pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4433a |
Genomic Coordinates | chr2: 64340759 - 64340839 |
Description | Homo sapiens miR-4433a stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4433a-3p | ||||||||||||
Sequence | 51| ACAGGAGUGGGGGUGGGACAU |71 | ||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||
Experiments | Illumina | ||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | CLPB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ANKCLB, HSP78, MEGCANN, MGCA7, SKD3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_030813 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on CLPB | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of CLPB (miRNA target sites are highlighted) |
>CLPB|NM_030813|3'UTR 1 CAGCCACCTGCCTGCTCCTATGTGCCCTCACCATCCAATAAAGGCCCCTTGGCTGTGGCATGGCAACTGACTTACCTTCC 81 CCTCATGCCGCTCCCATCTCTACCCAGTCTCAGGCCTGCTTACCTCCTCACAGCCCATGAAGACCCCTTCTCAGCCCCAA 161 AACCTGAAGGAGGAATTTCGCCCTACTCTGGCCCCTTTGTTGTGGGCCCATAACCTGCTAACAAGCCTTCAGGAGAGGAG 241 CTGCCTTTCCACCCCCTTCAAGGCAAGGAGGGATGGAGGTCCCTTATTTCCTTCAGAATGATCCCCATCCCCCATAGTCG 321 CCAGACTTTCTCATGTTCCCAGGAAGCTCAGAAGTATGGCAGCTAAGAACACAGCTGGCTGGAAGAAGACAGGGACCAGA 401 CTGAACTGCCACCCTCTGCTAGTCCTCATGCAACTCAGTCCCCAGAATGGCTCCACTGGGAGTGGAGGAAGAGCTCAGAG 481 GCCCAGGTGCAGATAGTTCTGCAATTTAGTCTGTAGCCTCCTCGTTCCCTACCCTAAAATTCTAAGGGGAAGGGACCCAT 561 AGAGGCTTGCCTGTTTCCGCTACTATATTATGCCCAGTGTTCCTCCTCACCCCACGTCCTGGGGTCAGGCCAGACCATGT 641 TTCGTCAGCCTTGGGGACTAGGCCAGTGTTGGGCACCTCCAGGAGGAGGCCTGACTGGTTCATTACCCTCCCCTACTCAG 721 ACTGAGCAGCAGTCCCAGATAACCAAGCAAGCTCAGCTCTGTGGGGGCCTCCTTCAAAAGACCAACATCGCAGACATTAG 801 GAAGCTGTAGGAAGAGAGATCATGGGTTTGACCTCTGCCCACATGGCCATGGAGTCAGCCTCAGCCCTGTCTGTACTGCT 881 CGTCCAGCTAAACGAGCCTGGAATAAACATGCAGTTTATTCAGTCTGCATGTTAGTCACAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293S | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
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HITS-CLIP data was present in GSM1084044. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noarsenite_rep3
HITS-CLIP data was present in GSM1084078. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_nohippuristanol_rep2_AbnovaAb
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
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Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | Prostate Tissue |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
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PAR-CLIP data was present in SRX1760631. RNA binding protein: AGO2. Condition:AGO-CLIP-22RV1_B
... - Hamilton MP; Rajapakshe KI; Bader DA; Cerne et al., 2016, Neoplasia (New York, N.Y.). |
Article |
- Hamilton MP; Rajapakshe KI; Bader DA; Cerne et al. - Neoplasia (New York, N.Y.), 2016
MicroRNA (miRNA) deregulation in prostate cancer (PCa) contributes to PCa initiation and metastatic progression. To comprehensively define the cancer-associated changes in miRNA targeting and function in commonly studied models of PCa, we performed photoactivatable ribonucleoside-enhanced cross-linking immunoprecipitation of the Argonaute protein in a panel of PCa cell lines modeling different stages of PCa progression. Using this comprehensive catalogue of miRNA targets, we analyzed miRNA targeting on known drivers of PCa and examined tissue-specific and stage-specific pathway targeting by miRNAs. We found that androgen receptor is the most frequently targeted PCa oncogene and that miR-148a targets the largest number of known PCa drivers. Globally, tissue-specific and stage-specific changes in miRNA targeting are driven by homeostatic response to active oncogenic pathways. Our findings indicate that, even in advanced PCa, the miRNA pool adapts to regulate continuing alterations in the cancer genome to balance oncogenic molecular changes. These findings are important because they are the first to globally characterize miRNA changes in PCa and demonstrate how the miRNA target spectrum responds to staged tumorigenesis.
LinkOut: [PMID: 27292025]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1084044 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noarsenite_rep3 |
Location of target site | ENST00000294053.3 | 3UTR | AAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1084078 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_nohippuristanol_rep2_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000294053.3 | 3UTR | AAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCUGAGU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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256 hsa-miR-4433a-3p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT088097 | SEPT2 | septin 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT143134 | MGRN1 | mahogunin ring finger 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT153912 | NCOA3 | nuclear receptor coactivator 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT154894 | GNAS | GNAS complex locus | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT200996 | ZNF805 | zinc finger protein 805 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT215729 | C5ORF51 | chromosome 5 open reading frame 51 | ![]() |
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2 | 10 | ||||||
MIRT235593 | POFUT1 | protein O-fucosyltransferase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT263250 | SGPL1 | sphingosine-1-phosphate lyase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT317951 | CDC5L | cell division cycle 5 like | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT325572 | HIATL1 | major facilitator superfamily domain containing 14B | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT354739 | LSM3 | LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT444552 | UBE2D3 | ubiquitin conjugating enzyme E2 D3 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT446978 | SUSD5 | sushi domain containing 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451036 | ZNF610 | zinc finger protein 610 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451596 | TRPM7 | transient receptor potential cation channel subfamily M member 7 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT452025 | NLRP6 | NLR family pyrin domain containing 6 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT452594 | CA6 | carbonic anhydrase 6 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT452768 | TCEA3 | transcription elongation factor A3 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT452959 | ZNF844 | zinc finger protein 844 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453191 | ACSF2 | acyl-CoA synthetase family member 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453382 | RHD | Rh blood group D antigen | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453685 | CEBPD | CCAAT/enhancer binding protein delta | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT455272 | DDX39B | DExD-box helicase 39B | ![]() |
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2 | 8 | ||||||
MIRT455346 | BAMBI | BMP and activin membrane bound inhibitor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT456494 | SERAC1 | serine active site containing 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT456585 | NID1 | nidogen 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT456888 | DDA1 | DET1 and DDB1 associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457123 | APOLD1 | apolipoprotein L domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457852 | ZNF324B | zinc finger protein 324B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457987 | APAF1 | apoptotic peptidase activating factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT459278 | APOBEC3F | apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT459625 | SLC25A33 | solute carrier family 25 member 33 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT459715 | SGK494 | uncharacterized serine/threonine-protein kinase SgK494 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460057 | RPL22L1 | ribosomal protein L22 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460182 | UNK | unkempt family zinc finger | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT460288 | PDE11A | phosphodiesterase 11A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460841 | EGF | epidermal growth factor | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT460860 | TBC1D19 | TBC1 domain family member 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT461519 | EMC7 | ER membrane protein complex subunit 7 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT461729 | SLC27A1 | solute carrier family 27 member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT461821 | SNAP23 | synaptosome associated protein 23 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT462066 | CCDC77 | coiled-coil domain containing 77 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT462084 | MSANTD2 | Myb/SANT DNA binding domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT462508 | MTFMT | mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 10 | ||||||
MIRT464239 | VCP | valosin containing protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT465316 | TRAF5 | TNF receptor associated factor 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT466549 | TBL1XR1 | transducin beta like 1 X-linked receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT467128 | SRGAP1 | SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT468091 | SHCBP1 | SHC binding and spindle associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT469630 | RAD21 | RAD21 cohesin complex component | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT471097 | PIK3C2B | phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472704 | MYBL1 | MYB proto-oncogene like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472830 | MTMR10 | myotubularin related protein 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472872 | MTHFD2 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472895 | MTDH | metadherin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT473728 | MAPK1 | mitogen-activated protein kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT473859 | MAP2K4 | mitogen-activated protein kinase kinase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT474047 | LONRF1 | LON peptidase N-terminal domain and ring finger 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT474297 | LAMC1 | laminin subunit gamma 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT474658 | KLF13 | Kruppel like factor 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475234 | IKZF3 | IKAROS family zinc finger 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475500 | HSP90B1 | heat shock protein 90 beta family member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475742 | HERPUD1 | homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT475793 | HDGF | heparin binding growth factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT477254 | ERGIC2 | ERGIC and golgi 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478228 | DDX52 | DExD-box helicase 52 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478393 | DCTN5 | dynactin subunit 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478754 | CS | citrate synthase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478827 | CRKL | CRK like proto-oncogene, adaptor protein | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT480234 | C9orf41 | carnosine N-methyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT480597 | BTRC | beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT484121 | C14orf142 | GON7, KEOPS complex subunit homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT484689 | PACSIN1 | protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT486331 | C11orf54 | chromosome 11 open reading frame 54 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT488599 | FAM3C | family with sequence similarity 3 member C | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT488833 | MRRF | mitochondrial ribosome recycling factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT492523 | RAB15 | RAB15, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT493632 | HIC2 | HIC ZBTB transcriptional repressor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT500026 | ABCF2 | ATP binding cassette subfamily F member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT501075 | SMAD7 | SMAD family member 7 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT503094 | BTG2 | BTG anti-proliferation factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT503336 | MMAB | methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblB type | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT505465 | STMN1 | stathmin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT505726 | SERTAD3 | SERTA domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT509333 | MS4A4A | membrane spanning 4-domains A4A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT509978 | KCNMB1 | potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT513068 | CHST6 | carbohydrate sulfotransferase 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT513446 | EMP1 | epithelial membrane protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT513736 | PSD3 | pleckstrin and Sec7 domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT513996 | CENPQ | centromere protein Q | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT516538 | MIXL1 | Mix paired-like homeobox | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517606 | SAV1 | salvador family WW domain containing protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518064 | CEP89 | centrosomal protein 89 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518119 | RNMTL1 | mitochondrial rRNA methyltransferase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT518325 | WDR92 | WD repeat domain 92 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT519048 | ABCB11 | ATP binding cassette subfamily B member 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT520972 | SPPL2A | signal peptide peptidase like 2A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT521359 | RPL35A | ribosomal protein L35a | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT523359 | GTF3C6 | general transcription factor IIIC subunit 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT523801 | FAM63A | MINDY lysine 48 deubiquitinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT524622 | C7orf73 | short transmembrane mitochondrial protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT525550 | PHB2 | prohibitin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT529709 | ZBTB49 | zinc finger and BTB domain containing 49 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT531605 | PLEKHA6 | pleckstrin homology domain containing A6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT532387 | UMPS | uridine monophosphate synthetase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534468 | SCD | stearoyl-CoA desaturase | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT537546 | ETNK1 | ethanolamine kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT541619 | C11orf31 | selenoprotein H | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT548380 | ENPP5 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (putative) | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT549523 | HDDC2 | HD domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT549774 | SOD2 | superoxide dismutase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT550578 | SLC2A5 | solute carrier family 2 member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT551498 | CENPN | centromere protein N | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT552301 | ITGA3 | integrin subunit alpha 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT555400 | PPM1L | protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1L | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556399 | LUC7L | LUC7 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT557047 | HOXB3 | homeobox B3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT558072 | ERO1L | endoplasmic reticulum oxidoreductase 1 alpha | ![]() |
1 | 2 | |||||||
MIRT559659 | AHCYL2 | adenosylhomocysteinase like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT561239 | ZNF354B | zinc finger protein 354B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT566899 | LRIG2 | leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT568786 | FAM120B | family with sequence similarity 120B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT574014 | MRPL12 | mitochondrial ribosomal protein L12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT574885 | Dnajc6 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575243 | Serping1 | serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade G, member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576194 | Vsig2 | V-set and immunoglobulin domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576309 | Acbd7 | acyl-Coenzyme A binding domain containing 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576484 | Lhx4 | LIM homeobox protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 3 | ||||||
MIRT576646 | Mill2 | MHC I like leukocyte 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT576708 | Kras | Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576855 | Socs6 | suppressor of cytokine signaling 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT576950 | Aldoa | aldolase A, fructose-bisphosphate | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT617133 | ZNF556 | zinc finger protein 556 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT617928 | ZNF783 | zinc finger family member 783 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618981 | MRPS16 | mitochondrial ribosomal protein S16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621100 | SIX3 | SIX homeobox 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT624537 | BROX | BRO1 domain and CAAX motif containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625663 | C2orf48 | chromosome 2 open reading frame 48 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT627059 | DCTN6 | dynactin subunit 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT628319 | CLPB | ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT630859 | ENTPD5 | ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT632295 | TMEM65 | transmembrane protein 65 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT634115 | ZNF207 | zinc finger protein 207 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT634736 | CYP20A1 | cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635655 | NDST3 | N-deacetylase and N-sulfotransferase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635772 | PDCL3 | phosducin like 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635911 | LILRA2 | leukocyte immunoglobulin like receptor A2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT636365 | OGFRL1 | opioid growth factor receptor like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT637251 | GLRX2 | glutaredoxin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT638705 | FZD4 | frizzled class receptor 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT639640 | PREX2 | phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT639676 | PPEF2 | protein phosphatase with EF-hand domain 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT642267 | SMIM17 | small integral membrane protein 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT642372 | ZNF581 | zinc finger protein 581 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT643545 | SLC25A17 | solute carrier family 25 member 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647994 | PDE12 | phosphodiesterase 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649094 | NOM1 | nucleolar protein with MIF4G domain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650993 | ZNF770 | zinc finger protein 770 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT651956 | UBE2N | ubiquitin conjugating enzyme E2 N | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652977 | SUN2 | Sad1 and UNC84 domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT654389 | RBM12B | RNA binding motif protein 12B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655637 | OLFML2A | olfactomedin like 2A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655729 | NRXN3 | neurexin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658171 | FCHSD1 | FCH and double SH3 domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660937 | ACOX1 | acyl-CoA oxidase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662112 | CERKL | ceramide kinase like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662302 | MPV17L | MPV17 mitochondrial inner membrane protein like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662993 | TMEM59 | transmembrane protein 59 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663071 | SFR1 | SWI5 dependent homologous recombination repair protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663704 | ABHD17B | abhydrolase domain containing 17B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663864 | MUC20 | mucin 20, cell surface associated | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665185 | HAUS5 | HAUS augmin like complex subunit 5 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT665402 | WEE1 | WEE1 G2 checkpoint kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665688 | TNPO3 | transportin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665795 | TMEM170A | transmembrane protein 170A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665847 | TIAL1 | TIA1 cytotoxic granule associated RNA binding protein like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT666999 | PDPN | podoplanin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT667598 | LIPC | lipase C, hepatic type | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT668576 | ELMSAN1 | ELM2 and Myb/SANT domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT670960 | UGGT1 | UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT671187 | ZNF891 | zinc finger protein 891 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT671739 | ZNF451 | zinc finger protein 451 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672745 | ZNF585B | zinc finger protein 585B | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT673446 | ZNF583 | zinc finger protein 583 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT679843 | GPR75 | G protein-coupled receptor 75 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT680556 | ZNF584 | zinc finger protein 584 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT680661 | C1orf210 | chromosome 1 open reading frame 210 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT681285 | RFC2 | replication factor C subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT683264 | ZNF329 | zinc finger protein 329 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT684519 | C1orf174 | chromosome 1 open reading frame 174 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT685065 | GEMIN4 | gem nuclear organelle associated protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT685157 | DTWD2 | DTW domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT685168 | ERCC1 | ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT685470 | CACNG8 | calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT686001 | NEK4 | NIMA related kinase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT687027 | RNF24 | ring finger protein 24 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT687543 | MOB1B | MOB kinase activator 1B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT687592 | MANEAL | mannosidase endo-alpha like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT687753 | KIAA1328 | KIAA1328 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT688050 | GLUL | glutamate-ammonia ligase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT688374 | ENPP1 | ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT688802 | CBFA2T3 | CBFA2/RUNX1 translocation partner 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT688957 | ATXN3 | ataxin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT689281 | C5AR2 | complement component 5a receptor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT689988 | NNMT | nicotinamide N-methyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT689997 | MMP17 | matrix metallopeptidase 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT690014 | LUZP2 | leucine zipper protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT690161 | ELP3 | elongator acetyltransferase complex subunit 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT690379 | ZSWIM7 | zinc finger SWIM-type containing 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT690563 | MICA | MHC class I polypeptide-related sequence A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT691891 | EVC | EvC ciliary complex subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT693107 | SCNM1 | sodium channel modifier 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT693832 | ZFP64 | ZFP64 zinc finger protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT694105 | ZNF446 | zinc finger protein 446 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT694179 | ZNF486 | zinc finger protein 486 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT694475 | LRTOMT | leucine rich transmembrane and O-methyltransferase domain containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT694998 | GGA2 | golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT695031 | ALG10B | ALG10B, alpha-1,2-glucosyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT695163 | TCTN2 | tectonic family member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT695525 | SLC25A34 | solute carrier family 25 member 34 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT696067 | ZNF264 | zinc finger protein 264 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT696616 | CRIPT | CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT696661 | AGXT2 | alanine--glyoxylate aminotransferase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT696705 | PNPO | pyridoxamine 5'-phosphate oxidase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT697173 | INMT | indolethylamine N-methyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT697303 | ZNF652 | zinc finger protein 652 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT697491 | ZBTB8B | zinc finger and BTB domain containing 8B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT698657 | TERF2 | telomeric repeat binding factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT699042 | SOAT1 | sterol O-acyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT699185 | SLX4IP | SLX4 interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT699598 | SHOC2 | SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700150 | RNF115 | ring finger protein 115 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700720 | PNO1 | partner of NOB1 homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700870 | PER2 | period circadian clock 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700912 | PDXK | pyridoxal kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT701095 | PAPOLG | poly(A) polymerase gamma | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT701194 | OTUD3 | OTU deubiquitinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT702203 | LPP | LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT702272 | LHX4 | LIM homeobox 4 | ![]() |
![]() |
2 | 3 | ||||||
MIRT703125 | GPRC5A | G protein-coupled receptor class C group 5 member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT703252 | GNS | glucosamine (N-acetyl)-6-sulfatase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT703262 | GNL3L | G protein nucleolar 3 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT703440 | FYTTD1 | forty-two-three domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT704321 | DCUN1D5 | defective in cullin neddylation 1 domain containing 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT704393 | CTSS | cathepsin S | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT704483 | CPT1A | carnitine palmitoyltransferase 1A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT704880 | CCSER2 | coiled-coil serine rich protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT704926 | CCDC36 | coiled-coil domain containing 36 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT705175 | BZW1 | basic leucine zipper and W2 domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT706561 | EIF2AK2 | eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 2 | < |