Gene Symbol |
PLA2G12A
|
Synonyms |
GXII, PLA2G12, ROSSY |
Description |
phospholipase A2 group XIIA |
Transcript |
NM_030821
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on PLA2G12A |
|
3'UTR of PLA2G12A (miRNA target sites are highlighted) |
>PLA2G12A|NM_030821|3'UTR
1 AGGAGATGCCGACAGCTAGTGACAGATGAAGATGGAAGAACATACCTTTGACAAATAACTAATGTTTTTACAACATAAAA
81 CTGTCTTATTTTTGTGAAAGGATTATTTTGAGACCTTAAAATAATTTATATCTTGATGTTAAAACCTCAAAGCAAAAAAA
161 GTGAGGGAGATAGTGAGGGGAGGGCACGCTTGTCTTCTCAGGTATCTTCCCCAGCATTGCTCCCTTACTTAGTATGCCAA
241 ATGTCTTGACCAATATCAAAAACAAGTGCTTGTTTAGCGGAGAATTTTGAAAAGAGGAATATATAACTCAATTTTCACAA
321 CCACATTTACCAAAAAAAGAGATCAAATATAAAATTCATCATAATGTCTGTTCAACATTATCTTATTTGGAAAATGGGGA
401 AATTATCACTTACAAGTATTTGTTTACTATGAAATTTTAAATACACATTTATGCCTAGAAGGAACGGACTTTTTTTTTCT
481 ATTTTAATTACACATAATATGTAATTAAAGTACAACATAATATGTTGTTTCTCTGTAGCCCGTTGAGCATATGAGTAAGT
561 CACATTTCTATTAGGACTACTTACAAGGACAAGGTTTCCATTTTTCCAGTTGTAAAATTGGAACCATCAGCTGATAACCT
641 CGTAGGGAGCAACCCCAGGATAGCTAAGTGTTATGTAATATGCCTAGAAGGTGATGTGAATGCGATTCAGAAGCATAGCC
721 ACTCCCATTTTATGAGCTACTCACATGACAAATGTCATCTTTTGCTATAACCTTTGCCAAGTTAGAGAAAAGATGGATTT
801 AATGAGATAAATGAAAAGATATTTAACCTAATATATCAAGGCACTATTTGCTGTTATGCTTTGTTATTTATTTCCCAGCA
881 CTTGTTCCTTATTGTAGATTTTTTAAAGACTGTAACCTTTTACTAACTGTGGTCTTACTAAAATTTGTGCTTGATACTGC
961 TTTTCAAAAAGCCTTTAATTAGAGCCAAAAGGATGGAAAAGGCAAGATATAAATGCCTTTTATAGATCTCTTATTTACAT
1041 TGAAAATTATTACCATATGTTTAGAGCAAATCCAAGAAAACTTCAACAGCTTCTGAAGATGTCTATGAATGTTGAAAACT
1121 TTTCAATCTCTTGGAATGCTCAGTTATGTTCCTAGACCGGTCTTTGCTGACTACTGGTTGTTAACCTTTCCCTAGCCTGG
1201 GACCTCAAGCCATATATATCCTTTGGGTGACCCATGGCCAAAGTTATTAAGATGAACTGACTTTCAAAGTCAGAGAAGGA
1281 CAGCATAGGGAGAGGCGGTTATTTGTAAGTCATTACAGGTAGAACAGGGCAGAAGGAAAAGTATGTTCTGGAGAAAGGGC
1361 CATGTTCCTAACTTTGGAGATATGTCATTGCCGGGAACCTAGTATCTTCCAACTTGAATTGGTGGCAGCTGTTCCAGTGA
1441 GACAAGGCACATGTATGCCTTGTGGCTAAGTGAGCAAACTGGGTTTCCACTTAAATGTTTGGGACCCTCAATTGATTCTT
1521 TATTTCAAACCTTTATAAAAGGTACAGTTTTGTAAGCCATTATTAATAATTAATGCTTATCGGCTGGGCACAGTGGCTCA
1601 CACCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGTTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCTGGCCAACAT
1681 GGTGAAACAGCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTTGCCGGGCGTGGTGGCGCATGCTTATAGTCTCAGCTACTCAGGAA
1761 GCTGAGGTACGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCACTGCACTGCAGCCTGGG
1841 CAACAGAGCAAGACTCTAAAAAAAAAATGGTTTATCAATATTTACTATTGAAATATTTGTCCAGGTAACTTTACACTTAC
1921 AATGAATTCATGGATTTTGTTAGCAGCATTGGCTTTCTCAAAAGGACAAACTCAATATCGTTATAAAATATAATTCGTGA
2001 TCACAAATTATACAAAAATCAGTAGAAACAGTTTTTTATGTTCAGATTAAAAAAAAAAACTTGGGATAATTTTAGATTTA
2081 CAGAAAAGTTGCAAAGATACATGGAGAGCTTCTGTGACCACTCACCCAGTTCCCCCAGTGTTAACCTTTTATTTAACCAT
2161 GAAGCATTTGTCAGAAGCTAAGTAACCAGCAATGGCAATTACTATTAACGGAACTTTGACTTTATTTTTCAGATTGTACT
2241 AGTTTTTTAATTAATGTCATTTTTCTTTTCCAGGATCCAATCTAGGATACCACACTGAATTAGTCGTCATGCCTAATTAG
2321 CCTCTGGTCTGTGATAGTTCCACAGTCTTTCTTTTTCATAACCTTGACAGTTTTGAGGAGTACTGGTCAGGTGTTTTGTA
2401 GAATATTCCTCAATTTGGGTTTGTCTGATGTTTTCCTCATGGTTAGAGTGGGGTTATAGATTTTTAGGAAGAATACCAGA
2481 GGTGAAGGTCCTTCTCACTGCATCATGTCAGGAGTTACATGCTATCAGCTTGATGGTGTATTAACTTTGGACACTTGGTT
2561 AAGGTAGTGTGTGTTGGTTTTTTGCTGCTGAAAATTACTGTTATTTTCCCTTTCCATACTTCTGTTCTTTGGAAAACAGT
2641 CACTAAGTCCAGTCATGGGAGGTGGTGGGTGGGAAAGATTACATTCAACCCCCTGGAAGTGGGAATATCCATATGTAGTA
2721 TTTGGAATTTTTCTATATGGAAAATTTGTTTCTCCCTCCCACCCTAATTTGTTTACATCAGTATGGACTCATGTATATTT
2801 TGTATTTTGGGTAACACAGTATTTATTTTGTTGCTTAAGTTGTCCAGCTTGGCTATTAGGAGTTCTGCCAGGTTGGCTAC
2881 TATGTCCCTTTGATGTGCCCATCCTTTTGATTTTTGAGCACTTCTTACTTTCTGGCACTACAAGATGCTCCAGGTTCATC
2961 TTGGATATTCCCTGCCCCAACCCTAGAATCCCTAGAATCAACCCCTGCTCCAAAGAGCCCTGGTTCCTTTTGTTGGAGAA
3041 TCATACTTAGAAACCAAGATCTGGGCATTAGATGTGCTTGTTGCTACTGGGATGTCACTGTTTGTAGCAGAGTTGAGAAA
3121 TATGTATGTATATTAATCCATGCATATGTACACATCTATAATTATTTATGTGTGTACAAAGCTAAACATGAGTTTGTACT
3201 GCCGTCTTCAACTCAAAATTTGTCCCAAAATTTTGTGGCATATGTTTAGATTTTAAAGTTGATATTTTCCCTATTGACAG
3281 AATAAACTCATTAAAAGAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAAGAACTAACTGTCAGCAGCTCTTTGCAAGAAAT
3361 GTAATATTGATACTTTAAAATAATACTGCCTTCAAATGATGCCTGTCTCTTTAAAATCTTTTGACATAGTTCTTCCAGGG
3441 ACAGATATGGCTGTATTTATTTCATAGATGGAGAAACTGAGCACAGAGCTGTAATGAAGACAGAATTGAGATATAAGGGC
3521 AAAAGCTAATTAAACGCATCCTCACAGGTAGCCTTTCTTTCAGTGAACCTGTAGACTAGTCCAGTAATACTTATTAAAAT
3601 TAGTTGTTAGAGGCTGGGCATGGTGGTTCAAGCCTGTAATCTCAGCACTGTGGGAGGCCAAGGCGGACAGATCACTCAAA
3681 GTCAGAAGTTCGAGACCAGCTTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGTTGGGTGTGGTG
3761 GCACATGCCTGTAATCCCAGCCACTCGGGAGGTGAAGGCACAAGAATTGGTTGAACCTGGGAAGCAGAGGTTGCAGTGAG
3841 CTGAGATTGCACTGCTGCACTCCAGCATAGGCGTCAGAATAAGACTCTGTCTTGGAAAGAAGAAAAAAAATTGTTAGCCT
3921 AAAACCAACTCTCTCTAAATTTAAAAGAGTGATTATTTATCTTAGTATTTATAGAAGTATGAGATTATCAGAAGGTGCGA
4001 TGCACAATGCTCATTATTTTATCCTAGTACAAGACACGTATAACATCTAACAGTAAAGAAGATGGAATCTTTCTATAAAA
4081 ACAATTCTGTTATTAATAGTTGACTGACTTCAGTAACTTTGAGGAGTAGAATGAAACTTATTAGGCAAGATCTTTCCACA
4161 TACACTACATTGTATTGTTCAAAATTCATAGAAATTACTTGCAATATATTGATTTAAGCCTTATGTAGTGACTGTTGCTA
4241 TATTTGAAGTAGCATTTTTAGTTTGCTGTTTTTCCTCACTGCTTAATCCTACAAAAACCAGCCATCTGCCTAAAAAATAA
4321 AAGAGCAAAAATGAATCAGTGCAACCGGTATACGAAAAATAATAATTATTAATAAAACTGTAAAGGGA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' agGUAGUCC---UCAGUACCUUCga 5'
|| :| | ||||||||:||
Target 5' gtCACTAAGTCCAGTCATGGGAGgt 3'
|
2639 - 2663
|
132.00 |
-17.20 |
2
|
miRNA 3' agguaGUCCUCAGUACCUUCGa 5'
|||||| :||||:|:
Target 5' gaaccCAGGAG--GTGGAGGTt 3'
|
1782 - 1801
|
129.00 |
-19.90 |
3
|
miRNA 3' agGUAGUCCUCAGUACCUUCga 5'
|| | || |||||||
Target 5' gaCAGATGAAG--ATGGAAGaa 3'
|
21 - 40
|
128.00 |
-11.50 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|