pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4763 |
Genomic Coordinates | chr22: 46113566 - 46113657 |
Description | Homo sapiens miR-4763 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4763-5p | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 19| CGCCUGCCCAGCCCUCCUGCU |39 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | NT5DC3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | TU12B1-TY, TU12B1TY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | 5'-nucleotidase domain containing 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001031701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on NT5DC3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of NT5DC3 (miRNA target sites are highlighted) |
>NT5DC3|NM_001031701|3'UTR 1 CCAAGGGCAAAAACTAGAAACTGTAACTGCCCCTGATTGGGCAGGCATGATGGGGTTGACTTCATGTGGGTCTGAGTGTT 81 GCTTTTGGAAAAGATACAGATAAGCCTTTTGATATTTATTTTGTACCTTACGGAGAATAATTCTCCCAATGGTTAAGACA 161 GGAGCTAGCAGCCCACCCCTCCAGCCTTTCCCCCCATGCAGGGCTGAAAGGCAAGCTTCACATTGGAACTCTGATTTTGC 241 CTTTTTGTTTACTGAGGTCCTGGAACATCAGGTTTCCTGGGATAGGTGAGACCACTTGATGCCATGTCTGTATTCTAGCA 321 GGTCAAGCTTGAAACGGTTCTTGACTCCTCCATGGAACATTTCCTGAACATTTACGGGCTATGCATTGGGAACTGCAGGG 401 GCACAGTGATGGGCAAAGATTAGCTGCTTCCAGAAGGCTGATTTCGTGGGCTCCACAATGGTAAAACGCTGCTGTGAGTG 481 GCAGAGAGGTTCCCCAGGTGATGGCCAGTTCCCAAATCATTTGGTACTAAGGCTTTGACATTCTGGCACATCACATCAAA 561 TAGAACACAGCCTCCCTGGAAGGACTTAAGTGAGAAAGAACAAGAGAAGCTGCAACTCCTGGACCCTTTTGTCCTCAGTG 641 TGTGGTTCCTGCGTCCTTCCCCAGCATGGAGGAGGGCAGGAGAGAGGAGATGAGAGCTCTGGTCAAAACCTGCCAGCTAG 721 TGGAACAGCCTTCTGTAGAGCCTTCTGCAAGAAACGAGTGGGTTTGAAGAACCAAAACATTTGTGGTAGGTCTCCCAGGA 801 GCTTGTTAAACCTGGAAACACCACCTGAGTTGGTTTCATCTGCTCATTGGAAGAAAGAAAATGAACCAGGAAAAAGCATC 881 TTTGTCATGAAATGCTATGCCATGCCACCCACCCAGTTGAATTGGAATCCTGTTAAAACATGAGATTTACCAGAAACAGT 961 CCTTTGTCTAGATGGAAACAAACAAGATCCTGGCTTCTCTCTAATGAGTTACCAACTGAGAGGTGCTTGGATTGGCCAGG 1041 GGAGGAGGAAGATGGCCACCACAACTTAGCCATGTCCAGCCTTCTCTTAGATTTCACTCCTGTGATGTTTGTGCGACTAT 1121 TTGGGAGTTTGTGTAGTTTGTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTAGATGTCTAAGATGGGAAAGGGCGAA 1201 GGACATTGAAGCTAAGGAATAGATATGACCTAGCTAACCAAGCTTTTCTCATTTCCTTCTGTTTTGTTTTGTTGAGATGG 1281 AGTTTTGCTCTTATTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCGGGTTCAAGCG 1361 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACTACCACACCCAGCTAATTTTGTATTTCTAGTAG 1441 AGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGATAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAATT 1521 GCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCACCTGGCCTGCTTTTTTCATTTCTTTCTAGGGGCAATGCAAGTGGCATGTATT 1601 CCTTTTGTTGGAGGGAAGAATCCTTAATTGCACCTGCATTTGTAGTATCCTTCAATGTAAAGTGCATATTTACTGCACTC 1681 TCTGAGTGCTATGGGAATGTCTGCTGTTATTAGTTATGGGGCTGCTAATACTGTTTTAATTGCATATGCTATATCAATAC 1761 TTCTGTTCAGATTAGCCTAATCTAGTATTGCTAAAACTCATTTTAAGCTTTTGCGGTAACTTGTATATATTCTTAAATCT 1841 AAAGGATGGCAGGAACATGAGGGGAGCTTGTGGAGAGTGCTTGCTTATTCAACATTTTTATTGTGATAAATGTATGTAAC 1921 CATCTATTGATGAAATCCAAGTCTGGCATTCCATGGGCTCCTTGCCAGATGGCAGAAACTTAATGAGTTATATAGCATCC 2001 TTTGTAATGCTGCTTGTTATAGTTGGAATGTACTTGTGATATTTGGCTGTATTTAACTATAATGGTGAAGGTGACCCTTT 2081 AGATCCAATAAGGCTTCTCCCCATCTTCTACATTTTGTTATGAACACAGTAAGGCACAGTAGTATGTTCTTTTTTTGGAA 2161 CAGGGTAGGCATTTTGTTTATTGTTTGCTTGCTTCTAGGTGTTTTCGCCATCAGGGTGTATTGGAGGCTGACACTTAATG 2241 GGTGTGTGTTGCGCCCAGAACTGCTCGGTGTCGGGGTTCTAAAAGAATGCGCTGGTGTTCTTGGCTTCAAGTTTCTGCTT 2321 TGGAGAAGCAGATTCAGGAAGTAGGTGTTGCTTAAAAATAATTCTTGGTTTTTATCTAATCAGATATTCATTGATTACCT 2401 ACCAGGTGCCAGTTATAGGGTGTTTTGTTTACTCAAGAATGAAGTAGAACTATTTTTAAAACCTGTTTCCATGAGTGTTC 2481 ACGTTAGGTGACCTAAGCTTTGAAGGAGAAAAACATTTTTGGGTATGAATAATGAGTTTTGTAATCAATTCCCAGTTAGA 2561 AGAATTTCAGTCTCTGGGCCATTGAGCTTGGCAGTGTTGAGATCTCCCATGTGACAGAAGCCTGACATCTGGGCCACCAA 2641 GGCTCACTGACTGTGTACCTTGCAGACTGTAGACCCATGTCGTGGCGGTAACGGGGCCGAACACAGTCATTCCCATGTGA 2721 ACGATGGAGGCACATCCCACTTTATTATTAATCCTTGTATATACTCAGTCAGGACAGATTTTAACTTGTCGCTGTCATGA 2801 CTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGCAAGGTCTCGCTCTGTTGCCCATTCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCA 2881 ACCTCTTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTTTCGTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACTGGTACATGCCACCAGGC 2961 CTGGCCAAGTTTTGTAGTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTAGCCTCAAGTG 3041 TTCTGCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTCTGGGTGTGAGCCACTGTCATGCCTGGCCTCGTCATGACTCTTTT 3121 CTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATTTAGTTTTGCTCTTTTTGCCCAGGCCGGAGTGCAATGGCACGATCTTGGCT 3201 CACTCCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCA 3281 CCACATCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGAC 3361 CTTGGGTAATCCACCTGCCTTGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTATCATGACTC 3441 AACTGGGATCTGGCACACTGCACTGGGTGTTTTGTTCTCTGATGTGCACATTGATGAATGCATATTGGTACAAGGGAAAT 3521 GAATCTGTTTTCAGCCATTTAAAAAATTGTGTTGTAAAGCAAACAAAAATAGCTTGAACATTTAAAAATTACTGTTTAAT 3601 ATTGTTTGACTGATTTTCTAAGAATTATGTGAACAATGATGAGTCCAGGGCAGCAGCCATCACAAATATGACAGTCCAGC 3681 AAGGCCCATGGAGGTCCCTTTGGAAGGGACTTGCACAGCTGATTTTCTTTTTCCAGTGTTGTTTTTACGGGTGAAACGTG 3761 GCTTTTGAAATACTTTAGTTGTTTGGCTTAGAGCTCCCACTTTCCCCCTAACATAGTGCCTGTCTGTTTTTTAAAACATT 3841 TTACCCTTCGGCACTATTTTCTGCTATTCCCATTAATATTATGTAACATAAACCACTTGCTACTGATTTGGGCATATTAC 3921 AGACTACAATTACTAGTTGCTTTGAATGCATTGGCACTCTTAATTATTGCAAAGGAGAATTGAAAAGTAGTCTTGTGGTC 4001 CTAGTTAATTTAGCTTTGGGCAAACTAAGTGGCTTTTCTTCTGTCCTCTTCTCAAAAGGCCTTTTAAGCAGCAGAGACTG 4081 GGCTAAATACTGGAACTGAATTCCACTTTTCTGCCTGCTCATTTGCTGCCAAAGACCACTTGGGGCTCCTTGTCTAGAAT 4161 GCTCTAAGACGAAATTTGGCCAGACACAGGGTTCCTTGATTGTTCTGTTCAACTAATAGAGAACCTACATTTTGCCTTCT 4241 TAATATCGACTTTCTTTTGTACCAGGTTTTTCTTTCTTTCTTTTTTGCCTTAGGAGCTTAGCTCAAAGTTCAGCTAACCT 4321 TTGACACTACTAGTGTCATTTAGTAACAGTAATCTTTGACACTACTAGTGTCATTTAGGAGCTTAGCTCAAAGTTCAGCT 4401 AACCTTTGACACTGCTAGTGCGTTCAAGAAAGGGTAGGGAATGAAGTACCCTTAATGCAGGGTCAGCAAACTTTTCCTGT 4481 AAAAGGCCAGATAGGAAGTATTTTTGGCTTTTTGGGCTGTTTGCTTTTGCTACTACTACTGTGGGAATGACCATGGTCAT 4561 GGCTGTGTTCCAGCACAACTTGATTTACCAAGACAAGCTGTGGGCTGTATTTGGTCCTCAGGCTGTGGCTTGCTAGCCCC 4641 TGCTCTAATGGATTGTGTTGGCGGCAATGGCAAGATTCCCTTGCTGAGAACATGCAGATGAATAACCTTATAGCTGGGAT 4721 GCAGAGAGGAGAAAGTTCTGTAGGTAATAAGTGCACTGTATTCCCTCTGAGCTACTTCCTGGGCATAGTTACATGTATGG 4801 CCAGTGTGTGTACTTGAGCCATCAGGCTCAGACACTTGTTGAATATACCTCTCATTGCATTAGTTTGTAATTGTGCTAGT 4881 GCTGGGTGCTGAGCTCAGCTGCCCGGATGACCTTTCCAGACTGAAGGACATACTCCCCTAACAGCTGGGAGTGCTGCTGG 4961 CTGGCCATTTACTTCCAGCCCTTATGAGGAGTTTCCCCTGCTGAAGAGCCCTGCCTGCCCCAGATCATACCCCCTTCCTG 5041 CCTGTAACCCTTACCGGCTCCATATGGGGTACAAAGGGCTGGCCTCCTCACCCCAACTTGGGAAACCCTCTGGGGCCATC 5121 CCAGCTCCAGAGCCCCTTGTGGGGTCAGTGAGACCTCATTGTGGCCACATTACAGCCCAGTGCCTCTCCCTGACAAGCCT 5201 GTACCCAGCCGGCTCAGCCCACAGCACTGTCCTATGAACCTTCCTGCACGCCATTCTCCACCTCAGTATCTGCTTTCGGG 5281 GAACCCAACCTGCGACAGTGCTTCTGTGTGTTTTCAGTCCTGCAGGTTTGAACTCTGACTTTGGAGACTTTTCCAGTTAT 5361 CTCGTGGAATGACAGATTGTGCCTGTATGATATCAGGCACAATTAATGCAAATTAGGCAGACCTATTTATTCTAGATGTG 5441 AATTTGCTATTTATTTTAAATGTTGATTTTATGTGTTATGTGACTCTGAACTTATTGCCAAATAAAAGTTTGAATTGTAT 5521 CATCTG Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293S | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1084065. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_emetine_AbnovaAb
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1084065 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_emetine_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000392876.3 | 3UTR | AUGAUGGGGUUGACUUC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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69 hsa-miR-4763-5p Target Genes:
Functional analysis:
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT116035 | DEPDC1 | DEP domain containing 1 | ![]() |
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MIRT347197 | SIN3B | SIN3 transcription regulator family member B | ![]() |
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MIRT443248 | C9orf170 | chromosome 9 open reading frame 170 | ![]() |
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MIRT475164 | IP6K1 | inositol hexakisphosphate kinase 1 | ![]() |
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MIRT495486 | VTI1B | vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B | ![]() |
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MIRT496755 | TGIF2 | TGFB induced factor homeobox 2 | ![]() |
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MIRT496863 | C21orf2 | chromosome 21 open reading frame 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT499264 | NBPF11 | NBPF member 11 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT499517 | MAFK | MAF bZIP transcription factor K | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT512952 | MKI67 | marker of proliferation Ki-67 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT514656 | NUP93 | nucleoporin 93 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT517986 | SLC16A13 | solute carrier family 16 member 13 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT522816 | KLHL9 | kelch like family member 9 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT525495 | CD63 | CD63 molecule | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT528111 | FOXH1 | forkhead box H1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT531683 | MYO3A | myosin IIIA | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT534806 | RAB37 | RAB37, member RAS oncogene family | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT573041 | SHMT1 | serine hydroxymethyltransferase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT576720 | Wars | tryptophanyl-tRNA synthetase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT609727 | MLXIPL | MLX interacting protein like | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT610843 | FAM180B | family with sequence similarity 180 member B | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT614735 | STAT5A | signal transducer and activator of transcription 5A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT616981 | EPOR | erythropoietin receptor | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT617265 | MMAB | methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblB type | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT619405 | INTS7 | integrator complex subunit 7 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT621832 | TIMM8A | translocase of inner mitochondrial membrane 8A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT621893 | TAF13 | TATA-box binding protein associated factor 13 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT630263 | SMIM14 | small integral membrane protein 14 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT634879 | SENP8 | SUMO/sentrin peptidase family member, NEDD8 specific | ![]() |
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MIRT636863 | ARSE | arylsulfatase E (chondrodysplasia punctata 1) | ![]() |
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MIRT637653 | ADAT1 | adenosine deaminase, tRNA specific 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT637699 | ZNF439 | zinc finger protein 439 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT637759 | GATAD1 | GATA zinc finger domain containing 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT638193 | TAOK1 | TAO kinase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT638996 | ADO | 2-aminoethanethiol dioxygenase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT642221 | RABAC1 | Rab acceptor 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT643327 | ATCAY | ATCAY, caytaxin | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT643419 | ERVMER34-1 | endogenous retrovirus group MER34 member 1, envelope | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT644499 | RNF14 | ring finger protein 14 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT644603 | NT5DC3 | 5'-nucleotidase domain containing 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT644795 | C21orf59 | chromosome 21 open reading frame 59 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT648732 | HIST1H2BD | histone cluster 1 H2B family member d | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT653856 | SHE | Src homology 2 domain containing E | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT654129 | RPL14 | ribosomal protein L14 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT658876 | DSN1 | DSN1 homolog, MIS12 kinetochore complex component | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT671624 | C20orf144 | chromosome 20 open reading frame 144 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT677367 | HSPA4L | heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT677579 | TRIM65 | tripartite motif containing 65 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678220 | MACC1 | MACC1, MET transcriptional regulator | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT679613 | RRP36 | ribosomal RNA processing 36 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT686081 | PNPLA3 | patatin like phospholipase domain containing 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT691817 | ICA1L | islet cell autoantigen 1 like | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT693869 | COX19 | COX19, cytochrome c oxidase assembly factor | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT694544 | BPNT1 | 3'(2'), 5'-bisphosphate nucleotidase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT694926 | ANKS4B | ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 4B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT697758 | USP37 | ubiquitin specific peptidase 37 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT697891 | UBE2B | ubiquitin conjugating enzyme E2 B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT701569 | MYPN | myopalladin | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT703081 | GPRIN3 | GPRIN family member 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT708104 | IGF2BP1 | insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT708320 | NT5C | 5', 3'-nucleotidase, cytosolic | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT709878 | TRAF1 | TNF receptor associated factor 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT713545 | GJB1 | gap junction protein beta 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT716275 | NUP85 | nucleoporin 85 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716621 | CRCP | CGRP receptor component | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717987 | C9orf171 | cilia and flagella associated protein 77 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT718438 | RAB11B | RAB11B, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722544 | AGPAT4 | 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT724013 | F2RL1 | F2R like trypsin receptor 1 | ![]() |
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2 | 2 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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