pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-3689d-1 |
Genomic Coordinates | chr9: 134849609 - 134849682 |
Description | Homo sapiens miR-3689d-1 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
pre-miRNA | hsa-mir-3689d-2 |
Genomic Coordinates | chr9: 134850277 - 134850356 |
Description | Homo sapiens miR-3689d-2 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-3689d | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 2| GGGAGGUGUGAUCUCACACUCG |23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experiments | Illumina | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | MACC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 7A5, SH3BP4L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | MACC1, MET transcriptional regulator | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_182762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on MACC1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of MACC1 (miRNA target sites are highlighted) |
>MACC1|NM_182762|3'UTR 1 AAACAAAGCGTGTGTTTTTGATGGGAGGGAAAATGAGGTAATGGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTCTGTGTGTG 81 TCTCTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGAAAGAAAGAATCTC 161 AGAAAAGCATTATATTAATTTTCTTCATGCTCAAAACCAGTTTTTTTTTCCTGATGAAAGCACAGCCTAACTGATAACCA 241 AGATGGGTTTTATCCTCAAATATGTATTTTTGTGTATGTTTCAAATACAAGTATTAGGCTGCTTTGTTCTTAGAAAGGAA 321 AGAAAAAAGAAAAGTGCCCTCTCTCTCTTTCAGTGTTATTTTAAATTTACTAAGTCAAAGCTGTTTGAATAATTACATCA 401 CACAGATATCTGGGTAAACTAGAGACTATCAACATGATCAAGGCAGTGTTCCCAGGAGGCAGCTAGAAAGAGGGGAAGCA 481 AGCACACACCCTGTGGCCAGTCACGGCTGCCCGCTTTCCACACCTGACCTCTTCAGTTCATCAGTGGGGTTCACCAGCAT 561 CACCCCCATTTTTCATGGGGAGAAACTCAGAAGTGGAGAGAACGTCTGAGGCTACATAGCCAGTACAAAGTAGGTTTTCT 641 GCTTGAAAAACCTGTTTCTATTTCTTTTTAAAAAATCATACTGCATAACAGAATAGTAAAAACAAAATGCGTGTTAAGAC 721 TTACAGGGAAACAGTTGCCGTTTCATTTTAAGTGAGACTTGCTACTCTTTTTCATCGTCTCTTGAAAGACTGACAGAAGG 801 AAAATATGACTTATCAGAAATCTGTTGTCTGCATGCATGGACCTAGTGTTTTCATCAGCTCCCTTCAGCATCTTGGGACC 881 TCTCTAATCCTGCCTAATTTGGGACTTTTTCTGCAGGATTGTAATGTAAAATAGTTCTTTAGCTCTTGGAGATTTTTAAT 961 AATACGAGTTATTAAAAACCACCACCACCAGAAACTTGATTAACTTGATTACCCTGTTGAGTAGAGAGGTCTTAACCACC 1041 GAAAACACTGATATCTTTATGTTGGCATGCTCATGCAAACACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 1121 ACCACAGTGTTTTATAAAGCACAGCCTAATTGATTATATAGGACAAAAATTGTATAGGACCCTGGGTCAGTATAAATGCT 1201 AATGGCTGACAAAGTTCACAAAGAGATGTATTTTGCTTACTCCTCTGTTCAATCCTCTGGTTGCCTGCCAGTGTTTATGT 1281 GTGTATTTGGACAGACATTCATTTATTGTCATTCAGTCAATAGGTAGAGTATATGTGTCTATTTTTTGGCAGGCATATAG 1361 ATGCTTGAGGCTAATGGGAAAAAACCAGCATGAACTCTGACTTTAGTAGTGCTAAGTAATAGATAATTTTAAAAAATGAC 1441 ACCGTTAAATAGAAAATGGCATGCATACTAACAGTTGCAATGGAGAGGCTGTGATGCTACGAGATATAAACGTAGAGATG 1521 CCATCATGTGAAACTGGAAGTGGGGGTGGGTCAGGGAAATTTGTTCTTGGAAAGAAATAATGAACCTCAAGGAAGAGTAG 1601 GCATTGTCCTGGTGTGGTGGGGTGTAAGCGGTGATCCCACAAAGCACTGAAGCTCTTAGATGGGTGGGAGCTGAATAGGT 1681 GCAGATAGCAGGGGTGAAGGAGTGAAAGGATAAAAGATTCAAGGTTGAGATGAGGATGGAGCAAGAAGAAGCCACATTAG 1761 GGCCATTAAGGCTGCTAGAATTTAGAAAGAAAACACACAGCCTCAAAGAAATGTGGGTAAGCCAAAGAAGGATTTTGTTT 1841 TGGGAACCTGAATAAAAGATGTCCATTTGGCTAAAAAGTAAAAGCAGAATCTTTTTAGGGCTTTTAATATACCCACCCTG 1921 GGATATTTGGTATGCTGGCAATGGTAATTCAAATTGGCGTTTAAGAATAATCTTGGCCGGGCGCGATGGCTCATGCCTGA 2001 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACTAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGCGGTGAAAC 2081 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGG 2161 CAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGTTCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGG 2241 CTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGGAATAATCTGTACGGCTTTCAGTATTTATATTTGATTATAAGGGAACACAGCCTGACCA 2321 AATAATTATGTATACACATTCAAGGACAGAATTTATTTTAATTAAAAATAAATTATGAGAGAAGGAAAAAAAAGCACAGT 2401 TTTTACTTTCAGAACACAGTCCTTTTTTGTGGTGATTTTGCTTTCTTTAGAACATTCTTGGAATCTTATTAACATGTCAG 2481 CTAACCAGAGAATTTTGGGAAGGGATAGTGGGGATTAATAACTGGGTTTTTCCAGGCTCCAAGATCTAAGAAGACAGAGA 2561 TCTTGTTAGCTGATTAGTGTAGTAAGATTAAATAAATAATTTAAGGTTTACATTGCATCATGTATTATGATTGTGATTGA 2641 GAATAATAAGAGTTTAAAAAAATGAAAAACAAGATCTCTGTAATTTGAGGATGAAACAATGGTTCTAATATTAATACACA 2721 CAAATATATTTTATAATCTTGTAACAAATCCTTCCAGGGGAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGCCAG 2801 AGTCTGGCTCTGTTGCCCAGACTGGAGTGCGGTGTTTCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGGTTCAAAAGA 2881 TCCTTCTGCCTCCGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCTTGTCCGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTGG 2961 AGACAAGGTTTTACCATTTTGGCCAGACTGGTCTGGAACTCCTGACCTCAGGTCATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAGAGT 3041 GCTAGGATTACAGGCATGAGCCACTGCTCCCAGCCTTCCAGAGGAATTTTAAGCCCATGTCCAAACATTCTGTTTGTATA 3121 AATATATTCTAATTTTTAAATAAATAGTTTCTACTTTTCTGAACTTTATATTTTTTCTTGCTATAATGGATTTTCATAAT 3201 CAGAAAAGATTAAATTAGTAATCATGAATTGCCTTCAATATTTGGCAGTAAGTCAATGAAATAATAAGGCACTTATATAC 3281 CATCTTTGACATCATTAAAAGTATCAAATCCCATTAATCTAAAACTTCTTTAAGCATTTTGAAAGCAGAAAATGTTTACA 3361 TGGTTCTTTCAGTTCCTCAGGCTTTTTGTCTAATGATGCGTGACTTAGGATAAGATTTGAATTAAGTGCCCAGCTTGAAA 3441 CATAATAATTTTTCTGTATAAGCCACAGATCCTCTACCTCCTTTGTGTTAAAGCCTTTATATGAAACAATTAAGTAGAAG 3521 CATTCAATAGTGTGTCATTAACTGTTCATACTAATAAATGGATACAGCACATTTTCATGGCCTGTAATGTAGAACATACT 3601 ATATAAAGTTCTCAGTTTGGGGATGACTAGGTTTCTGGAAGGAATAGAATGCTAAATCAATGGATGGCATTGGGCTGAGA 3681 AACACTGCTGCTACTAATCAGCCTTGAATGTGTAATGTGAACATGCAAAAGAGAACATGCATACACTCAAATTTGTACAA 3761 TGCTATAACTGGAAGTTGAAGGACTTGAATTTTTATATTGTGCTATTGTTATGTTTTCTGTAATTGTTTATATCTAAGGA 3841 ATTTTTGAGGTAATATAAAAGAAAAAGAGAATAATGAACAATGATGTCACTGGAGGGTTTTTACATTAAATTAGATCATT 3921 TTTCTTCTTATTCACAATAATAATCTTAATCTTTAAGAATTAATTATAATTTAATATTATAATTCATAATCTTTAAGAAT 4001 TAATAATTATAATTTAATATTATAATTAATAATCTTTAAGAATTAATAATATAATTTAATATTATAATTAATAATCTTTA 4081 AGAATTAATAATTACAATTAATAATTAATAATAATCTTAATCTTTAAGAATTAATAATAATCCTTAATCGCAATAATAAT 4161 CGCAAGGAGGAGAAGTAAGTCCCTCCTCCTTCTGTATGAACTTTTCTCCCACATGCTGCTGTATGGTTTAGTGAGAGTGA 4241 AGTTCTAAAGAACATCAATATGATTGGTGGGATAATCCAAAGACATTTTTTCAGAATCAAATGGCATGTCGAAGGTTTGT 4321 TTCTTGCATATGTATTTACTGGTCCACAGCACAAAATAAAGTGACCACATATACATAGGAAAGTTGAATTTGTACACATA 4401 CAGCATCTGAAATGTATCTGATGTTCAGCATCAAGATTTCACTGAACATTGTAGAAATGTGTATCTTTTGCATGTATATT 4481 TTACATTGATTTTCTATTTATGTACATCTAGAAAGTTTTAACCCTAATAAATAGTTTTGTAATTTTGAATAATAGTGTCA 4561 GTTTATATGTGAGGGAGTAGAGACAGAGAGGTTAGCACTGGATAATAATTAGTAAGGCCAAAGGAGAAAATTTCATAGAA 4641 AATATTGTTGTTGTCATAATGAGTACAGCATGAAAGGCTTCCTCTACAAGACACTAGTCAAAGAGTTGAGAGCTGCGGTT 4721 TCTAATCTTTGTCCATTACTCCCTTACTCCCTATGAGACTGTGGACCTGTCACTTGGCCTCTCTGGTCTTCAGTTTTCTC 4801 ACCAGTAAAACAAGGAACTTGAACCAAATGACCTCTAGTGTTCCCCTTGGGTTTAAATGTCTATAAATGTTCAATGACTA 4881 GAATGTATTGCGTTTTTCTTTATTCTTTTTGCTTTGAGAAAAGAGAATGTGATTTAAGAGTAATAATTTGAATACCAATT 4961 ATCCACATTAAAATTGTGTCCTCTATGTGTAAGGCATAGCACATTTAGCACACATACATAAGCACACTAAGCACCTTACA 5041 AATATCCTCATTTATTCTTTACATAATCTTTTGAAATTGATTATGTAATACACACTGTTTTTGAACAATTGGTGACTTCC 5121 AGCTGTTTAAAACAAACTACAGTATGGTGCTTGAGTACTGACTTAGGAGGTCAGCATTGGTTTCACTAGGAGCTTCTCAA 5201 AGCACGCTGCCAAACATGCTCCAGTCTCATTGTCAAGGCCTTAGACCAGGCAATCATTACGGCAGTGGTTCTTCAACTTC 5281 AGCAGCAGCAAAACGATCTGGCGGGGGCTTGGTGAAACAGACTGCTGGGCTCGACCACCAGAATTTCTCATTCAGAGGGT 5361 CTGGCCTGATCACTTGCATTTCTAATCACTTCCCAGGTGATGCAGATGTTTCTGGTCCAGGGACCCCAGTTTGAGAACCA 5441 CTGTATTAAAATTTCCTTCATCTCTATAGAAATGGAAAGATTTTTTATAAGTCCTCTAATTTGCTTTAAGATAAATGAGA 5521 TTTCACTTAATTCTGTTGGAGAAATTGTTTTAAAAATTGTGCTAAAGAACCGAAAATCACTTTATGTTAAGGCTCTATTT 5601 ATAGCAAGTGAACTTTTCATGAGTTAATAAAGGCCTACAAAAATAATTTTGACTGTGAAACTAATTAAAATCTCTGTGTT 5681 TCATTTAAAGCATAAACATATTTGAATAAAAATAGGTTAACAATAATTTGGGACATGTATTCAGTATAATTTTAAGATAA 5761 TTTTACAAAATATATGTAACATTGCATTTGTTTCTGTAAAATATCTTCGGAAAAAGCCTTGTTTTCCCTAGTGTGTTATT 5841 TGTTGAATTTCTTGTTAAATGTATTTTTTCCCATTGAAAAAAATGTTTTTAATCAATGTGATCAATACAGCTATCTATAT 5921 GCCCTGCTTTCACTGTAGAATTAGAAAGTGTTAATAAGGTGATCGGATGTTCTTTCTAAGGATCATATTCCACATTTAAA 6001 GAGATGGTGACTGAGAAGAGGTGGCAAGCTGAACCATCTCACTTTGAGATTGACGTATCACGTTTTATCCTCTGCCATCA 6081 TTTCCTTGTTAATTGTTTTTCTTTGGGTGATTGGAAGAATCTATGGCTTCCTTTTCTCTGTTCTTAAAGATATCAAGACT 6161 CTGCCCTTTTGTGACTGGAAGTAGATTTTAAATGTCCCTAATGTTTATATGCTCACTTAAACTCAATACATGGAATTTAC 6241 TGGGGCATTTAACTTGTTCATGAAAATAGAGTGAGTCATTGAAAAATCAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293/HeLa | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
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HITS-CLIP data was present in GSM1067870. RNA binding protein: AGO2. Condition:Ago2 IP-seq (mitotic cells)
... - Kishore S; Gruber AR; Jedlinski DJ; Syed et al., 2013, Genome biology. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Kishore S; Gruber AR; Jedlinski DJ; Syed et al. - Genome biology, 2013
BACKGROUND: In recent years, a variety of small RNAs derived from other RNAs with well-known functions such as tRNAs and snoRNAs, have been identified. The functional relevance of these RNAs is largely unknown. To gain insight into the complexity of snoRNA processing and the functional relevance of snoRNA-derived small RNAs, we sequence long and short RNAs, small RNAs that co-precipitate with the Argonaute 2 protein and RNA fragments obtained in photoreactive nucleotide-enhanced crosslinking and immunoprecipitation (PAR-CLIP) of core snoRNA-associated proteins. RESULTS: Analysis of these data sets reveals that many loci in the human genome reproducibly give rise to C/D box-like snoRNAs, whose expression and evolutionary conservation are typically less pronounced relative to the snoRNAs that are currently cataloged. We further find that virtually all C/D box snoRNAs are specifically processed inside the regions of terminal complementarity, retaining in the mature form only 4-5 nucleotides upstream of the C box and 2-5 nucleotides downstream of the D box. Sequencing of the total and Argonaute 2-associated populations of small RNAs reveals that despite their cellular abundance, C/D box-derived small RNAs are not efficiently incorporated into the Ago2 protein. CONCLUSIONS: We conclude that the human genome encodes a large number of snoRNAs that are processed along the canonical pathway and expressed at relatively low levels. Generation of snoRNA-derived processing products with alternative, particularly miRNA-like, functions appears to be uncommon.
LinkOut: [PMID: 23706177]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM1067870 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293/HeLa / Ago2 IP-seq (mitotic cells) |
Location of target site | ENST00000400331.5 | 3UTR | GACUCACUGCAACCUCCACCUC |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 23706177 / GSE43666 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||
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231 hsa-miR-3689d Target Genes:
Functional analysis:
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT059166 | TXNIP | thioredoxin interacting protein | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT080699 | KIAA1468 | KIAA1468 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT218770 | CDKN1A | cyclin dependent kinase inhibitor 1A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT278059 | KHNYN | KH and NYN domain containing | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT345933 | EIF4A1 | eukaryotic translation initiation factor 4A1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT366238 | VMA21 | VMA21, vacuolar ATPase assembly factor | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT449689 | CNNM2 | cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451149 | C19orf53 | chromosome 19 open reading frame 53 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451266 | NDUFA11 | NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT451375 | C19orf43 | telomerase RNA component interacting RNase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451570 | CIAPIN1 | cytokine induced apoptosis inhibitor 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451585 | HIRIP3 | HIRA interacting protein 3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451614 | MEIS3P1 | Meis homeobox 3 pseudogene 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT451763 | ZNF611 | zinc finger protein 611 | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT452383 | LY6E | lymphocyte antigen 6 family member E | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT452573 | ZFP69B | ZFP69 zinc finger protein B | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT452735 | PTGES3L | prostaglandin E synthase 3 like | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT452867 | LAX1 | lymphocyte transmembrane adaptor 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT452975 | CABP4 | calcium binding protein 4 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453215 | CERS1 | ceramide synthase 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453259 | PARP11 | poly(ADP-ribose) polymerase family member 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT453449 | GLG1 | golgi glycoprotein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453479 | PITPNM3 | PITPNM family member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT453663 | CD207 | CD207 molecule | ![]() |
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2 | 6 | ||||||
MIRT453724 | RAP1GDS1 | Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT453760 | RANGAP1 | Ran GTPase activating protein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT454181 | AP1S3 | adaptor related protein complex 1 sigma 3 subunit | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT454330 | PPARA | peroxisome proliferator activated receptor alpha | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT454338 | CDKL1 | cyclin dependent kinase like 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT454427 | GTF2F1 | general transcription factor IIF subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT454665 | FBXL18 | F-box and leucine rich repeat protein 18 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT454825 | POLR2J3 | RNA polymerase II subunit J3 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT455130 | TBC1D25 | TBC1 domain family member 25 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT455166 | SUV39H1 | suppressor of variegation 3-9 homolog 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT455416 | RXRB | retinoid X receptor beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT455668 | GLO1 | glyoxalase I | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT455999 | CYP2C19 | cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT456446 | TMEM81 | transmembrane protein 81 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT456642 | NOS1AP | nitric oxide synthase 1 adaptor protein | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT456728 | TMEM239 | transmembrane protein 239 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457131 | ASPH | aspartate beta-hydroxylase | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT457157 | MXRA7 | matrix remodeling associated 7 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT457358 | POFUT2 | protein O-fucosyltransferase 2 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT457458 | UNC119B | unc-119 lipid binding chaperone B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457619 | UPK3BL | uroplakin 3B like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457692 | ZNF587 | zinc finger protein 587 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457727 | SMOX | spermine oxidase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457788 | VWA1 | von Willebrand factor A domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT457875 | THEM6 | thioesterase superfamily member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT457909 | ZNF212 | zinc finger protein 212 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT458395 | ABCF1 | ATP binding cassette subfamily F member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT458496 | MARVELD2 | MARVEL domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT458544 | CYP2B6 | cytochrome P450 family 2 subfamily B member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT458577 | TCOF1 | treacle ribosome biogenesis factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT458732 | CES2 | carboxylesterase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT458814 | ZNF843 | zinc finger protein 843 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT458931 | SAMD4B | sterile alpha motif domain containing 4B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT459341 | ZNF17 | zinc finger protein 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT459365 | MPLKIP | M-phase specific PLK1 interacting protein | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT459572 | NLGN2 | neuroligin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460015 | DTX3L | deltex E3 ubiquitin ligase 3L | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT460144 | ASB16 | ankyrin repeat and SOCS box containing 16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460653 | IGFBP4 | insulin like growth factor binding protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT460798 | VPS33A | VPS33A, CORVET/HOPS core subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT461058 | KCNK6 | potassium two pore domain channel subfamily K member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT461458 | SLC19A3 | solute carrier family 19 member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT461572 | SCO1 | SCO1, cytochrome c oxidase assembly protein | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT461927 | TNFSF14 | TNF superfamily member 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT461953 | C3 | complement C3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT462278 | KRR1 | KRR1, small subunit processome component homolog | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT462744 | EFNB1 | ephrin B1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT463136 | ZNF451 | zinc finger protein 451 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT463566 | ZBTB39 | zinc finger and BTB domain containing 39 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT463866 | WNT7B | Wnt family member 7B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT464326 | UST | uronyl 2-sulfotransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT464796 | UBE2F | ubiquitin conjugating enzyme E2 F (putative) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT465034 | TTC39C | tetratricopeptide repeat domain 39C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT466207 | TMED10 | transmembrane p24 trafficking protein 10 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT467007 | SSBP2 | single stranded DNA binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT467029 | SRSF1 | serine and arginine rich splicing factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT468001 | SKI | SKI proto-oncogene | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT468031 | SIKE1 | suppressor of IKBKE 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT468575 | SERBP1 | SERPINE1 mRNA binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT468834 | RRM2 | ribonucleotide reductase regulatory subunit M2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT468970 | RPRD2 | regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT469450 | REL | REL proto-oncogene, NF-kB subunit | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT470888 | PLXND1 | plexin D1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT470953 | PKM | pyruvate kinase, muscle | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT471828 | NUFIP2 | NUFIP2, FMR1 interacting protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472590 | NACC1 | nucleus accumbens associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472805 | MTMR12 | myotubularin related protein 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT472818 | MTMR10 | myotubularin related protein 10 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT472914 | MSN | moesin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT474558 | KLHDC3 | kelch domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT474716 | KIF13A | kinesin family member 13A | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT475279 | TOR1AIP2 | torsin 1A interacting protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475300 | IFNLR1 | interferon lambda receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475759 | HDLBP | high density lipoprotein binding protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475786 | HDGF | heparin binding growth factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475933 | GXYLT2 | glucoside xylosyltransferase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT476212 | GNS | glucosamine (N-acetyl)-6-sulfatase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT476238 | GNPNAT1 | glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT476799 | FNDC3B | fibronectin type III domain containing 3B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT477988 | DNAL1 | dynein axonemal light chain 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT478317 | DDN | dendrin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT479257 | CHSY1 | chondroitin sulfate synthase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT479344 | CEP97 | centrosomal protein 97 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT479522 | CDCA4 | cell division cycle associated 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT479906 | CCDC117 | coiled-coil domain containing 117 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT481147 | AVL9 | AVL9 cell migration associated | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT481735 | APH1A | aph-1 homolog A, gamma-secretase subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT482089 | ALG8 | ALG8, alpha-1,3-glucosyltransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT482389 | AEN | apoptosis enhancing nuclease | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT483093 | TFPI | tissue factor pathway inhibitor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT484246 | ANK1 | ankyrin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT484342 | EPN1 | epsin 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT489141 | C5orf38 | chromosome 5 open reading frame 38 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT489163 | MRPL12 | mitochondrial ribosomal protein L12 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT489547 | SOX11 | SRY-box 11 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT489780 | GRINA | glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT489799 | KRT80 | keratin 80 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT490535 | KIAA1715 | lunapark, ER junction formation factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT492198 | SOCS1 | suppressor of cytokine signaling 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT492283 | SHISA6 | shisa family member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT501059 | SMARCAD1 | SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT501094 | SLC5A6 | solute carrier family 5 member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT503870 | CBS | cystathionine-beta-synthase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT507981 | BCL2L13 | BCL2 like 13 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT508125 | AMD1 | adenosylmethionine decarboxylase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT508205 | SLC35E1 | solute carrier family 35 member E1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT508385 | SPTBN2 | spectrin beta, non-erythrocytic 2 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT510308 | PDRG1 | p53 and DNA damage regulated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT510462 | ZDHHC18 | zinc finger DHHC-type containing 18 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT512227 | ATXN3 | ataxin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 8 | ||||||
MIRT512665 | STEAP3 | STEAP3 metalloreductase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT514184 | PGPEP1 | pyroglutamyl-peptidase I | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT515053 | EBNA1BP2 | EBNA1 binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT515138 | ZNF799 | zinc finger protein 799 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT515452 | ZNF747 | zinc finger protein 747 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT515791 | COL4A3BP | collagen type IV alpha 3 binding protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT515905 | AGTPBP1 | ATP/GTP binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT516129 | MRPS16 | mitochondrial ribosomal protein S16 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT516679 | ZNF860 | zinc finger protein 860 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT516750 | ZNF100 | zinc finger protein 100 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT516971 | OR7D2 | olfactory receptor family 7 subfamily D member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517491 | NPAP1 | nuclear pore associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517774 | PROM2 | prominin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT517938 | ZNF431 | zinc finger protein 431 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT518386 | ZNF250 | zinc finger protein 250 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT520621 | TMEM41B | transmembrane protein 41B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT521028 | SLC30A5 | solute carrier family 30 member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT521454 | RAD51 | RAD51 recombinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT521564 | PTPLB | 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2 | ![]() |
1 | 1 | |||||||
MIRT521581 | PTBP2 | polypyrimidine tract binding protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT522263 | NKRF | NFKB repressing factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT522410 | MXI1 | MAX interactor 1, dimerization protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT522543 | MED28 | mediator complex subunit 28 | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT522915 | KCNE3 | potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT523029 | IGF1 | insulin like growth factor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT523854 | ESPL1 | extra spindle pole bodies like 1, separase | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT524184 | DFFA | DNA fragmentation factor subunit alpha | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT524520 | CDK19 | cyclin dependent kinase 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT524674 | C12orf5 | TP53 induced glycolysis regulatory phosphatase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530257 | ZNF620 | zinc finger protein 620 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT540691 | BMP3 | bone morphogenetic protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT540976 | C17orf85 | nuclear cap binding subunit 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545505 | NAP1L1 | nucleosome assembly protein 1 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT545631 | GGCX | gamma-glutamyl carboxylase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT547358 | NAA30 | N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT550701 | MPL | MPL proto-oncogene, thrombopoietin receptor | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT550717 | PMPCA | peptidase, mitochondrial processing alpha subunit | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT551203 | NCR3LG1 | natural killer cell cytotoxicity receptor 3 ligand 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT553999 | SRGAP1 | SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT561081 | LLPH | LLP homolog, long-term synaptic facilitation | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT563523 | TAF8 | TATA-box binding protein associated factor 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564463 | SLC35E2 | solute carrier family 35 member E2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT565233 | TRAF6 | TNF receptor associated factor 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT566618 | NKAP | NFKB activating protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT569527 | AP5Z1 | adaptor related protein complex 5 zeta 1 subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT569639 | QPCT | glutaminyl-peptide cyclotransferase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570253 | SSPN | sarcospan | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570570 | OTUD7B | OTU deubiquitinase 7B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570621 | MTF2 | metal response element binding transcription factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT571098 | ISLR2 | immunoglobulin superfamily containing leucine rich repeat 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575196 | Entpd4 | ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575554 | Cd99 | CD99 antigen | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT575634 | Gnl3l | guanine nucleotide binding protein-like 3 (nucleolar)-like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT608267 | NOP14 | NOP14 nucleolar protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT609314 | FXYD6 | FXYD domain containing ion transport regulator 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT627670 | RPL28 | ribosomal protein L28 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT631185 | TSPAN14 | tetraspanin 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT631964 | YIPF5 | Yip1 domain family member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT632885 | GINM1 | glycoprotein integral membrane 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT642618 | CDKN3 | cyclin dependent kinase inhibitor 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645609 | TSPAN6 | tetraspanin 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662227 | PGBD4 | piggyBac transposable element derived 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662329 | MYLK3 | myosin light chain kinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662725 | LRRC3C | leucine rich repeat containing 3C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT665520 | USP14 | ubiquitin specific peptidase 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT666634 | RBMS2 | RNA binding motif single stranded interacting protein 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT668969 | CNBP | CCHC-type zinc finger nucleic acid binding protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT670925 | DESI1 | desumoylating isopeptidase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT673939 | ZNF500 | zinc finger protein 500 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT674675 | PLCE1 | phospholipase C epsilon 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT675230 | MAK | male germ cell associated kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT680864 | MACC1 | MACC1, MET transcriptional regulator | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT681047 | ZDBF2 | zinc finger DBF-type containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT681105 | CEP57L1 | centrosomal protein 57 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT683553 | HAVCR1 | hepatitis A virus cellular receptor 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT684508 | C1orf174 | chromosome 1 open reading frame 174 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT684812 | BRIX1 | BRX1, biogenesis of ribosomes | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT685981 | CCDC77 | coiled-coil domain containing 77 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT686709 | TBC1D19 | TBC1 domain family member 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT686867 | SLC25A32 | solute carrier family 25 member 32 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT688908 | C11orf84 | chromosome 11 open reading frame 84 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT691208 | KLHL30 | kelch like family member 30 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT692298 | CNNM3 | cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT694380 | MTA1 | metastasis associated 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT696497 | COX6B1 | cytochrome c oxidase subunit 6B1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT700686 | POLR3D | RNA polymerase III subunit D | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT701088 | PAPOLG | poly(A) polymerase gamma | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT703373 | GAPVD1 | GTPase activating protein and VPS9 domains 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT706189 | SAR1B | secretion associated Ras related GTPase 1B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT706648 | SMIM19 | small integral membrane protein 19 | ![]() |