Gene Symbol |
DBT
|
Synonyms |
BCATE2, BCKAD-E2, BCKADE2, BCOADC-E2, E2, E2B |
Description |
dihydrolipoamide branched chain transacylase E2 |
Transcript |
NM_001918
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on DBT |
|
3'UTR of DBT (miRNA target sites are highlighted) |
>DBT|NM_001918|3'UTR
1 AGACTGATAAGACATTCTTGAACTTTTTGAGCTTCCAAAGAGTATGTAAACCCTAGCTGTGCCAGCACATGTTCATCTTT
81 ACAATTTATATTGTAAATGATTTGTATCGTATGATTAAGGATCTAAGGCACAATATTTGTCACTGTTCTATTAGACTTTT
161 TACTGAAAATGAATAATGGTGTAATGGTTCTCCTGGGGCTGTCACATTTTATAGGTCAGAGTGTGACTTCTTAATATGGT
241 GCTGATGTTTTTGTGTCAATGGCTTGAAACTGGCAAGATTAACAAAATTAGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATC
321 CCAGCACTTTGGGAGGCCCAGGTGGGCGGATCACCTGAGGTTAGAAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCT
401 GGCCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGGGTACCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAG
481 GAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCTATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCA
561 A GACGCCATCTCAAAAACAAAAAAACAAAATTCATGTTACTAAAAGACAGGTAGCCATATACAGACAGTATATGCCCTAT
641 TTTTTTTAACTGACTCTTAATGAAACTTTAATTTTACTTAATTAAGAAATGGAATTTATATACAAAAATATTTTCCATTT
721 CCGTTATTATGCTAATTGTTGTATGAAATAAGTGCAATTATACTTCTCTTTTGAGATATCCAAGAGTATATTCTTGCTCT
801 GTATAGAGAATATCATCTGATAGTGTCTTATTTATATTAATTAATGTCTTTGAAAAGGGAAAAGTATAAACTGGCCTTAA
881 AATTGTCCAATTATAGTTTTATAACCAGTCTATTAAAGGTGTTTGTTTAAAATGGATATAGTTTTAGATTTGTGGTAATG
961 CTTTGGTATTTTCTTGGGGAAGACCTTCACCTTTGCAAACTTCCCTCATGTAAGGAAGGTACTTTAAATGTAGCAGCCAC
1041 TGACATTTCTTTTTTTAAAAAAAATTTGAGAAGTCTACTTCCTTTTAACTTTTTTGGTCTTCAGCTAAAAAATAGGATAA
1121 GAAATTAAGGTCTATTCCATTCTCCATATCCTGGGTAAGAATGTAAATAAGAGGAGAAGGAAGAGTCTAATAGTAATTAT
1201 GGATATAAAAAATAAGAAATTTTGTATAGAAATGAAGGTTTCATAATGATCATTTTGTTAAAGGTCTACTTTAATCAGAA
1281 ATAGCAACGAGATGAATGTATCCAACATTTCAATTTGCATTCGGAAATCCATGTTGTTTCTAATATTGTCCAGTTGAAAA
1361 CTGTATGCCAAAATTAGTTGTTTAAGTGAAGTTTTGTGACAGAAAAAAGGTTGTTTTAATATCTACTTGGTTTTTCTCAA
1441 AATGGAAATAATTTTAAAATCAGGAAAGAATAAATCAGCCAGGTGTGATGACTTGTAACTGTAATCCCAGTTATAGGGGA
1521 GGCTGAAGCAGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGATCCCATCTCAAAAAACA
1601 TTATTTTTAAAATTAGCCTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGCCAGATCACCTGAGGT
1681 CAGGAGTTCGAGACCACCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACAGTTTTGTAAAAATACAAAAAATTACCTGGGC
1761 CTGGTGGCACACGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAGCCCAAGAGGTGGAGGTTAC
1841 AGTGAGCAGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGGCAGAGCAACACTTTGTCTCAGAAAAAAAAAAAAAAACCAA
1921 AAAGCCAAGTGTGGTGGTGTGCACCTATAGTCCCAGCTACTCAGGAAGCTGAGACAAGAGGATCAATTGAGCCCAGGAGT
2001 TCAAAGCTGTAGTGAGCTGTCATTGTGCCACTATCCTCCAGTATGGGTGACAGAGTGAGACCTGGTCTCTAAAAAATAAA
2081 ATAAAATAAAAAAAACAGGTCAAATAAATGCTGTTGTTGTAAAATTTCAGATAATACAAAGAGTTAACCAATAAAAGAAA
2161 AAGTCATTCATAATCTTACCACTATTAACATTTTGATGTATCTATCTGTATGTATGGCTATTCTTTTTTGTTAAAACATG
2241 ATCATAGCATATCTACTATTTTATTATTTGATTTTTAAAATTTAACATTATATTATGGGTAACCTTACATGTCAATAAAC
2321 AATTCCACATTGTCATGCTTTAAATGGCTGCATAGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCTACCACTTTGGGAGG
2401 CCAAGGCAGGTAGATCACAAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCTCATCTCTATTGAAAATAC
2481 AAAAATCAGCCAGGCACGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCACCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTGAACCCAG
2561 CGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATTGAGCCACTGCACTCCAGCCTGGTGATAGAGCGAGACTCTGTCTCTAAATAAAT
2641 AAATAAATAAATAAATGTCTGCATAGTATTCCATTGTATGCATTTATTATACATTCAAACATTAAACATCTACCATACCA
2721 ATCATGGTTCTAAGCATACAGTAGCCACCTTCATGCTTCCTTGATTGGGCTTACAGTCTAGTAAGGAGACAGATATTAAA
2801 TAACTGCATAAAACACTGTTCTTGGTAGGTAATAACCCAGATGCTATGAGCCATCCAGTAAAGGTTACCGATCTTATCTG
2881 GAAGGATCAGAAGATGGATGTCCCATAATTTAACCAATTATCTATTGATAGGCATTTATTGAGTTTTAAATGAATAATGA
2961 CATGATCAATAAAAATGTCCTCCTCACTTAAAGAATAGAAAAACCAGGAGAAGGGAGTTCTGAAATAAGTAAGTATGTAG
3041 GTCCAGCATCAATGGCTCAAGATACTCTATTCCCAAATAACCCTTAAGTTATCTGGTTCTATTCCAACCCTTGGGTATTA
3121 CTATCTTCTCTTTGGTCTCATGCATTGAGAATTCAGCAAAGGATTTGTTCCCTACAGTGTGCACGGCCCTTAGGATAGCA
3201 GGATTCCCTGAAGAGGGCCAAAGGGGCAGGAGCGCAGCCTTAGTGGCAGTGCTGGTCCATGAGGCTCTACAAAGCAAGGG
3281 ATGGGTGTTTGGGAGGAGGAAAAGGCTCTTGCTGTACTCCTAGAGGTTGGAATTAAAGTGGAAAAGCCAGAAAATTCAAG
3361 TCCTTTACTAACATGTCTGGAGATTAGAAGGTATATGTACATGGGGGAGAAGCCAAAATTATTGCTGCGAGTGGTCAGCA
3441 AGAAAATCAAGGCTCTTTTCATTATTTTGAGCATTCCTCTGATATTTGAAAAGGAAGTACAACAGGAAAGGAAGTCTGAG
3521 GATGGAAGCTAAAATTGGTATGAATTTATATTTTAGAGATCAAAATGTACCTTATGTTGAAACCTATGTAAGAAGTGATT
3601 ATGTAGAAAGAGTGAAAGTGATAGCTCTTAGTCTGGAAAGCCCACTGGCTTGTTTGGGCATTTCTCATGGCTTCCCACTC
3681 AAAGTGGATCCCCAAAATCACTTGATGGATTTCCTTGCTGATTTCTAAGTAAACTATGGTTTAAGAAAGAAATGACAGGG
3761 CTCAGCACTGCCCTACAGTACCAAGAATACAAATGTTTCCATGAAGTCTTCAAAGGCATTTGTAAAATTCAGGCTGTAAG
3841 TGATTAGTTAGTTCATTCTGCACTTATTTATTAACTGTATATTCAGTTCCAGGCTCTAGGGTAGAGATTATGGATAAAGG
3921 TGAATTAGATAGATGAAGTTTTTGCCCTCACAGCAAAAGCTTTAGCCAATAATTAAAGCTATCACTGGAAGTGGGTCTGT
4001 GCCAATAACCTAGAGAAGAGCAGTGCTTTTAGAGTTGAGCTATATTCCCAATCAGTTCTTAATGGTGGTTTTACCCCCTT
4081 CCCTCTACACTGTCTTTTCTTGAGATTGGATCATGTGTGTGAACCCACATCATTTCCAGTCAAAATCACCAAGAGAGGCC
4161 GGACACAGTGGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCTAAATGGGTGGGCCTCTTGAGTCCAGAGTTTGAGAC
4241 CAGCCTGGGCGACCCCAGCTCTACCAAAAAAACCAAAAAACAAAAAATACCAAAAAAAAAAAAAATTAGGCCGATGAAGT
4321 GACATGCACCTGTGTGCCACCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGCAGGATCACTTGCATCTGGGGGCAAAGGCTGCCGTGAGC
4401 TGAGATTGTGCCATTGCGCTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
4481 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACACACACACATATATATACACACACCCCCAGGAGACCTTTTGTCTTTCTTGG
4561 TTCATGTGCCCATCAGTGTGGGCAGGAGAATAGAATACTCTGTCCACACTTGAGTCTTAGTCACCTTTGGAGCCTAGGAG
4641 TCAGCCATCCTCATTCAACTACATGGATCGAGAATGGGAATCTGGGAGAATTTTTTTATGGGCAGATTAAAAAGGAAGTT
4721 AACTATGTAAAGTAAGGCATTGCCTTCCCACCCCATCCCACCTCAGTTCGTGTTAAATTATGAATTTTTCTAAGAGAGTT
4801 CTTTAATGACATGGATAGAGAGGAAGCTGAGGTGGCAGTAGAGTAGGGAGTGGAAGGCAAATACATAAGATACTATTAAA
4881 CTGTGAAGCTGTTTGTTACAATTCCAAGATTTTATAATTTCTCCAACAAAAAACATTTGTATTTTCTTCCCAGTTTAAGT
4961 TCAATGTTAATTTGAGAAATAATTCTACTCTCAAACTTCATGTTATGCTGACAGTTCAACTGATGCTGTCAAAATGTGAA
5041 TTACTAACTTCAGTATTCTCTATTCATCTGATTTTTCTTAAAATGTTTGCGTGTTAATATACTCACTAGCTTTAATGCTC
5121 TACTCTTATACTGGCACCTTAATTATGGTAAAAGGTAAAAGGTTAAGTTAAAATTCCCAATCCTAGTTATTTGGTCAAAC
5201 AGAAGATTAACAGAACTCCATGGCTTACCACAGGAATATTTATCAAGAGAAAAAGAAGATACCTATTTGAATTTACATGA
5281 CACTTTCTGTGAAATATCTGGATTACCAGATTAGTCTGAAACAAATGCCTTCCAAATTCTACAGCGCATGCCCAAGGCAC
5361 TCTTTACAGTACCTGTTCGGGTCTTTTCTTCTAATTTTAAGCACCTACCCAAACGTCTTCCCAGGCTTGTCATAATAAGC
5441 AAATAACCTCAGAGCAGACAAAGTGATTCAATCTAAGAACCTTGAATTTCTCTCCTTTTCACCTCAAAATTTCTATTCTC
5521 ACACTTTCTTTTTGTTTCTCTTTCCGAGAAGTGGTTCTCCATCAGCAAATACCAACTGTTTTCTGTCCTCTATTATTTAT
5601 TCCATCTCTTCCTCCTGATCCCTGCCCCATGTTGAACCCCCATTGCCCCACTTTGATCCTTCAGTCTCTTCCTCACATCC
5681 AGAACTGTACCAGATTTACTCCCTTAGCACACTGATTAAAATTTATTTCCATTTCCTTATGGAGGAGGTATTAGAGACTG
5761 ATCCCAGACCTCTACAAATTTCATTGTGGCAGGGTAATGTTATGTGTCCATAAACCTTGTTCCTTTTCTTTCAGCCTGCA
5841 GTTAGGTAGAGCCATGTCATTTATTTGTAACTATTAGAATATGGGTATATGGGTTGAAGTAATGTAGGCCATTTCCAGAC
5921 ATGGCCCATAACACTTCTCAAGAGATTCTTCATATTCTATCTCTTCCCCTCCAACATGCACCCTTCAAGGTTGAAGATGG
6001 CACCACACAAGATAGAAGGAGCCAGTGTTCCAAATGACTAGGCAGAGCAGAATGCTCCCCTCCCTACACCCTAGCACCAA
6081 TTGGTTTGGATGTGATAGTTGAATAATACACTTTTATTGTTTTAAGACATTAATATTTTGAGATTAATCTGCAAGTCTAG
6161 TTAGTAAAACTCGAACTCTGAGCTGTCTAATGCAGTAGCCTCTAGCCACATGTAGCTATTTAAATTTAAATTTTAATTTT
6241 AATTAATCAAAATTCAACTCAGATATACTAGCCACATTTCAATTGCTCAGTAGCCACACTAATTAAATTTAAATTTAAAT
6321 AGCTACATGTGGCTTATAGCACCATACCAGATAGCACAGATGTAGACTGTTTCCATCATCACAGAAAATTCTATTGGATA
6401 GTGCTGCCTTAACTAATAAGACACAAATGTTCTTATTTTTTAAATAGTCCCTAAAACAAACGAAAAACAAAGAACTCCCT
6481 TCTCTAATGGCAAATTTCAGTTTGCCTAAAAGAAGACTCAGAATGCTTTTCTTATATTGTTACCTCTGACTGCCACTAAA
6561 TGAATAAATTTCCTGTCTTGCTCCTTCTGCCAAACTTCTTGAATGGGTGATCTTTAACTCCTTGCAATCCTGGCTTTTTT
6641 CCCCAGTGCTCACCTGTAATCAGTGTTGGCCACAACTCCCACCCAGATGTCTCCTAAATAGTTCTCTGAACCCACCTCTG
6721 TCCTGATCTACAGACATTCATTCCAATGCTTTAGCATTTCAAGGTCATCAAATGACTCAGTGACATCTCAGACAGTCAGA
6801 CAGACCAGGTCAACTATGAACTATTTATGCCAAACCTTACATGGTTCATGTTATCCTTGCTATCCCATCAAAATAACCAC
6881 AGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTTGAGATGGAGTCTCACTCTGTCACCCCGACTAGAGTGCAGTGGTGCGATCT
6961 CGGCTCTGCTCACTGCAACCTCCGTCTCCTGGGTTCAAACAGTGCTCATTCCTCAACTCCCAAGTAGCTGAGATTACAGG
7041 CATGCACCATCACGCCTGGCTAATTTTTCTATTTTTAGCAGAGATGGGGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAAC
7121 TCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTCCACCTCACAAAGCTTTGGGATTACAGGCATGAGCCACGGTGCCTGGCCTGCA
7201 GCCTCCTTTATTTTACAAAAGGCATTACCACTTAAACACTGAAGATAGCACGAATCTCTGATGTTTGCAAGTTCAGAATA
7281 AAATGGAAATGAAAATTCATTATGTGGCAGTCTCAGTACTGAGCACAAAGGCTTTTAACCACAAGCAAATTACTGTGCTA
7361 GCCAGACCGTGTGAGAGAACTCCAGGCCAGCTTGCTAAAACTGAGCAGGAGAATTTGGAGAGAGTCCAGAGGAGAGCCAC
7441 AGAAACAACTGAAGCATGACAAGAATAATTGCAGTTCTGTTATAGAGAGGTCATCTATATCAGGCTTTTATGGAGTACCA
7521 TGTGGAATGTTACCACGCAGAGCATGGGGAACAGCTGTTGTGACTCAACAAGAGACAGGACAGAAGAAATGAGAACAGGT
7601 GGAAGATCAATAATTTAGGTTTGATATGGGGAAAGATGGAACAGTCAAAGGGATTCACACTGATTTTTGGCTGAGCAGAA
7681 GGCAGAGTCTCCTCCAACGGGCAATGTAAGTGCCCCCACTCATCTACACCCCGAGAAGAGCCATCAAACTGTATTAAACT
7761 TGGAAAAAGCTATTTAACTTCAAGTGTGCTGCGAGAAAACTTCATAATAGTTCCTAAGATGTGCTAAAAAGTAAAGTCCA
7841 AAAAGATCATAAAGTCTGTAGAGAAGTTCTAAGAGTGCAGTCAGCTATAAAAACCTAGCAATTTAATTTCTTAGAAAAAT
7921 GTAGCTGGAGTTCAAACTGTAGTAACAAAGGCAAGTAAATTAAGTTGTGGGCAGGTGTAATTAAGTTAATAGGAATGGCA
8001 GGGATGAATATAAATCAGAACAGGACTAACAGTTTGAAACATTAGATATTCAAATGCTCAGAGCTGATGAGCCGAGCCAC
8081 TACGCTAACAACTCTGCAAACCAAAGGTTTCACAAATTGCACAAGAACCTGGCCTCGATCCCATTGTGTTGCTGGCATAA
8161 GATTAGAAGGGCCTGTTGGTTCAATTGTTGCTTTGGACAGAGGAGGACAAACTTGCCACAGTGAAGAAATCATTTTTAAA
8241 AACCACCACTGTCCTTTAGTGCACTAATTTCTCTAATAACTAGGTGTATATTAGAAATAATGATATATAAGTGCAGTATA
8321 CTCCAGTTTCAACAGAATGGTGTCACTTCTGTAAAATGTTGATTTTCAGATTGTCATACTTTCTAAATACAAAAATTTGT
8401 CACAGCTTCCACATTTACAAGATATTAAACATTCCATAAAATATTTGTAGAAATATGAAAAACCAATTTTTGTAGTTGCC
8481 TTTTGAAATGTATACAAAATATCCCACATGGGCAACATGGTAAAACCTCGTCTCTACAAAAAAAAAAAAAAAAATACAAA
8561 AAGTTAGCCAGGCCTGGTGGTGCACGCCTGTGGTCCCAGCTACTCGGGAAGCTGAAGTGAGATCACCTGTGCCCAGGAGG
8641 TCGAAGCTGCAGTGAGCTGTGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTTTGTCTCAAATAAACAAA
8721 AAGAGACATATACAAAATATATTAGAAAGTTGGGTTAATATCCTACAAACAAAGTATTACATAGTTTGCACAGGATTATG
8801 TGTGTAAAAAGTTTTAAATTCAGTATAGCTTTTATTTCTGCAGAACTAAAAGTAGTGCATAAAAATAAAAGTGGGATGAG
8881 CATATCTTTTTAATTTGCTATGCAGTAAAAAGTATCTCAGTCAACATATAGGAAACCAGTGCCATTTCTGTATCATTTGA
8961 CACCGAAGGGGTATTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTCTTTTGAAGAAAGACTTTTATGTCTTTTATTCTATTCTTCCG
9041 ATTTGGGGTTTAAATTACCCCCAATAAGTTTGCAGAATATTCTGATTACTACTGCTTAGGTGATATATTTCATATGAGAA
9121 CTATCTTTACACAATGGGAAAAAATATGGTAACCACTTCATTCATCAGAGAAGTTGTGTTTTGTTTACTTGTATTTTGTT
9201 TGCTAAATGAAATTGGTTATTTAGACTCATGGCATGCTTTTTCTCAAATGGAGATTTAAAAGTCATTTCCAATGTCCTTC
9281 TAACTTCTGGCCAATTCCCAGTAGGCTATAGAATAAACAGTTTTCATATAATAAAAAAAAAAAAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' cgaaagagccUCGAGUCUCGUu 5'
| |||||||||
Target 5' taagcaaataACCTCAGAGCAg 3'
|
5436 - 5457
|
152.00 |
-15.00 |
2
|
miRNA 3' cgaaaGAGCCUCGAGUCUCGUu 5'
|| || | |||||||
Target 5' ccagcCTGGGCG-ACAGAGCAa 3'
|
541 - 561
|
148.00 |
-16.40 |
3
|
miRNA 3' cgaaaGAGCCUCGAGUCUCGUu 5'
|| || | |||||||
Target 5' ccagcCTGGGTG-GCAGAGCAa 3'
|
1868 - 1888
|
148.00 |
-17.10 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|