pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-4680 |
Genomic Coordinates | chr10: 110898090 - 110898155 |
Description | Homo sapiens miR-4680 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-4680-5p | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 5| AGAACUCUUGCAGUCUUAGAUGU |27 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | TMOD2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | N-TMOD, NTMOD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | tropomodulin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001142885 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_014548 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on TMOD2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of TMOD2 (miRNA target sites are highlighted) |
>TMOD2|NM_001142885|3'UTR 1 ACTTCCTTGAGGAGAAGTGAAGTTTCACTGTGGTATGGCCATTGAAAAACAAAAACTCTTCTTCTTCCCCATCAGGACCA 81 TTTTATCAAAGTTCGTTCATTTCCGTTAACCACATAACTAATAATTTAATTGTTATTCTTTTTTAGCACTACTTATTTAT 161 CTTGGATTTTGTAATATATGCAATTGTTTTATTTGCTCATGGGCACTTCTGGCAACTTGACAAATGGACCGATGCAGATT 241 TTAGAGAGTGACGACATGGAAAATGAATTTAACCACTTTCTTATTGGGTTGTCTTGCTTTCTTACATGAACTTGTTTTTT 321 TAATCACTGAAAGGAATTTAGTGTATAATATGTGTTTGTAACTGTGATTATGATAGAGGCCTATCTCTGTTTACATGCAT 401 AGCTTTGAGTTAGGCTAAATACATCAGAAGTGTTCTACTGACCACATAAGAAGTTAGTATTGCCAATCTTTCACTGCATG 481 TGAAAATGTGACCAATTTAGCACAAATTCTCTCTTAGTTCCAGAAAAATCAGTAAATGCACATGCCCTGTTGATTGGAGA 561 TCAGTAGTGTCATCTTCATAAAGCAAGACAACATTATGACACTTTAAAACAGTAGCAAAGAAGTCTATTTATTAACCCAC 641 AAATGTAGCATCAAGCCAGACTCACAGGTAGCAAAATGAATTACACACCTACTTTTACTGACTATTCAACATAAATTGAA 721 TCTTTAACATGACTTTAAAGGCTATTTACAAAGCTGTTTTAAAGTTTTTCAAACATGATAGAAATTTTCTAAATTTTAGT 801 AAGAGAGAAGCTTTTAAAACAGTACATTCCTGAATAAAACAACAATATTGTATCTTAATCAAGGCTGTCTGATGCAGATG 881 ATTGCATTTTTTGGCAAATTTTAGAAGCATTTATTGCTTTGTCTTTAGTGTAACAAGATCACTGGATTAAATATAAACAT 961 TCAGGTTAATTATCTAGATTTTTGTCCACAGTATATGATCCATCCAGACATTTGCAAACGTCAGGAGAAAAATGTGAATT 1041 ATTTATCCAGATGCATGTCATCTCAAGGACAAAGCCTGTGAAAGTACAAGTGAGATGGTTGCATTGTAGTATGCATTAAT 1121 CTTTCAATGTAGTGGTGTAAAAATGCAGTGCTAAACTAATGAAGCAGGTGACTGCAGCCTTTGGCTCAAGCTCACAACTC 1201 TGATAACTGTCAGTGCCTGAGGTTGTGATTGGTGACATTCTGACACTGCCCAAGGCAACTCACCCTCTATTCCTCCTTTC 1281 TCCCCTCCCTTTCTTCCAATTCATTGTCTTTTTTTTCCTCTTTTCTCTGTAATTTGTTACTAAACAAATTCCAGAATTTG 1361 TTTAGTAGCTGAGTGTTCCTGAGTTGCCTAGTAGCAATAAAACAAGTGAATAGGAAAATAATTAATATATTATTCTATTT 1441 AGCTTGTAAAACACATGGAATCTGTTTAAGATAGCCCTTGTAAAATTGAACATTTACCTGTATTGTAAGTACCCACATCT 1521 GTGTCTCTGAAGTCCTTTGAAACATCTCATTATCTTGAAATTTTTTTAATGTTTGAGAACACCATAAGCAGAATATTCTA 1601 ACACCTTTGGCCCCTGAAAATCCTTTAATTAGTTTATGGCTTCATCTCCTTATCTATTTAAAAAACATAGTAAATAATGT 1681 TTATGGTTTTCAGTCTGATTTTTCCTTCCCTTTCACCCATTTAGGTGTGATGTGTTGGAGTCAACTTGTACAGGCTTGCC 1761 AACTGTTATATTTTCAAGAATTTTGCAAACTGGTTGTTCAATACAGCCATTATTTAAAATTAAATGATGTGCACTTACAA 1841 CTGAATGAATTATATTAAGGACAGAAGTAACAAATACTGTACTCAAAAATCTTACATTTTACTATTTTCTAACCTCTTAG 1921 ATTATTTACATCTAGTAGGTATGTATGTAGAAATATTACCAAACAGTATGCTACTGAACGTATCCTCTCAACTCCATGTT 2001 CACTACCTTCTTGTTACTACAGTGGCTTGAAATTGGCCATGGTAGAAATATTTACACCACAGAAATTAGCAATATGTAAG 2081 AAATTGGGGTTTTCTCCCTCTCCAGATTGCTGGTTGATAAACATTCATCAGCACACCACTGGGTGAAATTATACATTTTT 2161 TTATACATATGTTTCGCTTATCATGTTGCCGAAGGGAAGAACATTTCTCTTAGATGTCTTTTCTCCTCTTTGGATTTGTT 2241 ACAAACCTGTTTAAGTGCTGAGTCCCTGACCTGCCTCTCCAAGTAAGCCTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTACTC 2321 TCATTCTTGCCTTGACTCTTAAAATCCTGGACCCTATAGAGCATTCCTTGCAGCCCCACAGTGCTGTGGGCTGGGGGCTA 2401 AAGCAGTTCTTGGCAAACTCTGGCAGAAAGCAAGAAAAAAAGAATCAGAATTCAATCATGGCTGTTTCTTTTGTACAAGC 2481 AGTTGTTGATAGTATTAAAGCAAGATAATGGGACATTATCAAAAATATAGCACTGTTTTTACCTTATGAAATAGTTGGGT 2561 TGCATGCAACAGAGTCTATGAAATCAAATGTTTTTTACTAATCAGTTTGTTTTCTTATTACCTGTGTTTTTAAAGTGGCT 2641 TGAAAGGTGGCATTTCCATGAGTGTGCACATATTGATGATAACCCTTAGAAAAACATACACTTGAGGAGCCTATCCATCA 2721 TTTAATTAGCCTAGGACTTCATCTCCCTCTCTGCCCAAAGTGTGGAAGTGGTAGCTCTTTCATGATCATGGGCACAGTTA 2801 ATCCTTTGCTATCCATTGTGATGGGGCATAATGTATATAAAATATTTTTCTATGTATTTGTTCTGCCAGATACTGTGTTG 2881 AGATATTTGGCAATATCTGGATAACTGACTGAAGGGAGATAACTTCTCCCCAGGCCTATCTCCCTCCCCCTTTTAGAGTT 2961 GTGCAGGTCCACTTTAAGTGTAAAATCACTCACCTGGACTTGTGGGCTTGTATCACCAACATCTATTATGGCACATGTAG 3041 ATGACATTTAGGAGAAAAACCTTAGAAGTCTAGAAATCATATGATTAGTTCAGCACTGCAGCTCCCCATCTGCTTATAGT 3121 GTATAACTGGAAGCTCTTTCATCCTCATCAGCATGATTAAATGACTTCGTTTCTTTCATCTTTGGAGGGTATAATGTAAA 3201 TAAGTGTCGTGTGTGTATGTGTGTGTGTACTGTCAGATATCTAACTAGGTATTTGGCTACATCTGGACAACTGATTGAAG 3281 GGAGATGCTCTCTCCCCAGTCCTCTTCCCTTGTCCTTTTTAGAATTGCTGCAGGCCCAGGTTAAATATGAAATTACTCCC 3361 TAGGCTTTGCAGTTTATGTTACCAACCACCACATTTTATAGCTATGTAGAGGATGACTCTTAGGAAATAAATATTAGAAG 3441 CCTAGAAATCATTTAGTTGTTCTAGCACCAAATCTATCCATTTGCCTAATGTATTTAACATTCCATCCTCATCAACATGA 3521 TGAAGCCCCTTTCTTCCATCTTTGTAGGGCACATTGTATATAAATATTTTGTACATAAAGATCATCAAATACCATAATGG 3601 GGTATTTGGCTTCATCTGGAAAATTGACTGGAGGGAGATGCTGTCTCCCAGCCCTGCTTCCCTCGTCCCTGTCCAAGTTG 3681 CTGCAGGCCCAGGTTAGAAGATTACCAACCTGGAGGGGCATGCAGTTCATCTTACAATAAAAGCCCATTCATTTAAAAAC 3761 TCAGAAATCATCCCAGTGCCTGTACTCCTCAAACCAATTTCCCTAAGGGAAGACTGGCACACCAGCCCAAAGAGCAGGTG 3841 CTTCTCTTCCAACAGAAACATGGCCCCTGACAGGGCACCAGCATTAGGGAAACCAATGTCCTCCGAATAGCTGCCATGAG 3921 AACATTTCAGATGCTCAAACTGAAAATTCTTAAAACCAATATTAAGCATCAGCATGCTTTAAGTGTAAGATAGCCCTTTG 4001 GAATTTACAAACACATGTGCAGCTATTTCCTTCTTCACAGATATGATGTACTCAGCCCCCTCCTAGGCACTACGAAGAAG 4081 ACAGAGGAAGCATAAAAATTCTGGACTAATATAATTTTATATGTGTTTCTGAGATTGGGGAGTAGACTGAGTGCCTTTTT 4161 TACAAAGAAGATCCCATATTTAATTCAAGTATTTATAGCATCAGCAAAAATGGGCAGAGGGCGGGAAGTTGAGAACACTA 4241 GGTTCTGTGCTATGTTACCTGTATTCAGTAGAAGTGTTTCTGGAGTCAGGTTTTAAGTCATGATCCTGAAGCTTCCTTCC 4321 CCTCTTCCACTAATGATGCAATAATAGCTGTTTTCATTTTAACGAGCAGAGAACTAAGAGGAAAGGTCCTAGCTCTGCCT 4401 TCCACTTGCAGCTTCCCTTTACCTCCTCTTATTGCTTTCATCTCAAATATCCCTGCTACTCAACCAATCCTAAAGCTAAA 4481 GTACTGAGATGCACACAAAGGAAAGGTGTGAGAGTGCTTGGAAGCATCCAGCTGAGCCCACTGGATGAAAATCAGACGAT 4561 AGGGCCTCCTGTTGTAATATACTAGCCAGAGAAAAGCGCCAAGAACTTCAGGGATATTATTCACTGCTTTATTGCTCCCT 4641 AACCCTAGATCAGATTGGATTTTACTTTGTAGTTCAGGAGTTAAGAAGTCAAATTGCTGACCGAGGTGGGGAAGGATGAT 4721 GGAAATTAAAGGTTTACATTTGTTTAATGGCAGAACTGAGATTTGCTCAGCTTATCTCTTTCCCATCTGTCTGTAATAGC 4801 AATGACTGAATAATCAGTAGACCAATGGAAGAGGAGTTGCAAGTTTAAATTTGTAACCTGACTCTGGGTTCTGTTCTAGG 4881 AATAGTGCATGTTTTAGAGGCTTTGCCAGTTGGGATACATTGTTGACTTGGGGGAGGATGAAGGAGAGAACTGATGACCT 4961 AGACATAGAAAAGAGTAGTTAACTAACTAGATGTTCTTCTGATCTCTTCCATGGTAGACATTCTGAGCACATTGGCCCAG 5041 TTAGTTGGTATGGTGAAGGGGCACCGTACTAACAGATTTGGAGACTGAAACCTAATCCCATCACCAACACTTAGCAGGTA 5121 TATGATCATGGGCAATTCATTCAATTGCCTGCCAATTATAGACTATATAGGGGGAAGAGCACTGGATTTGGAGTCAAGAA 5201 ACCTGGACACTTGGCTCCACACTTCCTTAGCTGGGTAACTTTGGGCAAACCGCTTGGTCTCTCAAGCCTAAGGTTCTTCA 5281 GCTATAAAATGGGAATAATACTTCACTAACTACCTCACAGAGTTGTGGTAAGAATATAATCAGATAACTGGATAAAAACA 5361 CTATATAAACTGGAAAGCGCCGTACAAATGTGAGAGATCAGTTTTATTATCAAATCACTGTTTTCCACTGCCTCTTGAAT 5441 CGGCTTTATTCTAACCAACCATTACATCTTTCTCATCTTTTGGAGTATGGGTAATTGAGGCTTGGGTGTGTCATCAGGGA 5521 CTGGAGTTATTTCAGCTCCCATGTAGAGGTGGGAGAGGTGGTTGATGGGGCAGTGGAAGTTAGATACCAGCGATGTATAT 5601 GGTAGGACATTTTCCTGGGTCACTTTGACAGTACCTTGGGAAATTGTCAGTCCTTGCAGAGGGCCTAGGCTGGGCACAAG 5681 GGAGAAAGCGAACAGTTGACTAAGAATTGAGGGGAGGGTCTGGAGCGCTACTGCCCTCCTGTCATTGCTGTGGGTGGGAG 5761 AGGCTAAGACTTCAGGTTTGACTGGAGGCCTAGGAGAGAAGAGTGTCCTTAGGGTTTCAAGAATTTTAATGCCTAGCAGC 5841 TGAGTAACAGGCATTAGTTCTGATAGATAGTGAAGGGGAGAAAGTGCCACCTGTTGTGAGATCACCTCTCCAGGGCAGCA 5921 GCTGCCTTGTTATCACCAGCAACCTTAGCCCTGGTCAGTAATATTTCTGCTAAGAAAGGTTTTGAAGCATGGCCTCCAAT 6001 GACTTTCATAAGCCCTTGGAGGCAGGACTGTGTCTCATCCATCTTTGTATCTTCAGTACCATCTTGTAAGGTGCCTTGTA 6081 CATAGTAGGTGCTTAATGAACAAATGTTGCTTGAATTTAGCTGTCGTCCAGCCCCACAGAGTTATGCTCCATTTGCCACC 6161 ATGTGATATTTTTGAGAAACAATAGTGATTTGGATGCCAGCTCTATGTGACTTTGGGCAAGACTCTCCATCTATCTTGTC 6241 TTCATTTCATCTGTAAAATGAAGTGAGTAGATTCAATGCTCCCTAAGGTCCCTTCCAGCTCCAATACTTGACAAGCTTGT 6321 GATTCTAAATCGTTTCCGTTGCCTCTGAACATGGGTGAGTAATGCCTCCACTGCAGCTGTTTCTCTCCAGGAGGCTTTGT 6401 TCAGAGGAGGTCTGACTATTGCACAGCCAGTTTTTTCTTCCTCTTCAGCAGTTCTTTACTGTCTTCAGAATGGTTCTGGA 6481 TAAGCGGCCTTTTCTGAAAGGATATTTAAAAATATATACTATTTAGGCTGGGCCCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGC 6561 ACTTTGGGAGGTGAAGGTGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCT 6641 CTACTAAAAATACAGAAATTAGCTGGGCCCTGTGGCAAGAGCCTGTTATCCCAGCTACTGGGGAGGCTGAGGCAGGAAAA 6721 TCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGTAGTGAGCCGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAACGAAAC 6801 TCCATCTCAAAAAATAAAATAAAATATATACTATCTTGCTCCTCAGAACCAGTGGGGAAGAAGAGGGAAGGCAAAGAAAG 6881 AAACTGAGCATAGTAAACACAGCATTTTTTTGTAGGCTCTTATTTAAAATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTTTCT 6961 GAGTAAGTATTGACTGGGAAAAAGAGAGAAGTCAATCAAAAGTATACTGTGCAATTGAGAGAGGCTGGCCCAAGATTTAA 7041 AACTTCCTGTGGGTAATCTAACTGTGAGTAGATAGGAATCGGCCATATGACGAAATGAGATCAATAGGAAATGTGCTTTT 7121 TGAGGAAATTTTATTTTAGTACCAAATGTTGCCAGTGACAATCTTCAGTTAAGAAGTAAGTTATTCTGACCTAAAATTCT 7201 TATCTCTGCCACTTTGGTTTAAAAACAAAAACCCTTATATACATGGAATAGTTATATTTTAATTAAGCATTTATTTTAGT 7281 TGTTTTCATCCATTCAAGCAAAATGAATAAGCAGCATTTTTCATTGCACTTAAAAATGTAAAATACCTGCATGCCACTAA 7361 TCTGTAACATTTTACCAGTTCAGATGCCTGTAATGTGTGACTTTATGTGTGTCTGTGTTGTTTTGAAGAGAATAAAGGAA 7441 ATAATACTTTGCAAACTGTTTAAACAAGTGTTTAAACTTCTATTGGCAACATTTATTGGGCTAAGCAGTTATTGAAAACT 7521 CCGCATAGTTTTATTTTCCATTTGAAACTTCAATCAAATCAAGACTATTATATTCATTAGGGAATTAAAGACTAATTTGC 7601 TTTTTAAATGTGAAGTTGAACACTGTGTGGAAAGTAAATGTGTGATGAAGCAAAATGTATAAAGTATGAAATATTATACT 7681 TTTACCCTGGATAATTATTCAGGACCCCAGTTGGCCCAAATAGGTGCAATTTTTAATCCTTTGAAATTAGCCAGCCAGAC 7761 CTAATGCTAAGGTAAATGTAAACTGTTTTAATTAATTAAGATCTTTCTGCTTTCGAAGGTATAATGTATCTATTTCTGTC 7841 AGGAATGATATTTCCAAATGAAAATGTAAAGAACATTGGGAAATAATAAACTTTCCTTTCAAAGTAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DRVs in gene 3'UTRs |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|
Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
---|---|
miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
|
Conditions | HEK293S |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha |
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1084040. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noarsenite_rep1
HITS-CLIP data was present in GSM1084041. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_arsenite_rep1
HITS-CLIP data was present in GSM1084042. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noarsenite_rep2
HITS-CLIP data was present in GSM1084044. RNA binding protein: AGO2. Condition:CLIP_noarsenite_rep3
... - Karginov FV; Hannon GJ, 2013, Genes & development. |
Article |
- Karginov FV; Hannon GJ - Genes & development, 2013
When adapting to environmental stress, cells attenuate and reprogram their translational output. In part, these altered translation profiles are established through changes in the interactions between RNA-binding proteins and mRNAs. The Argonaute 2 (Ago2)/microRNA (miRNA) machinery has been shown to participate in stress-induced translational up-regulation of a particular mRNA, CAT-1; however, a detailed, transcriptome-wide understanding of the involvement of Ago2 in the process has been lacking. Here, we profiled the overall changes in Ago2-mRNA interactions upon arsenite stress by cross-linking immunoprecipitation (CLIP) followed by high-throughput sequencing (CLIP-seq). Ago2 displayed a significant remodeling of its transcript occupancy, with the majority of 3' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) sites exhibiting stronger interaction. Interestingly, target sites that were destined for release from Ago2 upon stress were depleted in miRNA complementarity signatures, suggesting an alternative mode of interaction. To compare the changes in Ago2-binding patterns across transcripts with changes in their translational states, we measured mRNA profiles on ribosome/polysome gradients by RNA sequencing (RNA-seq). Increased Ago2 occupancy correlated with stronger repression of translation for those mRNAs, as evidenced by a shift toward lighter gradient fractions upon stress, while release of Ago2 was associated with the limited number of transcripts that remained translated. Taken together, these data point to a role for Ago2 and the mammalian miRNAs in mediating the translational component of the stress response.
LinkOut: [PMID: 23824327]
|
CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1084040 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noarsenite_rep1 |
Location of target site | ENST00000249700.4 | 3UTR | AGGUGAAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM1084041 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_arsenite_rep1 |
Location of target site | ENST00000249700.4 | 3UTR | AGGUGAAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM1084042 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noarsenite_rep2 |
Location of target site | ENST00000249700.4 | 3UTR | AGGUGAAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGAGUU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 4 for dataset GSM1084044 | |
---|---|
Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293S / CLIP_noarsenite_rep3 |
Location of target site | ENST00000249700.4 | 3UTR | AGGUGAAGGUGGGUGGAUCACCUGAGGUCAGGA |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23824327 / GSE44404 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
|
133 hsa-miR-4680-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
![]() |
![]() |
|||||||
Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
|||||
MIRT378771 | MACC1 | MACC1, MET transcriptional regulator | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT393867 | ZDHHC21 | zinc finger DHHC-type containing 21 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT446684 | C2CD2 | C2 calcium dependent domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT447600 | MRPL3 | mitochondrial ribosomal protein L3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT450708 | RNF152 | ring finger protein 152 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT450784 | PAPOLG | poly(A) polymerase gamma | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT454623 | COL23A1 | collagen type XXIII alpha 1 chain | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT461620 | PTCD3 | pentatricopeptide repeat domain 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT462695 | SNRPD3 | small nuclear ribonucleoprotein D3 polypeptide | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475530 | HOXA3 | homeobox A3 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT475739 | HERPUD1 | homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT489676 | CYP1A1 | cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT490610 | SLC47A1 | solute carrier family 47 member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT493628 | HIC2 | HIC ZBTB transcriptional repressor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496152 | RPS15A | ribosomal protein S15a | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT499232 | VAV3 | vav guanine nucleotide exchange factor 3 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT501496 | PRICKLE2 | prickle planar cell polarity protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT507163 | GAS2L3 | growth arrest specific 2 like 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT512389 | MTRNR2L1 | MT-RNR2-like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT514626 | MTRNR2L7 | MT-RNR2-like 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517474 | PEX26 | peroxisomal biogenesis factor 26 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT525332 | CNGB1 | cyclic nucleotide gated channel beta 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526685 | BAK1 | BCL2 antagonist/killer 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527317 | CCR2 | C-C motif chemokine receptor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT527608 | EYS | eyes shut homolog (Drosophila) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT528794 | RAB32 | RAB32, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT531048 | TIPARP | TCDD inducible poly(ADP-ribose) polymerase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT532254 | TBPL2 | TATA-box binding protein like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT533801 | TMED7 | transmembrane p24 trafficking protein 7 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT535887 | MLEC | malectin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT540704 | PDPK1 | 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT544645 | PHF8 | PHD finger protein 8 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT545760 | HS3ST1 | heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT555310 | PPP2R5C | protein phosphatase 2 regulatory subunit B'gamma | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT555877 | PAFAH1B2 | platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT559507 | ARID5B | AT-rich interaction domain 5B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT560448 | SLC30A7 | solute carrier family 30 member 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT561262 | ZIK1 | zinc finger protein interacting with K protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT561795 | PAWR | pro-apoptotic WT1 regulator | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT567007 | KLHL15 | kelch like family member 15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT569298 | SURF6 | surfeit 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570606 | MTRNR2L11 | MT-RNR2-like 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT572888 | ADCY2 | adenylate cyclase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT573119 | ADAMTS18 | ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 18 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT608332 | ZNF670 | zinc finger protein 670 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT614942 | KCNK5 | potassium two pore domain channel subfamily K member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT615324 | ERN1 | endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618441 | ZNF800 | zinc finger protein 800 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT620110 | HARBI1 | harbinger transposase derived 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT626008 | ZNF517 | zinc finger protein 517 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT626626 | SLC30A6 | solute carrier family 30 member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT627842 | POU3F1 | POU class 3 homeobox 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT628386 | CACNB2 | calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT629305 | PTPLAD2 | 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT629864 | GATAD1 | GATA zinc finger domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT630444 | IDE | insulin degrading enzyme | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT631854 | PIGG | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT633173 | AGO3 | argonaute 3, RISC catalytic component | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT633477 | ZNF724P | zinc finger protein 724 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT634395 | PLSCR1 | phospholipid scramblase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635538 | TRIM72 | tripartite motif containing 72 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT635821 | OPA3 | OPA3, outer mitochondrial membrane lipid metabolism regulator | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT636169 | TIMM8A | translocase of inner mitochondrial membrane 8A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT636797 | CYB5D1 | cytochrome b5 domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT637952 | IVD | isovaleryl-CoA dehydrogenase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645136 | HES2 | hes family bHLH transcription factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645667 | ADK | adenosine kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646148 | FLVCR1 | feline leukemia virus subgroup C cellular receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT647004 | NCR3LG1 | natural killer cell cytotoxicity receptor 3 ligand 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648187 | C2orf68 | chromosome 2 open reading frame 68 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650090 | TERF2 | telomeric repeat binding factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT650329 | RTN2 | reticulon 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT654224 | RNF165 | ring finger protein 165 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT654545 | RAB1A | RAB1A, member RAS oncogene family | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT656457 | MAPK14 | mitogen-activated protein kinase 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT656828 | KLF8 | Kruppel like factor 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657112 | ITPRIPL2 | inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657930 | GATSL2 | cytosolic arginine sensor for mTORC1 subunit 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT659375 | CREG2 | cellular repressor of E1A stimulated genes 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT659833 | CARHSP1 | calcium regulated heat stable protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662108 | LACTB | lactamase beta | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT662789 | TBC1D25 | TBC1 domain family member 25 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT669501 | ARL3 | ADP ribosylation factor like GTPase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT669759 | ZNF101 | zinc finger protein 101 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT669800 | GAN | gigaxonin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT670050 | RPP14 | ribonuclease P/MRP subunit p14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT670299 | RBBP4 | RB binding protein 4, chromatin remodeling factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT670388 | EMP2 | epithelial membrane protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672862 | C22orf29 | retrotransposon Gag like 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT672890 | FXN | frataxin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT673210 | C10orf76 | chromosome 10 open reading frame 76 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT674001 | KCNN3 | potassium calcium-activated channel subfamily N member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT674163 | BLOC1S3 | biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT674502 | TIRAP | TIR domain containing adaptor protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT675470 | NUBPL | nucleotide binding protein like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT675671 | TMOD2 | tropomodulin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT676006 | CRKL | CRK like proto-oncogene, adaptor protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT676074 | TIMM50 | translocase of inner mitochondrial membrane 50 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT676386 | SEC24D | SEC24 homolog D, COPII coat complex component | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT676764 | SNX2 | sorting nexin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT676896 | GABPB1 | GA binding protein transcription factor beta subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT676978 | ZNF708 | zinc finger protein 708 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT677236 | C15orf40 | chromosome 15 open reading frame 40 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT677369 | HSPA4L | heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT677464 | PDLIM3 | PDZ and LIM domain 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678081 | EIF2A | eukaryotic translation initiation factor 2A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678093 | ATCAY | ATCAY, caytaxin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678324 | FBLIM1 | filamin binding LIM protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678417 | ANKRD36 | ankyrin repeat domain 36 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678521 | ZNF347 | zinc finger protein 347 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678700 | TRIP11 | thyroid hormone receptor interactor 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678829 | PDE6A | phosphodiesterase 6A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT679991 | RUNDC1 | RUN domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT680751 | PSD4 | pleckstrin and Sec7 domain containing 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT681249 | ZNF383 | zinc finger protein 383 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT681422 | GTF3C6 | general transcription factor IIIC subunit 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT681948 | SLC19A3 | solute carrier family 19 member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT689278 | C5AR2 | complement component 5a receptor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT690389 | PARP15 | poly(ADP-ribose) polymerase family member 15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT691845 | OSCAR | osteoclast associated, immunoglobulin-like receptor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT693863 | IYD | iodotyrosine deiodinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT696002 | DNAJC10 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT701930 | MLLT1 | MLLT1, super elongation complex subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT702341 | KLHL7 | kelch like family member 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT703557 | FKBP14 | FK506 binding protein 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT705033 | CACUL1 | CDK2 associated cullin domain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT706341 | STAC2 | SH3 and cysteine rich domain 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT709671 | RGP1 | RGP1 homolog, RAB6A GEF complex partner 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711212 | EFHB | EF-hand domain family member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718342 | PURA | purine rich element binding protein A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722755 | SIRPB2 | signal regulatory protein beta 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT723535 | NFATC2IP | nuclear factor of activated T-cells 2 interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT724498 | BFAR | bifunctional apoptosis regulator | ![]() |
![]() |
2 | 2 |