pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-548t |
Genomic Coordinates | chr4: 173268160 - 173268233 |
Description | Homo sapiens miR-548t stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-548t-3p | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 46| AAAAACCACAAUUACUUUUGCACCA |70 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Not_experimental | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | RAP2B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | RAP2B, member of RAS oncogene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_002886 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on RAP2B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of RAP2B (miRNA target sites are highlighted) |
>RAP2B|NM_002886|3'UTR 1 GGCGGCCACCGCGCGCCGGCCGCGCTCTGCGCACAAAAGCCAAACGCATCCGACTCTCTAAATGTGATTTATTTCTTGCT 81 TTGAGATTGGAGACCACTTTGCATTGGCCAGGGTGTCTTGGGAGCCCGGCTGGCCTCCGCGGCCGGCGTCCCCTGCCTCC 161 ACCCTGTGCCCGAGGGGGTGTCCGGTCCTGCCCATCCGATACTCTGGTGGAAATGTGGCTCTTTGCAGCATGTACGTTTC 241 TCCCTGATTTTGGTTGATGCATATTTCCCCGTTTAAGTAGCCGTTAGGGCGCAGTATCGGCAGCTTGACACCCACCAAGC 321 AAAAGTTTCAGCCTGGAAAAAAAATGGGGGGGAAGGGTGGATGAAAAGGAGGGAGAGAAGGTGGAAATGGTTTTTTTTTT 401 TTTTTTTCTATTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTCAACAGCCGTTTTTCTAGTTCCAAGTTTTAAATACAT 481 GGAAGGAAGTCCGGGAGAACCATATGAAGGAGCAGGAGGAGAGGAAGAAACTTTTTTTCCTTCTTTTCCAGGAGTAGCTG 561 GAAATTAAGATCGGGTTCCTTTTCTGCCAGCTTGGAAGGGCAACCCCATGACTGATTGCGATTCTGAGGATGTCTATGCA 641 AAGTTGGATTCTTGTTACAGTGTATCCAATCTGAAGTATTGCACATCTGAACTGGGACTGTTAACACTGATGCCAATACA 721 GTGTGGGGTGCCAGAAAGTGTCTGCTGATATTTGTGGAAAAAAAATCTATTTTGTTTACCTACTGTATCAAAGGGGAGTC 801 TGGGGGAGAATGGTAGTATTTTTTTTTTTTATCAGCTGTGAAAAAAATGTTACAGATCTGCACATTTTCGTGTGTACTAT 881 GGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGGTGTGTGTGTGTTTTAAGTTTAGCCTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTTGGCAGTAACCGA 961 TTTTAATGACTAGCTTTTAAAAATACAGTACAAAGACTTTGTAAATGTGATTCAGGGCCCCCAGCACCCCTGTGTCTGCA 1041 GAGTGCCTTCAAAACTCAGCTGTTCCAGCCGGTGCCAACCTGTGAACTTCCCACCATATCCCAGAATCTGCTATTCCCCA 1121 AACCACTTCCCAGTTTCCTTTCAGTAATCTTTCTGAAGGAGCCAGGACAATAGGGCCTGTTGTTTAGTGAATTTCTTTAT 1201 TATTTTCAGCCTTTAAAATGTAATTTCCATCTCTTGCAATGAATTTGTTTCCCTTTTTTTTGCTTCATTTTGTTTAAATT 1281 TTCAGGTATTTAGCTCCCCTTTCATATTATTTTTAAATTTTTTAATTACCTGTTGTAGGGTGTTCCTCCAGAAGCAAAGA 1361 GCAAAATTTTACTGTTGTGATGTACCAATTCTAACTAATTGTAATTTTTAATTTCATGCGTTTAATCATTGTCTCTTCAT 1441 TTTAAGACTTTTAATACAAATGTCATTTTTAAAGAAACAAACCCAAAACTATTGTTTGTGTTTCTGTGTTTCATATTCAG 1521 TGATTTAATACAGTATCATGGCTGAGGTGGATGGGGCAGGTGCATGATACTCTTCAGAGCTATTTGTGAAATTTTAAAGA 1601 CAGAAGTGTCTCAGTGACAAGTTGGATGACACTACTCCCAACTTTTTAAATTTGGAGAAAACCATCAAGGTCGAGGAAGC 1681 CCTGGGTATGGCCATTACCATCTGATTAGAAGATGAACAGGTATTTTGAATCTGATCTGACATGGAACAGTTTACCTCAT 1761 TGTAGGTAGGGAACAAGAGAACCCATCTATTAAAATTGCCTTAGATCTGGGAAAGTAACCATCCTTCTGGCAAAGTAGGA 1841 TGGCACTTTTAAGTTTTTCTTCCTTTTTTCCCTCTGTTTATATTGCACATCAAGTCAAAAACATGTTTGGGAAAGATGGT 1921 TTTCAATTCTGAAGTTATACCTAGTGATGTTTTTTGCAGTACATTTGAATGGATTGTAGACACTGCCTCAACCCTTTTGA 2001 GGTTTTGATTTGGAAATAGATTTAAAAGAAAACAGGCTAAGATAATATCCTTGTTCTCATTTACACCCTGCAGTTTGGAC 2081 CACATTTGACCTCATAAGTTTTTCCTTTTAACAGTAGGAGGCAGTGTGAGCTTTTTATTTTTTATTTTTCTTAAGGTGGT 2161 CTTAGTAATATAACATGTTCATACATATCAAGAGAGTACTTGGTATACCTTAGGTCTATGAAGTGTAGCTGAAATCTGAA 2241 GAGTCTTGACAAAGGGATTTACACCCTTGACAAAACCAAAAGAAATTAACAGGCCACAGGTTTCTTTAAAGCTGTGTTAA 2321 CATATCTTGCCTTAAAATGTGTGTGTGTGTTTTTGCTTTGCTTTTTTTTTTTTGCCCAAGAGGCATCTCAGTACTCCAGC 2401 AATGGAGGAAGAATAGAGAATTTTGCCTGGCAATGGTCCTACTGCCATTTTTTTTTTCCCACTCTGATCTCACTTAAGTT 2481 TGATATCAAACACAATTGGGAGGCAATAGTATCAATATCCTAAATGTAGAAATTAAAAGATACTGTATAATTTTATGCCT 2561 TTGCAAAGATTCGTTCTTGTATTTGAATAAATTCAGTTGCTAAAGTAGATCCAAAGTGTTAAAAATGCTGAAGTCATGTC 2641 AAGTACTGTCTGGAGGGTTTTTTTAAGAAAAGGCATTTGGCATTTAACTGTCTCTTGTTTTATTTTTAAGTTTTTGGAAA 2721 CCTTTTGACATAAAATGCTGCCAAGTATCTAAGAAATGTATATACTGACAGAAGATATTTGAAAGTGGAAAATTGGAAAT 2801 GAAATATGTTGCTGGGTGCGTTAATCACCTCCGCCCAGGATTTAGTCACTTGCAGGACCTCTTTATAGTCTAGGATGGCA 2881 GAGCAGAAGATTTTAATATGCTTTTATTAAGTGATGTAAAATAAATGCTTTTTGGATTATCAATGAAAGCAATTTTATGT 2961 GTGCCTGAAGCAAGAAAATAGCGTTTTTGGTTTTATCTCATATTTTCTTGGCAAAATTGAGAGAAATTAGGAACACTGCT 3041 ATTTTTTTCTTAAAAATGTTTTTAAGAATATGTTCGTTTCTTTGACTATTAAGAACCCCTTGTGGTATTAGTGTGTGAAG 3121 AGATAAGGGCATTTGTTTCAATGAAAAAGTTAGTGTTAAAGGAAGTGAGTCAGGGAGGGCGGAGTTTGTTGTAAGGCAAT 3201 CACCTGTCAAAACAGAAATTGGGTGGGAAAGGAGTCTTTATCTTGGGGAGCAAAAGCTGACTTTTAAACTTGACCCCTGC 3281 TGTTTTTAAACAGCTTTTCCTTTTGGTCTCTGACAGTCAATCCAGGTTTTATGTTATTTCAAAAGGGTTATTTTTGTCCT 3361 CCTTTTTTAATAGCTTCAGGAAAGTTAAAGGTATCATCTTAGGTCTAACACTCTAGTCTTTGAGAGTTACGGTTCTTTCG 3441 TAGAACAATTTCCATGTTGTTAACTGTTGTAGACTTAATTGAATCACATTTTGGGACCAGATGTATTTGGGGATAGAATT 3521 CTTTAAATGTATGGGACTTCATGCTTCCTGATTATGTAATATTTCCTGTGGTTGGGAATCCTAGAATGCCTGATCTATTT 3601 TATCTGTTCAGGTAGTTTTGTTATTGTACCCTCTTTTGGGTCATATTCTAGTATTTCTCACAGGGGGTATGAGAAACAGA 3681 AAGCTATATGTAGCAGCTGGTCTTGAGAAGTAGAAGCATCTTAACTGTCATAAGAGCATAGATTTTTTGTTTTTCACAAC 3761 AGCTGGAATAAGTTCCTGCATTATAAGTATAAAGGGAACCGAGATTTAATTTGGAGATCATCACTGTTAAAACGATACCA 3841 GACATTTGTCACAGTGTCTTATTTGGGGAAAGTTTGCTAATATACATTTTGTCTGTGAAAATATAGTAAATTTTAAAATA 3921 CTAATATAATGTGGTATTCTTGATTACAGTATTTTATGCAGACTATTAGGAATGATTCAGTGCATTTAACTGAACACAGA 4001 GCTAGTTCTAGGTGAGTGAGATCTTTATCTATTAACTGGATTTTGAAGGTTTGAGAAGGCTATGGGGATCATCTGGTTGA 4081 AAGGTTCTCAAACTTGACCATATATCAAAATCACCTGGAGCTTAAAACATGTACTGCTGGGACCCTCCTCCAGTTTCTTA 4161 CCCAGTGGGTCTCGGGTAGGGTCTCAATTTTCATTTCTAACAAGTTTCCAAGTGATTGTGTTATTGCTGTTCCAGGGACC 4241 ACACTTTGAAAACCAGTGATCTAGACTGAACTCCAAATGAGTACTATACTGACAGCCACCTAGATATTGAGAGACACAGA 4321 CTTCAGACTCATGTCACACATTTTGGAGTGCTGTCTACTACAGTTAGAGAATAATCTCTATTGAAATCTAAGCTAAAGAG 4401 GACATATACCATTTATACTAAGACTAACTGTTGTGTGTGAAATAGAATAAACATTGCAGGTAGTTTTTGATCATTTTCAC 4481 ATTATTACAGGAACATTTTGACTATGGTTTTCAATGTTAATTCAGAAGTTGACTTTAAATGAAAATGTGGTTAGAATAGA 4561 GGCAAAGCCTAAGTGATCAGAATCAACATTCCCCTTCTCCCCAACCTAGGGGAAAAAAAATTTGAAAAGTATGTCTTCAA 4641 TAAAAGGGGACACTTTATTTGTCTTCTCTTCAACATTAAAAAACAAAGATTTTAAGTTTTCATGGCAAGGGTTCTAAAAA 4721 TCATTGTGCCAGAGAATTTAAATCTTCATATCATGGTAAGCACATGCGTATGTCTGTGACTCAGTTTCTTAGCCAGACTT 4801 CCAGGTGTTAGTTAATTCCTTCTCATTTAGTTCTACTGTAATCCATTCTGGGAAAATGCATACCACAAAACTGTGTATCT 4881 TGCAGCTTCTTTCGTTATGCATCTTAATTCCCTCAGAAGGTCCCAGAACTTTATGTTAAAGATCTGGGTTTTTAAAGACA 4961 ATTTGGGGGCCTTCTAAAGAAACAATAGTAGATCTAATTACAAGTAGTGGATTGCTTACTTCAAATTTCTCTTTTACAAT 5041 TTAGAAAGTTTAGTACCAGTTTATAGACTGAGGGAGTAGTAGCTACTATTTAGATGCTGAGAATAATATTATCATGCTTG 5121 GGTGGGGAAGAAAGGCCCTTACTCAAATCTCCATTTTCATTTTTAATGCTTCCTGGACTTCAGTTATTTTCTTGCTTTTG 5201 CCTCAAGAATAATAAATATTTTTGGTTAAAATTTTTTTTGTTCAACCCTGTTGTTGTTACTGTTATTTTCATAGCACAGT 5281 AGTCTACAGCTCTCTATAGTAGCTTAATAGCTATTTGCTGAATGAATGGAACATGGAGTGTTACATCTGAAACTATTCTA 5361 TTAGAAGGTGAAAAGTGTTGATTGAAGAATGGTAGGATTTTATCTTCCCTACCCATGATAGATTTATTAAGATTGTCTTT 5441 GGAGCTATGTCTTCCATTCCAACTATACAGAAATAAACTTTTTTAAAGTTTAGTTTGCCCATCTGATAAAGGAACATTCC 5521 TGTATGCTATTCTAAGGTTCATTTTCAACAAAAGTTACAGACATTTATGGTTGATAGTTTGAGATCTATGACAGTTTTAG 5601 GGAGCTCCATATTCAAAAGGCTATTGCTGGTGATAGTACAATGAAACACTGACTTCAGTATATTTTTATCTTGGCTTTCA 5681 TTTTACGGTTATTTCTACTACTGTTAATATGGACTAATACTTGATTTTGTGAACCTGTTTTAATTTTAGGGTTATATTTA 5761 TGTTGGAATAATATATTTTAAAAGTGTCCTATACTATGAATTTATTTGCCATATATAAGACAATCAGAATTATCTGGTAG 5841 TTTATTCTAATCCTGGTTAATAATCATTAGGACTAAACTATTTACATTAAAGAAGGAAAAAACAATGAGATGATAATTTT 5921 TTTTTTCTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGGCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACTTCCGC 6001 TTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTTCCAGTAGCTGGGACTACGGGCGCCCTCCACCACTCCCGGCTAAT 6081 TTTTGTATTTTTCATAGAGACAGCATTTCACCATACTGGCCAGGCTGGTCGTGAACTCCTGACCTTGTGATCTGCCCACC 6161 TTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCACCCAGCCTTTTTTTTGAAATGGAGTCTGGCTCTGTCG 6241 CCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTAGCCTGCCTCATC 6321 CTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACCACCACGCCCGCCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACT 6401 ACGTTGGTCAGGATGGTCTTGAACTTCTGACCTTGTGCTCCACCCACCTCAGCCTCCCAAGAGTTGGGATTACAGGCGTG 6481 AGCCACTGCACCCGGCTGAGATGATAATTTTATTTAAAAAAAAAATTGTAGAGATAGGGTCTTGCCGTGTTGCCCAGGCT 6561 GGTCTCAAATTCCTGGGCTCAGGAGATCTTCCCTCCTCAGCCCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACTGCAT 6641 CCAGCCAGGAGTGACAATTTCTAAAGCCTTAATTAGTGAAATGGTTTGTTTTGAGAAGCAGAAATGACTAAGTGGTATAG 6721 ACATGCAGGAAAAGCAAAATGGGCCTTATGGCTATTGAAATTATGAGTGTTGATCTGTTCTATAAATTGGAGGAGACAGC 6801 TATTTGCATTCTTTCTTATCCAGTTGACTAAACTTACTCATTTTAAAATGAATTATCTTGCAAAATTATGTGAGGTTAAG 6881 TTTGTCAGAGGATTGAAAACGTGGTTGGTTTATTTGTGGTAATTGTGAAAAATTGCAAAGGTAGCAAAATTTTTTAAAAA 6961 ATGGAAAAGAGAAAGATTATTGATGCCTTGTGAATACAGGTGTCCCCAAAAGGCCTGAGACCAACCTTAATTATCAAGAA 7041 TATGGTTGCAGTGGAAATTGGTAAACAGCTGAAATTGATTCATTGATTATTCAACACTTATTGAGCACATACTACTATTA 7121 TTAATAGCTGTACTGCGAGCGCTAATACTTAAAAGAGGAAGTCAGGTGAAGGCGCAACAGCTTTATGCTCTTTTTCACTA 7201 TAATCTGTGAAATAGTGTATATTAAACAATAATAGTATATGGAAAAGCACATCTACATGTGTCATCAGTTATAATACTGT 7281 GGGGCTGTTTGGCAGACAATAGAGTAGATAAATTTATTGAACATTGGGCCTTTGAAAGGTATGTGGAAATTGTAAATAAA 7361 AATGGATTCCATGAATTTC Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DRVs in gene 3'UTRs |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|
Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
|
||||||
Conditions | HeLa | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in Chi_124B_2A8_130_50. RNA binding protein: AGO. Condition:HeLa cell miR-124 + B
... - Chi SW; Zang JB; Mele A; Darnell RB, 2009, Nature. |
||||||
miRNA-target interactions (Provided by authors) |
|
||||||
Article |
- Chi SW; Zang JB; Mele A; Darnell RB - Nature, 2009
MicroRNAs (miRNAs) have critical roles in the regulation of gene expression; however, as miRNA activity requires base pairing with only 6-8 nucleotides of messenger RNA, predicting target mRNAs is a major challenge. Recently, high-throughput sequencing of RNAs isolated by crosslinking immunoprecipitation (HITS-CLIP) has identified functional protein-RNA interaction sites. Here we use HITS-CLIP to covalently crosslink native argonaute (Ago, also called Eif2c) protein-RNA complexes in mouse brain. This produced two simultaneous data sets-Ago-miRNA and Ago-mRNA binding sites-that were combined with bioinformatic analysis to identify interaction sites between miRNA and target mRNA. We validated genome-wide interaction maps for miR-124, and generated additional maps for the 20 most abundant miRNAs present in P13 mouse brain. Ago HITS-CLIP provides a general platform for exploring the specificity and range of miRNA action in vivo, and identifies precise sequences for targeting clinically relevant miRNA-mRNA interactions.
LinkOut: [PMID: 19536157]
|
Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |
---|---|
miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
|
Conditions | HEK293S |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1084064. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noemetine_AbnovaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084065. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_emetine_AbnovaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084074. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_nohippuristanol_rep1_SantaCruzAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084078. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_nohippuristanol_rep2_AbnovaAb
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
|
CLIP-seq Support 1 for dataset Chi_124B_2A8_130_50 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | HeLa / HeLa cell miR-124 + B |
Location of target site | ENST00000323534.2 | 3UTR | AAUGGUUUUUUUUUUUUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 19536157 / Chi_HITSCLIP |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1084064 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noemetine_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000323534.2 | 3UTR | AAUGGUUUUUUUUUUUUUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM1084065 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_emetine_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000323534.2 | 3UTR | AAAAGGAGGGAGAGAAGGUGGAAAUGGUUUUUUUUUUUUUUUUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 4 for dataset GSM1084074 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_nohippuristanol_rep1_SantaCruzAb |
Location of target site | ENST00000323534.2 | 3UTR | AAUGGUUUUUUUUUUUUUUUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 5 for dataset GSM1084078 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_nohippuristanol_rep2_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000323534.2 | 3UTR | AAAUGGUUUUUUUUUUUUUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
168 hsa-miR-548t-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
![]() |
![]() |
|||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
|||||
MIRT059365 | ANP32E | acidic nuclear phosphoprotein 32 family member E | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT072839 | ARIH1 | ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT076945 | PCGF2 | polycomb group ring finger 2 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT083941 | TFAP2C | transcription factor AP-2 gamma | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT085401 | ETS2 | ETS proto-oncogene 2, transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT109790 | KLHL15 | kelch like family member 15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT114046 | AKAP11 | A-kinase anchoring protein 11 | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT130165 | TXNIP | thioredoxin interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT150013 | MIDN | midnolin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT181258 | ASH1L | ASH1 like histone lysine methyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT205594 | NCL | nucleolin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT222253 | ACTB | actin beta | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT245653 | EIF5AL1 | eukaryotic translation initiation factor 5A-like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT250947 | CDK5R1 | cyclin dependent kinase 5 regulatory subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT252497 | NWD1 | NACHT and WD repeat domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT271990 | ARF1 | ADP ribosylation factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT280804 | RNF11 | ring finger protein 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT293803 | FEM1A | fem-1 homolog A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT318231 | RREB1 | ras responsive element binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT341455 | ATP6V0B | ATPase H+ transporting V0 subunit b | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT347413 | CEBPG | CCAAT/enhancer binding protein gamma | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT351860 | PLEKHA3 | pleckstrin homology domain containing A3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT357983 | GRPEL2 | GrpE like 2, mitochondrial | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT377094 | PPP1CB | protein phosphatase 1 catalytic subunit beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT407303 | IGFBP5 | insulin like growth factor binding protein 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT441564 | LMOD3 | leiomodin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT442364 | ZC3H12C | zinc finger CCCH-type containing 12C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443228 | ARL5B | ADP ribosylation factor like GTPase 5B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT443404 | HMX3 | H6 family homeobox 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT446055 | NR5A2 | nuclear receptor subfamily 5 group A member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT448277 | ZNF652 | zinc finger protein 652 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT450822 | KCNB1 | potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT453016 | CCDC115 | coiled-coil domain containing 115 | ![]() |
![]() |
2 | 17 | ||||||
MIRT454463 | PPP2R2B | protein phosphatase 2 regulatory subunit Bbeta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT456360 | CITED2 | Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460007 | DNALI1 | dynein axonemal light intermediate chain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT463154 | ZNF385A | zinc finger protein 385A | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT463766 | YPEL2 | yippee like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT468310 | SFT2D2 | SFT2 domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT470668 | POLR2D | RNA polymerase II subunit D | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT478517 | CTTN | cortactin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT480507 | C11orf57 | chromosome 11 open reading frame 57 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT484718 | INHBA | inhibin beta A subunit | ![]() |
![]() |
2 | 12 | ||||||
MIRT485494 | HMGN2 | high mobility group nucleosomal binding domain 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT487302 | SLC38A9 | solute carrier family 38 member 9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT487771 | ANKEF1 | ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 16 | ||||||
MIRT491876 | YWHAZ | tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT494304 | CEP120 | centrosomal protein 120 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495396 | TRIM24 | tripartite motif containing 24 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495646 | CDK1 | cyclin dependent kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496665 | TMEM237 | transmembrane protein 237 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496837 | ZNF460 | zinc finger protein 460 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT498638 | CHD4 | chromodomain helicase DNA binding protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT503928 | FBXL13 | F-box and leucine rich repeat protein 13 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT506063 | PPP2R2A | protein phosphatase 2 regulatory subunit Balpha | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT506582 | MIER3 | MIER family member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT506606 | MAT2A | methionine adenosyltransferase 2A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT506844 | KIF23 | kinesin family member 23 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT508536 | RPP14 | ribonuclease P/MRP subunit p14 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT509669 | ZNF354B | zinc finger protein 354B | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT511170 | MBNL3 | muscleblind like splicing regulator 3 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT512147 | COX6B1 | cytochrome c oxidase subunit 6B1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT512831 | ID4 | inhibitor of DNA binding 4, HLH protein | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT514558 | XRCC3 | X-ray repair cross complementing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT515856 | AJAP1 | adherens junctions associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT521848 | PNISR | PNN interacting serine and arginine rich protein | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT525364 | SYNM | synemin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527120 | ARHGAP15 | Rho GTPase activating protein 15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527271 | FBLN2 | fibulin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527439 | COL4A3 | collagen type IV alpha 3 chain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527658 | CD300E | CD300e molecule | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT528334 | TBC1D22B | TBC1 domain family member 22B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529033 | EXOC8 | exocyst complex component 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529321 | PDE5A | phosphodiesterase 5A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529677 | TRPV2 | transient receptor potential cation channel subfamily V member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529846 | SMTN | smoothelin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530385 | ZNF431 | zinc finger protein 431 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530913 | GPR85 | G protein-coupled receptor 85 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT531794 | KDR | kinase insert domain receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT532246 | KLF2 | Kruppel like factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT532658 | CBX7 | chromobox 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT533630 | TMX3 | thioredoxin related transmembrane protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534811 | RAB33B | RAB33B, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534975 | PSD3 | pleckstrin and Sec7 domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT536588 | ITPKB | inositol-trisphosphate 3-kinase B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT536779 | HNRNPD | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT538764 | CABLES1 | Cdk5 and Abl enzyme substrate 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT539294 | ANGEL2 | angel homolog 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT539621 | SHISA9 | shisa family member 9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT539651 | BUB1 | BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT540347 | OPHN1 | oligophrenin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT540413 | PITPNC1 | phosphatidylinositol transfer protein, cytoplasmic 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT541396 | CDC27 | cell division cycle 27 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT542916 | HSBP1 | heat shock factor binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT544710 | EIF5A | eukaryotic translation initiation factor 5A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT544998 | MFF | mitochondrial fission factor | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT553289 | TSPAN3 | tetraspanin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT553455 | TNRC6C | trinucleotide repeat containing 6C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT553782 | TAF13 | TATA-box binding protein associated factor 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT554656 | ROBO1 | roundabout guidance receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT555104 | PURB | purine rich element binding protein B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557235 | HNRNPA1 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT560861 | GAL3ST3 | galactose-3-O-sulfotransferase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT561545 | SON | SON DNA binding protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT561554 | SLMO2 | PRELI domain containing 3B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT563764 | ZNF678 | zinc finger protein 678 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT565653 | SIX4 | SIX homeobox 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT568080 | CELF2 | CUGBP Elav-like family member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT568759 | MYBL1 | MYB proto-oncogene like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT569078 | CADM2 | cell adhesion molecule 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||