pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4291 |
Genomic Coordinates | chr9: 93819357 - 93819421 |
Description | Homo sapiens miR-4291 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4291 | ||||||||||||
Sequence | 11| UUCAGCAGGAACAGCU |26 | ||||||||||||
Evidence | Experimental | ||||||||||||
Experiments | SOLiD | ||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | DISC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C1orf136, SCZD9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | disrupted in schizophrenia 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001012957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001012958 , NM_001012959 , NM_001164537 , NM_001164538 , NM_001164539 , NM_001164540 , NM_001164541 , NM_001164542 , NM_001164544 , NM_001164545 , NM_001164546 , NM_001164547 , NM_001164548 , NM_001164549 , NM_001164550 , NM_001164551 , NM_001164552 , NM_001164553 , NM_001164554 , NM_001164555 , NM_001164556 , NM_018662 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on DISC1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of DISC1 (miRNA target sites are highlighted) |
>DISC1|NM_001012957|3'UTR 1 GGAGTGACGGGATGGGGGAGGGAGGTGGGCCACCATGTTTGGACCCGGGGGGCTGCTCTTCCCTCCCCCGCCATAGCTAA 81 GATGCCTGAATCAATTACGGAGATACAGAGCCTTGAGGTCTTTCAGTGGAAAGGTGGTTCATGTTCATTCTCATCAGTGT 161 GAAACTGAGGAGTCTGCAATTTGGAATATGGAGAGAGAGACTGATTTGCTGAATTTCCTTCTAAATGTCACTCAAAAATT 241 TCTTTTCCATGTCATTCTTGGGAATGTCTTCCACAGGATTTGAGAATAGTTTCATCTCAGCCCCCATTAGAGAGAAGTTG 321 GGGTGAATTCTGGAAAAATGTCTCTTTTTCCTGTGCCATTTGCCTTCTGCTGCAACGAAAATATTTCCTGATTCAAGATT 401 CTATAAAAAGGAAACCAAGCATAAGACTCTGTCATCATACCTGTTACACGTTCCTACAGGTGCACAATCTAAGAGAGCTA 481 ATTAACCTCAGAGTCTGGAGTTAACAGCTTTTCACCTTACTTCTCCTGTGATCTAATATTATCTTAGAAAAATTAATATG 561 CAATTTCCAAAAGATATTTTGGTAAGACAACAACCTCCCAGTGATATGCCACCTTTCAATTTTCCTTTTGTGGCAATGAT 641 TGCATCTGAAGAAAGGATCCCTGAGAGTCTCTGTTTCATCAGGACATTCTGAAATTTACCCACAGTGAGGCTGTGGATGG 721 ATCAGGGGACCTGTATAAAATGTTTGAGCCTGTTCCATTTTCCCGTGGAACCTGTTTCACTCAATGCCAGGCAGTGCAGC 801 ATTTAGGAAAGCAGTGCAGTACTCAGTAAGGCAGTGCAGTACTCAGTAACACAATACAGTACTCAGGCAGTGCAGTACTC 881 AGTAAGACAGTGCAGTGCTCAGTAAGGCAGTGCAATACTCAGTAACAGTGTAGTACTCAGTAACAGTGAAGTACTCAGTA 961 ATACAGTACAGTATTCAGTAAGGCAGTGAAGTACTCAGTAATACAATACAGTACTCAGTTAGGCAGTGCAGTACTCAGGA 1041 ATGCAGCACAGTACTCAGGCAGTGCAATACTCAGTGCGGTACTCAGTAACACAGTGCAGTACTCAGTAACAGTGCAGTAC 1121 TCAGTAACAGTGCAGTACTCAGTAAGGCAGTGCAGTACTCAGTAACACAGTGCAGTACTCAGTAATACAGTACAGTACTC 1201 AGTAAGGCAGTATGGTACTCAGTAAAGCAATGCAATGCTCAGTAACACAGTGCAGTGCTCAATAAGGCAGTGCAGTGCTC 1281 AGTAAGGCAGTGAATTGCTTAGTAACACAGTGTAGTGCTCAGTAGGACAGCATAGTACTCAGTAACACAGGGCAGCTAGT 1361 ACTCAGTACTATAAGTACTGAGTACTTATATAGGCAATGTAGTACTCAGTAAATCAGTGCAGTACTCAGTAATGCAAGGG 1441 CATTTCAGGCTCCTGCTGGGCTGCTTCTTTGGCCCAGCTGGGACTCCTATTGAGACAGCTGCAAAACAGGCTGATTTCAA 1521 TTAGGCAGCACTTCCCAAAGTGCACTGAGGAAGGTGGCCCCAAGAGAAGCTCTCTAAACAAAGGAGTACCCTCTCTGGTC 1601 AAGTACCTTTGGTAAATACACCATACCATAATATCTGCTTGGAGAACCACAATGCACATTAGCATATTAGTCTGAGAGAG 1681 AACTTATAGTAAGGAAACTCACTTGATTTTATCTAACCTCAAACTTTCCAAGTTTAATGGATCGTGAATTTTTTTCATGT 1761 AACTCCTATTCATATCCCATAGATCTAGTATTGTACAGCACTGCATTCTCTGAGGAAGTCCCAGTCCAAACTCTGATTTA 1841 CATCACTTTAGAAACCACACTCACACTTTTGCAGAGTGTTGAGCTTAATAACTACCTGCCACAGATTGGTAAATTTAATC 1921 CAGTGGTTGTTCTGTTTGTGCTTCTGTTCTCATTTATGTGTTTAGGGATAGTGAGGTTCCTGCCTTCACTAGGATCCACG 2001 GATATGAGACCATTTTTGTCATTTCCTGAAGTCACACTGGCGTTTCCAGAAGGCATCTGGTGCTTTGCTCAGCCTTCCAT 2081 GCTGTGCAGCACTTCTGTCCTCAGTCAAGGAGATGGCCATGCTTAAGCCAGCAATTGGCTGGGGTCCAGGAAACAAAGCA 2161 AAAGCACAATATGTGAATGTGCTGATTGTGTTCCCTATGGCTTTATCTCGAGCAAAATACACTCTACATATTTTAATAAT 2241 AAGTATAATTAGCTTGTTCCTGGACTTCATTTTCAATGATGAACCAAATTCCTGAATTATTTATAATTGTGTCTAAAGAA 2321 AATTATGAACTGGTCACATGGCACTTGGAATCCTTGAGTTAATTCCAGTGAAGCAAAACTTGGGAAGAGTCAGGATTGGC 2401 CACATTGCCAATAACAAATTCCTACTTCGACATATGTCTTTTCAAAAAGCCTCCCAGACACAAGACATCTTAACCGTCAC 2481 TAGCCCAAGTGTTTTGTATTACTCAGACACCATCATGAAATAATTCTGTGAGGTCATGATGTATTTGAAAATTCTGCAAG 2561 TTAATAACTGCCTTGAATTGTTTGAACCCGAAATAAGGGTTCTTTGGTACCTCTAGTAGATAGTGTGTTCATTTCCCTGC 2641 TGCAAATTTTGAAGTATTTGGGCAGGTGAGTCATGTTTTAACCACAAGCCATAACTCATCTGTTGTCTTTGCTTGGTCTT 2721 AGAGTATCATTCAGAAAGTCCGCTAAGGGCCAGCGTGCTTCTTCTGGCTACACAACCTTCTCAGGACAAGCCCACTGTCT 2801 TAAGCCACTTTGACCCTGGGAGACACAGGACTGTGTATCCTCAATCATACTATACAGCAGTTTTTGTCAGGGGAACATAA 2881 AAATATCCAAGAGAGGTTAGGGCTTAGATTTAAAAGCATCAAAACAACAACAATGGAAATTTATGTTGGCGATAGCCAAG 2961 ACCACAAGCAAAAGCACATACTGGAAATGATGAGTTAGAATCTGATTTGACTGGGATGTTTTATGAGAATGTAAGTGTGA 3041 TATTATACTGTCTGCCTTGCTGGAATGCTGGCTTTCAAATGGTCACCCATTTTTCTTTCACTGGCCTGAGTTAGGACATG 3121 CTATCAGTAATAGTCCCAGTTCCATCCAACTTTCTGAAATTTCATTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCTCTCTGTCACCC 3201 AAGTTGGAGTGCAGTGGCCCCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCTACCTCCCAGGTTCAAGCTATTCTACTGCCTCAGC 3281 CTCCCAAGTAGCTGGGGTTACAGGCATTTGCCACCGGGCCCTGATGATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGCTTCACC 3361 ATGTTGGCTAGGAGGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCGATCCACCCCCACCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGAGATTACAG 3441 GTGTGAGCCACCGCACCCGGCCAACTTTCTGAAATTTCAAAACTGAATTGATCCTTCTCCAAATTAGTATATACTATTGG 3521 AAACTTGTCTTTCCCTGCAGTAAGGCTGGTTTCCCCACCCCAGAAACATGTAACGGTTGGTACCATGCTAAGCCCTTGCC 3601 ATGCTAAGCCCTTTACAGTCATATCCTATAATCCCCATATCAACCTTATAAGGAAGGTGTTTGTAGATGATGCAACTGAG 3681 CCTTAAGAGGACTAATTCCCTTTTTCTAAGGCACAGAGCTGGTAAAATGTGAAGTAATAGTGAACCTAACAGTCAGAGAC 3761 AGGCAGCATGCTCTTAACTAGTGCTCTTCCTAAAGTTCCTTTAATGTCCTTTTGAGATTTTGAGCCATGGAACTTACTTG 3841 TTCACCTGGCTAAGAACTCATGGCCACTGTGGAAATCTTGGTTAGGGAGTCAAAGAAACTGAGCCTGGGGCAAACGAGGC 3921 TTCCCACACTGCCAGGGGAGCCTCACTGTGAAGTCTAGGCTCAGACAGGCATCAACAAACCTATTCACCCCACCATCATC 4001 CTGATCTAACCATTCCCCAGTCATCCCAGGAAAACCACTCACAGCCTGACACTGGGCTGACTTTCTTGAAGATCCTCATC 4081 CAATTGGTGTTTTTCAGAAGTGTTCCAATATTATGAATTCTGTGTTGTGGAGAAAAGCAACCATGCATTTACTGGTCAAT 4161 GCCTTCTTGTATATGTAATTCAATACTTTTACTTTTAATATCCTCACCTTATCTAATCTTTGAATTTTGTCATGTAATTT 4241 ATTGCTTCATTAAGGTTACTTTTTGTTATACAAAATAAAAGCTGATATCCAAGGCATGGTGCATCTTGATGATTTTTTGT 4321 CCTTTGAAGTATGGATGATAGAAAAATGTATCAGGTTTATTCATCTCATCTTTCTGTTACAGGATGATTAATTGTACAGT 4401 TACATCACACGAAACATTTATAATAAAGTCATGCTTTAGAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293S |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1084065. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_emetine_AbnovaAb
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM4903829 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Human neurons / CTLTD_shCTL_a |
Location of target site | NM_001164537 | 3UTR | CUGAAUUUCCUUCUA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161238 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM4903830 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Human neurons / CTLTD_shCTL_b |
Location of target site | NM_001164537 | 3UTR | CUGAAUUUCCUUCUA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161238 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM1084065 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_emetine_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000439617.2 | 3UTR | UUGGAAUAUGGAGAGAGAGACUGAUUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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82 hsa-miR-4291 Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT102445 | CALU | calumenin | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT108677 | ZBTB33 | zinc finger and BTB domain containing 33 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT125969 | SHOC2 | SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT179018 | PAFAH1B2 | platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT379033 | CDK6 | cyclin dependent kinase 6 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT442473 | CPEB4 | cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT442910 | PCBD2 | pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT442979 | ZNF736 | zinc finger protein 736 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT445663 | TNFSF15 | TNF superfamily member 15 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT446237 | FZD6 | frizzled class receptor 6 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT448860 | FAM49B | family with sequence similarity 49 member B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT455559 | TRAF1 | TNF receptor associated factor 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT459704 | ZNF641 | zinc finger protein 641 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT460608 | FEM1A | fem-1 homolog A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT462251 | LAMA4 | laminin subunit alpha 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT462469 | FIZ1 | FLT3 interacting zinc finger 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT466656 | TAF1D | TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit D | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT466841 | STX6 | syntaxin 6 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT471403 | PDP2 | pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT471517 | PCGF3 | polycomb group ring finger 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT471681 | PABPN1 | poly(A) binding protein nuclear 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT472858 | MTHFD2 | methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT474813 | KIAA0226 | RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT474931 | KCTD15 | potassium channel tetramerization domain containing 15 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT475814 | HDGF | heparin binding growth factor | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT480434 | C17orf49 | chromosome 17 open reading frame 49 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT480903 | BCL2L2-PABPN1 | BCL2L2-PABPN1 readthrough | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT481478 | ARL8B | ADP ribosylation factor like GTPase 8B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT484982 | UBE2V1 | ubiquitin conjugating enzyme E2 V1 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT485019 | TMEM189-UBE2V1 | TMEM189-UBE2V1 readthrough | ![]() |
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2 | 8 | ||||||
MIRT485036 | TMEM189 | transmembrane protein 189 | ![]() |
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2 | 8 | ||||||
MIRT495074 | HEYL | hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif-like | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT496004 | CD180 | CD180 molecule | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT500675 | TRIM37 | tripartite motif containing 37 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT504544 | ZNF417 | zinc finger protein 417 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT506782 | KLHL15 | kelch like family member 15 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT507256 | FGF2 | fibroblast growth factor 2 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT507386 | EN2 | engrailed homeobox 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT512505 | BTBD19 | BTB domain containing 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT516903 | CTSB | cathepsin B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT528124 | PPP1R10 | protein phosphatase 1 regulatory subunit 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT528874 | ATF3 | activating transcription factor 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT536091 | MBOAT2 | membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT541079 | RLIM | ring finger protein, LIM domain interacting | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT541099 | RAF1 | Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545360 | LIN7C | lin-7 homolog C, crumbs cell polarity complex component | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545831 | ZNF367 | zinc finger protein 367 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT547115 | PHLPP2 | PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT547312 | NPTN | neuroplastin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT547959 | HIGD1A | HIG1 hypoxia inducible domain family member 1A | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT549943 | RPL7L1 | ribosomal protein L7 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT550749 | ENTPD1 | ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT565145 | TUBB2A | tubulin beta 2A class IIa | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT571050 | POLQ | DNA polymerase theta | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT571361 | ZNF45 | zinc finger protein 45 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT610133 | FOXI2 | forkhead box I2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT613145 | DSE | dermatan sulfate epimerase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT613379 | ABCC12 | ATP binding cassette subfamily C member 12 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT615752 | C6 | complement C6 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT616460 | ADRA2B | adrenoceptor alpha 2B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT616719 | FEM1B | fem-1 homolog B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT618312 | IPP | intracisternal A particle-promoted polypeptide | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT631491 | RASSF4 | Ras association domain family member 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT643134 | PLCXD2 | phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT643482 | DISC1 | disrupted in schizophrenia 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT649715 | TWSG1 | twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT653542 | SLC38A7 | solute carrier family 38 member 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT666307 | SLC22A3 | solute carrier family 22 member 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT692005 | NAP1L4 | nucleosome assembly protein 1 like 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT696838 | ARL2BP | ADP ribosylation factor like GTPase 2 binding protein | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT698204 | TMEM248 | transmembrane protein 248 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT703316 | GDPD5 | glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT709376 | FAM13A | family with sequence similarity 13 member A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT710112 | MED23 | mediator complex subunit 23 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT711975 | HOMER2 | homer scaffolding protein 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT712275 | PPIP5K2 | diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT714108 | TMED9 | transmembrane p24 trafficking protein 9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719113 | MAML1 | mastermind like transcriptional coactivator 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT719727 | SLC39A11 | solute carrier family 39 member 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720018 | TFAP2C | transcription factor AP-2 gamma | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720358 | ZBTB8B | zinc finger and BTB domain containing 8B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT720372 | NUDT3 | nudix hydrolase 3 | ![]() |
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miRNA-Drug Associations | ||||||||||||||||||
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miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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