pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-635 |
Genomic Coordinates | chr17: 68424451 - 68424548 |
Synonyms | MIRN635, hsa-mir-635, MIR635 |
Description | Homo sapiens miR-635 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | |
Associated Diseases |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-635 | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 16| ACUUGGGCACUGAAACAAUGUCC |38 | |||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||
Experiments | SAGE | DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Biomarker Information |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | RAP2B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | - | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | RAP2B, member of RAS oncogene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_002886 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on RAP2B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of RAP2B (miRNA target sites are highlighted) |
>RAP2B|NM_002886|3'UTR 1 GGCGGCCACCGCGCGCCGGCCGCGCTCTGCGCACAAAAGCCAAACGCATCCGACTCTCTAAATGTGATTTATTTCTTGCT 81 TTGAGATTGGAGACCACTTTGCATTGGCCAGGGTGTCTTGGGAGCCCGGCTGGCCTCCGCGGCCGGCGTCCCCTGCCTCC 161 ACCCTGTGCCCGAGGGGGTGTCCGGTCCTGCCCATCCGATACTCTGGTGGAAATGTGGCTCTTTGCAGCATGTACGTTTC 241 TCCCTGATTTTGGTTGATGCATATTTCCCCGTTTAAGTAGCCGTTAGGGCGCAGTATCGGCAGCTTGACACCCACCAAGC 321 AAAAGTTTCAGCCTGGAAAAAAAATGGGGGGGAAGGGTGGATGAAAAGGAGGGAGAGAAGGTGGAAATGGTTTTTTTTTT 401 TTTTTTTCTATTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTCAACAGCCGTTTTTCTAGTTCCAAGTTTTAAATACAT 481 GGAAGGAAGTCCGGGAGAACCATATGAAGGAGCAGGAGGAGAGGAAGAAACTTTTTTTCCTTCTTTTCCAGGAGTAGCTG 561 GAAATTAAGATCGGGTTCCTTTTCTGCCAGCTTGGAAGGGCAACCCCATGACTGATTGCGATTCTGAGGATGTCTATGCA 641 AAGTTGGATTCTTGTTACAGTGTATCCAATCTGAAGTATTGCACATCTGAACTGGGACTGTTAACACTGATGCCAATACA 721 GTGTGGGGTGCCAGAAAGTGTCTGCTGATATTTGTGGAAAAAAAATCTATTTTGTTTACCTACTGTATCAAAGGGGAGTC 801 TGGGGGAGAATGGTAGTATTTTTTTTTTTTATCAGCTGTGAAAAAAATGTTACAGATCTGCACATTTTCGTGTGTACTAT 881 GGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGGTGTGTGTGTGTTTTAAGTTTAGCCTTTTGTTTTTGTTTTTTGGTTGGCAGTAACCGA 961 TTTTAATGACTAGCTTTTAAAAATACAGTACAAAGACTTTGTAAATGTGATTCAGGGCCCCCAGCACCCCTGTGTCTGCA 1041 GAGTGCCTTCAAAACTCAGCTGTTCCAGCCGGTGCCAACCTGTGAACTTCCCACCATATCCCAGAATCTGCTATTCCCCA 1121 AACCACTTCCCAGTTTCCTTTCAGTAATCTTTCTGAAGGAGCCAGGACAATAGGGCCTGTTGTTTAGTGAATTTCTTTAT 1201 TATTTTCAGCCTTTAAAATGTAATTTCCATCTCTTGCAATGAATTTGTTTCCCTTTTTTTTGCTTCATTTTGTTTAAATT 1281 TTCAGGTATTTAGCTCCCCTTTCATATTATTTTTAAATTTTTTAATTACCTGTTGTAGGGTGTTCCTCCAGAAGCAAAGA 1361 GCAAAATTTTACTGTTGTGATGTACCAATTCTAACTAATTGTAATTTTTAATTTCATGCGTTTAATCATTGTCTCTTCAT 1441 TTTAAGACTTTTAATACAAATGTCATTTTTAAAGAAACAAACCCAAAACTATTGTTTGTGTTTCTGTGTTTCATATTCAG 1521 TGATTTAATACAGTATCATGGCTGAGGTGGATGGGGCAGGTGCATGATACTCTTCAGAGCTATTTGTGAAATTTTAAAGA 1601 CAGAAGTGTCTCAGTGACAAGTTGGATGACACTACTCCCAACTTTTTAAATTTGGAGAAAACCATCAAGGTCGAGGAAGC 1681 CCTGGGTATGGCCATTACCATCTGATTAGAAGATGAACAGGTATTTTGAATCTGATCTGACATGGAACAGTTTACCTCAT 1761 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AAGTACTGTCTGGAGGGTTTTTTTAAGAAAAGGCATTTGGCATTTAACTGTCTCTTGTTTTATTTTTAAGTTTTTGGAAA 2721 CCTTTTGACATAAAATGCTGCCAAGTATCTAAGAAATGTATATACTGACAGAAGATATTTGAAAGTGGAAAATTGGAAAT 2801 GAAATATGTTGCTGGGTGCGTTAATCACCTCCGCCCAGGATTTAGTCACTTGCAGGACCTCTTTATAGTCTAGGATGGCA 2881 GAGCAGAAGATTTTAATATGCTTTTATTAAGTGATGTAAAATAAATGCTTTTTGGATTATCAATGAAAGCAATTTTATGT 2961 GTGCCTGAAGCAAGAAAATAGCGTTTTTGGTTTTATCTCATATTTTCTTGGCAAAATTGAGAGAAATTAGGAACACTGCT 3041 ATTTTTTTCTTAAAAATGTTTTTAAGAATATGTTCGTTTCTTTGACTATTAAGAACCCCTTGTGGTATTAGTGTGTGAAG 3121 AGATAAGGGCATTTGTTTCAATGAAAAAGTTAGTGTTAAAGGAAGTGAGTCAGGGAGGGCGGAGTTTGTTGTAAGGCAAT 3201 CACCTGTCAAAACAGAAATTGGGTGGGAAAGGAGTCTTTATCTTGGGGAGCAAAAGCTGACTTTTAAACTTGACCCCTGC 3281 TGTTTTTAAACAGCTTTTCCTTTTGGTCTCTGACAGTCAATCCAGGTTTTATGTTATTTCAAAAGGGTTATTTTTGTCCT 3361 CCTTTTTTAATAGCTTCAGGAAAGTTAAAGGTATCATCTTAGGTCTAACACTCTAGTCTTTGAGAGTTACGGTTCTTTCG 3441 TAGAACAATTTCCATGTTGTTAACTGTTGTAGACTTAATTGAATCACATTTTGGGACCAGATGTATTTGGGGATAGAATT 3521 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GACATATACCATTTATACTAAGACTAACTGTTGTGTGTGAAATAGAATAAACATTGCAGGTAGTTTTTGATCATTTTCAC 4481 ATTATTACAGGAACATTTTGACTATGGTTTTCAATGTTAATTCAGAAGTTGACTTTAAATGAAAATGTGGTTAGAATAGA 4561 GGCAAAGCCTAAGTGATCAGAATCAACATTCCCCTTCTCCCCAACCTAGGGGAAAAAAAATTTGAAAAGTATGTCTTCAA 4641 TAAAAGGGGACACTTTATTTGTCTTCTCTTCAACATTAAAAAACAAAGATTTTAAGTTTTCATGGCAAGGGTTCTAAAAA 4721 TCATTGTGCCAGAGAATTTAAATCTTCATATCATGGTAAGCACATGCGTATGTCTGTGACTCAGTTTCTTAGCCAGACTT 4801 CCAGGTGTTAGTTAATTCCTTCTCATTTAGTTCTACTGTAATCCATTCTGGGAAAATGCATACCACAAAACTGTGTATCT 4881 TGCAGCTTCTTTCGTTATGCATCTTAATTCCCTCAGAAGGTCCCAGAACTTTATGTTAAAGATCTGGGTTTTTAAAGACA 4961 ATTTGGGGGCCTTCTAAAGAAACAATAGTAGATCTAATTACAAGTAGTGGATTGCTTACTTCAAATTTCTCTTTTACAAT 5041 TTAGAAAGTTTAGTACCAGTTTATAGACTGAGGGAGTAGTAGCTACTATTTAGATGCTGAGAATAATATTATCATGCTTG 5121 GGTGGGGAAGAAAGGCCCTTACTCAAATCTCCATTTTCATTTTTAATGCTTCCTGGACTTCAGTTATTTTCTTGCTTTTG 5201 CCTCAAGAATAATAAATATTTTTGGTTAAAATTTTTTTTGTTCAACCCTGTTGTTGTTACTGTTATTTTCATAGCACAGT 5281 AGTCTACAGCTCTCTATAGTAGCTTAATAGCTATTTGCTGAATGAATGGAACATGGAGTGTTACATCTGAAACTATTCTA 5361 TTAGAAGGTGAAAAGTGTTGATTGAAGAATGGTAGGATTTTATCTTCCCTACCCATGATAGATTTATTAAGATTGTCTTT 5441 GGAGCTATGTCTTCCATTCCAACTATACAGAAATAAACTTTTTTAAAGTTTAGTTTGCCCATCTGATAAAGGAACATTCC 5521 TGTATGCTATTCTAAGGTTCATTTTCAACAAAAGTTACAGACATTTATGGTTGATAGTTTGAGATCTATGACAGTTTTAG 5601 GGAGCTCCATATTCAAAAGGCTATTGCTGGTGATAGTACAATGAAACACTGACTTCAGTATATTTTTATCTTGGCTTTCA 5681 TTTTACGGTTATTTCTACTACTGTTAATATGGACTAATACTTGATTTTGTGAACCTGTTTTAATTTTAGGGTTATATTTA 5761 TGTTGGAATAATATATTTTAAAAGTGTCCTATACTATGAATTTATTTGCCATATATAAGACAATCAGAATTATCTGGTAG 5841 TTTATTCTAATCCTGGTTAATAATCATTAGGACTAAACTATTTACATTAAAGAAGGAAAAAACAATGAGATGATAATTTT 5921 TTTTTTCTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGGCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACTTCCGC 6001 TTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTTTCCAGTAGCTGGGACTACGGGCGCCCTCCACCACTCCCGGCTAAT 6081 TTTTGTATTTTTCATAGAGACAGCATTTCACCATACTGGCCAGGCTGGTCGTGAACTCCTGACCTTGTGATCTGCCCACC 6161 TTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCACCCAGCCTTTTTTTTGAAATGGAGTCTGGCTCTGTCG 6241 CCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTAGCCTGCCTCATC 6321 CTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGTGCACCACCACGCCCGCCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACT 6401 ACGTTGGTCAGGATGGTCTTGAACTTCTGACCTTGTGCTCCACCCACCTCAGCCTCCCAAGAGTTGGGATTACAGGCGTG 6481 AGCCACTGCACCCGGCTGAGATGATAATTTTATTTAAAAAAAAAATTGTAGAGATAGGGTCTTGCCGTGTTGCCCAGGCT 6561 GGTCTCAAATTCCTGGGCTCAGGAGATCTTCCCTCCTCAGCCCCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCACTGCAT 6641 CCAGCCAGGAGTGACAATTTCTAAAGCCTTAATTAGTGAAATGGTTTGTTTTGAGAAGCAGAAATGACTAAGTGGTATAG 6721 ACATGCAGGAAAAGCAAAATGGGCCTTATGGCTATTGAAATTATGAGTGTTGATCTGTTCTATAAATTGGAGGAGACAGC 6801 TATTTGCATTCTTTCTTATCCAGTTGACTAAACTTACTCATTTTAAAATGAATTATCTTGCAAAATTATGTGAGGTTAAG 6881 TTTGTCAGAGGATTGAAAACGTGGTTGGTTTATTTGTGGTAATTGTGAAAAATTGCAAAGGTAGCAAAATTTTTTAAAAA 6961 ATGGAAAAGAGAAAGATTATTGATGCCTTGTGAATACAGGTGTCCCCAAAAGGCCTGAGACCAACCTTAATTATCAAGAA 7041 TATGGTTGCAGTGGAAATTGGTAAACAGCTGAAATTGATTCATTGATTATTCAACACTTATTGAGCACATACTACTATTA 7121 TTAATAGCTGTACTGCGAGCGCTAATACTTAAAAGAGGAAGTCAGGTGAAGGCGCAACAGCTTTATGCTCTTTTTCACTA 7201 TAATCTGTGAAATAGTGTATATTAAACAATAATAGTATATGGAAAAGCACATCTACATGTGTCATCAGTTATAATACTGT 7281 GGGGCTGTTTGGCAGACAATAGAGTAGATAAATTTATTGAACATTGGGCCTTTGAAAGGTATGTGGAAATTGTAAATAAA 7361 AATGGATTCCATGAATTTC Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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