pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-4793 |
Genomic Coordinates | chr3: 48644194 - 48644280 |
Description | Homo sapiens miR-4793 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-4793-3p | |||||||||||||||
Sequence | 58| UCUGCACUGUGAGUUGGCUGGCU |80 | |||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||
Experiments | Illumina | DRVs in miRNA |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | MDM2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ACTFS, HDMX, hdm2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | MDM2 proto-oncogene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001145337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001145339 , NM_001145340 , NM_002392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on MDM2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of MDM2 (miRNA target sites are highlighted) |
>MDM2|NM_001145337|3'UTR 1 TTGACCTGTCTATAAGAGAATTATATATTTCTAACTATATAACCCTAGGAATTTAGACAACCTGAAATTTATTCACATAT 81 ATCAAAGTGAGAAAATGCCTCAATTCACATAGATTTCTTCTCTTTAGTATAATTGACCTACTTTGGTAGTGGAATAGTGA 161 ATACTTACTATAATTTGACTTGAATATGTAGCTCATCCTTTACACCAACTCCTAATTTTAAATAATTTCTACTCTGTCTT 241 AAATGAGAAGTACTTGGTTTTTTTTTTTCTTAAATATGTATATGACATTTAAATGTAACTTATTATTTTTTTTGAGACCG 321 AGTCTTGCTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTTGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCGCACCA 401 TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAATTAGCTTGGCCTACAGTCATCTGCCACCACACCTGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTA 481 GAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTG 561 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGTCCGGCCTAAATGTCACTTAGTACCTTTGATATAAAGAGAAAATGTGTGAAAG 641 ATTTAGTTTTTTGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGAGATGAGTCTCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCA 721 GTGTCATGATCTAGCAGTCTCCGCTTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGGCTCAGCCTCTGGAGCAGCTGGGATTACAGG 801 CATGCACCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCACGAAC 881 TCCTGACCTCAAGTGAGGTCACCCGCCTCGGCCTCCCGAAGTGCTGGGATTGCAGATGTGAGCCACCATGTCCAGCCAAG 961 AATTAGTATTTAAATTTTAGATACTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCCATCACCCAT 1041 GCTAGAGTGCAGTGGAGTGATCTCGGCTCACTGCAACTTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCTATTCTCCTGCCTCAGCCTTCC 1121 AAGTAACTGGGATTACAGGCATGTACCACCATACCAGCTGATTTTTTTGTATTTTTAGTAAAGACAGGGTTTCACCATGT 1201 TAGCCAGGCTGATCTTGAACTCCTAAACTCAAGTGATCTACTCACCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGATGTGA 1281 GGCACCTGGCCTCAGATTTTTGATACTCTTAAACCTTCTGATCCTTAGTTTCTCTCTCCAAAATACTCTTTCTAGGTTAA 1361 AAAAAAAAAGGCTCTTATATTTGGTGCTATGTAAATGAAAATGTTTTTTAGGTTTTCTTGATTTAACAATAGAGACAGGG 1441 TCTCCCTGTGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGAGATCCTCCTGTCTTGGCCTCGCAAAGTGCTAAGTA 1521 GGATTACAGGCGTTAGCCACCACACCCGGCTGTAAAAATGTACTTATTCTCCAGCCTCTTTTGTATAAACCATAGTAAGG 1601 GATGGGAGTAATGATGTTATCTGTGAAAATAGCCACCATTTACCCGTAAGACAAAACTTGTTAAAGCCTCCTGAGTCTAA 1681 CCTAGATTACATCAGGCCCTTTTTCACACACAAAAAAATCCTTTATGGGATTTAATGGAATCTGTTGTTTCCCCCTAAGT 1761 TGAAAAACAACTCTAAGACACTTTAAAGTACCTTCTTGGCCTGGGTTACATGGTTCCCAGCCTAGGTTTCAGACTTTTGC 1841 TTAAGGCCAGTTTTAGAAACCCGTGAATTCAGAAAAGTTAATTCAGAAATTTGATAAACAGAATTGTTATTTAAAAACTA 1921 ACTGGAAAGATTGTTAAGTTCTTTCTGAATTATTCAGAAATTATGCATCATTTTCCTTCAAGAATGACAGGGTCAGCATG 2001 TGGAATTCCAAGATACCTCTTGACTTCCTCTCAAGCTCCGTGTTTGGTCAGTGGAGGCCCATCCGAGCTCAGCACTGAGA 2081 AGTGTTAGTTTCTTTGGGACCCATCTACCCTGACCACATCATGATGTTCATCTGCAGCTGTTGCAAGGTGTTCAGATTGT 2161 ATAAACATAAATGTCACAAAAACTTTAAAAGAAGTGCAATTCTCAAAAGGTTAGGTGGACTAAAGCATTCTGTAAAGCAA 2241 CTGCTAATAATGAGCTTACAGTGGATTTGAATTTGAAAAATATAGTAACAAGCCTGTCAAATATCTGCAAGAACTATGGA 2321 ATAAAACTACTGATGCAGTGAAGACAGTTGAAAAGATCAAACAAATGCCAAGCTATATTTATAATGAACAAATTCAAGAA 2401 AAAGGACTACGGAAAGTTCAGGACATCAAAGAAGTCAGGCAAAACTCATCTTGACCCCTGTTGCAGGCAAAGGAACGCAG 2481 CTGGAAGAAAAGATGATATAACAGTTAACAGGATGCAGACATGGCAGAGGTTTCCTAAAAATCTCATTATCTATAACCAT 2561 TTCTATATTTACATTTGAAAATCTCCTTTGGAGACTTAGAACCTCTAAATTATTGACTTATTTTTTATATAAGGTCACTC 2641 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TATATTTGGGTAACAAAAGGCACAAGTCTGAATGTGTTTCTTTTTCTGGAATGGCCATGCCTGCCCACTTTAGAAATACA 4481 AATATCACTGGGCAGCTTGAAGCAGTTGGGAGCCTCCAATGAGAGCAACTTGAGAGAATGATGTTGCAAGTTAGTAGGAG 4561 TAAGAAATGCTGTGTTCTCCCTGTCTTCTCTTAGGTCACATGGCAGCCTGGCCTAAGTGATCGTGAATGGTCTATAAGGG 4641 AGGTAGCTGGGACAGGGAGGGGAGTTTGGGCTAGCCACCGTACCACTTGTCAGCGTGAAAAGTAAGATTGTAATTGCCTG 4721 TTTAGTTTTCTGCCTCATCTTTGAAAGTTCCACCAAGCTGGGAACCTCTTGATTGTGAGGCACAAATGTAAGTACATCAG 4801 AAAAAAACAAAAAAACTGGCTTTAAAGCAGGAGCTTGTGGGCCCCTAAGCCAGACGGGGACTAGCTTTTGGCATTATATA 4881 ATTAAGATTTTTTAAATCCTTAATAAGGGTTTTATTTTATTTTTATTTATTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTGGCTC 4961 AGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGGCTGTGTTCAAGTGGTTCTGCTTCAGCCT 5041 CCCAAGTAGCTGGGGTTAGAGCACCCTGTCACCACGCCCCGCTAATTTTTGTATTTCTAGCAGAGATGAAGTTTCACTAT 5121 GTTGGCCAGGCTGGGCTCAAACTCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCCCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCGT 5201 GAGCCGCCACGCCCAGCCTAATAAGGGTTTTAAAGATAATTAGTGTGTAGGTCTGTAGGCTTATGATGGTAACCACAAGT 5281 TGTTAATGGCATTGTGAAAAGTTTTTAGTTGCGCTTTATGGGTGGATGCTGAATTACATTTTGATTTGATACTTATAAAA 5361 AGAAAAAGTATTTCTTCAGCTTAAAAAATTGTTTAAAAGTTTGTGATCATATTGTCTACCATGTAGCCAGCTTTCAATTA 5441 TATGTAAGAGGGACTTTTTGACATTTACAAATAATACTTTGAGGTAGATATCTGAAAGCACCAGCACTTGGAAGGTGTTC 5521 AGAAGTAACAAATTATAAAATGAGCTAACAAACGAAAGGCAAAATAAAACCGTAAAGCAAGCAGATGGGAGGCGTGTTCA 5601 GTAACTTATTCATAATGCATCTGAAATGATTGCTGTACTCAAATATTTAACGTTAGAGTAATAGTATTTTGAATGAAAAC 5681 CATAGTTGATTGTCT Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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