pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-7107 |
Genomic Coordinates | chr12: 121444273 - 121444352 |
Description | Homo sapiens miR-7107 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-7107-5p | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 6| UCGGCCUGGGGAGGAGGAAGGG |27 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Meta-analysis | ||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SHB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | bA3J10.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | SH2 domain containing adaptor protein B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_003028 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SHB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SHB (miRNA target sites are highlighted) |
>SHB|NM_003028|3'UTR 1 GCGGACCAGACCTGCCCTGCTCTGTGACAGAGCCTGAGACTTGGAGGTGCCAGAGGCCCCCCACCAACCAGCCCAGCCAC 81 TGTTGCTGGCTGTGTCGTTTGTGTTGTGTGTATGGTACTAGCACACCACTGCATGTCTCTAGAATGCTGTTGCCACTTAC 161 GGGGGCTGGAGAAGGCCTGGATAAAGACAGAAGGGCGGCAACACACCACCCCAGCCCCCACCCCCACCCTCTCCTTGAGT 241 TTCTGTGAATTAAAATATTTGCAAATCCAAAGAGATGCCTTCCAGGATGAACAAAGGCAGACCAGCTCCGAGGGGCGGGG 321 TAGGGTGGGGCGGGAGCTCCCTGGCTGACATCTCTTTGTTCTCCAGCTGTCTCAAATTCACACCTCTGTACAGGGCAAAG 401 TTTTCCCACAGGAGCCCCCCTACTGATGCTGGGAGCCAAATGCTGGTGCTTTGAGAGTCCCGGAGGCCCCGGGGTTCCCG 481 CCCCGCTGGTGTGTATATGTGTGTCTGTGTGAGTGTGTGTGTGAGTACAGATGTGAGAAGGTGGTCACACACAGATGGGT 561 AAGCCCACTGATCTACTTGTAGTCACTCAGTGTAATCATTAGGCTATCTTCAAGGAATCATTGTGCAGTCAAAAAGAGGA 641 TTCAATTATTTATGAATAGGGTGTGTAAATAAAATAGTCATTTAATATATAGCCTTATCCTTTTTTGATATACTGCAGAG 721 GGTCTCTGAGGGGGCAGTTCTGGTTTCACTCCCAGAGCAAGGCGTGTCTCCTCTGGGCTTGCTGCTGTGGCAGGCCCCAG 801 GGAGGGGAGGGAGGCCGAGGCCTCAGCTCCAGCCCTCAGCAGCTCTGGACACAAGAGCCGTCTGCTCTGACAACTGGGCT 881 GAGGCAGTCGGTAGCACTCTGGGAGTCAACCCAGAGCTCAGAGTTCAGGCTTCAGCAGTGGACATAGTCAGGAGCCTCCA 961 GTGTTGACCAAAAAACCAGTCTTTCCCTCCTGCAGTGGGACGTCTGTGTTGACACCCCCCCAACCCCTGGACACAGCACC 1041 CAGCTGGCTACAAAGGGCTCTCTCCCCACTATCTGTTAGCACCACCTGGGAGGTATTTGGCATGTAGGGAAAGGGAGACA 1121 GAGAAGGAACGTCATTTGCCCAAAGCCACACAGCTCACCAGCAGCAGAGCGGTTCTGCAGCCAATGCTCTTTCGTTGGTT 1201 CTGCATGGCCTTGCTGTCACCCTGCCCATGGAGGAGGGAGAATCCTGACCTCCCAGGGACATAGAGCCCTCAGTGGTCCA 1281 CACTGCTTCCACACACAAGAACACCTACACACACACACACACACACACACACAGCCCTCAGTGGTCCACACTGCTTCCAC 1361 ACACAAGAACACCTACACACACACACACACACACACACAGCCCTCAGTGGTCCACACTGCTTCCACACACAAGAACACCT 1441 ACACACGCACACGCACACGCGACCTCTCTCTTGCTTGCCATAGCAGGGTCCTCCCACACAGGCCAGGCAGCCCCGATGAG 1521 GCTAAGAGTTTCTCAGCTCTCCTGCTTTTTCCACCCACCCAGTAGCATGAAGATGTGGCTGCCCTCTCCTGAATGAGATA 1601 CAAGGGTTCCAGAGCCTTCGCCAGGCACCAGCTGGTCTGAATGAACTAGAAGTTTGACGACTGTCATCCCTGGCCCACCT 1681 GGGCAGAGCACAAGGGGCCGAGTTTGAATGTCATCAGCAGGTTCAGACATCAGCGCTGCTCATGTCTTTAGAGACTGTTT 1761 GGAGGTGGTTCCAGCTCACTGTTCACATGCAGAGACACAGGCCCGGAGAAGGAGGACTCGCCAAGGCCACGTGTCGAGCT 1841 GGGACTGAGCCCTGCCCCTTTAGGTAGCTGCGTGGACTTCAGCGGTTTGTGCAAAGCCCTGCCCTTGGTGACCCGCCTTT 1921 AGTGACCAGTCTGCCTCTTGGGTCTTCCTCCCAGGCCTTGTCTGGCACGTCCACGTGGCCCAGCCCTCATAGAGACCACG 2001 CTGGCTGTGGCCTGGGTTTAATCTCTTAAAGAAGCCAATCCTTTCCTTGCCTGTTTGGCATTTCCTAAAACATCCCTCAA 2081 TGAGGGAGGAAGGCAGGGACACCCTGGAACGATTCGTGCTTTCCTTTGGGGGAGTGGGAAGGTAGGTGGGAAATGACAAG 2161 ATGAGTGAGGAGTTGGCACTTGGCCAAACAGAGGAGCCTGGACCCCAAGGCTTATTCTCAGAGGAGGCCCAAGAGAGGCT 2241 GAGGAAGAGGGGGAACAACCCTCCGGCGGGGGAGGAGGGTGAGACCTCACACTGGCAAGTTCAGGTCCAGCCACTTCCTG 2321 AGGCTGCTGGGTGGGGCCGCACCTCACGGTCCTTCCCTGTAGACCATCTTCCCGGGCACATTGCTCCTCAGAAAAGGCTC 2401 TGGGAGGGTCTCAGTGGAAGCTGGCAGCTGTGCCCTCTGGCCCTGACTTGGCCTCTTAGGGTATTCCTGGGACCCTCCCT 2481 CTGTCCCTGGCCTTCGTCTTCCTGAAGTTTCCCTGGGAGGCCCAACCTCCTGCCCCTCTCAGGGACAGAGGCCAGCAGAG 2561 GAGCCAGCTTACAGGATGGGAGCTGCTGAAAAGAATTTTTTTCCCTTAATTTTATGAACCTCTCCCTCTTCTTCCTCTAA 2641 TTGTGACCGTTTCCTGTGTCAGCCTGTATTCATGTTTTCTTGGACATCTAACAATTGAAACAGCTTTTCCCTTTCAGAAA 2721 CACTCACATTCAGGTTACTGGCTTTGGTTTGGTTTTTGTTTTGGGTTTGTTTTTTTTTTTTTTCATCTGCTGCCAATTAA 2801 TTGGGGAAAAAATTGAGCTGGATTTCTTTGAGAGAAAAGAAAAGCTCCTGCCACACAACGTCGCGCCCTCGGCATTTTGT 2881 CTGAGAACCTCCAGCACTAGCGGCTGTTTCTGTGTCTCCCTTCTTTGCTGGCTTTATTATTGACCATAATGCCTGCCCAC 2961 TTGAGCAACTCTGTCCTTGAGCGCTGAGGAGTCAAGGGCCCTTCTGGCAGCCCCCCAAACAGGATGGCGCCCACAGAAAG 3041 AAAGGAGGCTTTGTAGGGGAAGAGGGCCCCACCGCCTGCCAGTCCCGTCCTGAAGTCAGAAGAATGGCCCAGGCTGACAC 3121 CCTCTCCTGGAGAGAGGCTCACAGCGTAGCTGTTCCCAGGAAAGGGGTGCAAAGACTCCGAGGCTTCAGGAGGCAGGCCC 3201 TGTCCTCACAGGGCGGCTGTGGGCCGGGGCCCCTCTGTGGCCTGAGAGTGAGCAGGAGGGAAACCTGAAGCAGCTACCCG 3281 CAAGGCGTCCGGTCAACAGGGTGGAGCTGCAGGCTCCCTCTGCCCATTCCCAGAACCAGCGGCCCCCTTTGTAAGATGCT 3361 GAACACGAAGTTCCGGTAGCTCCCCAGACGCTGTCTCAGAAGTGGTGATATCATTGACCAAGGGCCTGGCAAGGACCGGC 3441 AGCCAGGGTCCCCATTTGCTCTTGCAGCCCTAGGGACTGTGCAGGTAGAAGCCCTGCCAGCAGAGCAGGCTGGCGTTTGG 3521 TGTTGGCCCACAGACACCCGTGAAGGGTCATGGCCGAATCAGGCAGCTGTCCAGCCAACTGTCTCTCCACCCTTCCAGAA 3601 TTGGTGATCAGCGAAGACCAAATTCGGCAAGCCATCCAGAGGGAGTGCAGGGCGCACAGTCTTAGATGTGGGCGCACCTC 3681 CCAGAACCCCACGGGGACTTGTTCACAGGCGCGCTTGCAGGAGGGCAAGCCCCTTGGTCCTGGAACACAGGTGCCCCTTG 3761 GCCTTTCCACCTCCCTCCTTGGGGCTGTTTGCATCCCTGCCAGGAGCCTTAAACCAGCCACCTACTGCTGAAGTCTCTTG 3841 TAACATTCCAAATCTATGTGACACACTGTATAATGATGAATATTTAATGTGAAGCTCTTAATATACTACAAGTGTCTTGT 3921 TTA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293S |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1084066. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noemetine_SantaCruzAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084067. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_emetine_SantaCruzAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084081. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_hippuristanol_rep2_SantaCruzAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084082. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_nohippuristanol_rep2_SigmaAb
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1084066 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noemetine_SantaCruzAb |
Location of target site | ENST00000377707.3 | 3UTR | AGGGGAGGGAGGCCGAGGC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1084067 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_emetine_SantaCruzAb |
Location of target site | ENST00000377707.3 | 3UTR | AGGGGAGGGAGGCCGAGGC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM1084081 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_hippuristanol_rep2_SantaCruzAb |
Location of target site | ENST00000377707.3 | 3UTR | AGGGGAGGGAGGCCGAGGC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 4 for dataset GSM1084082 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_nohippuristanol_rep2_SigmaAb |
Location of target site | ENST00000377707.3 | 3UTR | AGGGGAGGGAGGCCGAGGC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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144 hsa-miR-7107-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID | Target | Description | Validation methods | |||||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
MIRT060580 | CCND1 | cyclin D1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT451035 | ZNF610 | zinc finger protein 610 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT485711 | CASP16 | caspase 16, pseudogene | 2 | 8 | ||||||||
MIRT488402 | TDRKH | tudor and KH domain containing | 2 | 2 | ||||||||
MIRT492084 | TCF21 | transcription factor 21 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT504213 | VAV3 | vav guanine nucleotide exchange factor 3 | 2 | 13 | ||||||||
MIRT505723 | SERTAD3 | SERTA domain containing 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT509007 | FBXO6 | F-box protein 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT509843 | FOS | Fos proto-oncogene, AP-1 transcription factor subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT514761 | RBM4B | RNA binding motif protein 4B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT515664 | LRRC27 | leucine rich repeat containing 27 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT516316 | F8A2 | coagulation factor VIII associated 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT516342 | F8A3 | coagulation factor VIII associated 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT517139 | KCTD21 | potassium channel tetramerization domain containing 21 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT518746 | C1orf35 | chromosome 1 open reading frame 35 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT519299 | MLH1 | mutL homolog 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT521527 | QSOX1 | quiescin sulfhydryl oxidase 1 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT531756 | TXK | TXK tyrosine kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT542208 | C14orf142 | GON7, KEOPS complex subunit homolog | 2 | 2 | ||||||||
MIRT542235 | FUT9 | fucosyltransferase 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT542791 | PLEKHA3 | pleckstrin homology domain containing A3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT554378 | SETD5 | SET domain containing 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT569908 | PCSK9 | proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570222 | SLC27A1 | solute carrier family 27 member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT570976 | RGS19 | regulator of G protein signaling 19 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT573046 | SHMT1 | serine hydroxymethyltransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT574954 | Vav3 | vav 3 oncogene | 2 | 8 | ||||||||
MIRT609297 | MMAB | methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblB type | 2 | 2 | ||||||||
MIRT612990 | GBX2 | gastrulation brain homeobox 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT613851 | SHB | SH2 domain containing adaptor protein B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT613935 | POLR3A | RNA polymerase III subunit A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT614243 | WDR53 | WD repeat domain 53 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT615158 | SPIB | Spi-B transcription factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT616145 | HS3ST1 | heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT616389 | C1orf87 | chromosome 1 open reading frame 87 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT617737 | ATCAY | ATCAY, caytaxin | 2 | 4 | ||||||||
MIRT621449 | TCN2 | transcobalamin 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT625784 | GCNT1 | glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT628556 | MELK | maternal embryonic leucine zipper kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT632041 | ZNF430 | zinc finger protein 430 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT634937 | GTF2H2C | GTF2H2 family member C | 2 | 4 | ||||||||
MIRT637208 | MEAF6 | MYST/Esa1 associated factor 6 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637610 | LOH12CR1 | BLOC-1 related complex subunit 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT637832 | CACNG8 | calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT638107 | ZBTB43 | zinc finger and BTB domain containing 43 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT638387 | RAB11FIP1 | RAB11 family interacting protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT641689 | SPCS1 | signal peptidase complex subunit 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT642611 | APOPT1 | apoptogenic 1, mitochondrial | 2 | 2 | ||||||||
MIRT643850 | LACTB | lactamase beta | 2 | 4 | ||||||||
MIRT649575 | PALD1 | phosphatase domain containing, paladin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT649860 | WDR12 | WD repeat domain 12 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT651026 | ZNF699 | zinc finger protein 699 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT652336 | TMOD3 | tropomodulin 3 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT653286 | SMURF2 | SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656292 | METTL14 | methyltransferase like 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT656458 | MAPK14 | mitogen-activated protein kinase 14 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT659539 | CHCHD5 | coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT661537 | NWD1 | NACHT and WD repeat domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT668042 | GTPBP10 | GTP binding protein 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT668147 | GDPD1 | glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT668800 | CYP20A1 | cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT669818 | STOML1 | stomatin like 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT670490 | DCUN1D2 | defective in cullin neddylation 1 domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT670615 | NPHP1 | nephrocystin 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT670892 | CYTIP | cytohesin 1 interacting protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT670943 | LIPG | lipase G, endothelial type | 2 | 2 | ||||||||
MIRT671268 | MTRNR2L5 | MT-RNR2-like 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT671903 | GBP4 | guanylate binding protein 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT672239 | ABHD15 | abhydrolase domain containing 15 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT672326 | C9orf3 | chromosome 9 open reading frame 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT673113 | MFSD2A | major facilitator superfamily domain containing 2A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT674412 | GNE | glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT677718 | IRF1 | interferon regulatory factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT678585 | PPP1R3B | protein phosphatase 1 regulatory subunit 3B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT678726 | SRCAP | Snf2 related CREBBP activator protein | 2 | 2 | ||||||||
MIRT679338 | ISG20L2 | interferon stimulated exonuclease gene 20 like 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT679614 | RRP36 | ribosomal RNA processing 36 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT679695 | SLC1A5 | solute carrier family 1 member 5 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT679715 | RPL24 | ribosomal protein L24 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT680065 | CD96 | CD96 molecule | 2 | 2 | ||||||||
MIRT683379 | ESR2 | estrogen receptor 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT683683 | MICA | MHC class I polypeptide-related sequence A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT683865 | OCIAD1 | OCIA domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT684073 | TLR7 | toll like receptor 7 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT684126 | CEP104 | centrosomal protein 104 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT684485 | GPR137B | G protein-coupled receptor 137B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT684736 | DNAJB13 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B13 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT684778 | MYO1F | myosin IF | 2 | 2 | ||||||||
MIRT685028 | MRI1 | methylthioribose-1-phosphate isomerase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT685189 | DCTN5 | dynactin subunit 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT685307 | ASB16 | ankyrin repeat and SOCS box containing 16 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT685514 | MSH3 | mutS homolog 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT685702 | BHMT2 | betaine--homocysteine S-methyltransferase 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT685944 | PTGIS | prostaglandin I2 synthase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT686311 | VPS53 | VPS53, GARP complex subunit | 2 | 2 | ||||||||
MIRT686686 | TIMM10 | translocase of inner mitochondrial membrane 10 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT687641 | LRIF1 | ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT687923 | HOOK3 | hook microtubule tethering protein 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT688117 | GEMIN8 | gem nuclear organelle associated protein 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT688460 | DNAJB4 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT688629 | CRISPLD2 | cysteine rich secretory protein LCCL domain containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT688823 | CAPZA2 | capping actin protein of muscle Z-line alpha subunit 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT689117 | ZBTB25 | zinc finger and BTB domain containing 25 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT689166 | ZNF665 | zinc finger protein 665 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT690070 | MBD1 | methyl-CpG binding domain protein 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT690733 | IRAK4 | interleukin 1 receptor associated kinase 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT691324 | KIAA1841 | KIAA1841 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT691517 | ZNF682 | zinc finger protein 682 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT691607 | IPP | intracisternal A particle-promoted polypeptide | 2 | 2 | ||||||||
MIRT692314 | RFK | riboflavin kinase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT692376 | LY6G5B | lymphocyte antigen 6 family member G5B | 2 | 2 | ||||||||
MIRT692436 | METTL8 | methyltransferase like 8 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT692782 | SYNPO2L | synaptopodin 2 like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT693136 | THEM4 | thioesterase superfamily member 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT693422 | TECPR2 | tectonin beta-propeller repeat containing 2 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT693871 | COX19 | COX19, cytochrome c oxidase assembly factor | 2 | 2 | ||||||||
MIRT694049 | PRIM1 | DNA primase subunit 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT694092 | KIAA0930 | KIAA0930 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT694190 | ZNF347 | zinc finger protein 347 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT695177 | SLC25A33 | solute carrier family 25 member 33 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT696180 | GNB5 | G protein subunit beta 5 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT697387 | ZMAT3 | zinc finger matrin-type 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT698924 | SPEM1 | spermatid maturation 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT699314 | SLC35F5 | solute carrier family 35 member F5 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT701106 | PAPD5 | poly(A) RNA polymerase D5, non-canonical | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701575 | MYPN | myopalladin | 2 | 2 | ||||||||
MIRT701825 | MRPL37 | mitochondrial ribosomal protein L37 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT702047 | METTL21A | methyltransferase like 21A | 2 | 2 | ||||||||
MIRT703034 | HAS2 | hyaluronan synthase 2 | 2 | 4 | ||||||||
MIRT704143 | DNAL1 | dynein axonemal light chain 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT704759 | CDKN2AIPNL | CDKN2A interacting protein N-terminal like | 2 | 2 | ||||||||
MIRT705079 | C4orf29 | abhydrolase domain containing 18 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT705346 | ATP1B3 | ATPase Na+/K+ transporting subunit beta 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT706104 | ENTPD4 | ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT709070 | FAHD1 | fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT709534 | ZBED1 | zinc finger BED-type containing 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT712356 | NAT14 | N-acetyltransferase 14 (putative) | 2 | 2 | ||||||||
MIRT713713 | PAOX | polyamine oxidase | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714304 | ZNF454 | zinc finger protein 454 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT714919 | PPP1R12C | protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C | 2 | 2 | ||||||||
MIRT715792 | TBL3 | transducin beta like 3 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT717376 | RBM41 | RNA binding motif protein 41 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT719069 | ACOX1 | acyl-CoA oxidase 1 | 2 | 2 | ||||||||
MIRT724548 | HAUS2 | HAUS augmin like complex subunit 2 | 2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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