pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-3140 |
Genomic Coordinates | chr4: 152489327 - 152489416 |
Description | Homo sapiens miR-3140 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-3140-5p | |||||||||||||||
Sequence | 12| ACCUGAAUUACCAAAAGCUUU |32 | |||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | NEGR1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | DMML2433, IGLON4, KILON, Ntra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | neuronal growth regulator 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_173808 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on NEGR1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of NEGR1 (miRNA target sites are highlighted) |
>NEGR1|NM_173808|3'UTR 1 ATTCAAAGACCCATAAAAGGCTTTTAAGGATTCTCTGAAAGTGCTGATGGCTGGATCCAATCTGGTACAGTTTGTTAAAA 81 GCAGCGTGGGATATAATCAGCAGTGCTTACATGGGGATGATCGCCTTCTGTAGAATTGCTCATTATGTAAATACTTTAAT 161 TCTACTCTTTTTTGATTAGCTACATTACCTTGTGAAGCAGTACACATTGTCCTTTTTTTAAGACGTGAAAGCTCTGAAAT 241 TACTTTTAGAGGATATTAATTGTGATTTCATGTTTGTAATCTACAACTTTTCAAAAGCATTCAGTCATGGTCTGCTAGGT 321 TGCAGGCTGTAGTTTACAAAAACGAATATTGCAGTGAATATGTGATTCTTTAAGGCTGCAATACAAGCATTCAGTTCCCT 401 GTTTCAATAAGAGTCAATCCACATTTACAAAGATGCATTTTTTTCTTTTTTGATAAAAAAGCAAATAATATTGCCTTCAG 481 ATTATTTCTTCAAAATATAACACATATCTAGATTTTTCTGCTCGCATGATATTCAGGTTTCAGGAATGAGCCTTGTAATA 561 TAACTGGCTGTGCAGCTCTGCTTCTCTTTCCTGTAAGTTCAGCATGGGTGTGCCTTCATACAATAATATTTTTCTCTTTG 641 TCTCCAACTAATATAAAATGTTTTGCTAAATCTTACAATTTGAAAGTAAAAATAAACCAGAGTGATCAAGTTAAACCATA 721 CACTATCTCTAAGTAACGAAGGAGCTATTGGACTGTAAAAATCTCTTCCTGCACTGACAATGGGGTTTGAGAATTTTGCC 801 CCACACTAACTCAGTTCTTGTGATGAGAGACAATTTAATAACAGTATAGTAAATATACCATATGATTTCTTTAGTTGTAG 881 CTAAATGTTAGATCCACCGTGGGAAATCATTCCCTTTAAAATGACAGCACAGTCCACTCAAAGGATTGCCTAGCAATACA 961 GCATCTTTTCCTTTCACTAGTCCAAGCCAAAAATTTTAAGATGATTTGTCAGAAAGGGCACAAAGTCCTATCACCTAATA 1041 TTACAAGAGTTGGTAAGCGCTCATCATTAATTTTATTTTGTGGCAGCTAAGTTAGTATGACAGAGGCAGTGCTCCTGTGG 1121 ACAGGAGCATTTTGCATATTTTCCATCTGAAAGTATCACTCAGTTGATAGTCTGGAATGCATGTTATATATTTTAAAACT 1201 TCCAAAATATATTATAACAAACATTCTATATCGGTATGTAGCAGACCAATCTCTAAAATAGCTAATTCTTCAATAAAATC 1281 TTTCTATATAGCCATTTCAGTGCAAACAAGTAAAATCAAAAAAGACCATCCTTTATTTTTCCTTACATGATATATGTAAG 1361 ATGCGATCAAATAAAGACAAAACACCAGTGATGAGAATATCTTAAGATAAGTAATTATCAAATTATTGTGAATGTTAAAT 1441 TATTTCTACTATAAAGAAGCAAAACTACATTTTTGAAGGAAAATGCTGTTACTCTAACATTAATTTACAGGAATAGTTTG 1521 ATGGTTTCACTCTTTACTAAAGAAAGGCCATCACCTTGAAAGCCATTTTACAGGTTTGATGAAGTTACCAATTTCAGTAC 1601 ACCTAAATTTCTACAAATAGTCCCCTTTTACAAGTTGTAACAACAAAGACCCTATAATAAAATTAGATACAAGAAATTTT 1681 GCAGTGGTTATACATATTTGAGATATCTAGTATGTTGCCCTAGCAGGGATGGCTTAAAAACTGTGATTTTTTTTCTTCAA 1761 GTAAAACTTAGTCCCAAAGTACATCATAAATCAATTTTAATTAGAAAAATGAATCTTAAATGAGGGGACATAAGTATACT 1841 CTTTCCACAAAATGGCAATAATAAGGCATAAAGCTAGTAAATCTACTAACTGTAATAAATGTATGACATTATTTTGATTG 1921 ATACATTAAAAAAGAGTTTTTAGAACAAATATGGCATTTAACTTTATTATTTATTTGCTTTTAAGAAATATTCTTTGTGG 2001 AATTGTTGAATAAACTATAAAATATTATTTTGTATTGCAGCTTTAAAGTGGCACACTCCATAATAATCTACTTACTAGAA 2081 ATAGTGGTGCTACCACAAAAAATGTTAACCATCAGTACCATTGTTTGGGAGAAAGAAACAGATCAAGAATGCATATTATT 2161 CAGTGACCGCTTTCCTAGAGTTAAAATACCTCCTCTTTGTAAGGTTTGTAGGTAAATTGAGGTATAAACTATGGATGAAC 2241 CAAATAATTAGTTCAAAGTGTTGTCATGATTCCAAATTTGTGGAGTCTGGTGTTTTTACCATAGAATGTGACAGAAGTAC 2321 AGTCATAGCTCAGTAGCTATATGTATTTGCCTTTATGTTAGAAGAGACTTTCTTGAGTGACATTTTTAAATAGAGGAGGT 2401 ATTCACTATGTTTTTCTGTATCACAGCAGCATTCCTAGTCCTTAGGCCCTCGGACAGAGTGAAATCATGAGTATTTATGA 2481 GTTCAATATTGTCAAATAAGGCTACAGTATTTGCTTTTTTGTGTGAATGTATTGCATATAATGTTCAAGTAGATGATTTT 2561 ACATTTATGGACATATAAAATGTCTGATTACCCCATTTTATCAGTCCTGACTGTACAAGATTGTTGCAATTTCAGAATAG 2641 CAGTTTTATAAATTGATTTATCTTTTAATCTATAACAATTTGTGTTAGCTGTTCATTTCAGGATTATATTTTCTACAAGT 2721 TCCACTTGTGGGACTCCTTTTGTTGCCCCTATTTTTTTTTAAAGAAGGAAGAAAGAAAAATAAGTAGCAGTTTAAAAATG 2801 AGAATGGAGAGAAAAGAAAAAGAATGAAAAGGAAAGGCAGTAAAGAGGGAAAAAAAGGAAGGATGGAAGGAATGAAGGAA 2881 GGAAGGGAGGAAGGGGAGAAGGTAGGAAGAAAGAAAGGATGAGAGGGAAGGAAGAATCAGAGTATTAGGGTAGTTAACTT 2961 ACACATTTGCATTCTTAGTTTAACTGCAAGTGGTGTAACTACGTTTTTCAATGATCGCATTTGAAACATAAGTCCTATTA 3041 TACCATTAAGTTCCTATTATGCAGCAATTATATAATAAAAAGTACTGCCCAAGTTATAGTAATGTGGGTGTTTTTGAGAC 3121 ACTAAAAGATTTGAGAGGGAGAATTTCAAACTTAAAGCCACTTTTGGGGGGTTTATAACTTAACTGAAAAATTAATGCTT 3201 CATCATAACATTTAAGCTATATCTAGAAAGTAGACTGGAGAACTGAGAAAATTACCCAGGTAATTCAGGGAAAAAAAAAA 3281 ATATATATATATATAAATACCCCTACATTTGAAGTCAGAAAACTCTGAAAAACTGAATTATCAAAGTCAATCATCTATAA 3361 TGATCAAATTTACTGAACAATTGTTAATTTATCCATTGTGCTTAGCTTTGTGACACAGCCAAAAGTTACCTATTTAATCT 3441 TTTCAATAAAAATTGTTTTTTGAAATCCAGAAATGATTTAAAAAGAGGTCAGGTTTTTAACTATTTATTGAAGTATGTGG 3521 ATGTACAGTATTTCAATAGATATGAATATGAATAAATGGTATGCCTTAAGATTCTTTGAATATGTATTTACTTTAAAGAC 3601 TGGAAAAAGCTCTTCCTGTCTTTTAGTAAAACATCCATATTTCATAACCTGATGTAAAATATGTTGTACTGTTTCCAATA 3681 GGTGAATATAAACTCAGTTTATCAATTAAAATATGTATTTGACTCATTTTAAAACTCTATTAGCTTAAGAGAAAGAAGGA 3761 AGAAATAATAATTTGAAGATATTTCTGCTATTCTCTTTATTTCCTGTATTACACTCATCTTTCTGCTTACTCTAAAGCAG 3841 TACAGGGTAAAAATTCTAGATGCTACAGTTTCAAATGACTCCACACTATATTCTTTCTTGCTGTTGCTGATTCCTAAAAG 3921 GTTTGATGAGCTGAACTACATCTAAACTAAAAATAAATTTTCTGGAAACATTTTATTATTAATTATTTAGAACCTTTACC 4001 TGGTAAAATACAGCAGAGTTAGCAACAGAGACTAAATATCCTGTTGATAAAATCCTGATGATCTTACAGGCTAAACAACT 4081 GAAAACTCAAACGCTTGTAAGAGCCAGGCAGAGTGTAATTTCTTAACAGCTGGGTATAAAACAACGGGCACCTGAAGGTA 4161 TTCAGATACAATTTCCTTAAAAATACCTTGGTTTCCAAGCAAAACACGTTATTTGGCTGAGAACCTTTAGTTTGTAAATA 4241 CCAAACCATAATATACAAATGAGATCTCAAGCCAAATGAATTTTTTAAGCCCTCTTTCCCATATCTGTTCATCTATGATA 4321 GTCAACTGAATAAATGAGAACAATGTGATAGATAAAACAACAAAGCATAAAAAAGATTCATGCTTGGTTTTATAAGCTAT 4401 TTTGAAATATAAGTATCATTGCTATTCTGAGAAATCTATATACACCAAAGCCCTCCCTCCACAAAAAAACTGGAAATGTT 4481 CTAATAAATGTCTGATTTCCCCCA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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