Gene Symbol |
SLC1A2
|
Synonyms |
EAAT2, EIEE41, GLT-1, HBGT |
Description |
solute carrier family 1 member 2 |
Transcript |
NM_004171
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on SLC1A2 |
|
3'UTR of SLC1A2 (miRNA target sites are highlighted) |
>SLC1A2|NM_004171|3'UTR
1 GGATATGAGTCTCAGCAAATTCTTGAATAAACTCCCCAGCGTATCCTATGGTAACTGATGATATAAACAAGCTTTCTTTA
81 AAAAGGAAAAAAATGCGTATATTTCTATGTTTACTTAATCTGTTAGCCGAGGCTTAGAGGAGCTCTTGTGAGTCAGTGAT
161 GACAGGCACGGTGCTGTGTCTTTGCCAAATAATGCTTTATAACCGTCTAATTTTCTCACTTGTATTATTATTTGAATGGA
241 TGCTGCTGGAGGAATCAGTTGGAATTGAAGACACGTTCTTGCCAGCTTCCCTTTTCTCCCAAGATGCAGAAATGTGGATG
321 CTCTTTTCCCAGGGGACATGAGTAAAGCAGTGTGGTACACTCCAGGGACTTGGGAAAATGAGCAAACACACAGCGTGTTA
401 TTCCTTAAAGTGTTCTCCATGTCTCGCCTTGTTATGCACAAGAGATTCTATTAAAAGCCTCTAGAAGTAACTCCCCTTAA
481 AATGTCTAGTAAAGCTTGCACATGGATTGATTAAAAGCAAATACCTGTCTTAGGGAATTCTGACAATTTATCTTCCATAT
561 GCTCTTTAAGTAAAATGTTTCAAAGACAGTTTTAAAGGGAGCCATGCTCTTAAAGGCAGTTGATTAAAGAACCTGTTACA
641 TCTCTGCCTTACCCTGTGTAATCTGTGAGAACAATGGTTGAAATTTCAAAGTATGTTTCATTATTCTTTCTAAATTTGAT
721 AATTGATTAGGAAGTATTTTATATATAACCACTGTAGATATTGACAAAAGTAAGAGAGCACAGTCAACATAAAGTTTAAC
801 CAGAGTTAAATATTCAAATTTATTTATGTTCGGTTTGCCTTCACCTGGTGTAGTAAAATCAAATGAGATTATTTGGTATG
881 TGTTTTGCTTTGTTTAACCCAAAAGATTATTTTTTGGTTCCTAAAGAAAAAGATATTTTTAATCTGTCAATTATTTCAGT
961 CATCATCTCATCGTCCTAGAAAGCCTGGTCATTTTACTGTCCTCACACATGGAAGACACTTGTGTTGGCTGTGCCTCTTT
1041 TAATGTCATCTCTTGATGAAACAAAAATACTGGTATTTATCCAATATGTTGAAAGCGTTTTGTTATCTTCTATCAAAGCA
1121 CATAAAACCAGTTATAGGACACAGTTGGAAGCAGAGCCAGTCTTCCTCCTCAGTCTTCTCAGTAGAAAGGAACAGAAAAC
1201 AAACATCTGTGCAAAACCCTATAAAAGTGATATTCCTATGGCAGAGTCCAGGCAGCCTTGAACAATGACATGGCAACAAA
1281 GGATGGCTCTGTACAACTTCACAGATGGAATCTTGTTTAAGGCTGTGAAGTTTTAAGGAATAAATAATATAATTGGTGTA
1361 GCACAGTGCCTTGCATGCAGTAGGCAGCCAACAAATCCTTAATGATTGGTAATGCAAGCTAAAATTTTTAATGTCTCTAC
1441 TATCCTTTTTTATTGAATAACGCACAGTATTTTCCTAAGGTTGCTGGGTTTGGGAGTAAGCTTGGGACTTGAATCATTGA
1521 GAAATAAAGCACATTTGACTCTAAGAAGTATGTAGAACCTTGTTTATAGGTGAGAATAGGCTGTATTATATGAAACCAGC
1601 GGAGGGATGCTGAGACAGTCATGGTTTATAGAATCCAAATTCTCTGAGATGAGGGTGCTTATGGACCTCAAATAGCCTTT
1681 CTTATCTGCTCCTTGTGACTTCTCTCTTTTAAATCAGATACCTTTGAAACATACAAGAGACATGAGATTCCAGTTGTTTT
1761 TGTCTCCTAAACCCTAGTGATTTTTGGATAAGGATCACTACTGAACAGTATTAGGCAACTTTTCATTTTTGCTTTTCAAA
1841 TGACATTGGTCTTTATTTCCAGTAGATGGGCAGTAAACAGGGTCAGGGTGGTCAAGGGATATGATTAAGTGTAGTAGTAG
1921 AAAATGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCTCAGGCTGGAGTACAGTGGCACGATCTC
2001 AGCTCACTGCACTGCAATGTCCACCTCTCTAGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG
2081 CACATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTACAGATGGGTTTCATTATGTTAGCCAGGATGGTCTCGATC
2161 TCCTGACCTCATGATCCACCCGCCATGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT ACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCAGAAAA
2241 TACATTCTTTACAGCAAATGTTATAGGTTAAGGAGACAGTTCCTGGGTTTAGCTGTGAAACTGTTTAGGATTTTCTTTAA
2321 GTGGTGTTCCCAAGAGCTTTTTTCTGGTAAGTTGGAGGCTATAGGCAAAGCGTCTAGGAGCTTGTTGTTTTTTGCTATGG
2401 AAGGCCAGCTTTGGGATCTATATACATGGGCATGTTTCTCAATGGAGTGGTCACAGGATTCTCTTCTCAGAACTCTGCCT
2481 GAAACCTTTCCGGTGTGTTTTGTCTTCAACTTTTTCCTAGCTATCCTATTAGCCTGTAAATATGTCAGCAGACAATGTGT
2561 TTGGAAGAAACAAGGTGTACAACTTCACAAAGCAAGTTTTTTCTGGTCTGAGACTTACTGTGTGCAGGAAGTCTCGTGAG
2641 AATATACTTAGAAAATCACACTTATCTGGAAATTCAATAAGTCATATTAAAAATATACAATTTCTTGAACTCAGGACTAG
2721 CCTGAAAATCCAAAATGCATGTAGAGTTGACATGTTGACATATGTCTATGTCCTCTGTTTTTATTTAAGCCTCATTTATT
2801 TCTCCCTTGCCATGCCCATTTGGGATTTTCTTTGCCCAGCATATGTGCCATAAACAGAACAAATGGATCCAGGGTATACC
2881 TCTAATAACCTTTATCTAAATAGAATACATTTAACCTGTCAATTATATGTATAGATTTATCCTAATTGGTTCAACATATA
2961 TATGAATGCTTGTAATAGTCTGTTACTATTTGATAATGCATAAATGTTATATTTATATACAGTTACAGCAGGCCAGAAAC
3041 ATACATACACTGCATCCTGTAAGGTCTGTAAATCAGGGCTTCGGCAATGCCATTTTGCTATAGACTCATTCATGTTTTTT
3121 AGGAATCAGAATCATTTCAGGAGAAAACCAACTAAGTAGACTTTAATTCTTCTCTTTCTCATTCTTGCCCTTTGAGAAAC
3201 CCAAGTGGAATCATCACTTAATTACTTACTCAAATTCAATGAATCAAATCCAATCCAATCAGTGAGAAGAATAGCTTATC
3281 TTTCAAGGTAATACTTTACCTTAGATCTTTGAGGGCATGCTTCCCATACAAAGAGCATCAGAAAATCAGGGCAATCATCT
3361 AGATCTCACAGATCTTCAACATAGGACTCTAGGTTATGAGAGCTGAACCACATAGCTATCAGTTTCAGTTTTTACTTCCT
3441 ATTGAGTGTGTAGAAACACAGCCTATGGTTTTGCTGTCTGCGGAAGTTACCATACCCTGTAAAAGACAAATATTTCTTTC
3521 TCCTCTCGAACCACTAGTCAGCCTGGATATTCATGAAAGCTGAAAGAAGGGGTGCCAAAATGCCTAGCTCCTGGATTTAG
3601 ACTCATGGAATATGAGAAAGGCTTAGGGAAAATTCAAGTCATGGGGAGATTCCTGCTAGGTGATGCCAGGAATCTCAATG
3681 ACCTGTTGATTAGAGGGTCTCTGGTCATTTCCACTTGTGTGTGGAGAAATACATCATTTGCATATGTATCTAGTCAAGAA
3761 GCCCTTTTGGAGCAAAGTGGTTGGGAAACTCATTTACTGGGTCCACCAAAGGAAACCCAATTCTGCCATGTTTTTGCAAA
3841 TACTACACGTCCCTTTGCTCTCAATAGCAAAAGTGATGTTATAGTTTTTTTTACTTTTGTCAGAATCAAGGCTTCGGCCA
3921 CCTGTGCAATATTTTCCCATGGAATGCAGCAGTAAATCCAAGTAGGTATATCCGTGCTCAGAGAGAATTCTCCATAGTTC
4001 TGACTCCTGAAAAACAAGTCTCATTAGCTCTCATCTAGTTTGATGACTAAAAGTGCACAGCAGTTATACCCCAGTGGAAG
4081 TGATTTTTCTCACCTAGCTGCTCTCTAACTCTTACGGCTATCTAGTTGTCTGAGCTGCTGGTTTGTTTTACTTATTCTCC
4161 AACTGAACTCATTCCAAACCAAGAAAAAGGACCAAATGAAATTTTCAGTTATTATCATACTTGCTCCTTGAATAAGAATG
4241 CTAGAGTCTGGAGGCAGAAGAAGACTAAGTTAAAAAAAAAACAGCCTGAAGGAATTCTGGAGTGAGTTTTGTAAGTCTAA
4321 TTGTCAAAGAAGATAAATGGTCTCAGTATCTGTAGTAATTTCTGGTTAAGCCTAGAGGGATCACTGAGTGCCAATCCAAG
4401 CAGGTGGCACTAGAGGCAGATTGTTCTCCTAGCATAGAGTGAGTTTCCAGCTGCTCATGACACATTTTCTTATGATTTTC
4481 CCTAAAAGAAAACCAAATTTTCTACTCCACCTCTTCCTTTCCTATCATTCCACTTATTGTTGCTGCTTTGCTAACAGCCA
4561 GCTTAGTAAGCCATCACACAAGTTAGTGTGAGGCTTGGTTTTAAAATAGATAACAGAGAATCTTGATTAAATAGTATCCA
4641 ACTTTGTAGCATAACACAGCTAATTCAGGCAATGACATAGAGATGATAAGAAACAACATGGTTTGGTAGAGGGAACATTT
4721 GATTTAGACTCTGCCCATTTTTAGCTGTATGACTTACATAAGTCATTTTGTGTCCAAGCCTCATTTTCTCCCATATGAAA
4801 AGTGAAGGGGTTGGATTAAATGACTAAAATCCCCTTCCAGCCCTATGAGCCCAATGTATTATGATCTCTGCTTTGTTTCC
4881 TTCTTAAGAGGCTTCCTACTATAAAATGTGACCTATTTACATTTTAAGTTGAAGTAGCCCACAATAATGAATAATCAATT
4961 TAGATTTTTCTCATCTCCTTTGGGAGAAATTAAATTCAAGCCTCTATTCATTTGATGTTTTACAACAAGCTTCAAAGTTG
5041 GCCATGTTCATTCACAGTTTGATATTTTGAGACACCAATAAAAGTTTTTTAATAAAAGTTCCCTTGACTTAAACTCACCT
5121 TCCTAATAGAAGTAGTGATTTGGCTCACGGAAAAATGTTTCCAGAGTCAACATGAGAGGACTGGATGAACCTACAGCCTC
5201 ACTCAAGCTGTTGCATCATTGCTGCTGTAGCAACAGAGCCCTCTCTGAATACCCAAAACACACAATTTTCTCCAACAATT
5281 CTAATTGCCCACCCAGTATGGGAATTTGAGAGCCTTTGGTGAATAACCTTGATCACTCTTTTGAAATTTGGTACAACACT
5361 TGCACAATCACGGCAACTGTTTGTAAATATCTTTTCTTCTCCGCCAGTATGTAGACATGCACACCCATTCACAAGTAAGC
5441 CCGCAAATTCATTTTCACATTTTCCTCTTGGTTTGTTTTTATCATGGGTATCACATTGCAGGAAGAGATGCTCTAACTTA
5521 CAAGAATGGAATTTTCTGACTATCATTGCCCTCTTCAAGGCCTGATTAGTTTGTAGGGTGGATGGGATACAATGCATGGT
5601 CTACAAGGTCCATGTCACCAGCCATGATCTTTAAACAACCTCTTGCACTTTCTGGCACTGCTGCAATGGCCCATGGTGGA
5681 CACCTCTGCTGTTTGTCCAAACTTCTGCTAAATAGAGTAGTGTTGGTATTTGTTGTGTTGTGAACTCCTTTGTTGTCAGA
5761 GAAGACTTCAGCTCTTCAGGTTTGCAAGGGCAAGATGTAAAGCTAGGACTGAAAGGATTGGGTTTTGTTTTTCGGCCGGC
5841 TTTTTTCCATTAGTGCAAAAAACCTGATGCAAGGGCAGCAAGATAAACACAATTTCTTCATTGACCCAGATAAGAACCTG
5921 TAGAAAAGTGAGAGATGCCCCTAAGTTCCTATTTCATTTATCCTAAATAATATCCTGAATAACTACTGATCAGTTTTTTT
6001 CTATGTCCAGCCTTGCTTCACTTTCCAACCTCCAGGCCAAATATTCATTTTGATATTTTACAAAATCCTTCTGGTTTTTA
6081 CACAGGGCCCTTTTGTGCTGAGAATAAAACCAGCTATTGGAACAGACCTCACTGCTTTGTAGAGTCAGAAGTTGACCTAG
6161 AGAATGGGTAGCAACAGGTCCTCAGTTTCTCTGGAGACACCCCCAATCCTTGGGTGAGTGTTGAAACCTGACAACTGACT
6241 GTTAGCCTTGTCATCATCCTCACTGGAGATGGAGATGTTGCAGTCGGAGCCTCACTCCTTCTGGGGCACTGTTTCTTCTC
6321 ATGGCAACCATTTTGCCTGCCTGGAAACAGCCTGTTGCCTTTGCTAGGGGGCAAATACACACACTAGCCAAGGAAGTTGG
6401 TCCAGCACATCTCTGAGGTTTCTCCCCCATGGACCCATGGAGCGAATTCCCTGAGATAAATGATCAGAAAGTTGGCTGTC
6481 TGGTGGTTTAATACTCCATAAGAGTTACTTCCCTTATAGAAAGTCATCCTTTGGCATCTAGATTTTTCTACAAATCACCT
6561 TAACTCCCTCCCTTTCTCTTTCTCCTGGAAAACCTCAGCATTGCATCTCCATGTTGCACAACACAGATCAGATTATCTGG
6641 TCACTATAGAGATTTGTATATAAAAAAACTACTTTTTTGAGGATTTTGTATATTGTTTTTCTATTTGTTTTCTACAGCTT
6721 GAGGAAAGAGCTGGCAAACTGTGAATCTAACTTGATCTTGTTGCCAGCAGATATATTTTGGCTTCCTGGTAAGAGTCTGT
6801 GTTACCAGGGACAATATATTGCCCTCTGATCAGTATTGCACCCTAAATCCACAAATTCCTCCAGCCCAGTCTTACATTTT
6881 TTTAAACAAATCCCCTAGCTTGTTTGCTATTATTTATAAAGAGCATTAGAAAATGTATTTATAGACCTGGATGTTATATG
6961 TTTAATATTAATTTAGCCTTTAATAATGTTATAGGTTTGTAACTATTCTTCAGAAATTATAAAGAACTCAGTGTAGACTG
7041 AATTAATCTATTTAGTATCTGTAATTTTGCAGACATATTTTCTTACAGTATTTTCTATGTAACCACACATGTAGAATTAT
7121 AACTAATTAGAGCACAAGAAGTTTCTTCAGCAATTTAGAGCTACCAATTGTTTCTTGACTATATAGTCACATTTGACAAA
7201 TTTAAGAACCCAGTCTTTAGTGATGCAATAAACAAAATGAACCATTAAGAACAAGGAATTGCTTAAATCCCTTAGCTGGT
7281 GAGGATATACATCTAAATAATTCATCTTTCTAACTCAAGGAATGGTGCTGATTTTTTAAATGTTTGACACCAGGCCTTGT
7361 TTTTCCAGCTGAGCATTCTCATTTTGCTTTTCTCTAAGACTATCAAAGACAAGGTATTAATAGTAGGATTATTCCTAGAT
7441 CAGAATGTTTCATACATTCCTAAAGGTTTATGTGGAAATTGGCTTAGGAAAACTTTGAGTAGCAGAGACTGAGGATGAGT
7521 GCTAGAGATGAAATCAGGACAGATTTGTTGCAGTTAATTCTTGCCAAGCAAATTAGTGGTAAATGTCACATTGTTATGTG
7601 AATTGAGCACATATTTTTAAAGAAAGTTTACAAAAAATTTTTAGAACCAACTATGAGGCAATACTGTATCACTGGGGGCT
7681 GGGAGTGGGGGCTTAGAATCATACTGAAATTGTTTAAAAGCAGCCCAGGTAGTTTCTGTCCTCAGGTGAATAACAGACTA
7761 TATAACTTCCCCGAAAGGTAAAACGATAGCCACTGCAGAGACGAGGTGTCTTCCTTCCACCAAATACTTTCTGAGATGGT
7841 GGTAGGAGTAGTATTTTTACCGTGGTTTAAAAAGTAGTCAGTTACATAGAAAGTGTATTGGTATGTATTTGAACCTGCTC
7921 TTCATTAAACAAACAGATTAGATGTACCCTCGACTGGCAATAATTGTATCTATTTTCAAGTACAGCTAGCTGTCAAAGCA
8001 TGAAGCTCTTGTGTATACACACTGACACTTGGTTCACGCATGAAGAACAGTGCCTATGCACTTTGTGTAGCTATAATGTA
8081 GGTATCTAGGTGTAATTTCAGTGAAATGGTGTATAGATGTATTGTAATTTAAATGTATATGTTATTTTTGGCTATTCATC
8161 TAAATGCAGTAGACATGTTGATCGGTGTTTTGCAAACATTTCTTTTTCCTTCTTAGATAACTAGTCGTGAATCATTTCTC
8241 CTCTTTCTCAGTGTGGCTTGGGAATATATATGAGTGAAGAATTTATCTGTGAATCCTTTGTACTGATGATTGTTTGAAAG
8321 TCTGTGTGTGTCCAGCACCTTTGTAAATACACAATTCAGAGCAGGGATGGGCTGGGTGTGTGTCCTGGTTCTTAGTGAAA
8401 GGTCATCTCATGTCTGTTTAATACATGGTGAATGCAACTGTGGAACTTTTGATTACCTAGACTTAGGTAGGTTTAGAATG
8481 AGAACATCCATCTACAGTCCTCCTTTGCTTGGTGGATTGGGCTCAGAGGAACAAAAAGTTAGTCTGACTCTGTGCATATT
8561 AGCATCATGTCTTTAGAGAAAGGTCAGCCTCTCTGGTTGCCAAATACTCATCATGATGCTCATGACTTAAAGGTTCTGAG
8641 GAGCCTTGTCTCCCTTGGATTTTTGAGTCAGGGTACAGGAAAAAACATTGCTGACTAACTAACTGCAAATGCATCTGCAG
8721 GTGAAACCCTACGAAAGCACAGTTCTGGCTATAAACTTCAGAGTTCTCTGTAAAAAACTTAGAGCACTAGAAGCACAGGA
8801 ATAGTGAGTGTACAGCTTATGCGGTTGTAGAGGGGCAACTGATGAACACAGGTCCCACATATATGAGGGAGTATGACGTT
8881 CTCTACCTAATATGTTCTGTGTGCATGTTTTGAATGATTGAAGATGGGATTAACTAATGCAAGTTTACAGTTGCCTCCTA
8961 AAACACACATTCTGTATAATTATCGCTAAATACAATGCTGTGAGGTCTATAGTTCCTGTAACCCCTTTCTCCTCCCCAAG
9041 GACAGAGAAGAACTAGCCATGTGCTATAGGGAACCCTGAGTGCCCTACTCTTTTCCCAAGAAGGGTAAAGCCTACAATAT
9121 CATCAGGGGGCATGAAGCACATTAATTTGCAGTGGCTGCTTCATATGAGGAGATATGGTGGACAGGCTAATTTTTCCTTG
9201 AAAATGTGGCTTCTTCAACTCCTTTCAAATTTAGGATGGAATACTTCCTGAAATAAAACTGGGCTTTATGCAGGATTCTC
9281 TTTGAAAATTCTTGTATGTCCAGAACAAAAGATAAAACTAATTGTATTCCTCACATTCACAATCCCCATTGGTCTGAAGT
9361 CACGTAGCACAGAGCATCTATAGCACATAGTGTTTAAAGACTAATGAATGCAAAAAGATAAAATCTTCAACTAATTTTTG
9441 AATTGTTTCTCATATATGCTACTAGAAAATGCCTTGTTGATGAAGCACATTTTGGGTAGTTGAGGTCTTTTGTTTTCGCC
9521 TTTAGCTTTCTAAGCTTTCTTACAATGTGGACTGATTACTGTAACATTTCACGTGTAAAATAACTGGATATTCTTTATAT
9601 ACTGGAAATAACCTGTGAATCCAATATTTCACTAAGTGTTTTAACTTTTGTGTATATATCTCTCATCAATAAATGTGGAT
9681 TTCAATTTAAAAAAAAAAAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' ugacGUCGGAACUGGAGGGUc 5'
| ||| ||:|||||||
Target 5' ccacCCGCCATGGCCTCCCAa 3'
|
2176 - 2196
|
165.00 |
-21.40 |
2
|
miRNA 3' ugACGUCGGAAC----UGGAGGGUc 5'
| |||||||| ||:|:|||
Target 5' tgTCCAGCCTTGCTTCACTTTCCAa 3'
|
6004 - 6028
|
141.00 |
-19.70 |
3
|
miRNA 3' ugAC-GUCGGA---ACUGGAGGGUc 5'
|| ||||:| | :||||||
Target 5' ctTGCCAGCTTCCCTTTTCTCCCAa 3'
|
278 - 302
|
139.00 |
-16.30 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|