pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-6737 |
Genomic Coordinates | chr1: 153962351 - 153962420 |
Description | Homo sapiens miR-6737 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-6737-5p | |||||||||||||||||||||
Sequence | 6| UUGGGGUGGUCGGCCCUGGAG |26 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Meta-analysis | |||||||||||||||||||||
SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | APOL6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | APOL-VI, APOLVI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | apolipoprotein L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_030641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on APOL6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of APOL6 (miRNA target sites are highlighted) |
>APOL6|NM_030641|3'UTR 1 ATGTTCCTCAGGACATGGCATACAATGGCCTTGGAGGTCCAAATAATATCAAGTACATCTTGGAGATGAGGGTGCCTGTC 81 CTGGACAGACCTCGGCATGCCTTCTGTTTCTCCTTCAATGCTCCTTAAGGCCTATGTGCTGGGAAAAGGGTCTTCCCTGT 161 TTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGAGACAGGGTCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTAATCTCGG 241 CTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGAGTGCAAGCAAGTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACGCAC 321 CACCACGCCCAGCTAATTTTGGTATTTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCACCATTTTGGCCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGA 401 CCTCAAGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAATGCTGGGATTACAAGCGTGAGCTACCCTGCCCAGCCGGGTCTTCCC 481 AGTTTTAACAAAGAGGTCACAGAGCCACAGGCGGAGTTAGGAACTAAATTGTCTCCTCCTCCCAATTCATATGTTGAAGT 561 CCTAAACCAAAATGTGGCTGTATTTAGAGATGGACCCTTTGGGAGGTAATTAGGGTTGACTGAGGCCATAGGGTGAGGTC 641 CTAACCCGATGGAATTGACTTCTTTATAAGAGGAGGAGGAAATACAAGAGGGCCTCCCCACCCCTGCTGCACACCTACAC 721 TGAAGGAAGGCTATTTGCAGATGCAGCAAGAAGGCAGCCATCTGCAAGGCAGAAGAAGAGAGCCCTCACCAGGAACTGAA 801 TAAGTCAGTCAGTCTGGGACTTCCAGCCTCTAGAACTGTGAAACAATAAATTTCTGTGGTGTAAGCAACTCAATCTATAG 881 TAGTTTGTTACTATTTTGTTATAGCAACCAAAGATGACTAAGCCAGACAGGTTATGTCACTCGCCAAGTGTCTTAGTCTG 961 TTTGTGCTGCTATAACAAAATACCTTAGACTGGGTAATTTACAAACAACAGAGATGTATCCAGAGATCCACAGTTCTGGA 1041 GGCTGAGAAGTCTAAAATCAAGGCACCAGCAGATTCCACATCTCGTGAAGGCTCACTCTCTGCTTCACAGATGGCACTGT 1121 CTTGCTGTGTTCTCACATGGCAGAAGGGGCAAACAAGCCCCCCTGGGCCTCTTTTATAAAGGCACTAACTCTATGCCTAA 1201 AGGCAGGGCCCTCATGACTCTATCACCTACCAAAAGGCTCCACTTCTTTATACTATTGGAGGGGTAGAAGGAACTTCCTT 1281 TCTAGACCTTGAAGGTTTAAGAATTTGAATCTATAAAACAAGCTGACAATAGACAGATTAACAGGAGAAAAAGCATATAC 1361 ATTTTTTAATGTGGGCCAGATGGCAGAAGCTTAAATAACACCCCAAGCTACAGGAAGTGAGGCCTCTGATGGGGAGGTAG 1441 TGACACAGGCTGTGGGAGGGGGTAGGGGGAGGAAGTCTGTGGTGAGCAAAGTTTGCCTTATTACACTGATAAAGTGTAAT 1521 TACACTAATAAAGCTGGATCACCTGAGGTTAGGAGTTTGAGAACAGCCTGGCCAACATGGCAAAACCCTGTCTCTACTAT 1601 AAATACAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGCAGGGCACTTGTAATCCTATCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTT 1681 GAACCCAGGCTGTAAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCATGCCACTGCACTCCAGTCTGGGTGTCAGAATGAGACCCCATCT 1761 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CTCCTTTATTCAAAGCACTCAGCATGCCAAAGCACCCTATTTTAGGGTATCTTTTTCTGAGCCCTAAACACTGTGTTGGG 2721 GATGTCAACTGTGACAGGAAAATATCTTGGGGCCCCAGAATCACTAAGGAAAACTCAAGCTTAGGGAAACTTCTTAGGGC 2801 AAACCCACCTCCCACTCTATTCAAAGTTATCTCTCTGCTCACTGAGATAGATACATATCTGATTGCCTCCTTTGGAAAGG 2881 CTAATCAGAAACTCAAAAGAATGCAACTGTTTGTGTCTCACCTATCTGTGACCTGGAAGCTCCCTCCCCACTGAACCAAT 2961 GTTCTTCTTACATATATTGATTAATGTCTTATGTCTCCCTAAAATGTATAAAACCAAGGTATGCCCCAACCATCTTGGCC 3041 ACATGTCATCAGGACTTCCTGAGTCTGTGTCACAGTGTGTCCTCAACCTTGGCAAAATAAACTTTCTAAATTAACTGAGA 3121 CCTGTCTCGGATTTTCTGGGTTCACATTTTGGAAACCATGAATGGATTCTGGGTGGAGATGCCCCTGACCCTTGACAAAT 3201 CTATCGGTGCTTGGTACCAGCATGAGCTAACTTTATGGCTCAAACCAATAGGACAATTTGCTGAGGTCTGAGAGGACTCC 3281 CTCCAGAAAATCCCTGATCTCTTAAAATTTGGTAGAGATCGGAAGTTTATTTTGCTGTACAACACCTCTTTTTTTGGAGT 3361 TTTACTTGCTCCCAACAAGGAAGGCAAGTTTTCCTGCTTTCATGATGATGGAAGGCAGGTGATGTTTTTATGGAGTTTCA 3441 GCTTTCTTCCAATGCACTTAGAGCACTCAGAAATTGTATAATTTGTGTGACCATTGTTAGTTTTGCTTAACTGTTTTGTT 3521 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AATGAAGGTTTTTGCTTTTTTTGAAATCCTTGAATTATCACTTGGATTAAATAAATGACTTTACGATGACCTGTAATTTT 6241 ATTTTGTAATGTCAAGTGTTTTAAACCTTTTGTATTTGACAAGCTTTCCAAAATCAAATTATAAATTATGTATTTTTCTA 6321 ACCTAATTAATCCTTTAAGATCTTAGTTTCCCTAAAGTCCTAAAATGACATAATTTGGCTTATTTGGTATAAAAATTATA 6401 TAGGAAGCATTGTCAAATGTGAAATGGTGTTTGGTTTTCTTTGGGCTGTATTTGTATAAATATGTTATTGGTGTATGTTC 6481 CAAAATTATGTGAAACTCCTATAATTCTAATATAACTTAGTGTACATTATCAGTAATAATCATAATTGTTATATTAAAAT 6561 TATTGTGTGCCACAGAGGTAAAAAATTTCCTTGTCAGTTTTGTCTTTTGACTATGGCTGCCTTAAAACTTTTTTCTTCCA 6641 TGCACAATTGTTGTTTTGGTCCTCTTTTTTAAATATATTTTTATTATTATTTTTGAGATGGGGACTCACTCTGTTGCCCA 6721 GGCTGGAGTGCAGCGGCACGATCTTGGCTCACTGCAACTGCCACCTCCCAGGTTCAAGCGGTTCTCCTGCCTCAGCCTCC 6801 CGAGTAGCTGGGATTACAGGCATACACCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTCAGTAGAGATGGGGTTTCACCAT 6881 GTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCAGCCCACCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGAAATTACAGATGT 6961 GAGCCACACACCTGGCCTATTTTGGTCCTCTTTAGAAGGTGGTTTTATAATCAGCTGTAAAACTCCAACAGGTGCTCTTA 7041 CATGCAGGTTTCTGATAACTTTGGAGATTGTGACATCAGAATAGAGGGAAAAGTTTCAGGACTCATGGAGAGCTAAAATG 7121 TTCATGAGTATCAAGCAGAACAGGAATTAACTGCATAGACTGAACCAATCTTTTTGACTTTTTGCTTAAAATGTTTGCTG 7201 ATCCTTTGTTTTGTGTTTCAGTCTTAAAACTTTTCTTTTGAGCTATTGACAGCTTTTAACAATTTAGTATACTCCTATGA 7281 CAAAATTTGGAGCATATTTGTTTCTCTCTACCTGATTTCTCCAGAATTCAGAAACTATTTGTAAGTATTCTTAACTTATG 7361 GTGATACAGTTATTTGCATAAGTGCAATAAGAATCTGTTCTAATTTGTAACAGGACACGATTGGAGAAATTGGTTGTTTT 7441 ACTAAGACTTTGACTGGAATGGTGTGCTTTTCTTTAAGGAATCAAACTTGACTTATGGAACCAATAAAGTCCTTGGAAAA 7521 ACTGGCCCCATATTTTGTGTACACAGTCTCCGTACAAGATTTCTGACCTGTAGTAAGTAAAGAATGTCACTTTCTGACAG 7601 GCACATAAGCCCCAGGTTTACCTCAGAACCTCAAGAGGAGAGGAAATTCACCCAATTTATAAGTATTTGATGGCACAAAT 7681 CCATGGCTGGGCATGGCTTTAAGAAAGTCTTATCTGAGATTCCTCCTGTGGAACAAAGTTAATTGGTTCCAGAGATTCAA 7761 AGCCAGAGTTGCTGTCAGTTCATTGGTAGAGATGCCATCACTGGGCAAGTGTTCTGAAAACATCTTATCTGAATAACAGC 7841 AGTCCTGGAGAACATCTAGGGATCTAGCAAAGCGAGAGATACATGAAGGACATAAAAACGTTTTTAGAAAGTCCTTGGAA 7921 ACAGTTCTCATTTCAGACATGTAAGCATGAGCTAGGATGAAAAGTGATTTCATCCTGGTATCTGCAATTTTCACATTCAT 8001 TAGGTTTCAACATATAAACTTTCAGGGGACACAGACATTCAGACTATAGCACCAAGCTGTAGAAGCTACATAGTTGTAGA 8081 CCAGGGTCAGCAACCCAAGAAGCCTGACTTCCAAGCTGTGCTTTTAACTTCCCCACCATGTTGCACCTAAAGCTTTGGAG 8161 TTTTCCTGTGATTAGTGTTTTTGGTGTTGTTTTATTTTTTTTCTTACAGGAACTCTTGCAAGAAGAAAGGACTATGAGTT 8241 CAACTTTAGAGGGAGCCATGGGGACTAAACAAAATTCTGAGGCCCCCTCAACCATCTAAATGGACTTCCTTCTGGGCCAG 8321 GACACTCGAAAATTAAACCTGAAAGACTGGTTCAGGCCATGATGGGAAGTGGGAGTCGAACATGCCTCATCATACCCTCC 8401 AGCATTAACATCAACACAGACCTTAAGGCTGATAAGAAGCATTTACAATCTATTCTCTCTGAAGTCTTCTACCTGGAGGC 8481 TTCATCTGCATGATAAAACTTTGGTCTCCACAACCTCTTACAACCCAGGCATTCCTTTCTATCGATAATTACTCTTTCAA 8561 CCAATTGCCAATCAGAAAATTGTTATATCTACCTATAATCTAGAAGCCCCCACATCAAGTTGTTTTGCCTTTCTGGACAG 8641 GACCAATGTATATCTTAAATGTATTTGATTGATCTCTCATGTCTCCCTAAAATGTATAAAACCACGCTGTTCCCCGACCA 8721 CCTGGAGCACATGTTCTCAGGGTCTCCTGAGGGCTGTGTCACAGGCCATGTTCACTTACATTTGGCTCAGAATAAATCTC 8801 TTCAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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