pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-640 |
Genomic Coordinates | chr19: 19435063 - 19435158 |
Synonyms | MIRN640, hsa-mir-640, MIR640 |
Description | Homo sapiens miR-640 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-640 | |||||||||||||||||||||
Sequence | 61| AUGAUCCAGGAACCUGCCUCU |81 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | RT-PCR | DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | DIS3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2810028N01Rik, EXOSC11, KIAA1008, RRP44, dis3p | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | DIS3 homolog, exosome endoribonuclease and 3'-5' exoribonuclease | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001128226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_014953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on DIS3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of DIS3 (miRNA target sites are highlighted) |
>DIS3|NM_001128226|3'UTR 1 CTATATTCAACAAAAATCTTCAAAGACTGGTTTCTTTTTTAAAAGAAAAAACTTGAAAGAACACTTCTAAGCCTAAGTGT 81 GTGATACAGTTTGTTACTTTTAAGTACATTTTAATAATTTCAGACATCTGCATTTTTATTGAACAGTTGACTGTATCTGA 161 CCCATCATACTACTATACTTCTGGGTTGAACAGAATTATTTATGCAGAATAATTCAATTGAATATCCATCACTTAAATAC 241 AGTGACAGGACAGCAACTTCAGGGATCTGTAAAGATCATTTAAATGGAGTGCTCATCTCATTGAGGAGCAGATTAATTTT 321 GCGTAAGTACTTTGATTATTTAATATTTGTAAGAAAAAACTTTCATTTTCCTACAGAGGAAAATAGAACAATTTTAGAAG 401 CAAGGAACAATCTCTTTTCTAAGTCTTGGAAGCTGTCAGTGTTGAGGATGTAATCTCCTTTGCCATCTTTAATTCACCTA 481 ACTTACACTAGGTGTTCTCTTACTGTCTTTAAAAGCTTCCTGTATTTTATTAGTGGTCCTTGAAAAACTGTGAATGTTTG 561 GGAATTGGTAGAAAGGCAAAAAGTAGGATATTTTGACCTGACTGGAAAGATGGTTGTGTTTTTATTGCCAGGTAATAAGT 641 GTGATCATTGTTGAACTTCAGCTCCAGTGTCTCTCCAGAATAAGACATTGGCATTCAAATGTCTATATCTTGTTACTTAC 721 AAAATAAAAAACAGATTAATTAGTGGCTTTTAAATTGTAGTTATATCAGTGTATATACACGAGGGGAACTGTATAAAGAC 801 ATACTAAAGGGAACAGATTAAAATAAGTATTATTAATAAAATTTGGTGTGCCAGACTGACTACTTCCCTTGCTAATCACA 881 GAGATTAGTAATGATTAAATTAATATCTTCAGGAATATTTTGGGATAGGGTTGCCTTAAAACATTTTACTTGGCTTATTC 961 AATTTCTAAAGCACTTACGTTGTGCCAGGTTCCACTCAAGTAAATTATCTCTGCCTTCAAGGAGCTTGCAGTATAGTGAG 1041 AAAAGCCTGCCAAGTAAATCAGCAGGTATACTAAATAGGTAGTCATTTAGGCACTCAATAAATGTTGACTAATTTTTCCA 1121 GTTTCCTATTACTGAGGAAAACCTCCATACACTGAGGCAGAAACTTGTGTCAGTTGGAGGAAAATAGACTTGAGTAGTCT 1201 TTGGTCCAGGTAAAATGGGTCAGTGACACTGAAACAGTAGAGTAGGAGTCAAAAAACCTTTTCTGTGAAGTGCTAGAACA 1281 TTTTAGACTTTGTTGGCTATGGTCTGTATTGCAACTATAGTACACAACTCTGCCGTTGATAGTGTGTAAGGAGCCATATA 1361 CAATATGTAAACAAATCAACATGACTGTGTTTCAACAAGGCCTGATTTGTTAAGTTTCATATATAGTCATATGTCACTTA 1441 ATGACAGGGATATGTTCTGAGACATGTCACTTGGCAATTTCATCATTGTGTGAAAATCATGATGTAGTTACACAAACCTA 1521 GATGGTATACCCTATGGTATCCTATATGGGATAGCCTATTGCTCCTAACCTACAAACCTGTATGGCATATTACTGTACTG 1601 ATTACTGTAGGCGGTTGTAACACAGTGCTAAGTATTTGTGTATCTAAACATATCTAAACATAGAAAAGGTACAGTAAAAA 1681 TATATATATAGATATATATAAGATATAAAATGGTACACCTATTTAGGACATTTACCATGAACAAGTTGGCAGGACTGGAA 1761 GCTGGCTCTGGGTGAGTCAGTAAGTGGTTAGTGAATGTGAAGGCCATGATATTACTGTGCACTACTGTAGACTTTTATAA 1841 ACACTATATACTTAGGCTACATAAAGTAATTTCACTATGATGTTACCATGGCTGTGTCCCCAGGCAATAGGAATTTTTCA 1921 GCTCCATTGTAATCTTACGGGATCATCATCGTATATTTGGCCATTGTTGACCAAAAGTTATGCAGCACATCATTATAATT 2001 TTGATGTGTCACAAAACATTACTCATTTGATTTCCCCCACCCCCGCCAACCATTTAAAAAAGTTTGCCGGCTAGGTGCGG 2081 TGGCTCATGCCTGTAATCCTAGCATTTTGGGAGGACGAGGCGGGTGGATCACTCGATGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTG 2161 GCCAACATGGTAAAACGCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAACTTAGCTGGGTGTAACGGCGGATGCCTGTAATCCCAGCT 2241 ACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCACCACTGCAGTT 2321 CAGCCTGGATGATGAGAGTGAGACTCCATCGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGCA 2401 AGTGCCTTTAATCCCACCTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGA 2481 TCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAACAAGACTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGAGAAGAAAAACTGCCTACAGG 2561 CCATAGTTAACCTGCAATAGAGAAGAAAGGGAAGTAGGGCAGTGCATGACTGGCCTTAGGTTTTTTCTTTCCAAGTTTAT 2641 TTTCTTGTGCTTCAGCTACTAGAAAGGTTTAATTCAGGGATAAGTCCCAATTGAGTAGTTCAAGATGATCAGAGACTTTG 2721 CTATTTTCCCCTAAGTTCTATTCCATAATCTAAAATGTTCTGTTTCTAGTGCCAGTTCTTATGCTAAGCAGGTTACGTGG 2801 AATATATCACTTAACTCAAAAAGCCCTGTTAAGCCAGGACTGTTATCTCCATTTAACAGATGAGAAAATGGAGGTTTATG 2881 GTCTGTTCTCACACTGCTACGAAGAAATACCCCAAACTGGGTAATTATTATAAAGGAAAGAGGTTTAATGGACTCAGTTC 2961 CGCATTGCTGGTGAGGCCTCAGGACACTTACACAATCATGGCAGAAAAAGGAGAAGCAGGCACCTTTTTCACAGGGCGGC 3041 AGGATGAAAATGACTGCCAGCAGTGGAAATGCCAGACGCTTATAAAACCTTCAGATCTCATGAGACCGGCTCACTATCAC 3121 AGGAACAGCATGGAGGAAACCGCCCCCATGATCCAGTTACCTCCACCTGGTCCCACCCTTGACACGTGGGGATTGCTACA 3201 ATTCAAGGTTAGATTTGGGTGAGGACACAGAGCCATACCATATCAGCCCAGATCAAGTAGTGACAGAGTAGGGATTTGAA 3281 TACAGGTTATAGTCACTATTGTGTTATTTCTTGACTTTTGTACTATTAAAAAACTGTAGCCAGTGAGGCTTCTACCCTTA 3361 GTACCCAGAACTCCTTTTAGGTATAGCAATTGTTTTTAGGTAAATTTATATTGAGTTTAACACCTGTGTGATTAAAGACA 3441 ACTTTCCAATGTAGTATCTGTAGCCATGTCCCCTAATGGCTATTAGTGTTCATGGTTAGTGTGTTGAAGATGAGCCAGGT 3521 ACATAACGCGGCACATTTTCTGCAGGTCAGCAGTAAGGTTTCAAGGTACAGTTATGGAGGAAAGAAGAAAATGACACATT 3601 GATAACACAGGTCTTTATTCCCTTTTGAATGAGACAGTTTTTAAAAGTTGATTTATAAATACAAAAATACATTCTCCAAA 3681 GATAGTATTTCCAAACTGTTATATACCCATCTACTCCCAACATGGATATAAGTTTTTTAAAAAAATAGTTGTATATAACA 3761 TACATATCTGCCCCAGTGTTACTTCACAGGCCTATGCCCTACGGGAACTCCACTCTCCCAGCCCCACTTTTTCTCTTGGT 3841 TCTCCCACATTCTTATTCTCCCACATCCCTACCCACGTTTGAGCTGGAAAGGATGTCCCTACCCTAGGCATGAGGTATAT 3921 TTTATTCTGGGCACCACACATTTGCCCCATAGATAACAATACACGTGATGATGTCACTAGTACTACCTTTCTAGTATTTA 4001 CATACTTAAAAGTAGTAACTAGAACAGTTATCACTGGAACTAAGAATTTTCCCCACAGAGGTGAACAGACCAAGAACTAA 4081 AATTTCAGGAAACCTGTTTAATTTCTTTTGTATCTTTGAAAAGTTAGTTTTATATCTAAGATTTCTTCACATAGGTTATA 4161 ATTCATCTGTATGTTCAAGCTTTTATGTAAAAATATATAGTGCCTTCAGTTTTAACATAGTTTCACATGTTCTCAGAACT 4241 GCTAAATTCAGTGCTACCAGTAAGGCTTAATAAGTAGTTCATTGACCCTGTAAGATAGGAGCACTCAGCTCTGTCACAAT 4321 TTGTTGTTAAACACATCACTCAATGTAAGTATAAAAATATTTATTGATAAAAAATAAACTTATAATTCAGCAAAAAAAAA 4401 AAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293S | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1084065. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_emetine_AbnovaAb
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM4903833 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / CTL_TD_21_a |
Location of target site | NM_001128226 | 3UTR | AGGCGGGUGGAUCACUCG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1084065 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_emetine_AbnovaAb |
Location of target site | ENST00000377767.4 | 3UTR | UUUUGGGAGGACGAGGCGGGUGGAU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM1013110 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | hMSC / hMSC-replicate-1 |
Location of target site | ENST00000377767.4 | 3UTR | GGGAGGACGAGGCGGGUG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 24038734 / GSE41272 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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194 hsa-miR-640 Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT097121 | TNPO1 | transportin 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT115090 | ARIH1 | ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT204603 | HSPE1-MOB4 | HSPE1-MOB4 readthrough | ![]() |
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2 | 8 | ||||||
MIRT204634 | MOB4 | MOB family member 4, phocein | ![]() |
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2 | 8 | ||||||
MIRT344451 | MTRNR2L1 | MT-RNR2-like 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT405772 | EIF5 | eukaryotic translation initiation factor 5 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT445876 | SENP6 | SUMO1/sentrin specific peptidase 6 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT497418 | FAM46A | family with sequence similarity 46 member A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT504394 | HMX2 | H6 family homeobox 2 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT504691 | SLCO2B1 | solute carrier organic anion transporter family member 2B1 | ![]() |
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2 | 8 | ||||||
MIRT512386 | MTRNR2L3 | MT-RNR2-like 3 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT513003 | MAN1A2 | mannosidase alpha class 1A member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT513084 | USP9X | ubiquitin specific peptidase 9, X-linked | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT519122 | ALDH2 | aldehyde dehydrogenase 2 family (mitochondrial) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT523836 | F2RL1 | F2R like trypsin receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT565356 | TMCC1 | transmembrane and coiled-coil domain family 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575895 | Dis3 | DIS3 homolog, exosome endoribonuclease and 3'-5' exoribonuclease | ![]() |
![]() |
2 | 3 | ||||||
MIRT576894 | Poteg | POTE ankyrin domain family, member G | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT613780 | RPS6 | ribosomal protein S6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT613934 | POLR3A | RNA polymerase III subunit A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT614348 | LOH12CR1 | BLOC-1 related complex subunit 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT614534 | NOA1 | nitric oxide associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT617019 | ZBTB8B | zinc finger and BTB domain containing 8B |