pre-miRNA Information | |
---|---|
pre-miRNA | hsa-mir-4419b |
Genomic Coordinates | chr12: 128244506 - 128244573 |
Description | Homo sapiens miR-4419b stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | |
---|---|
Mature miRNA | hsa-miR-4419b |
Sequence | 42| GAGGCUGAAGGAAGAUGG |59 |
Evidence | Experimental |
Experiments | Illumina |
Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
---|---|
Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
|
Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Gene Symbol | ZNF99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C19orf9, F8281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | zinc finger protein 99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001080409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ZNF99 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ZNF99 (miRNA target sites are highlighted) |
>ZNF99|NM_001080409|3'UTR 1 TTCATACTGGAAAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACAATTCCTCAACCCTTAGGAAACATAAG 81 ATAATTTATACTGGGAAGAAACCATACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAAGCAGTCCTCACACCTTACTAGACA 161 TAAAGCAGTTCATACTGGGGAGAAGCCCTACAAATGTGGAGAATGTGGAAAAGCTTTTAACAATTCCTCAACCCTTAAGA 241 AACATAAGCTAATTCATACTAGGGAGAAATCGTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAGCAATTTCTCAGCCCTT 321 AGGAAACATAAGATAATTCATACTGGGGAGAAACCATACAAATGTGAAGAATGTGGTAAAGCTTTTAAGTGGTCTCAAAA 401 CTTATGGAACATAAGGTAATTCATACTGTAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAAGCATTTCTC 481 AGCCCTTAGAAAACATGAGATAATTATACTGGAAAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACAATTC 561 CTCAACCCTTATGAAACATAAGATAATTCATACTGGGGAGAAACCGTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGGTTTTAACA 641 ATTTCTCGACCCTTATGAAACATAAGATAATTCATACTGGGGAGAAACCGTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTTT 721 AAGCAATCCTCACACCTTACTAAACATAAATCAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAACGTGGCAAAGC 801 TTTTAGCCATTTCTCACGCCTTACTAAACATAGGATAATTCATACTGGAAAGAAACCCTACAAATGTGAAGAGTGTGGTA 881 AAGCATTTAGTCCTCAAACCTTACTAAACATAAGATAATTCATTCTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTGGCA 961 AAGCCTTTAACCAGTCCTCACACCTTACTCAACATAAAACAATTCATACTGGAGGGAAAACCTACAAATGTGAAGAATGT 1041 GGCAAAGCTTTTAACCATCTTTCAGCCCTTACTAAACATAAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCCTAAAAATGTGAAGA 1121 ATGTGTCAAAGCTTTCAACCATTTTACAAACCTTAATACACATAAGATAATTTATACTAGAGACAGACCCTCCATATGTG 1201 AAGAATGTGGCAAAGCTTTTAACCAGTCCTCAAGCCTTAATAGGCAGAAAACAATTCATGCTGGAGAGAAACCCCACAAA 1281 TGTAAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCACACCTTAAATACACATAAAATAATTGATACTGGAGGAAAACCCT 1361 ACAAATATAATAAAGGTGACAAAGCTTTTAACCATTGCTCAGCTGTTACTCAAAATGAGAGAATTCCTAAAGAAGATAAA 1441 CTCCACAAATGTGAATAATATGGCAAAGCTTTTAACTGGTCCTCAAATCTTACTGAATGTAAGATAATTCATACTGAAGA 1521 TAAACCCTTCAAATGTGAGGAATGTGGCAAAGCTTTTAATCAGTCCTCAAATCTTACTGAACATAAGATAATTCATAGTA 1601 GAGACAAACACTGCAAATATGAAGAATGGGCAAAGCTTTTAACCAGTCCTCAAACTTTACTCAACATAAAATAATTTATC 1681 TTGGAGAGGAACACTACAAATTTAAAGAATTTGGCAAAACTTTTAACTGCTTCTCAAAACTTACTGAACATAAGATAATT 1761 CATACTGGAGAGATACTTTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCTTCTAACGGGTTCTCAGATCTTACTGAATATAAGAT 1841 AAATTAGAGAGAAACCCGCCTCATGTGAAGAGTGTGGCAAAACTTTTAACTGGTCCTCAAACCTTACTGAACATAAGATA 1921 ATTCATACTGAAGAGAAACCCTACAAATATGAAAACTGTGGCAAAGCTTTTAACTGGTTTTCAGACCTTACTCAACAGAA 2001 AATAGTTGATACTGAAGACAAACTCTAGAAATGTGAAGAATGTGGCAATGCTTTTAATCAGTTAAACTTTATTAGACATA 2081 AGAAAATTCGTACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTGAAGAAAGTGGCAATGCTTTTAGCCAGTCCTCAACTCTTGCTAAA 2161 CAACATAATTCAATGGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAATAATGCCATAAGCATTCTTCAATTTTTTTTTTTTTTTTTTT 2241 GAAACAGAGTTTCGCCCTAGTTGCCCAGGCTCTGGAGTGCAGTGGCACAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGG 2321 GTTTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCAGGGACTATAGGCATGTGCCACCACGCCCACCTAATTTTGT 2401 ATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAAGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCTGGTGATCTGCCCGCCTCGG 2481 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGAGCCACCGTGCCCAGCCTAATTCTTCAATTCTTAATAAACAATTTATACTG 2561 AAGAGAAACCCTACAAACGTGAAGAATGTTGCAAAGCTTTTAACGTCCTCAAACCTTACTGAACATAAGATAATTCATAA 2641 TGGAAACTAGCCCTACAAATATGAAGAATGTGGCAAACACTGTAACCATTTCTCACATCTTACCACACATTAAGATAATT 2721 CATACTGAAGAGAAACCCGACAAATGTGAAGAATGTAACAAAGTCTTTAACTGGTCTTCAACTCATACTAAATATAAGAG 2801 AATTCATACAGAAGATAAATTTTATAAATATGAAGAATGTGACAAAAGCTTTAAAAACATTTCAACCCTTATTACACATA 2881 AGATAATTTATGTTGTAGAGAAATTCTACAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATGGAGTCTC 2961 ACTCTGTCGCCCAAATTGGAGTGCAATGGTGCAATCTCAGTTCATTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCT 3041 GGCCTCAACCTCCCAAGCAGCTGGGATTGCAGGCGCCTGCCACCACGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGG 3121 GGTTTCACCATTTTGACCAGGCTGGTTTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCCCCA 3201 AAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGCCATTGAGCCCGGTCGAATGTGGCAAAGTTTTTAATAAGTTATCAAATCATACTGG 3281 AGAGAAGCTCTACAAACCTAAAAGACATGACAGTGCTCTTGAGAACACCTTAAACTTTTCTAAACATAAAAGAAATCATA 3361 GTGTCAAGAAGCCCTAGATGTGAGTCATGTCACAAAGCCTTTAAATGGTTGTCACACTTGAGTATAAGCTAATTTATCCT 3441 AGAGAAAACTATGAAGAATGTGGCAAAATATTTAACCAATACTCACACCTTATCGCATAGGAAAGCATTTATACTTGAAA 3521 AAAAATGTACACCTATGAAGAATGTGGAAAAGCCATTAATATCTGCTCACATCTTAACATCACAGAGTTTATACTTAAAA 3601 CAAATATTAAAAATGCAATTACTGTGAGAATATCTTTTAGAAAATATAAACCTTAGAATGGTGAAGAGTATTTCTTTTGA 3681 TGACAAACATTACAAATATAAAGACGGTTGTAGTACTATATTTGTATCACAGATCTTATTGTGCATATTTTGTGCTAGAG 3761 AAAAACCCTAAAGTTGCTCAAACTTTGTTCAATATCAGGGAATGTATAATAGAGAAAAAAACCTGCAAATGTAATAAATT 3841 TGGAAAAAAGTTTATAAACTACAGCTTAGAAAACAGAGTAAGTTTTTTTTGTAGATGCAGTAAATATGAAAAATATTCAA 3921 TCCAAAATTAACTCTGTAAATGTCAGAGAATTCACAGTAGAAATGATAAGGCACTGGCACTTCAGACTACACTAAATCAG 4001 AGTGTTGAGTAAAAAAAATAATTTCAATCTAAAATTTAGATAAGTTATTTGCATATAACTTAAAAAAGAGGAGGTGATTT 4081 TTTGGAGAATTATAATTACATTTGAAGTATACTTTTTGTATACTTCAAATATCAAAAAAATTAACATCACAATATTGAAA 4161 AAAATTACAGACTCTGAAAAGCAAATAAGGATGTAATTCAACTCTCAAGTTACTTCATGCTCTTCATTCCTACTTTATTT 4241 ACATGTGAAAGCATGCGATCAATTGTTGCTGCATCAGAGATATGAAAGATTCTTTTTTATTAGATGGGCATTATTTATGA 4321 CCTTTTTCATAAAAGAGAAAGGATATTAAAATATAAAATGCATGATAAAAATCTAAATGGAGAGGCTTTTTGTGGTTAAC 4401 TTAAAATATTGAGTGATGTATGAGGTAGGTGTTCTGAGGAATATATTTTTGTGCATTATAGTGAGAAAAACATTTTAAAA 4481 TTTTAGTTAAAATTAAAATTAAATTAGTGATGTATTATATTAGTTGTGCTTTTATGTAATGTAGTACATTCATAAATTTT 4561 TAGATTATATGTAAACTTAATTTTTTAAACATTTTTTGACATGTTAAGTCTGTTGTACATTCAATGAAGTGTTATTATGC 4641 CACTCGCTTTAACCTATCCCACCTTACTCAAGGGTGTAGGTAAGAGATGGCAACAGTTTACTATTTGGTAAGAGTGGAAT 4721 AACATCTCTAGTAATCTCTTTTTTTCAGTGGCTTTAACCTGCAAATAAATTAAAGAATATTGTTCTCGTAGGTTACATTT 4801 TTATACTTTTAATCTTATTTAAACTTCTTTTTTTTTTTGCCTTGACAAATTTAAACTTATTTTTCTTAACTTTTATGGGT 4881 ACATAGTGTGTAGATATATTTCTGCCATATATAGCATATTTTGATACCAGCATAAAATATGTAATAATCACGTCAGGGTA 4961 AATGAGGGATTCTTCACCTTCAACATTTATTCCTTGAATTACAAGCAATCCAAATCTACACTTTTAGTCACTTTGAAATA 5041 TAAAACTAAATTGTTATCTTTATTATAGCGTCATTTTTGTGGTCATAATAAAAATCATATAGGAATGTAAATAAAATCTA 5121 TACATATCTGG Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DRVs in gene 3'UTRs |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SNPs in gene 3'UTRs |
|
Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
|
||||||
Conditions | Hela | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
HITS-CLIP data was present in GSM1048188. RNA binding protein: AGO2. Condition:Hela_AGO2_CLIP_ptb_knockdown
... - Xue Y; Ouyang K; Huang J; Zhou Y; Ouyang H; et al., 2013, Cell. |
||||||
miRNA-target interactions (Provided by authors) |
|
||||||
Article |
- Xue Y; Ouyang K; Huang J; Zhou Y; Ouyang H; et al. - Cell, 2013
The induction of pluripotency or trans-differentiation of one cell type to another can be accomplished with cell-lineage-specific transcription factors. Here, we report that repression of a single RNA binding polypyrimidine-tract-binding (PTB) protein, which occurs during normal brain development via the action of miR-124, is sufficient to induce trans-differentiation of fibroblasts into functional neurons. Besides its traditional role in regulated splicing, we show that PTB has a previously undocumented function in the regulation of microRNA functions, suppressing or enhancing microRNA targeting by competitive binding on target mRNA or altering local RNA secondary structure. A key event during neuronal induction is the relief of PTB-mediated blockage of microRNA action on multiple components of the REST complex, thereby derepressing a large array of neuronal genes, including miR-124 and multiple neuronal-specific transcription factors, in nonneuronal cells. This converts a negative feedback loop to a positive one to elicit cellular reprogramming to the neuronal lineage.
LinkOut: [PMID: 23313552 |