pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-2115 |
Genomic Coordinates | chr3: 48316360 - 48316459 |
Description | Homo sapiens miR-2115 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-2115-3p | |||||||||
Sequence | 58| CAUCAGAAUUCAUGGAGGCUAG |79 | |||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||
Experiments | 454 | DRVs in miRNA |
|
|||||||
SNPs in miRNA |
|
|||||||||
Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
---|---|
miRNAs in Extracellular Vesicles |
|
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | ZNF621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | zinc finger protein 621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001098414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_198484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ZNF621 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ZNF621 (miRNA target sites are highlighted) |
>ZNF621|NM_001098414|3'UTR 1 GCTTTATCTTGGCAGTCTTACGGCTCTTATGCCTAGCAAATCTCCAGCCTAATTTTATATATTTTTTTGAGAAAGGGTCT 81 TGCTCTGTCACCCAGGCTAGAGTGCGGTGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCCCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTC 161 CTCCTTCAGACTCTCGAATAGCTGGGATTACAGGCACGCCTCACCACGCCCAGCTAATTTCTGTATTTTTAGAAGAGATG 241 GGGTTTCGCCATCTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACACCTGACCTCAAGTGATCCGCCTGCCTTGGCCCCCCAAAGTGCTGG 321 GATTACAGGAGTGAGCCACTGTGCCCAGCCTCCAACCTAATTTGAGTTTCATTTGTATTTTTTTCATCACCTTACATGTG 401 TTAACAGCTGTTTCAACATAAACTCCATTATAATCTATATACATTTAAAGACCGTGTTTACATAATCTCTTCTGGGTAGA 481 AAATGGAAATACTTAACCTTTGCATTGGTCCCTTTCAGGCTTGAACAACAGTGGCTGTATCTGCATCGTGGGGTTGCTGG 561 TGGTAGAACACTTTGGTGTTAGGAAAGTTTGGAAAAGAGGATATCCCTGTATTAGGCCATTATGATTAGAGATAAGCAGC 641 CTGGGAGAAACATACAAGACCTGTGGCTACTGGTAGAGAATTGGAATAAGCTTCCAACAATGGACTGTAGAGATTAATGG 721 AGATTGTTTAGTGGGCCCATGGCTAGGTGGGGTATTAATACAGTTGAAGTTATGTTGCCCTTGGCACAGATCTTTGAGAA 801 TCTCATACATCTGTGAAAAAGATAATGTGAAATAAACAGTAAAAAAAAAAAGTATGTTGATGGCAGTGAGAGTAATCATG 881 TCTTTAAACGTGAAGTTTTTTTTTCTTTAGTTTTGCTCTTGATAGCTAGATGTTTCTTTTAACTTTTATTTCGTAAGTAA 961 ATATACACAAAGGCATTCATCTTTGTTGAATCTGTTGTGCAGATTTTTCTTGATGAGCATTCTGTTTTTTTTTCTTTGTG 1041 AGCACTGGCTTCTATATTTTATTTCATATTTATGAATTATAAATATGAATTTAATTACTAAAGAAATAAAAATAATGGTG 1121 TAAAGCCAACTCGAGGGGAATCTGAATAAGCTTCCAAAATTTTTTTTTTTAAGAAATAAAGGGAGCTGTGTAGTGGGTCA 1201 GTGGCTAGGTAGGTTAGTGAAGTGGAATTTGGGGTTGCTCTTGGAAGTGGCCTTGATGAGGATCCTTTACAACTATTCAG 1281 AGGACTGTGTGAAGTAGTTACTGGAAAAAGAACTTGAATTATGCATTTATTGGCATTAATGTAAACAGTAAGTCCTAAGC 1361 TTTGATGGAAGGGTCCATACATTTTTTTTTTTTTTTTGCTGATGTTGCTATCTAGATGTTTCTCTATAGCAATTAATAGC 1441 AAAACCTTTACATTCTTGGTTTTTAAACTTTACCATGTGTCTGAATTACATAGTGTGCTTGTAAAAAGAAGAGTTTTCTC 1521 TCTTGCACAAATTCTGATTTTGGCTATCTGTGGTGATGGCCAGATCTTTAGCATGGACCATACTTTGAGAGATATGCTTC 1601 AAACAGAAAATGCCCACCCCTCCTCCTTTACCCAGCATAAACTCTATGGTTAATTCTTAAAATAATGCCTTACAGTCTCC 1681 ATTAACTCCCTTGCCCTTCTCTTGCTTTGTCATGCTCGCTTGGCAAAACCTCATCTCTGACTAAATGCAGTTCTTTGCCT 1761 TCTCTGTTCCTGCACCAAAAATGATCAGGAGAAAGCATATTACCAGGCTGAACTGTCACTTTAAATTCATGACCAGTAAC 1841 TTCATGGAGGCCCTTAACGTTTCCTGATGGTCATACTACAATTTTTGGAGTCCACTTAACTCCCCTGCTTTCCTAGGCCA 1921 CTACTTTATACTTTCTCTCTTCTGTAACTTCCAAAGCATCCCTCTCAGTTCTCATGCTCAGCTGATGGTTATGTTTCTGC 2001 CTTCGGCGAGAGAACAGCAAGCTCCAGAAAGTGGCTGCGCCTTCAGCCCCGTGCTAGAATGAGAACATATGGAGCCAACT 2081 TGAGTTCGGAAGGGCTGTGGCCACCTCGTTTCGCCCATCTACTTTTCACCTTGCCGTATCTGATTCTTCACCACCGTATT 2161 CTCAGTCACTTCCACTAAACAGTGCCAGTGTTTTAAGGTTCTGTCACACTCAGTAACCCACTTCTGGTTCCTCATTCCGT 2241 GTCAGTGATCAGCAGTAGACTGAAGAATCTACCTTAGATTTGCTCCATACTATTAATTAGCTTACAAAATGTCTAAGAGG 2321 AGCTAAGCTGGGATGCCACATAGGCAGAAGCCAGGAAAAATGACCAACCACAGAACCAAGTGGTTCCAGTGGAAACTCAG 2401 CAGCTGCTGGTGCCTGCTACTGGACTGCCACCCCCCATTGAAGAGACTGGACCACCAGGAAGGTCGTTTCACATTCTGTA 2481 GTAAAAATACCCCTACAATCATTTTGGTAGGGTCTTCTGTCTTCAGCCAGGGTGTACCTGCTCGGTGGGAGTTGGTTATA 2561 TATGTATGTCCAAGTTGCAGGGGCTTCTGGGAAATACAGGTTTTGGATTCTGCCTGGGAAGAGAGTCATAGTATGAAGAA 2641 GTCTGAAAATGGGGAAGGGATTTTCAGAATATGTTGAGCAGCTGTAAAATATCAGATACCCATTATAGGCATTGAAGGTT 2721 ACCTAAATGACAGAAGGATGCACTATATTCATGGGTAGGAAAGATTAGTTTCATCAAGATTTCAATTTTTATCAATTCAT 2801 AAATTAAAAACAATATAAAAATTCCAGAGGGGTGTGTGTATAGAGAGGCAAAGGACACAGAGTAGCTAACCTAGTTTTGA 2881 AGAACAAGATGGGGGGTTTTATGCTACCAGATATTATATACAATGATCATCAAACACAGAACAAAGCAAAAAACAAACTC 2961 CCCAAACCCAAGTTGAAACAAAAAAAACCCCCAGACTGTAATAGTATTATTATTATTTTTTAAGATGGAATCTTGCTCTG 3041 TTGCTCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTACACCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGCCTC 3121 AGCCTCCTGAGTAGTGTGTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTTAATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCA 3201 GGCTGGTCTTGAACTCCTGGCAGCCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGTCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCC 3281 ACTGCACCTGGCCTGTAACATGATTTGCTGAAATTTTTAAAAATCTTAAATAATGTACTGTTTAGAAATATACATATTTT 3361 ATACAAAATTATAAAGAAAGCATAGAGAGGTAAGCATTAGTGGCACAGCTGAGAAAATATAAAAGGTAGTTCTGTCTCTA 3441 TCCTGTCTCCTTTATTCTGCTACTGCTCTCATTCTGTCTCATCCCAGGAATCCAGTCCCAAGTGCTGCCTGCCAATCGTC 3521 CAGCACCCTCCACCTTTGCCACCTATTTCTTGTTGTAAAACAGATGTTTGTTTCTAAAATATAATGAATTAATGATTATC 3601 AAAGTACAGGCATACCTCATTTTATTGCAGTTTGTTTTATTGTGTCTTGCGGATATTGCATTTTTTACAAACTGAAGGTT 3681 TGTGGCAGGCCTGTGTTGAGCAAGACTATCAGTGCCATTTTTTTTCAACAGCATGTGCTCATTTCATTTTTCTGTGTCTT 3761 ACACAGAAACTTAAAATATTTCAAACTTTTCATTATATGTGTTTTGGTGATTAGTGACTTTTATGTTTCTATTGTAATTG 3841 TTTTGGGGTGCCACAGACTGCATCCATCTAAGACAGTGAGCTTAGTTGATGTGTGTGTGTGTGTTCTGATTACTCCACTA 3921 ACTGATGGTTCCCCATCTCTCTCCCTCTCCTCAGACCTCACTATTCTCTCAGACACAACAGTATTGAAATTAGACCAATT 4001 GATAACCTTACAAACACCTTTAAGTGTTTAAGTGAAAAAGTCACATGCCTCTCACTTTAAATCAAAAGCTAGAAATGATT 4081 AAGCTTAGTGAGGAAGGCTAATGTCAACAGCTGAGATAGGCCAAAAGCTAGACTGCTTCTGCCAAACAGTCAAGTTGTGA 4161 ATGCAAAAGAAAAGTTCTTGAAGGAAATGAAAAGTACTTCTCCAGGGAACACATGAACGATAATAAAGTGGCCAGGTGCA 4241 GTGGCTGACACCTAGAATCCCAGCACTTCGGGGAGCCAAAGCGGGAGGATCCCCTGAAGCCAGGAGTCCGAGACCAGCTT 4321 GGGCCACAAAGTGAGACCCCTGTCTCTACAAAAAATTAAAAATTTAGCTGGGTGTGGTTGTGCATGCCTGTAGTCCGATC 4401 TACTTGGGAGGCTGAAGTGAGAGGATCCCTTTAGCCAGGGAGTTCGAGACTGCAGTGAGCTATGATTGTGCCACTGCACT 4481 CTAGCCTGTGTGACAGAATGAAACCAAAAAAAGTGAAACAGCATTATTACTGATATGGAGAAAGTTTTAGGGGTCTGGAT 4561 CAAACCAACCACAAATTCCCTTAAGCCAAAACCTAATCCAGAGCAAGGCCATAACTGCCATTGTATGAAGGCTGAGAGAA 4641 GTGAGGAAGCTGCAGGAAAGTTTGAAGCTAGCAGAGGTTGGTTCATGAGGTTTAAGAAGTCATCTTATCATAAAAGTGCA 4721 AGGTGAAGCAGCAAGTGCTGGTGTAGAAGCTGTAGCAATTTATCCAGATCTAGCTAAGTTAATTGATGAAGTTGCTACAC 4801 CACGAGATTTTCAGTGTATTCCAAACAGCCTTCTTTTGGAAGAAGAAACCATCTAGGACTTTCATGGAGAAGAGAAGTTA 4881 ATCCCTGGCTTAAAAGCATCAAAGGACAGCTCGTCTCTCTTGTTAGGGGTTCATGCAGCTGGTAACTTTAAGTTGAAGCC 4961 AATGCTCATTTACCATTCAGAAAATCCTAGGGCCCATAAGAATTATGCTAAATCCACTCTGCCTGTGCTCTAGAAATGGA 5041 AGATCAAAGCCTGGATGACAGCACATCTGTTTACAGCATGGATTACTGAATATTTTAAGCCCACTGTTGAGACCTACTAA 5121 ATATTAGGAAAAAAGAATTCTGTCAGGTGTGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGCAGGTGGA 5201 TCAGTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCTATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTG 5281 GATGTGGTGGTGTGTGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAATCCAGAGGCAGAGGTT 5361 GCAGTGAGCTGAGGTTGCACCACTGTGCTTCAGCCTGGGTAACAGAGTGAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAATTTAGTT 5441 CCAAATATTACTGCTCGTTGATAATGTGTCTGGTCACCCAAGAGTTCTGATGGAGATGTACAAAGAGATTAATGTTTTTA 5521 TGTCTGCTAAACAACATCCATTCTGCAGGATCCATTACTCCATGGGTCAAGGAGTAATTTTGACTTTCAAGTATTATTTA 5601 AGGAATACATTTTGTAAGGCTGTGGCTGCCATAGTGGTTGTTCTGTACAAAGTAACTTGAAAACCTTCTGGAAAGGATTC 5681 ATCATTCTAGATGCCATTAAGGACATTTGTGATTCATGGGAGAAGGTCAAAATATCAACATTAACAGGAGTTCAGAAGAC 5761 ATTGACCTCAACCCTGATGGATGATCTTGAGGGGTTCAAGACTTCAGTGGACGAAGTAACTGCAGATGTGGTGGAAATAG 5841 CAAGATAACTAGACTTAGAAGTGGAACCTGCATATGTGACTGAATTGCTGCAATCTCATGATAAAACGTGAACAAATGAG 5921 GAGTTGCTTCTAATATAAGAGCCACAAAAGTGGTTTCTTGAGATGGAAACTACTCCTGGTGAAGATCCTGTGACCATTGT 6001 TGAAATGACAACAAAGGACTTAGAATATTACATAAACTTAGTTGATAAAACAGCAGCAGAGTTTGAGAGGATTGACTTCA 6081 ATTTTGAAGAATGTTCCACTGTGGGTAAAAGGCTATCCAACAGCAACACATGCTACAGATAAATCTTTCGGAAAGGAAGA 6161 GTCAGTTGATGTTGCAGCCTTCCTTGTTGTCTCATTTAAAGAAATCTCTAGAGCCACACTAACCTTCAGCAACCACCACA 6241 CCGATCATTCAGCAGCCATCAACAGTGAGGCAAGACTGTCTTCCAGCAACAAAGACTCACTGAAGACTTAGATTATCGTT 6321 AACATCTTTTAGCAATAAAATATTTTTAAATTAAAGTATGTACATTGTCAGATATAATGCTATTGCAAACTTAATAGACT 6401 ATAATATAGATTAAACATAACTTTTATAGGTACTGGAAAATAAAAATAATTGTGTGACTCCCTTTATTGTGTTAAACATT 6481 TTATTACAGTTGTCTGGAAGCAAACCTGCAATATCTCCAAGATATGCCTGTATTTTTCAAAATGTGGTCTTTTAACATTG 6561 CTATGAAGTTTATCAGTAATAATATCTTATTTCATGGTTGTCCAGAAGTTACATAACTTGTCTTAATCTAAAAATCATAT 6641 CATTTAAAAAGCCTGATGATTTAATATTTTTCATAAAGAAAACTTTTGACAATTTGTTTTTAAG Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DRVs in gene 3'UTRs |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|
Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
---|---|
miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
|
Conditions | HEK293S |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1084044. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noarsenite_rep3
HITS-CLIP data was present in GSM1084047. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_arsenite_rep4
HITS-CLIP data was present in GSM1084064. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noemetine_AbnovaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084065. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_emetine_AbnovaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084068. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noemetine_SigmaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084073. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_hippuristanol_rep1_AbnovaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084076. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_nohippuristanol_rep1_SigmaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084077. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_hippuristanol_rep1_SigmaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084078. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_nohippuristanol_rep2_AbnovaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084082. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_nohippuristanol_rep2_SigmaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084083. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_hippuristanol_rep2_SigmaAb
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
|
CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1084044 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noarsenite_rep3 |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | AGUUGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1084047 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_arsenite_rep4 |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | AGUUGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM1084064 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noemetine_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | GACAGUGAGCUUAGUUGAUGUGUGUGUGUGUGUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 4 for dataset GSM1084065 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_emetine_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | AGUUGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 5 for dataset GSM1084068 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noemetine_SigmaAb |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | AGUUGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 6 for dataset GSM1084073 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_hippuristanol_rep1_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | AGUUGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 7 for dataset GSM1084076 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_nohippuristanol_rep1_SigmaAb |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | UGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 8 for dataset GSM1084077 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_hippuristanol_rep1_SigmaAb |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | AGUUGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 9 for dataset GSM1084078 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_nohippuristanol_rep2_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | UUGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 10 for dataset GSM1084082 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_nohippuristanol_rep2_SigmaAb |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | AGUUGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 11 for dataset GSM1084083 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_hippuristanol_rep2_SigmaAb |
Location of target site | ENST00000339296.5 | 3UTR | AGUUGAUGUGUGUGUGUGUGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
80 hsa-miR-2115-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
![]() |
![]() |
|||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
|||||
MIRT057089 | DDIT4 | DNA damage inducible transcript 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT071216 | FCF1 | FCF1, rRNA-processing protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT226901 | RAD23B | RAD23 homolog B, nucleotide excision repair protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT235961 | BACH1 | BTB domain and CNC homolog 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT294569 | ZNF460 | zinc finger protein 460 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT321046 | RAC1 | Rac family small GTPase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT359666 | NUS1 | NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunit | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT366451 | KLHL15 | kelch like family member 15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT405375 | ZBTB18 | zinc finger and BTB domain containing 18 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT441794 | TCEAL5 | transcription elongation factor A like 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443295 | TCEAL3 | transcription elongation factor A like 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT455275 | DDX39B | DExD-box helicase 39B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT458523 | C5orf22 | chromosome 5 open reading frame 22 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT464960 | TWIST1 | twist family bHLH transcription factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT466848 | STX6 | syntaxin 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT469252 | RHOB | ras homolog family member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT469825 | RAB14 | RAB14, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT470047 | PTGFRN | prostaglandin F2 receptor inhibitor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT471420 | PDP2 | pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472024 | NPM1 | nucleophosmin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT484156 | CENPN | centromere protein N | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT485490 | HMGN2 | high mobility group nucleosomal binding domain 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT490462 | PROSER2 | proline and serine rich 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT493069 | MTCH1 | mitochondrial carrier 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT493573 | HSP90AA1 | heat shock protein 90 alpha family class A member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT494919 | NDUFC2-KCTD14 | NDUFC2-KCTD14 readthrough | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT500439 | ZMAT3 | zinc finger matrin-type 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT500931 | SRPR | SRP receptor alpha subunit | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT501551 | POC1B-GALNT4 | POC1B-GALNT4 readthrough | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT501809 | NEURL1B | neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT502415 | GALNT4 | polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT506504 | MSANTD4 | Myb/SANT DNA binding domain containing 4 with coiled-coils | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT507861 | CCNE2 | cyclin E2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT510511 | YOD1 | YOD1 deubiquitinase | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT516073 | RAB42 | RAB42, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT519030 | KYNU | kynureninase | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT521762 | PPIL1 | peptidylprolyl isomerase like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT522898 | KCNJ3 | potassium voltage-gated channel subfamily J member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT527370 | MGARP | mitochondria localized glutamic acid rich protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530691 | C8orf46 | chromosome 8 open reading frame 46 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530867 | TRUB1 | TruB pseudouridine synthase family member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT531832 | MTPAP | mitochondrial poly(A) polymerase | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT533035 | ZBTB5 | zinc finger and BTB domain containing 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT533165 | WIPF2 | WAS/WASL interacting protein family member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT533464 | TRIM71 | tripartite motif containing 71 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534331 | SHCBP1 | SHC binding and spindle associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT539372 | ADSS | adenylosuccinate synthase | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT545951 | ZBTB10 | zinc finger and BTB domain containing 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT553283 | TSR1 | TSR1, ribosome maturation factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT553532 | TMEM185B | transmembrane protein 185B | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT556480 | LIPA | lipase A, lysosomal acid type | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556975 | HSPA4L | heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557697 | GATA6 | GATA binding protein 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558901 | CCDC58 | coiled-coil domain containing 58 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT559224 | BLMH | bleomycin hydrolase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT559827 | SLPI | secretory leukocyte peptidase inhibitor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT563435 | SLC3A2 | solute carrier family 3 member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT569270 | PCDH11X | protocadherin 11 X-linked | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT571386 | JKAMP | JNK1/MAPK8-associated membrane protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT572567 | AFF1 | AF4/FMR2 family member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT610400 | AR | androgen receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT611058 | ZNF621 | zinc finger protein 621 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635118 | TMEM233 | transmembrane protein 233 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT641617 | DEFB118 | defensin beta 118 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT642146 | CHORDC1 | cysteine and histidine rich domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647295 | C8orf33 | chromosome 8 open reading frame 33 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648155 | MPLKIP | M-phase specific PLK1 interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652780 | TENM3 | teneurin transmembrane protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657356 | HNRNPA2B1 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658718 | ELN | elastin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662441 | RALGAPA1 | Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665302 | ZBTB38 | zinc finger and BTB domain containing 38 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT699898 | RUNX1 | runt related transcription factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700921 | PDS5A | PDS5 cohesin associated factor A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700992 | PDE3A | phosphodiesterase 3A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707397 | DCAF4L1 | DDB1 and CUL4 associated factor 4 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711895 | INSIG2 | insulin induced gene 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT712072 | XRCC5 | X-ray repair cross complementing 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716121 | PTPLAD2 | 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT724470 | SMAD2 | SMAD family member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|