAAACAGTGAGTGATAGAGAATTTCTGCCATGCTTTTAACTCCAAAGTGAAAGTCTCTTTCTCTGGAT
1441 TATTTTAAAATTTTGGCGTGTTTAACCATTAAGAAATGCTGTATTCTTAAATATGAAACAGTTAATCTAAAGTCTTATTA
1521 TTTCTTCTAGTAAAATAAAATATTGTTAGATTAGTTCTCATTAAATTTATTATATGCTAAAGAATAAAACTCCAGTTAGA
1601 TTTAAAAAAATCCCATTTACAAGCATTGCACCTTTAAGAAGAAAACAAATATGACAGTATGGTAGCTATACTTGTGATGT
1681 CTGACGCATGATGGCCTATGGTTTTAAAAATAGTATTGTGGAATATATTTTTGGGTAATAAGAATGGTTGAGTGCAACAT
1761 CATGTATTAATATCAAATGAAAGACAAGGGTGCTGTATCTTTGATTATTTATCAAAAAAGTATAAATCTTTTAAGGAAAA
1841 TGTTAGAATTTTAAAGTTTTTTTTTGATTGTTGAAGCATTTATCTTGTTGATTTCTTACAAAAGAAAAAGGACGATGTCA
1921 GTCAAGCAGCACTTTTTCAGAATATACAGAACATAAATAATATGATGTGGTTGAGTGTTAACATAATAAATCATATACAG
2001 TATGACATTTTAAGGAAATAAGTCTGCATTGATGTGATTGCATGCTTGTTTTTACAGTTCACTCCATACCATCTGTGGAA
2081 AAATGCAATAATATGTTAATATAGTATGGTAGTTTGAGAGAATCAGGTAGGTGCTACTAGACACATTGAAACTAGAATAG
2161 GTTTATAAACTGTTCATATCTTTCAATGCATAATCTTTAGAAAGACTCCACAAAGCAAAATTCATCCTGTTAGTACAAAA
2241 TGGAAAGGTTCTTATTACAGAAGTAAGTTGTACAAACTGCATCATCAATTACTATGTAAAGCCTAATTTCAGGATGCACT
2321 TACAAAATTGCTACTCTTCATCGATGCCGTATTTACATCCCTCTTCATTTCATCTATATTCTACTTGGCTCCAACAACTA
2401 AATTGTTGCCTAAATAACTCAATCATTATTTATAGCACTGTAAAATTAGAAATCCAAAATTGGTTGCATTTCATGATTTT
2481 TGACTCTTTTAACCCTTCAGAGTAATATAAAATCTCATTAGAACTCTTATAAAACCAGTTAGCTAAAACAACTAGATTAT
2561 TATACTAGTTATAAATGCTGGTATATTATAATTTGTGGGATCTAATTAAATGTTTGCCTATTAAATATAGTTTGATTTAA
2641 ATGAGACACCATGTTCTGAACTGGAGAAAACAATATCAATGAAGTCATATTTTCATACCTTTAAAAATTATTTAATTTTC
2721 AACCAAACAAAAAATAAATTGTAAAAATTATGCTCATTTCTATTCCAACAAGTCAGAAAATAATGACATAATATTTCTAA
2801 ATGAGAATGATGTCAATTTCATTGTCTGGAACATGCACACTTGTGTGCACATAGAGTCAATTTCTGTCTCTTCTAAGTGA
2881 GCACAGTAGGTAGGGAACTCAATGGAAGCAGTGTGCACACACACACACCCTTAGTAGAATATGGAGCATTATTCTTTACC
2961 AAAAGTAGCTATTCTCTGCCAGTGTACTGTTTACAGTGTAAATTGATTGTCCTCCGTCAAAATCAAGTCTAAGCGGCATT
3041 TTACTTTTCTTTTCTTTTTTATTTTCCATTTTTGGGTGTTCTAGATAGGATTATTATCAAAAGTAGGAGGAAAAAGAAAT
3121 GTTTGTGAGTGCAAGATTAAAGACAGAGCGCATGAGCAGAGTACTGATGGTGTGCGTGTTTGTGTGTGTGTATATGTGTG
3201 TGTATAAGAGAGAAAGAGAAATCGAAAAGAGAGAGAAATTTCAACTTGTTTTCTTTTACCAGAGAATCCAAGAAGCAGTT
3281 TAAGGAACCTGATATTGGAGTTTAATCTAGAAACTGGATGATCTCATATTGATTCATGATGCTTAATCTTTCATTGAAAC
3361 TCCACAATTAAAATAACAAATAGAGAAAGAAAACTAACTTTCCTAAATATGGCAAAGAAACTAACACCTCATTTATTTTT
3441 ATTTCTTTGTAAAAATATAAATATCTCAATCAAAAGTACAGGCTCATTTGTAATTATGTACTCATGATTGTAACAGCATT
3521 GAGATTTCATATAGGCACATGTATAGCAGCTGTTTGACAGTGATGGCTCTTCCATGTAACATAGCAGTTATCGTGTAATT
3601 TAGTGCCACTTATTGCAAAGTGTTACCAAGGGGAACATTTCAAATGCCTTTTGTTTTTCTTTGGACATCAAGGTAATTTA
3681 GTGGACAACAAATATTAAATTTTACATTATGCTTTTTAATTGTGGAGAAAATGCAAAACCTCATGTCTTACCACAACTTT
3761 CCCATGGTATTGCTAATTACTTAGAGTCTCTAAAATTGCCCAATATTATTTCCCTTTGCAAATGGTAATTTCTGATAAAA
3841 CAATACAAAACAAAAAAAAAGCAGTAATCACAGCCAAATAAATGAAACACCTAATGAGAATTACTGTTGAGTAATGCTTT
3921 TTATTAAGTGGCACAAAGTACACACTAAAAACTATGCAAAATATAGGTAACTACAGTGTACGTACATGTAAGTATCTTGT
4001 ACTTGCTGTGTATGGATGTTGGAAACCCATGTAATTATAATATGCATTTTGAATATTGGGAAAGAGGAAATCTTAGTGTA
4081 GATAATAGAATTTGTTTTGAAATATACACTGGCAATATTGAAATATACTCAGTGCAATATCTGCAGTTCTATTGCTGGAT
4161 ACTTAATGCAAAGGGATTTTAAAGAATTCTTCAGCAAGATCCAAGAGGTTGCTAATCTTCACCTCTCACATACTAAAGCA
4241 TTCATTAAAAATACAACTAATTCAAGGACAAGTTAAGTTTTTCTTATTAATGTGACACAGTAACATTTTTATTTGGATTA
4321 GTTTTTGGTGTTATTGCAGAGAAAGAAATAACCTGAGTTTTAAATTTCGATTCATATCTCATTGAATTGGGAATTCTTCA
4401 ATTTTGTTTGAAATGTGTGCATGTTTTCATAGATTGTAGCAAGTACAAATGTATTCAATGAAAGAACATAGGGTAGTTTT
4481 AATAGTTAAAGTCACTATATCTTAATGGGAATTTTAAAATATCTTTTCTTTTTCTATTCATTTTTTCCCTTTCTCTCTCT
4561 ATTCTACCCCCAAACAAGCCCTTTGCACTCATACCCTTCCAAAGGCAATGGATTGAAAGTAGCAAGATAATAAAGAGAGT
4641 TAAAGGGGACAACATATAACAATGGGTTCTAAAATCATCAGCATTTTTATGTATTGAGATTATTAATATTGAATGCAATA
4721 GTTATTGGATATAGCTGGTAAGTTCTCTGCCATGCATACTTACAATAATCCTTCTACCTCTCACTTTTAACATGGGCTAT
4801 GATACTTCAATATAAATAGAGGAAATAATTATTTACCAGATATCCCAGGAAGCATTCTTATGGAACTATTATAACAGTGC
4881 ACTCCCCACCCCCTGGGAAATCTCAAAAGCCAAGTTCTTCAGTGTATTCTATGGTGTATGAATCTGCATTTGTTTTTCCT
4961 TTTCTATCATTAGCTTTTCCTAAAGGCAAAATATTATAACTTTATAAGAATAGTCCTTCTCCTGCCTATTTAATATTTCA
5041 ATGTTAATATAATTGTATTGGTTTTTAAAAATAATTAAAATGGCAACACTTTGCGATCCAATCTGATATTTAATTTTTAA
5121 AATGTAACAATTTCTTATAAATTCATGCTGTGTTTTAAGTAAAAATCATGTATATGAATTATTTTACCAAGTAGTATTAT
5201 CTGCACGAGACAAATTTAAGTATTTTAAAAATCATCCTTATTAATAAATAATCCTCATATAATGCACAGTATTGCCACAA
5281 ATGCCCACTTCATTTTGTCTGCATAGACATATTAAGAATTTTTCAATGATGTAATTTAATTATCCTAAAAGAAATGACAG
5361 ATTCTTCTGTAGGAAAAAATAAAAACATGAATATCTCAAATTATAATGGTTAATCTCTAAAATATGCTTAAAGTAAGATG
5441 TTTCTATGTTATGTGGTTATGTTATCAATAATATTTGGTTGATCTTCACATATTTTATATGCATATATATATCAAGAAGT
5521 TATATATATATAACTCAAGAAACTCAAGTTATATATATATGTCAAGAAATGTATGATTATTTTGGAGAGAATGGGCCCAA
5601 ATGTGAAAAAGATATAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAAAAACACTATTTTCCCCTACGAAATATACTGTATATTTCAA
5681 AAGAAGAAAAGTTAAAAGATATTTGAAGATTGCAGGGGCAAAACAAAAACCTACCAGGGCTCAGCACTTAAGCACTTTTC
5761 CCACATCCAGGGTCAAAGCAGCAGTAACTACATGGACTTTTAAGTGCGGTATGAAATGCAACATTACGCTTACAAACAGT
5841 ACTGTCAAACCTCAAATGCTTTCTTTCTTCAGATGCTTTTTCGTGTACATGATACTAGTAGACACTTTTCTCTTTATATT
5921 TACTGATAGTGAAAATCATACGCAATAAAATATTGATGTTTGAAGGCAGTGGTCACCAATTGGTTAAAAAACTATGAAAT
6001 GTAAACTGAATTGTTATATCTCTATCCTTTTTGCTTTTCTCTGTGTTTTTAATGTATGGAATAAATCTCATAAATAGAAA
6081 GAAAAATAATCTAGAAATTTTTCAAAGCTAGTACTCTTTCTCCTTATAAATGTACACAATTTTAATCTTTTTACAAATTT
6161 ATTTAACTGTACCTACTGTACTTATTGTAGATTCAATGACGCAGTTAAGTCATCACCCAAGGATTTATGAATTTGAGATT
6241 ACTGACCTGTTTTCTTCATATTGCATTCACATCAATATTTGTGAATTTGTTGTTCAGCTTTTCATTCAAACAAAAAATAT
6321 TCCCTCAAGAAAGCTCCATTTTTATCATAAACATTTCAACATAACCAACATTAGAACAAGTCTGCCATGTTAAAAATAAT
6401 TTAAAGACTTATCTCTGAAAACGGTATCCAGAAACGCAGGTGTTCCCAGTAATGTAGCTTCAAAAATAAAATGTGCTATT
6481 TATATGACATGAAATTCATAACTTTTGGAAGGGTATATTTATGACAGCATAAAAAATAAATTCTGTGCTATAAAGAAGAT
6561 CCAACAAATTAACCATATAAGCACAGAAAATAGAGAAACACAGTTATTGAATCTACTCTTGTCATTAACATTTTCAAAAA
6641 ACAAAATGCATATTGTAATATTTGGTACATGACACTTGCATGTTGATATGCCTATATACTTACAAAGTATTCAATGTGTA
6721 CTTAGCGGCGCTTAAAATATGTCATGTACAACTCTTATAAACATTTTTACAGGGTTCCCATTTGCACTTCATCTTTCAGT
6801 AAAGTCTTGTCAGAAAAAAATTGTCTGATAAATATGGAAAAATAAAATTTGAATTTTAGTTATCTGTTGGACATTACTGA
6881 ATTGTCTATTCATTTAGTACATTTTCTTAACCTTGAAAACAGACATTGAAAGATGGAACTTTCTTTTTTCCAGTGACAGG
6961 TCATTAAATCGATGGTACAAAACATACTTCTTTATGCCAAACACATTATTTTGAATACCTTTTTTTCAACTTCATACATT
7041 ATCCATCCATTTTAGTTTTCCTCGATGATGCCCATTTTCTTTGTAAATTTCTAAGTGGAAGTTTTAAAAATTAAGCATCA
7121 GTAAAATAAATGTTATCTTATTTGTACAACATTTAATCGTTATTCCTTGGAATATATGAACCTTGTAAAGTGATGACTAA
7201 GGGTCAAAAAAAATGTTGCTGACTTAGGGAAATTTGCTTGAGAATGCCAAAATTTTAAAACTCTGTAAAGGTAATTTTAC
7281 ATTCACTTATGTGTGTTTACTAATGTTGAGTAGGAACAGAAGCAAAAATACCTAAACCTATTTTTTTTAACCTTCACACT
7361 CTAACCAGTATTATATATTTCAGCTACCTAAGATAATGCAATTAATCATATATCCAACCTAAGCTTCTGCCAATAAGGAT
7441 TTCAGATAAGCTTTTAAATTTATGGAGGATTTTCTTTGTGTCTTTGGAAGTTCACTTACCATAAAGTATTTTATAGTCTA
7521 CTTTAAATAACAGATTTTGTTACACAGGGTAAGCCAAAGGCTGTACAAGATTTAGTGTCATTGGGTCTCATATTTGTGTT
7601 AGACCATGAAATATTCCATTAAAATTTATCTGTAAATACAAGGCAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' accACGUUUUCAUUAAC---ACCAAAAa 5'
||: || |||||| |||||||
Target 5' caaTGTTAATATAATTGTATTGGTTTTt 3'
|
5039 - 5066
|
170.00 |
-9.60 |
2
|
miRNA 3' accACGUUUUCAU-UAA--CACCAAAAa 5'
|| | | || ||| ||||||||
Target 5' cctTGGATCATTATATTGAGTGGTTTTt 3'
|
283 - 310
|
160.00 |
-10.40 |
3
|
miRNA 3' accaCGUUUUCAUUAACACCAAAAa 5'
||| :| : | |||||||
Target 5' tgacGCATGATGGCCTATGGTTTTa 3'
|
1682 - 1706
|
149.00 |
-6.30 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|