pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-6818 |
Genomic Coordinates | chr22: 30007049 - 30007113 |
Description | Homo sapiens miR-6818 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-6818-3p | |||||||||||||||
Sequence | 44| UUGUCUCUUGUUCCUCACACAG |65 | |||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||
Experiments | Meta-analysis | |||||||||||||||
SNPs in miRNA |
|
|||||||||||||||
Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | LSAMP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | IGLON3, LAMP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | limbic system-associated membrane protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_002338 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on LSAMP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of LSAMP (miRNA target sites are highlighted) |
>LSAMP|NM_002338|3'UTR 1 TAGAATAAAAATTTAAAAATAATTTAAAAAACACACAAAAATGCGTCACACAGAATACAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAG 81 AGAGAGAGAGAGAGATGGGGGAGACCGTTTATTTCACAACTTTGTGTGTTTATACATGAAGGGGGAAATAAGAAAGTGAA 161 GAAGAAAATACAACATTTAAAACAATTTTACAGTCCATCATTAAAAATTTATGTATCATTCAGGATGGAGAAGGTTCTAC 241 TGGGATATGTTTATATCTACTAAGCAAATGTATGCTGTGTAAAGACTACACCACACTAAGGACATCTGGATGCTGTAAAA 321 ATAAGAGAAGAACCAGATGGATATTAAGCCCCCCAACACACACTTTATCCTTCCTTCCTTCATCTTTTTTCATCTGTGGG 401 GAAGAAAATAAGGTCTTGCCTTTGGTGTTTATATTTCCATAACCTTTTAATTCTATTTTTCATTTGAGCTGACTTGTAGC 481 CACTTCAGACTATCAATGGAATCTTATGTTGAGCCTTTCTCTGGCTTTCCTTCCTCCACTATCTCTCCAACTTTAGAGAT 561 CATCCCCTCTCCCTCCAGTGCGTTCTATCTCCCCCACACCCACCCTAGATACTCCCTTTTCACCCACCTTTCCTCCCTCA 641 CCTCTCCTCACCTCCACCCCCTCCCCAGAGCACTAGTCATGCCGCAAATGCTAGGAAGTGCCATTTTCATTTTCTCCACT 721 GTGCGTGTGTGCTCAAGTCTTTCGCTCTCACGTGGGTGTACATGTGTGTGAGCGTGTGTGTGTCTCTCTCTAAAGCATGC 801 CAAGGGAATGGTCCATGTGTACATAGACTCATTGTGCTGTAGATACTGTCCTGCATTGTAATTGTGAGATGCGGCTGTAA 881 CAAGTTGCTGGGGGAGATGGCGGGGAAAGAGGCAAGGAGCAGAGTCCTCCCTACATCCATGGCTGTCACATGGCATCAGT 961 GTGTATTCAAACCAAGCTATGCTCCTTCCAAGGGCAGGACCCCATATTCCTCCTAGTCCCATCATCAGAACCGAGTGGGG 1041 AGTCACTCAGAATATCACTGTAAATGAAAGTGCCTACTATCGATGGGGTAAGCAAACAGCATAAGGAATTATGACGTGGA 1121 CGAGGTGACCTAGGAGAGAAAATTTCAGATTTTACTCTCATTTCATGAGTCTGAGGGATTCTTATATTTCCTGGCATTTA 1201 ACAGGGTAGGCCCTGCTCCACTGTGAAAATGAGCAGCATGTGTTGAGTAAATCCCCAGAAACAGGAAGGTCTCCAAGTGT 1281 CAACTCCCAGTGAAAGAATGATGAACCACTTGGAGATCCTAAGCAGCCCTGTTTTACCTCCTCCCTAATCTTAAATAACA 1361 TTTGTCCCATGAATTCCCCTGAGCAGAGATTGTTTCCTATTTCAGATAAAATACAGTGAAAGTGAGCAAGGCAGAAAAAG 1441 TCAACAGATGCCCAGGCTCCTACTGTATTCTGGAGATACTGTCAGAGCTCTAATACAGAGCACTGGCCATAATGAAAAGC 1521 AGTTCACTCCTTGTGCTCCTCTGCAGATGTTTTTCCCAGTGTTCTAGGTTAATGTTTTATTTGGTTGCCTGCATAATCCC 1601 TGTTCTGTTTCACTGATGGTGTTTGCAGCACCACTGTTCATGGTGGTCCACTGTTATCCTATGCCAGGGTGCTAAGAATT 1681 GCATGATATTCATCTTCCCTGCTCTATTTAAATTTACATCTATAAGAGTCATCTTGACATTAACACTGAAATGTGATCTA 1761 GGTCCTTAACCAAAATTGCTGGGCAACTTGTAATAAATTTAGACAGAAATTTTATGAGTACCACAAAGCTTGGTGTTACC 1841 ACATCACCAGAAGGATTTCTTAGGAAATGTCTTGCCGAGAGAGCTGGCTCTCTGCATATAGATGTCTTTGTCAGAAAACC 1921 AACCCTTGCTCTCACTTACACAGTAGTAAGCACTGAAAGTGGTTCAGTTCATGAGAGGACAGAGAATTATTTTGAGATTA 2001 TATTTGAATGTAATCTTGCAGAGCCAAATATGGTATGTCATTAAGTTGGAACCTTGTAAATAGCTGTTCCATGTTATAAA 2081 ATGAGAAACTTTGTAACTGGAAAAAAAGAAAGGAAAGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGCAGGGAGGGGGGGACGGGG 2161 AAGGGGGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGGAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAGAAAGGA 2241 AAGGAAGGCAGGAGGGAGAAAGATCTAAGTAGCATTGTTAATTTCTTCAATTTCTTCTAAGGGATTTTATTGTTTGTTTT 2321 AGAAGCTTATCACAGCCTTCTTTCATGATTTTGCAGTTTAGACTTGATACAAGGAAAAATTCAGCTTGGGGATGGTTAAG 2401 AGTGTTTATAGCAGATTCTGACATAGGAGAGAAAACAAATTCTCATCCAAGAAGGTAGCTAGTAAAATATAGGGAAGGTG 2481 AGCCATATTCCTATGCAGCATCAATTTATTGACAATCAGGTATTTCTCTTAACAGTTTGGTCTTCTTAGTTCAAGAATAA 2561 AGGGTATCATCTTTAATAATAAGCATTCCCCAAAAATTGAAGAGGCAGTCACACACTTAAGTGTGTGGCTTTAGAAAAGC 2641 GCATGCTAATTTAAAGATATACAGGAAGAGAAAAGTAGGAGTTAAGTTGGATGTTGTTAGAAGTTGGATGTTAGTATTAC 2721 CTTCAGGAACAGATCCCCATGGCATGTCACAGGCCTTAATTATATACCTGGCTTTCTTATTGTCTCCACTTTATCATGAG 2801 GACAAGGTCTTGGTTTCATGGGAGGAACTTCTCCATTGAAATAAATGTCTGCCATGTCAGCACCGTTTGTTCCCTCAGTT 2881 TTAATATAATGGACCATATATTAAACATAATTAAACATATATTTAAATGTGGTGTTTGCCTGTGTCTCTAGCAGGATCTT 2961 GAAATTTTAAAAATTTGCTTCTGGTTCCTGTTTCAGAGAAAACATTGTCCCCAGAAATTTCATAGGATTGAAAGTGTTCC 3041 CTAAGCAGTGTGAACAATGGAGGAAAATATAGTTTAGAGAAAAGTCAGGGAAAGGTAGGGCCAGAGGACTGACACCAAGA 3121 AATCATTGAATCTCAACATAAGACTTCTTGGAATTTAGTTAATCATATTGGAATAAATTCCTTCAAGAATCTTGTCCCTT 3201 GGTAATCAAAGTTTGAAACCCCGCACTGAAAAGCACCAACTGGTTGGAAATAATATACTGAGAGGAGTGAAATTCATCAA 3281 TTAATCTGAGTGGCTAATATATTTAATATCCTTTGTATACAAAGTAAAACTCCACCATTCGTAAAAGGAAATCCTTAGAC 3361 CCAACTTTCAGTTAACAAAAACAGAAATGACTTTGACCCAGGGTGCTTCCTGAAGAATGAGAACTATCCAGGGCTTTACA 3441 ACTGCAGAATTGTAATTATGCTCTGTGCAATTGTTGAGCAAAGGTTTTGCCTTGCTGGATAAAAAGTCTTGTTTGTTTCG 3521 AGACATGAAATCCCCATGTCTTAAAAGAACTAAGGCTTATAGAAAAGCAGATGGGTTTTCTCTCAGGAAGGACTGCCCCA 3601 TTGACCTTTGCCTTCTCTTCCAAGTCAGACAGACTTCTCGCTTGCCATGGGCATTTTTTTACTACATAGTCAGACTACTG 3681 GGGCTACTTATAGAGACCTTGTAAAAGTACTCGTGATTTTCACGTTCTTGGAGGACCAAACAAAAATCTGTTTCTCCTCC 3761 AAAAATGGACTTACCTCCTTTGCACACAAAAGCTAAACTCCTCAGCATGAAATTGTTTGAGTTATTACTTTACCAAGTTG 3841 TGAGCTTCTTGAATCCTCCAGAGTCGCAGATTCCATCCCTGAGTTGGTTGTGGTTTCACTGTTTCTATTGGCTATTCTCC 3921 CTGAATTTTTCATTTTGTTCTTTGCAGGGCTCGAATTATTTGTGGAAAACAATAATATATATGTGTGTGTATTTTTTATC 4001 TTTATAGATGCTATATTTACAATAATGTATGTATTATAAGACAAATTAAGAATAATGTTTTGATCTTAAAAGGAAGAAAA 4081 GTACTGAATTTGGTTGTTTAGAAAGAAAATCTATGCTCACGTAGAAAGACATAGAGCCCCACTTTTTCCGTTTTGTAATT 4161 ATTTGGCGAAAAGAAATTTGCTTATAGACTATGTTTAATGGGATTAACCATGTCCTCATTTTTCTTTTCATCCTCATACA 4241 CTTTTAGCCTGCATTTAGTCTTGGTTACCAATATCATTTTTTAAGAGAAATGTAAGTACAGTGCTATATCTTACCTACAT 4321 AAACTATTAATATTTTGAAGACAAATGTGAAACACACCACAAAAATGGTGAGATAAGAAACAAAAATGCAGTTTAGGAAG 4401 CCTCCTCCTTGCTTAAATGTTTAGAATATTTCTTCTCCAAAGACTGCATTTGCCTCAGTGATGTAAATTTTCCATCATGG 4481 TTGGCATAATATCTGTAAACATCTCACTAAATGCAAAATGGAGTTTACATTTATGTGCATACTAGCAGAAAAGAAGTAAA 4561 CTATTCTCATTTGCATGTAGCTATGCTGTTCAAATGTCGCCAACCAAAATTTAGGAAAGAATTTGTTTTCACCCAGCATG 4641 TACATCTCACTTTTCTCTTGGCAAGGAAGCTGGTGTTAACGTTGGGTTTAGGTTTAACATTTACACCAGCGAAAATGTTT 4721 ATGAATATTATGGAAAACTTATTTTAAACCTTGATTTCTTTTGAGCACATTTACATGCTGCGTGCTGATTAATAAATTAG 4801 GCACCAATCATGTGTAAATCAATGTAAATCACTAGTTTATGTACATAATATAAACTATGTAAACTTCATTTTTCATGCAG 4881 TGCCCAACTACTGCTAAGGTTTACTATGATTCTTAAGGAAAAAAAAATCAAATAAAAATAAATAAAAACTGAAACGTTTC 4961 ACAGTTCAGAATCGGAAGAATTACGACTAAAGCTCCAAATATGAGGTTGCCTTAGCCAAAGGAAGCAGACCCACAGGAAC 5041 AGTTCAAGGTTTATATCCTGCTCAAGTCACCTCTTTGGTCTTTCAGGATCTAAGTGGAGATTGTCCCAACTGTTGCTGTA 5121 GTTGTCTCACCCGACCCCAAAGCAAGGGAAATAGAGGGAAAGGTTTTAAGGGCTATATGTCTGCTGTATCCACTCCCAGC 5201 TATCTTCTTTTTACTCCTTTCTCACCATCTAAGATGTCTTATTTAAATAGCTCCAAGGAAGTGACCTAAACCTTGATGAG 5281 CAAAATATTACTCAGTTTTTATTTTCCATTCAACAAAAGCAGTGGGAAAGCTTGCCATCTGGATTCTAAGAAATTGTGCA 5361 ATATAAAAAATGTTATATCCTCGAGAAATATCTTGCTGAGTCACCCTAGGAAATAACTACCTTTTATTTATCTGGTAGCC 5441 TAATGTTTCCACACATTTATCCTGAATATTGCAAGTGAGGGACTGAATCATTTTTAATTGGGAGTTATCTTTCTCAGGCA 5521 TGTTCTCTTGGAGTCTTTTTGAAGTGCCTGACACGTGTAACAGGATGACATATATATCATTCCTACAATATGAACAACTG 5601 TTACATAAAAAATTATCAAGGAGATGATTTCAGGAAACAAGTGAACTTTCTGCAAAGACTTATAAAAATTTTAGGTCAAA 5681 TTAACTTCAGGCTTTAAATGCACTAATCTACCTAAGAGAAAAAAAAAGAAAAAAAACAGGAAGGAGTTTTAAGGGCTCAT 5761 GTGCCTGTTGTATCAACCCCCAAGTGTCTTCTTGGTACTGCTTCCTCATCATCTAAGATAAACTGACAACTTTAAAGTGA 5841 GGTAGAAGGTGTATTGAATTGGGAGTCAGGAGAATTGGGTTCTAACCCCAAGTTCAGCCACAAATAAAGCTGTGAGACAT 5921 TGGCAAGTCATTTAACTTTCCTGAGTCTTGGTTTTCTCATCCTGAAAGTGAGGGATTCGGCTGACGTCTCTAAAATCTCT 6001 TTCAACTCTAACCTTTATTCTGAATAAGAATTTAATATTCACTTAGTGCTGTGCCCAGCACTGTTTGTAAACAGCAGCTG 6081 TTTGTTATCTCTAGTTTGGTCTCTGTATTCTCATCACTTCTCAGAACTATCATTCTACCGTCTTCATTTCTAAACCCAAA 6161 ACTGCTAGAATACAGGGACTCTGGACTGGGTCTGTAAATTTTTTCTGATCAAAACTTTATAGCAGTGTAGAGAAGGGACA 6241 CATTCAAATTACACTAAGGACATTGACATAGCTGGGGTTGTTTCCTTGTTTATATTATAAAACCTAAATGTGGAACTATA 6321 TTCTAATAATCTTTCATAGGAAGGAAAATAGCCAGACTGGGTATTATGCATGTAACAAATGAGGACATTGTGCATAAGAA 6401 AGGAAACATTAGTTTTCTGTCATCCTGGGCCAAGTACCTCATTACAGTAAATGTGTGTCTTTGGAAACTCTTTGCTTGTG 6481 CTGATGGCGGTAAGCATGGGGTCCCAGGCAGGTTCAAAGGCTGAACTGTAAGAAATGGGCAAGACAATACATTTTGTTTT 6561 GGAAGGAATTTCTCATGGGATAAGTTTCCCAAAGCTTGAATTATAGGCTATGAAATAAAGCAAATAGATGGAGAGAAAAC 6641 AAGTATTGTTTTCAAAAAGTACAAGTCAATTCTATTTAAAGAAGACAAGCTGAAAATAAAACAAAAATAAACACAATTTA 6721 GGAGGTTACAGAGTTGAAGACAGTATGAATTGTTGTGAAGGCCAAAATCAAATGTGAAAGTTAGGTTCTCTGAGAAAAGG 6801 GTAAGCAGAAAGGATGATTTCTCAAGCAATTAATAAGGAATTATTTTCTTGTGCCATGTTCTAGATGCATTGAGCACAGA 6881 TCCTCTTGTCCTAAGCTGTCCTAGAGGCTCAGGTTAGCATCTATCCAAAGTTGTCCTTTGATTTTATTGTCTGAAAGAAC 6961 AGAAGGCATCAGAGTTTCCAGTCACTGAAGAGTAGGGTTTGTTCATCACTTCCCAGCAATCACATCACTTTGTGTAGGTA 7041 AGGATATATGATGTGCTTAGATTACTTATGAAGCTCTCTCTAAGTGGGAGAATGACCTGTCCATGGGACAACTCCCCGTT 7121 TTCATGGTCATTTCAGAAGTACCTCTTTTTGGGCAGTGCTCCTGGATCTACTTCTACAGCCACATTCTACTCTGCACAAT 7201 CCTCCCTATGTAAAGCCAGGCACAGTACAAATATGCTTCTTGCAAGTGAAGAAAACCCATGGAAGTCCTAGCTTCATGGC 7281 ACGCTGCAGCAATCCCAAGCTACCAGGAGCCTCTTTTGAACCCACTTCCCTAAGTCTTTGCTCTTCACCAGAGAATGGAA 7361 ATTGTTCATCCTGGTGAACTGTGGCCAAGTTCTGCTCCCTAAGTATTTACTTGGAGTAGGGAGGTTAAAGGGAAGAAATT 7441 CAGGGGGAGAGAAGCAAAAGAGAACACTTCCAACTCCCTCCCCCATCTCCCAATGCTCCCCACCTTCCTTATCACTGCTC 7521 TACTGAAGGGTGTATAAATCCTGCTCTTGGTTAGAATTCTCCTTATTAACAGTGTTATATACATATAAATATATATATAA 7601 ATATATTCCTTTTTTCAGCCCTGTAGACATGAACTGATCTTCCCTTGAAGATACAAACACATGGCCATTTTTTGTTTGGG 7681 ATTTTTTGTTTTTCAAGGTTTTTCATTTTTGTTTATTAGGTGGATTTTTTTCCCTGGGTACTAGCTCTGTGAAGGAGATA 7761 AAAAGCGCAATGTGTGTTAAAAAAAAAAAATTAAAATTAAAATGAAAAAAAGCTTTTTTTCTTTTCTTTTTAAATGTATT 7841 TAAATTCTGTTTCTCTCTTCTGTTACTTTACACGTATGAATGCTCTGCTCTTCTGTGATCTTAAAACAAAATGAAATAAA 7921 CGTGAAAAGGAGATGTGTCTTCATTGACCTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DRVs in gene 3'UTRs |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|
Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
---|---|
miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
|
Conditions | HEK293S |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1084045. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_arsenite_rep3
HITS-CLIP data was present in GSM1084065. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_emetine_AbnovaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084077. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_hippuristanol_rep1_SigmaAb
HITS-CLIP data was present in GSM1084078. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_nohippuristanol_rep2_AbnovaAb
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
|
Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |
---|---|
miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
|
Conditions | Cardiac Tissues |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM2202480. RNA binding protein: AGO2. Condition:S5_LV_36yo_Male_AGO2_bound_RNA
... - Spengler RM; Zhang X; Cheng C; McLendon JM; et al., 2016, Nucleic acids research. |
Article |
Elucidation of transcriptome-wide microRNA binding sites in human cardiac tissues by Ago2 HITS-CLIP.
- Spengler RM; Zhang X; Cheng C; McLendon JM; et al.- Nucleic acids research, 2016
MicroRNAs (miRs) have emerged as key biological effectors in human health and disease. These small noncoding RNAs are incorporated into Argonaute (Ago) proteins, where they direct post-transcriptional gene silencing via base-pairing with target transcripts. Although miRs have become intriguing biological entities and attractive therapeutic targets, the translational impacts of miR research remain limited by a paucity of empirical miR targeting data, particularly in human primary tissues. Here, to improve our understanding of the diverse roles miRs play in cardiovascular function and disease, we applied high-throughput methods to globally profile miR:target interactions in human heart tissues. We deciphered Ago2:RNA interactions using crosslinking immunoprecipitation coupled with high-throughput sequencing (HITS-CLIP) to generate the first transcriptome-wide map of miR targeting events in human myocardium, detecting 4000 cardiac Ago2 binding sites across >2200 target transcripts. Our initial exploration of this interactome revealed an abundance of miR target sites in gene coding regions, including several sites pointing to new miR-29 functions in regulating cardiomyocyte calcium, growth and metabolism. Also, we uncovered several clinically-relevant interactions involving common genetic variants that alter miR targeting events in cardiomyopathy-associated genes. Overall, these data provide a critical resource for bolstering translational miR research in heart, and likely beyond.
LinkOut: [PMID: 27418678]
|
CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1084045 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_arsenite_rep3 |
Location of target site | ENST00000490035.2 | 3UTR | CAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1084065 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_emetine_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000490035.2 | 3UTR | GAAUACAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAUGGGGGAGAC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM1084077 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_hippuristanol_rep1_SigmaAb |
Location of target site | ENST00000490035.2 | 3UTR | AUACAGAGAGAGAGAGAC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 4 for dataset GSM1084078 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_nohippuristanol_rep2_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000490035.2 | 3UTR | UACAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
150 hsa-miR-6818-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
![]() |
![]() |
|||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
|||||
MIRT112122 | TIMM17A | translocase of inner mitochondrial membrane 17A | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT262243 | BAMBI | BMP and activin membrane bound inhibitor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT446689 | MCF2L2 | MCF.2 cell line derived transforming sequence-like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT449923 | TPST2 | tyrosylprotein sulfotransferase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT464356 | USP12P1 | ubiquitin specific peptidase 12 pseudogene 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT485703 | CBX7 | chromobox 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT497478 | XPR1 | xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT499435 | ODF2L | outer dense fiber of sperm tails 2 like | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT514246 | S1PR2 | sphingosine-1-phosphate receptor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT515032 | EBNA1BP2 | EBNA1 binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT515065 | PLA2G2C | phospholipase A2 group IIC | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT520235 | USP9X | ubiquitin specific peptidase 9, X-linked | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT523685 | FHL2 | four and a half LIM domains 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT525524 | FSIP2 | fibrous sheath interacting protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT525838 | FAR2 | fatty acyl-CoA reductase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT528583 | PTGER3 | prostaglandin E receptor 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530404 | SULT1B1 | sulfotransferase family 1B member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530703 | RNMTL1 | mitochondrial rRNA methyltransferase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT535118 | PLSCR4 | phospholipid scramblase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT539880 | IRGQ | immunity related GTPase Q | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT540195 | ARHGAP18 | Rho GTPase activating protein 18 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT540938 | SLC25A43 | solute carrier family 25 member 43 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT541501 | TOR1AIP1 | torsin 1A interacting protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT542544 | MRPS10 | mitochondrial ribosomal protein S10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT542559 | ZNF280B | zinc finger protein 280B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT542689 | RPS15A | ribosomal protein S15a | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT548759 | CNNM3 | cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT549735 | MAPKAPK5 | mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT553060 | ULK1 | unc-51 like autophagy activating kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556303 | MAP2K4 | mitogen-activated protein kinase kinase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT560816 | DIP2A | disco interacting protein 2 homolog A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT567455 | GLTSCR1 | BRD4 interacting chromatin remodeling complex associated protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575143 | Cd93 | CD93 antigen | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT607217 | ACSM2A | acyl-CoA synthetase medium chain family member 2A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT607286 | CD300E | CD300e molecule | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT607302 | RREB1 | ras responsive element binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT608645 | ABCF3 | ATP binding cassette subfamily F member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT611095 | MYO1F | myosin IF | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT611576 | CLEC4D | C-type lectin domain family 4 member D | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT614271 | WSCD2 | WSC domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT614855 | PLEKHA6 | pleckstrin homology domain containing A6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT617114 | KANK2 | KN motif and ankyrin repeat domains 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618002 | SLC9A3R2 | SLC9A3 regulator 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618028 | CTU1 | cytosolic thiouridylase subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619062 | BSND | barttin CLCNK type accessory beta subunit | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT619289 | FAM26E | calcium homeostasis modulator family member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619356 | CFHR5 | complement factor H related 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT620725 | CCL16 | C-C motif chemokine ligand 16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT620913 | LRRTM2 | leucine rich repeat transmembrane neuronal 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621902 | TAB1 | TGF-beta activated kinase 1 (MAP3K7) binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT622025 | STAT5A | signal transducer and activator of transcription 5A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT622556 | PTPN3 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623137 | NCKAP1 | NCK associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623140 | NAV2 | neuron navigator 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623701 | HHAT | hedgehog acyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT624602 | B3GALT5 | beta-1,3-galactosyltransferase 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625944 | OLIG3 | oligodendrocyte transcription factor 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625988 | SPATA17 | spermatogenesis associated 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT628028 | LSAMP | limbic system-associated membrane protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635521 | MC2R | melanocortin 2 receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT638916 | CALCOCO2 | calcium binding and coiled-coil domain 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT639796 | EPX | eosinophil peroxidase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT640344 | C1orf210 | chromosome 1 open reading frame 210 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT644806 | VLDLR | very low density lipoprotein receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645303 | AGTRAP | angiotensin II receptor associated protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645629 | SYTL4 | synaptotagmin like 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645683 | TBC1D13 | TBC1 domain family member 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646216 | DUSP10 | dual specificity phosphatase 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648505 | PIGG | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649748 | UTP20 | UTP20, small subunit processome component | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649797 | CLEC2D | C-type lectin domain family 2 member D | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650482 | UFM1 | ubiquitin fold modifier 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT653199 | SP9 | Sp9 transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655741 | NR2F2 | nuclear receptor subfamily 2 group F member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT659978 | C2CD2L | C2CD2 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660350 | BAG4 | BCL2 associated athanogene 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662185 | MEI1 | meiotic double-stranded break formation protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663290 | TECPR2 | tectonin beta-propeller repeat containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT666817 | PRCP | prolylcarboxypeptidase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT671665 | HEYL | hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif-like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT671838 | PDE3A | phosphodiesterase 3A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672193 | F2 | coagulation factor II, thrombin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT673870 | KLF2 | Kruppel like factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT683563 | CARD8 | caspase recruitment domain family member 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT684545 | ZNF708 | zinc finger protein 708 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT685140 | TACR3 | tachykinin receptor 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT685413 | ACAD8 | acyl-CoA dehydrogenase family member 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT686039 | SLC5A5 | solute carrier family 5 member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT686126 | B4GALT7 | beta-1,4-galactosyltransferase 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT687473 | NHLRC2 | NHL repeat containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT687946 | HHIP | hedgehog interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT688171 | FRRS1 | ferric chelate reductase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT688295 | FAM208A | family with sequence similarity 208 member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT689044 | AMD1 | adenosylmethionine decarboxylase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT689194 | ZNF574 | zinc finger protein 574 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT691253 | ICOSLG | inducible T-cell costimulator ligand | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT695358 | PHAX | phosphorylated adaptor for RNA export | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT696674 | APOC3 | apolipoprotein C3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT697358 | ZNF394 | zinc finger protein 394 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT697604 | XIAP | X-linked inhibitor of apoptosis | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT697726 | USP6NL | USP6 N-terminal like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT697776 | UBXN7 | UBX domain protein 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT698478 | TIAL1 | TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT698984 | SPAG9 | sperm associated antigen 9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT699851 | SAR1B | secretion associated Ras related GTPase 1B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700172 | RIMKLB | ribosomal modification protein rimK like family member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT704339 | DCAF16 | DDB1 and CUL4 associated factor 16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT704589 | CLN8 | CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT705836 | AHCY | adenosylhomocysteinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707085 | TIMM50 | translocase of inner mitochondrial membrane 50 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707132 | TRA2B | transformer 2 beta homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707145 | C17orf105 | chromosome 17 open reading frame 105 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707234 | H6PD | hexose-6-phosphate dehydrogenase/glucose 1-dehydrogenase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707347 | XPNPEP3 | X-prolyl aminopeptidase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707445 | PPFIBP1 | PPFIA binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707494 | AXL | AXL receptor tyrosine kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707638 | CRIPT | CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707690 | FAM118A | family with sequence similarity 118 member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707706 | CDC6 | cell division cycle 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707817 | TMEM170A | transmembrane protein 170A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707957 | PDK3 | pyruvate dehydrogenase kinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT707996 | NUDT4 | nudix hydrolase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT708026 | MRPS14 | mitochondrial ribosomal protein S14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT708058 | LIX1L | limb and CNS expressed 1 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT708089 | KIAA1671 | KIAA1671 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT708125 | GK5 | glycerol kinase 5 (putative) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT708194 | ANP32E | acidic nuclear phosphoprotein 32 family member E | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT708201 | AHSA2 | activator of HSP90 ATPase homolog 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT710503 | BSDC1 | BSD domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711308 | IFNGR2 | interferon gamma receptor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711740 | DTX1 | deltex E3 ubiquitin ligase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713202 | SOCS6 | suppressor of cytokine signaling 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714380 | PDP2 | pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT715210 | NPVF | neuropeptide VF precursor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT715559 | EPHB4 | EPH receptor B4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT715835 | SZT2 | SZT2, KICSTOR complex subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716680 | HLA-B | major histocompatibility complex, class I, B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717660 | THBS2 | thrombospondin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718132 | PALM | paralemmin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718322 | METTL7A | methyltransferase like 7A |