Gene Symbol |
CELF2
|
Synonyms |
BRUNOL3, CELF-2, CUG-BP2, CUGBP2, ETR-3, ETR3, NAPOR |
Description |
CUGBP Elav-like family member 2 |
Transcript |
NM_001025077
|
Other Transcripts |
NM_001025076
,
NM_001083591
,
NM_006561
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on CELF2 |
|
3'UTR of CELF2 (miRNA target sites are highlighted) |
>CELF2|NM_001025077|3'UTR
1 TCCTAACCCCAGAGGCTCCCTGCTCTCATTTTAGCTTTCTTAGGGTAAGTCCCACGAGCCAGCCTGTCTCAACAGGGAAG
81 GCAGAGGAGGACCACATTGCCAACTTTTACCAAGAGAGACGGTTATTTTTACAATAAGGCCTCCATGTCCCCACCCACTT
161 CCCCTACCCAGTTTGCCATAATTAAAACTTGGGCTACTTTGTTTCTATTGAGTAATTCCTCCTCCAGTTGTGCCACTGTA
241 TTCTCCTTTGTTTTGCGATTTGAATCTCCTTTTACCTTTTTTTTTAATTTTTTTCATTTTTGCTTTTTTTTAAAGAGAAG
321 CATATACACAAATAAATGGCATCTTGAGAATTTAAAAGGCAAACAAACAAACGCTAATGTGCAATTCTAACTCTGAAACC
401 ACTGGTGCCCCGAGAGCACTGCCTGGAGAATTCACCCCTCCTTGCCCGGCGCCCGCCCCCGGAGGGAGGGCCCGGTGCTT
481 AGAGGTTAACTTGGTGGCCTAGGAGAGGGAGAAGCCAGGAGAAGCACTTACTCCAACCACACGTCTTTCCACTACATCGG
561 CTTGTTTTACTAAGTAGGATTTTATTTTAGGGTTCAAAGAAACATGACATTTATTGGTCAAAATATTACACTGGTTGTCT
641 ATTTTGTTATTGTTTTATTTTAGTTTTTAGAAAGGATTAATGTACAAAAAGATTTAGAGATCTGTTTCTTAAAGCTACAG
721 GGTTTAAAAAATAAAAATGAGTGAAAATACTTGATGTTTCTTGAAAGATAAATTTAATAATAATAAATAAATACATAAAT
801 ACATAAATAAAAAAGAAAGCCACAGGCCTGTAAATTTTATTTGTAAAAAAGCATTTCTATTTTTATACAAAATTTTTACT
881 GCCTCAGAAATAATGGAAGTTATTTATTGCCTATTGTTAACTTATTGGGTACCTAAAGAGCAGTTCTCTGTCTAGCTAGA
961 ACCTTCTGAAGTAGTCTCTAGAGGAATTGTTCTAGGAATGGGCTTTTTTTCACCGTTGAACCCTAGACCTGAAGTTCATG
1041 CTTTATCCTCTCGTTGTTTGTATCTGTCTGATTATTTTGTTTGTAACTTCCATTATCTAGTTTACAGTTCAGTCGTCTGA
1121 CTTTCCCCGTATGTCACATTTGTTGAAACTGGACCTTCTCCCCCTGTCCCTCACCCCAAAACACCCGGAATCCATCCCCT
1201 TTCGCTCTCTCCAGATGGATTCTCTTGGGGTTTCATTGTGCTGTGGATAAGGAGTGTAAGAAATGCAAATTATGTGAATG
1281 GCTCGGAGACTCCCTAATGACCTAAGATTTGCATTAGTTTTTCTCCTGCACCCTTAAAAGTGATTTTGTTGCCGCTGCAT
1361 AGATTCTGTGTAACTTTTTACTCTTCCTTGTTTTTTCCCTAGACATCTTCATGCCCGTTAGTTCATCGTTTGCCTAGCAT
1441 GTCCCTGTGGCGTCTCAAAAAAAAGTTTCATCGTCCCGTCATTGTTTCTGATGTCTTTCTGACCTCACATCATATTTGGT
1521 TCTCCTACTGACCTTTGATCTAGTTTGACCTTTGAAATTTGCATGTGACCTCATCTAGCTATGAATTCTGGGAAGTCAAT
1601 GTGAAAAACATTGCTGCATTCATGCAAGACTGAAATTTATTATTAGACAAATTCATTATAGAAAAAACCTGTGGCAAAAA
1681 CGTTTCTTTCTTATTTTTTTTCTTTTCCTAAAACAGACTTGAAAGTATTATACAGGGATTGGCATTCTTCCCGGTCACTG
1761 GTAACAATAGCAATATGTGTCCAGGGACACAGAATGTTGGTTTCTAACAGACTACTTCCAAAAACAGTTTGAGAAAAAAA
1841 CTGTCTGATTTTAAGTCTCTAGAGGTCTGTAATAGTTTTTACATTTTTCAGGCAGTGTAAAGTTTTTTGATAAGGCCATT
1921 TTAGGTGGCTCACTTTCTCATTAAGATATATATATAGAACCACTTTTTGTAGATTAGTATAAGAAAAATATTTACCCTGT
2001 TTTGGGGCAAATGCTACCTATTTGTGTCACCTTTTGCTGAACTCACAGTTAGACAATCCATGGTTTAATGCACATGAAAT
2081 TACCTATATTTTATACTGTTTCAATGTACAGGAGAAAGGTTACTGTAAACTGTGTTATGTTGGTGCTTCTGTGAATTAAG
2161 TTGTGGTTTCATCATGAGTCTTAATGTTCTTTGTTGATAAGACAAGTTTAGAATTGGTTTACTTAATACAAAAAAAAAAA
2241 AAAGAATTTCAAAAAAAAAAGTTGTTTGCTTAAAAAAAATTTCATGTGAGGGAAAAAAAAAAAACCTATTCCAGAATAAG
2321 TTTTGTGTTGGCTTGTGAAGCATTGATGTCATTTTTTTTAATTGTGGACTATTTAGATGTGTTTGTGTTCAGCAAAATGT
2401 GATCTGTTTTTTTCTTTTAAAGAAAAAAAGTGAAAATATATAGTGCCAAATTCCAAAGGTACTTCCTTCCTAGAGCTTCA
2481 GTGTGTTTCTTGTGAGAAGTAATTTGATAACATGGGTATTTTATTATGTGTTTTGTATAAATCCCTAATATTTAAAAAAA
2561 AAAACAAAACAAAAAAAGGTTACAAAGTTTGTTAACTTGCTATCCTGTGGTCTTGTTGCCTGAAATTGTTATTGTTTGTT
2641 ATTTCTCTCTGATGTTTTTTGTAAGACATTGTATAAGTGCCCATGTCCCACTTTTTTAACCACTCCGCACATCAGTGCTG
2721 TGAAGGCAACCTCACCATGTATTTTCTTCATAATCTATGGAAACCTCTAAGGTGAGAAAGTTTTGAACTTTTAACCCTTT
2801 CTACCCAGAGCTATCTGGAATGTTGATGACTTTTTATACTGTCATGATTTGAGTTTGTTTTGGGGTGTTTCCAATTTGGA
2881 TTTTTTTCCCTGCATCTATCCTCTAAGTTGTTTCGGTTTGACTACTTTGTTCTTTGGTTAAGATCCAAAAGAAAACAGAA
2961 AACAATTCCACGAGGCCAATCTAAAGGGAAAAAATCCTACACTACTTTTACTACTTTTGATTATTTCTCATTTTTGGGAA
3041 AAGAATTCCTAATGTGCTACTAGAATTCCTTCTTCAGTTTTAACGAGTAATTGGATAAACCCTGAGGGAAAACGGAGGTA
3121 GATTCAGCACCTAACAATCCTGTATGCTTTTGAGATCACGTTTAGTGCTATGTCCTAGTCTAGAATATTTTCATATACCT
3201 TGCAGTAAAACGACTTTGTGGCAGGACAGTCTCTTGAGGGGTTTTGTTTCTGTTTCCTAAATACTCCTAAATAATATTTC
3281 TAATCAGCCATTATGCTGGGGCATCTCTGATCCCAGTAGGTACCTCTGAATATACCAGGTGTCTGGAGTTAGAAGCCCAT
3361 AGCCCTTTCCCAGCCTTTTTGGTTTTTTTAATTGAACACATTTCATCTAAGTAAAGCTCAGTTCTTTATCACAATTTACT
3441 GACCAAATACCTAGCACCAGTTCCTGCTGCCACTTTTTAAAGTGCCATATGACTTTCTACGAACAGGTACCTTGCTGTCT
3521 TGACAAATCCTAATGTCACGCCTACAGCCCCAACACAAGCTCCAGTCTTCCTCTTCGGCATGCCCTGGAAGCTTCTTGGC
3601 CTCAGCTCCCCTTCCCCGCTCAGCACCCTGTTAGGATCAGTGTGTGTGGATGGGATAGCCCTGGGATGGAAAGGACTAGC
3681 CTCTACTGATGCAAAAAAACAAAAAGCAACACAAACGTTTCCTTCTTATAGCACATGCACTTCCTTACAATGACATGATT
3761 TGTATTATCCTCACATGTGTTTACTACTGCTGGGGCCTTCCTTCATCCTCTGAGGGCTATTTTGTACTTTCTGCAGCAAT
3841 CAGCTTAATAACAACACTTATTGCACCTGTCTCTCTCTGAGAACACGGTGTGTCTCGACACGTACCACGTACGTGGAAAC
3921 ACAAGAGCCCACCACTTGAATTTCTAAGACCATTTCATTCTGAAACTTCTTATCAATTACCTAAATCTCAACGAAAAACA
4001 ATTTACTGAAGCCGACTCCCCTCCCCATCTCCCTCTCAACCTCAACCCACCTGCATGCATCTCCCCCAGAGGAAACACTG
4081 AGGGTAGGGGACAGGAGGCTCAGGACGCGCCCTCTGAATCGAGTGTTTCTTCTTCACAAGTCACCAAGAGAGGACATGAG
4161 GGGGAAAGTCCTTTTTTGCCCTTCTCCAAAAAATAACCTTCCACAGAGACAAACTGTCCTTCTATCCACTTTTATCTTTT
4241 AATAAATATCAAAAGGAAAAAGCTGCAAGGGTGCAAAGGGCCTGTGCCAGAAGAAAACACACACAGGGAAACCGCTTTTT
4321 TTAATCAATTGTAGAGAATAGTCATTTTTAATCTAAATTAGAGAATTGTGATACAATGGCAGTCCTCAAAGGCGTAACGA
4401 GTTCATCTTTCTTTCACCATAGGGGTTATAGTTGGCTTGTGCTACTCTGGAATCATTTTACTGTTTGTTTTTATTATCTT
4481 AAGTGCTAATTAAAAAAAAAATAAAATTTTAAAAAAACCTGTAGTTTCATTACCTTTTTGAATAATGTCATACAAAAAAT
4561 GTATTTGTTTTTTTGTGCTGTGAGAATTGATGTTTGTAGATTAATAATCATTTTGTTTAGAATTACAAAATAGTTTTTAA
4641 ATATTGTCTGAGAAAAGCCAAAGTTAATGCAACCTAGTGGAAACTGTAAGACCATTTGAGTATTGTTTGTTTTATTGATG
4721 CATTTGGATTTTGTTGTTTGATGGAATTTGAGCCAAAAAAAAAATACGCAGGCTTTCCTATTTCTACAACTGATTGTACT
4801 TATGCATTTTGTACCAGTGGAACTTTTTATACTGGAGATTAAAAAAAAAATGGAAATTTTTGTGGCTTGCTCTGGTGGGC
4881 CCCTGACAATGACTGATTTCAAGTTTGATTTCGGGTTGATTGATTGATTGATTGATAGAAAGAAAGTTGCTTTTCTTTTG
4961 AGAATTAAAAACTTTGGCTTGATTTCTTTTTTCCCTTTGCTTATATCTAGCATTAGAATTTTGTCTTAAAATAACAGCGG
5041 TAAGTTTCACTTTTTATTCTGTATTGTGCAGTTACACAATAAGGTAATTAGATTTAGAAGTACTCAGTCACTTTAAGTGG
5121 ATAAATGTATTAGTTAAAACTTTAGGGTTTGCTTTTTTGCTGTTTAGATCAAAGTTTTTTCTGATTCTTCTGTCCTCATT
5201 GTGAACATAACCGTGTAGTTGAAACAGTCAAACTTATTTTTGTAATGTATGTTATTGTGTGATGCAGTTTTTTGCTTCTG
5281 TCTCCAATATTAAACCATTTTCCTAATACTTGTTTCTCTCTCTGCGTGTTGTATTGTTGGTAGTCATTATATGTTGGTGA
5361 TACATCTGCACACCTCACTGTTTCACGTATCTGTTTTTTTCTCTATGTTGTGTAAAAAGATACAGTCGATTCCACTTAAG
5441 TGAATATCTGATTTGGGGAAGAGGAAACTGCACAGCAGCCACCTTTGATTTATGTACAACCGCCCACTTGAACTCCTGCT
5521 TCCAAGATTTATACACTTTTTTCCTACAGTTCACCTCAGTAACTGCCTTTGGGGTTGGATTTGCCAAGGTGTTTTACGGT
5601 CTTTTGACCACACAGGTTAATTTCCCCTTCTCTCCCCTCCCTCATGAGTCTATCCACGCAGTTCTTAACATACATTCCAA
5681 ACTGCTGCGGGGTTTCCTCTCCACACCCACGAGGCCAAACCCGCATCATTACAGTCCAACTCTTCTTAGACACTAATCAC
5761 TTTCTAAAAGAAGTGAGTTCTCCAGGGAAGAAAAATCAACTTAGCCAGTGAAAAGGGTTAAACTTAAGTCTATTATTTGT
5841 TGCCCTCAATCAAAAGATATGTATAGAAAAGTCATTTAAATTATTTATTTCTACAAGCTAATTGAATCCAGGAGCAGCTT
5921 TAATTATTAACACTAACGGAAGAGAAAAGAAGTATTTCCAAGGGCTCAAATGGAAGCTGTACTCAGTCCGGTGGAGGCAG
6001 GGGGAGGTAAAGTTTCTCACACTCAAGTCGTCTTCATAGTTTACTGTCCTTTTCCAAACAAAAGCTAATAACGCCATACG
6081 CATCCACACACTCCCTCCTGGATGAACCTAAGTCTCGTCCCCACTGTCACCCCAAGGCCAGTTATCAAAAACTGTTCCTT
6161 CTCTGCCCTCAAAGACTGAAGCCGCAGGCCCTGTTCTGCCTCTGCTCAGGAATCTGATTGCTCTTAAAGTGCTCTTACAA
6241 GATTCCGTCGATGTTTGCTCCCTCTGTCTTATCTCTCCTTCCAGTATTTTCAGACGCACAAGCTCTGACTCAGGCCACCC
6321 AGCACCTGGCAGCCTTCCTCTGCGTGCCAGTGAAATCTCTCCCAGTAGGTGCTCAGGCTCTTCACCCTCTCGTTGCAGCA
6401 GCCCCTCTGGCCCGAGATTGTATTTTCTAGTCTGCTCAAGAACAGAGGGGCCTGGCGAGGTGGAGGAAGGGAGGCTCCCT
6481 CCCCGGGGCTGGCCGCCTCAGTGATGGTGATGCCACCAGCTCCAGCCTGCACGGATGGAGCTCACTTCCTACCATCACTT
6561 CTGCTTTCAGTCTCCTCATAGCCTTCGGCAGTCTCCTCTGAAAACACACTGCCTACGTTAGTGGGAAAGGATGGCTAAGG
6641 GTGTGATTTCTTTTTATTAGGGAGGTGGGAGGGGGATGTTGGGAGGCATGGGGGGTGATTAAATTATCATTTCCAAGGTG
6721 CAAGTGTTTATTTTTCAAATCTATAAGTACATAGTTCCACCATTTTGGCACAAGACAAAATACTCATGCTAAGCAAAGGA
6801 AGAGAAAGACAAAGCCAGTTTTTGTTGCTTTTCTAAAGCAACAAATAATTCTCCAAAGAAGGGGATGAAAATGCTAGTTC
6881 CTTTAAGCACTTACTGACTGTAAAGTTGGTCCCTGCTTAAATTCATACCCATAGTTTTGAGTCGGTATGACACCACTGCA
6961 GTGTGAGCAAGGTGAATCCGTGTGCCATGCATGGACCACCTTGGGATACCGCAGCACCATCAACATCCGCCTTGCTGATG
7041 GAAGCCACACACGCTGCCCAGCCCACAGCAGTCGCACGCAGCCGATGGGCTCGGACTCTTAGCTGGCAGGCTAGGACACA
7121 CAGTGAACATTAATGTACTGTGAATCGTTCCTGATAAGTGAATAAAACATTGTGACCAAACAATCAGCTTATTCACTTAT
7201 CAGGAATCGACTGTTCTGCTAATTTGCTGTTGTTGTTTTTCATCTCTGTTGTAGTTCACTATTTTTGCTGTGTTCTGTTT
7281 TCTCCTCTCATGCTTGGGCAAATCACTGGGAATATTATCTTCATGTGACCATGAAACGTTTCTATTGAGTGAAAATGATA
7361 TCTTAACAAAATCTATGCACTTGCTATCAGGAACACAATACTGGATGTGTCTTATATATATTGAACTATATAGTACTCGA
7441 TTTCTTAAATAAAGCTTAAGAAAGGACTCTGTTGTGTGTAAAGTTAATGTGATTATTTTTCAAAGCAGTGTTTCTAAGGG
7521 GTATTTTTGTTCTTTTAAGTCTTGAGTGATACAGGATATTTTTCATTAAAATTATATCACTGGCTTTATGACTTAATATT
7601 CAATAAATTGACTTTGGAAACAAAAAAAAAAAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' auaaCGUAGAU---AGGUUUGGAa 5'
|::|:|| |:||||:||
Target 5' gcaaGTGTTTATTTTTCAAATCTa 3'
|
6720 - 6743
|
141.00 |
-8.30 |
2
|
miRNA 3' auAACGUAGAUAGGUUUGGAa 5'
||| | | | :|||||:|
Target 5' agTTGAAAC-AGTCAAACTTa 3'
|
5217 - 5236
|
138.00 |
-7.82 |
3
|
miRNA 3' auaacgUAGAUAGGUUUGGAa 5'
|||||| ||||||
Target 5' ttcataATCTATGGAAACCTc 3'
|
2747 - 2767
|
135.00 |
-11.00 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|