pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-6867 |
Genomic Coordinates | chr17: 40193597 - 40193663 |
Description | Homo sapiens miR-6867 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-6867-3p | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 47| CUCUCCCUCUUUACCCACUAG |67 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Meta-analysis | DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | SPTLC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HSN1C, LCB2, LCB2A, NSAN1C, SPT2, hLCB2a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_004863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on SPTLC2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of SPTLC2 (miRNA target sites are highlighted) |
>SPTLC2|NM_004863|3'UTR 1 GCCTTTTTGGTGCTCCCTCAGAGGAACTCTCCCTCACCCAGGACAGCCTGTGGCCTTTGTGAGCCAGTTCCAGGAACCAC 81 ACTTCTGTGGCCATCTCACGTGAAAGACATTGCCTCAGCTACTGAAGGTGGCCACCTCCACTCTAAATGACATTTTGTAA 161 ATAGTAAAAAACTGCTTCTAATCCTTCCTTTGCTAAATCTCACCTTTAAAAACGAAGGTGACTCACTTTGCTTTTTCAGT 241 CCATTAAAAAAACATTTTATTTTGCAACCATTCTACTTGTGAAATCACGCTGACCCTAGCCTGTCTCTGGCTAACCACAC 321 AGGCCATTCCCCTCTCCCAGCACCTTGCAGACTTGGGCCCATCAAGAGCTACTGCTGGCCCTGGCTCCGCAGCCTGGATA 401 CTTACCTGGCCCTCCTCCCTAGGGAGCAAGTGCCTTCCACTTACTTCCCATCCAGGTCTCAGAGGTCTCAAGGCCAACCT 481 TGGAATCCTTATTTAACCATTCAAGTAATCAACGGAAGTTTTCACCCTTTAATCTTAAGTTTAGCCTTTTAAGAAAAACA 561 GTAAGCGATGACTGCTGAAAGGCTCATTGTGTAATCTCCCAAGGGTTTGGTCTTATTCCATTTTCTTCTGGTCACCAGAT 641 GATTTCTTCCTTTACCATCAAATACTTCTTCATAATGGTCACAGTCTGAGGATGTGCGCAAATTCTGGTTCTTCCCAAGC 721 TCTAACCGTAACACGTCCCACCCCCTTTTTAAAGCACTTACTGTTTTCAGAGCACCCATATCCCACCCTGGTGAGAAGGC 801 CACTCTCACATCTGAGTGTTGGGTACAAAGCTGCTCCGTAGAGTGATGTGCACTCCTGGTGGGTGAGGGGCAGGGGCAGT 881 GGCAGTGTGCAAAGAATTGATTACTCCTTGCAGAGCCTGTGGCTTGCATTTCCTACTGCTTTCTACGTTTGAAAATTATG 961 ACAGTCTCTGGCTAGGTCTGGGTCCAGATTAGGATTTAAACTGATAAAGGAAACTGTTGGTAAATCCTCTGCTCAGAAAG 1041 CATTTATCATGTTCCTATTTAAGGATTAGGTTTATTAATTTAGGCCTCTTAGAAGCTAACCCACTTAAATATTACTCTTC 1121 TGAATGCTAGTTCTCTTTTATTCTTGATGTCCTAAGTCAATTGAATCTGGCATCTGGGGCTAGGGTCTGCCTGTCTACAT 1201 ATTTTTTATTTTTTTCTGAGAAATTCTGAACACATAGATCTCTTTCCTAAACTGACATTTTCTATTTTGACTGTTTTCAT 1281 ACTATAACCAGGTAAAGGGACTTCTTTCAGAGAGCTTTATACTGCCTGACCAAAGAACAAATCTGAAAATCACCATTTTA 1361 AAGTTATTTTTTCAGTTGAACCAAAGTTTAAGTGAAGAGGACTTTTGGCATATTATACCCAGGATCAGTTTGTCTTTTTG 1441 TATCCATCAAGTATTACAGGAGAAGGATTGGGAACAGAATGGAAAAACAGTGTATGAAAGTCATGTTACAGGCCGAGTGC 1521 GGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGCTCACTTGAGGTCAGGAATTCAAGACCAGCC 1601 TGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAAGACAAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCGGGCACCTATAATCCCAC 1681 CTACTTGGTAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGACGAGATTGTGCCACTGCAC 1761 TCTAGCCTGGGTGACAGAGCAAAACTGTGTCTCAAAAAAAAAAGTCATGTTACACATTTAAGTTTTTGAAATTGCTCCTT 1841 TTATCGGTAAAGATTCTCAATCCAAATTCTCCTGGGTGTGTTGTCATCAGCTGTGATATGTTTGTGCACATTACGTATAG 1921 CAGAGGATGTAAGCAATATTATTGTTTGTGAAGTTTTGTTTTTAATGTCTTGAGTATGAGTTATGTTTAGTCACTGTCAG 2001 CATCTGAGAACTTTAATAAGCCCTTGAGATATTCCAAAGTTTTATTTTACTTTTTTAAAGAACAGAAAAAGATGAATGAA 2081 AGAACCAAGGAGAGATGCAGAGACTATATTTAGCATGTATAGGTTAAAGTAAGAAGGAGGTTGTGGTAACTAAATAGGAG 2161 TCCTATAAAATCAAATACATTGTCAACCTTTTCTGCACATCTAGTTTCCTACCATAGAATCCCACTGGAATACCACATAG 2241 CTTTTGCACTGCAGTTACTATTTACTAATGTAAACGTAGGGTTTGTAAAAGTCACAAACTTATAAGCAATGAACTTACCT 2321 GCTAGTCTTTTTATTTTGGCTTGCATGAAGTCACTGCAAATTCAAATGTCAGTACCGGCATTTAAAATATATCTATATCA 2401 CTTTGTTGGTACAAAGTTATTTCAAGATAAGTGTAATTTTGTTACAAGTTTATTTTGAAGAGACAAATCTCCTGTGATCT 2481 ATGCAGGACCTCTGTACTTTCTAAAGAACAAAATGTTATGTAGACATTATACATGGTTGGTTGTCTCTTCTTGAAACTGT 2561 AATGTAAATCTAGGGTCCAGTCATATCCTAGGTATCATCATTTATCCAAGTACTTGGAGGAATACAAGTATATATAAATA 2641 CAGTCATTGAGAATAAGTCGATTTGAGGCATACAAGAGTAGTTTCTTACACAGTTTAACACGGCCTGATTCAAGACTCTG 2721 ATAGGATTCAAACAGATACCGGTTAACCATGACTACCAAAACTGATCATCTGAGTCGATTGATAGAGGTGTGACTAGTCC 2801 TTAGCACTTTTTCTCATTCCTCTTTTTATTCAGCATTGCTGTTACCTATTTCAGGTTTATAAGACCTCTTTCAGCAGATC 2881 ACATCAGAAGCCAGGAAATGCATAGCTAGGAGATGTCAAAAGCCCATATGAGGAGTGGACCAAGCAGCAGTGGCGGTTTC 2961 TCCTCGCATCTTTTTTTTTTTAAGCTTTAACTTAGCAGGGGCATGGACTTTATAGCACTTTTTCAACTTTTTGCTTTGCT 3041 TTGGATAAGAAATCCTTACCTTTAAAAAAAGCTTCTAGTCTCCATAACCCCCAAAGTACTGCTTATTTGTTTGAAGAATC 3121 CAGCCATCGTAGTGCTTTAGTCACTATCGTAAACATTCATGATAGGGCAAGGATTTTAAAACAGGATTCTTGCTTCTGTA 3201 GTCATCAAGGTGAACAGAAGCATCCTACACAACCACTAAGGGCTCTATGTTTGTGTCATGCCTCTTCAAACACCAAGGAG 3281 TTGAACATGCTTCCAGTGATTTGTCTCCGTAATGCCTTCTTCCTTTATTTGGCCTTTCTTTCTTTCTGTACCTTCAAGTT 3361 CTTGATTTTTAAAATTCCAACTCTAGAGAAAACCAATATATGGTGGTGCTGGGCTTTGAAGATAGCATATCAGACGCCTT 3441 GGTTCTGTTTGTACACTTAGCCTTACATTTCAGGAGGAGGCTTTTCATTAGGGGCTTAAGCTAGCTCCTTTGGCTTTTAA 3521 AAAAAATTTTTTTTCAAATTTCTTCATTACCTAAGGGAGCCTGCATCTAAATTTCTCAACTAGTTCAGCCTAGCTGAATT 3601 TTCTAGTGTGTTATACACTTTGCTTCCTTCTTATTGGTGAAAACCAGGGGGATGAGTGGCTTCCATGGAGAGATTTCCTG 3681 ATTTCTCAGGGAGGAAAAAAGTGATGACATTTACCACTACTTTTATGTTTTTCCCCTTTTTCCAAATTGATAAGGATTTC 3761 TGGTTCCTAGTGATCCGGGATTGGGCAACAGTGCAGAACTGCCAGTCATGCCGTAGGCCGTGAAGAAAGAATGTGAGTAA 3841 CTGTTGTTTTGCAAGGATTTGTAGGGTTATGGGCAGTTGTTGTTTGAAGCATTGCTATGACCTAATTCCCAAGGTATCTT 3921 TCCTCTCTTGGTGTTCTAGGTAAGCCAATGAGCTTTAATCTCTACTTGCTATAACCGTGTGCTTAGAAAAAGAGGTGAGA 4001 GTAGTGGTTTTCCTTCAAACTGTCCACATTCATGAAGATTATGAATTGTTAGGACAGCCAGGGCAAGATAGACCCTGTCT 4081 CTACAAAAATTTTTTTCTAAATTAACCGGGCATGGTGGTGCCTGCCTGTAGTCCCACCTGTGTGGGAGAATCACTTGAGC 4161 CTGGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCCATGATTGCACCCCTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGGCTCAAT 4241 AAGAGGGGGAAAAAAAATTGTTAGGAGCTGGGTGCGGATGCAGCCTGCAATCCCAGCTACTTGAGAGGCTGAGGCCGGAG 4321 GATTGCTTAAACCCAAGAATTTGAGCGTAGCCTGGGCAACACAGCAAGACCCCATCTAAGAAAAAAATGTTTTTTAAATC 4401 AGCTTAGCCCAAAGGGGTTGTGAATGGGGAGGTATAAAAAGCAAAGATTATTTTTTGGCTACTAAGCCAAGAACTTACAG 4481 GGATTTTTTTTTTCAGTCCCAGAACCTACAGATACCCTGCTACTTGCTTCACGTGGATGCTCAGTGCCCAGCAGCCATCT 4561 TAATACATTAAACCAGTTTAAAAAATACCTTCCATGTGGAGAAAAACATGTCTTTTTCTCGCCTCAACTTTATCCACATG 4641 AAATATGTGCCCATGGCTGGGCGCAGTGGCTCACCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTGAAGCAGGCAGATTGCTTGA 4721 GGCCAGGAGTTCGAGAACAGTCTGGCCAACATGGCGAAACCTCATCTCTACTAAAATTACAAAAATTAGCCGGGCATGGT 4801 GGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACGTCAGGAGGCTGAGGCACAGGAATTGCTTGAACCCAAGAGGCAGAGGATGCAATG 4881 AGCCAAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTTGGCGACAGAGGGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGGTGTGCCC 4961 AGGCCCCTAGCCATTGCCATGTGCCCAGCCAGAGAGCCAAATTAGAGGGCTGGCTTCCCTATCACACAGAATAAATGCTA 5041 GTGCTAGCCAATGATCCCTTTGCTTTTAATGTATAGAAAATACTGTTGTTCCTTTTGTCATTTCCAGTGACATCTGTTTT 5121 CTAAGCAGCTCTTTTCTAGGGAGGAAACCAAAGGGGCTAGGTTAAGACCCTAATAGAAATGTTTTTTCTAATCTCTGGTG 5201 AGTCTGGAAGTGTCACATTCACAGTCCACCCTTGGGAGTGGCTTGGTGGAGCTGGGGACAAGGTTTTGTTTACTACATAG 5281 TGCACATGATAAATGGCCTTAAACTGTGATTCTTTCTGGTAGGATAAGTTATAATAAACTGACCCTAAAGAATGCAATGG 5361 CTTTTAAACTGCAGTTACTGTGTTCTTAATGAAGCAATACCCAAAGCTCTGTTCTTTTGGAGCACTTGAGGGGAGCTTGA 5441 ATGAAAGGTGCAGATAAGAGCAGTACCTTGATCTTATGCTTTCTGAGTGTCCTGCCTTGTTGCCATCTGCATGGATGAGT 5521 GAATGCTTCTATGCACGAGGAGACTCAAGCCAACTCAGAGTCTGCTTTTTCCAACGCTCTTCCCAGGTTTCTTTTGCAAA 5601 GCTTGGTCATTTGGCCCAGGTCTTCCTGGAAAGTGGAGTACATGTCACTGACTAGGGTGGCGTGGTGTCTTTACCCTTAA 5681 CATTAAGTCTTGTTACCTCAGTGATGTGAAGCCAATGGTTGGAATTATAAAAAGCATCCTTGCTGGTTCTTCACAGGACA 5761 CTGGAACCCACCCTGTCAATTCAGCTAGCATGTCCACACAGTCTTGATGATCCCTCTCTGTAACAGGCAGCTAACATTAA 5841 GAGAAGGGGGAAAGAGAAGAAGAGAGCAATAGCTTATGGGAGAGCTGAGATCTTACTTCGTTGACCCATATTTTTCCCCT 5921 GACCAAGTTACCTGTAAACTGGAATTTGCAAGGGGATGCTGTGATGATAACCCCTTTCTATTGCTGTAATGTTCATATAA 6001 CCTGGGAAACTGAGAGAAGGGGATGTGTAAATAAAAGCTTAAACATTTTAGTAATGTGTTAAAATGTCACTCTCTCTTAC 6081 CCTGTTTCCCTTTTTTGCCAGATGATGATTTTTTTATTTTTATTTTGTACTTTACTGGATGACTGTGAAGCGATGAGTAT 6161 TGGGTTGGGGTAGGTGTGTTGATTTTGAGAGTGCATGTTAAGAACTGAAGGGGAACTACTTGAGATGACTTAAGAAGCAT 6241 CCCATGCAAATATCTTGTTTTGCCCTAATAAAATATTCAGAAAGATA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293S | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
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HITS-CLIP data was present in GSM1084068. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noemetine_SigmaAb
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1084068 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noemetine_SigmaAb |
Location of target site | ENST00000216484.2 | 3UTR | AGAGGGAGACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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203 hsa-miR-6867-3p Target Genes:
Functional analysis:
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT078229 | DYNLL2 | dynein light chain LC8-type 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT107799 | SLC1A1 | solute carrier family 1 member 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT115808 | CAPN15 | calpain 15 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT137570 | RCOR1 | REST corepressor 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT161372 | MBNL1 | muscleblind like splicing regulator 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT320477 | HOXA10 | homeobox A10 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT444449 | PTPRG | protein tyrosine phosphatase, receptor type G | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT461305 | MRPS27 | mitochondrial ribosomal protein S27 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT470306 | PPP6R1 | protein phosphatase 6 regulatory subunit 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT471679 | PABPN1 | poly(A) binding protein nuclear 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475546 | HNRNPUL1 | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT480901 | BCL2L2-PABPN1 | BCL2L2-PABPN1 readthrough | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT489368 | RAB11B | RAB11B, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT489557 | PLD6 | phospholipase D family member 6 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT494969 | TMEM233 | transmembrane protein 233 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496634 | SLC46A1 | solute carrier family 46 member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT500259 | ZNF788 | zinc finger family member 788 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT500272 | ZNF781 | zinc finger protein 781 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT500328 | ZNF487P | zinc finger protein 487 | ![]() |
1 | 3 | |||||||
MIRT504012 | ACSL6 | acyl-CoA synthetase long chain family member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT504830 | EREG | epiregulin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT513588 | DCTN6 | dynactin subunit 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT520896 | STMN1 | stathmin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT525275 | C18orf32 | chromosome 18 open reading frame 32 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526166 | ANKRD65 | ankyrin repeat domain 65 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526582 | CCDC43 | coiled-coil domain containing 43 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT527812 | TMEM74B | transmembrane protein 74B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT528141 | LRRC38 | leucine rich repeat containing 38 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529903 | C1orf64 | steroid receptor associated and regulated protein | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT531980 | SLCO1B3 | solute carrier organic anion transporter family member 1B3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT532251 | TBPL2 | TATA-box binding protein like 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT534300 | SKIDA1 | SKI/DACH domain containing 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT534879 | QKI | QKI, KH domain containing RNA binding | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT538305 | CSNK2A1 | casein kinase 2 alpha 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT539385 | ADRB1 | adrenoceptor beta 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT541304 | GDE1 | glycerophosphodiester phosphodiesterase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT543960 | RNF20 | ring finger protein 20 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT544380 | ZNF266 | zinc finger protein 266 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT544451 | KRBOX4 | KRAB box domain containing 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545783 | ZNF791 | zinc finger protein 791 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT548156 | FRAT2 | FRAT2, WNT signaling pathway regulator | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT556660 | KMT2D | lysine methyltransferase 2D | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT557715 | GABARAPL1 | GABA type A receptor associated protein like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT562701 | ZNF415 | zinc finger protein 415 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT563050 | ZNF138 | zinc finger protein 138 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564307 | CCNT1 | cyclin T1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT568333 | BACH1 | BTB domain and CNC homolog 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570864 | ZNF525 | zinc finger protein 525 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570874 | ZFP1 | ZFP1 zinc finger protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT571516 | ZNF625 | zinc finger protein 625 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT572470 | MTMR10 | myotubularin related protein 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT572898 | RUNDC3B | RUN domain containing 3B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT573084 | APLN | apelin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575251 | Timp3 | tissue inhibitor of metalloproteinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575275 | Mapk8ip2 | mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT607230 | LINS | lines homolog 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT611803 | FCRL4 | Fc receptor like 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT612669 | POU2F1 | POU class 2 homeobox 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT612739 | MYOCD | myocardin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT613409 | CDH8 | cadherin 8 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT614007 | PAOX | polyamine oxidase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT615188 | CLUAP1 | clusterin associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT616497 | ATP6AP1L | ATPase H+ transporting accessory protein 1 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT616524 | URM1 | ubiquitin related modifier 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT617066 | SPIB | Spi-B transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT617813 | EMX2 | empty spiracles homeobox 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619291 | FAM26E | calcium homeostasis modulator family member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619375 | KLHL12 | kelch like family member 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619499 | TXLNB | taxilin beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619601 | MKKS | McKusick-Kaufman syndrome | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619754 | MYO1F | myosin IF | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT619976 | ZSCAN22 | zinc finger and SCAN domain containing 22 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT620743 | CCR5 | C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT620871 | KCTD7 | potassium channel tetramerization domain containing 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621380 | CLNK | cytokine dependent hematopoietic cell linker | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621511 | ZNF638 | zinc finger protein 638 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621537 | ZNF500 | zinc finger protein 500 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621772 | TMEM87B | transmembrane protein 87B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT622193 | SLC5A12 | solute carrier family 5 member 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT622319 | SEC63 | SEC63 homolog, protein translocation regulator | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT622738 | PITPNM3 | PITPNM family member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT622996 | ONECUT3 | one cut homeobox 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625301 | SHISA6 | shisa family member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625637 | KCNQ3 | potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT627698 | RFFL | ring finger and FYVE like domain containing E3 ubiquitin protein ligase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT627751 | RAD51L3-RFFL | RAD51L3-RFFL readthrough | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT628438 | ANTXR2 | anthrax toxin receptor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635440 | SLC25A44 | solute carrier family 25 member 44 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT637166 | TMEM50A | transmembrane protein 50A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT638207 | SPTLC2 | serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT639288 | TFAP2A | transcription factor AP-2 alpha | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT639398 | NEURL1B | neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT641230 | SEMA3E | semaphorin 3E | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT641501 | STC2 | stanniocalcin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT642577 | PSTPIP1 | proline-serine-threonine phosphatase interacting protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT642735 | TDRD6 | tudor domain containing 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT644001 | PPP1R3G | protein phosphatase 1 regulatory subunit 3G | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT644210 | CBS | cystathionine-beta-synthase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645405 | FAM110A | family with sequence similarity 110 member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645685 | TBC1D13 | TBC1 domain family member 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645699 | C1orf50 | chromosome 1 open reading frame 50 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645761 | SURF6 | surfeit 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645826 | INADL | PATJ, crumbs cell polarity complex component | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645914 | PLXNA3 | plexin A3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646167 | PTPN14 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646634 | COA4 | cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647547 | CYP2B6 | cytochrome P450 family 2 subfamily B member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648262 | ZNF582 | zinc finger protein 582 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648385 | ZNF22 | zinc finger protein 22 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648629 | LEMD2 | LEM domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649353 | SLC27A2 | solute carrier family 27 member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649395 | SH2D4A | SH2 domain containing 4A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650241 | CD68 | CD68 molecule | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650379 | PTGIS | prostaglandin I2 synthase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650705 | KRT32 | keratin 32 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650854 | UNC13D | unc-13 homolog D | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT651042 | ZNF644 | zinc finger protein 644 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT651102 | ZNF48 | zinc finger protein 48 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT651130 | ZNF398 | zinc finger protein 398 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652089 | TSKU | tsukushi, small leucine rich proteoglycan | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652200 | TRIM33 | tripartite motif containing 33 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652422 | TMEM239 | transmembrane protein 239 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652755 | TET3 | tet methylcytosine dioxygenase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT653201 | SP9 | Sp9 transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT653338 | SMG7 | SMG7, nonsense mediated mRNA decay factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT653715 | SLC25A32 | solute carrier family 25 member 32 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT654456 | RAP2B | RAP2B, member of RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT654499 | RABIF | RAB interacting factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT654678 | PSMB5 | proteasome subunit beta 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655162 | PHF20L1 | PHD finger protein 20 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655540 | PADI2 | peptidyl arginine deiminase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT655850 | NFE2L1 | nuclear factor, erythroid 2 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT656248 | MEX3A | mex-3 RNA binding family member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT656581 | LSAMP | limbic system-associated membrane protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657597 | GRID1 | glutamate ionotropic receptor delta type subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657824 | GJD3 | gap junction protein delta 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658466 | FAM102B | family with sequence similarity 102 member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT659083 | DENR | density regulated re-initiation and release factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT659196 | CYBB | cytochrome b-245 beta chain | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT659558 | CGGBP1 | CGG triplet repeat binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT659860 | CAPRIN1 | cell cycle associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660172 | BNC2 | basonuclin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660626 | ANKRD52 | ankyrin repeat domain 52 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660917 | ADAM19 | ADAM metallopeptidase domain 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660979 | ABHD2 | abhydrolase domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT661564 | EPHX2 | epoxide hydrolase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662214 | CCRL2 | C-C motif chemokine receptor like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662246 | C15orf52 | chromosome 15 open reading frame 52 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662560 | IL2RA | interleukin 2 receptor subunit alpha | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662591 | MAGEB4 | MAGE family member B4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663294 | TECPR2 | tectonin beta-propeller repeat containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663437 | FBXO2 | F-box protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663811 | RNF128 | ring finger protein 128, E3 ubiquitin protein ligase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT663821 | NLRP12 | NLR family pyrin domain containing 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665959 | SZRD1 | SUZ RNA binding domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT666115 | SRRM4 | serine/arginine repetitive matrix 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT667448 | MAPK14 | mitogen-activated protein kinase 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT669330 | BSND | barttin CLCNK type accessory beta subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT669409 | ATP9A | ATPase phospholipid transporting 9A (putative) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT669641 | ACSBG1 | acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672663 | GTF2H5 | general transcription factor IIH subunit 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT673266 | RUNDC1 | RUN domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT676995 | CYP20A1 | cytochrome P450 family 20 subfamily A member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT679290 | SSBP2 | single stranded DNA binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT687508 | NCKAP1 | NCK associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT698932 | SPATA2 | spermatogenesis associated 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700852 | PERP | PERP, TP53 apoptosis effector | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT702426 | KIAA1958 | KIAA1958 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT703939 | EPB41L1 | erythrocyte membrane protein band 4.1 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT708962 | SLC12A3 | solute carrier family 12 member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT709742 | UBD | ubiquitin D | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT709946 | TRUB2 | TruB pseudouridine synthase family member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711121 | CYYR1 | cysteine and tyrosine rich 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711217 | RETSAT | retinol saturase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711576 | ASPA | aspartoacylase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711599 | LHX5 | LIM homeobox 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT712232 | RCC2 | regulator of chromosome condensation 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713317 | TMEM44 | transmembrane protein 44 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713510 | PAFAH2 | platelet activating factor acetylhydrolase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713543 | GJB1 | gap junction protein beta 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713621 | MED8 | mediator complex subunit 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714988 | TSPAN11 | tetraspanin 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT715449 | PTCD1 | pentatricopeptide repeat domain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT715575 | ATP5J2-PTCD1 | ATP5J2-PTCD1 readthrough | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT715771 | DDX42 | DEAD-box helicase 42 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT715887 | GNG2 | G protein subunit gamma 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716091 | HARS | histidyl-tRNA synthetase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717403 | ZCCHC24 | zinc finger CCHC-type containing 24 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717965 | PXMP4 | peroxisomal membrane protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718324 | METTL7A | methyltransferase like 7A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718628 | DIP2A | disco interacting protein 2 homolog A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719213 | CAMK4 | calcium/calmodulin dependent protein kinase IV | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719234 | CYSLTR2 | cysteinyl leukotriene receptor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719817 | LRRC4 | leucine rich repeat containing 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719978 | MAPK1 | mitogen-activated protein kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720480 | TMEM178B | transmembrane protein 178B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720713 | RAPGEF6 | Rap guanine nucleotide exchange factor 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721006 | ZNF619 | zinc finger protein 619 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721741 | SDK2 | sidekick cell adhesion molecule 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT723547 | ZDHHC22 | zinc finger DHHC-type containing 22 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT723596 | FKRP | fukutin related protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT723746 | AIFM2 | apoptosis inducing factor, mitochondria associated 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT724784 | C1D | C1D nuclear receptor corepressor | ![]() |
![]() |
2 | 2 |