pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-2355 |
Genomic Coordinates | chr2: 207109987 - 207110073 |
Description | Homo sapiens miR-2355 stem-loop |
Comment | None |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-2355-5p | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | 11| AUCCCCAGAUACAAUGGACAA |31 | |||||||||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||||||||
Experiments | SOLiD | |||||||||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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miRNAs in Extracellular Vesicles |
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Circulating MicroRNA Expression Profiling |
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | IGF2BP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CRD-BP, CRDBP, IMP-1, IMP1, VICKZ1, ZBP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001160423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_006546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on IGF2BP1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of IGF2BP1 (miRNA target sites are highlighted) |
>IGF2BP1|NM_001160423|3'UTR 1 CCAGCCCCTCCCTGTCCCTTCGAGTCCAGGACAACAACGGGCAGAAATCGAGAGTGTGCTCTCCCCGGCAGGCCTGAGAA 81 TGAGTGGGAATCCGGGACACCTGGGCCGGGCTGTAGATCAGGTTTGCCCACTTGATTGAGAAAGATGTTCCAGTGAGGAA 161 CCCTGATCTCTCAGCCCCAAACACCCACCCAATTGGCCCAACACTGTCTGCCCCTCGGGGTGTCAGAAATTCTAGCGCAA 241 GGCACTTTTAAACGTGGATTGTTTAAAGAAGCTCTCCAGGCCCCACCAAGAGGGTGGATCACACCTCAGTGGGAAGAAAA 321 ATAAAATTTCCTTCAGGTTTTAAAAACATGCAGAGAGGTGTTTTAATCAGCCTTAAAGGATGGTTCATTTCTTGACCTTA 401 ATGTTTTTCCAATCTTCTTCCCCCTACTTGGGTAATTGATTAAAATACCTCCATTTACGGCCTCTTTCTATATTTACACT 481 AATTTTTTTATCTTTATTGCTACCAGAAAAAAATGCGAACGAATGCATTGCTTTGCTTACAGTATTGACTCAAGGGAAAA 561 GAACTGTCAGTATCTGTAGATTAATTCCAATCACTCCCTAACCAATAGGTACAATACGGAATGAAGAAGAGGGGAAAATG 641 GGGAGAAAGATGGTTAAAATACATAATAATCCACGTTTAAAAGGAGCGCACTTGTGGCTGATCTATGCCAGATCACCATC 721 TTCAAATTGGCACAACTGAAATTTCCCCACTCTGTTGGGGCTTCCCCACCACATTCATGTCCCTCTCCCGTGTAGGTTTC 801 ACATTATGTCCAGGTGCACATAGGTGGTATTGAATGCTCAGCAGGGTAGGGGCTGACCACTGTCCCTGATTCCCATCGTT 881 CTCAGGCGGATTTTATATTTTTTTAAAGTCTATTTTAATGATTGGATATGAGCACTGGGAAGGGGACGCTAACTCCCCTT 961 GATAAAGTCTCGGTTCCATGGAGGACTTGAGTGGCCCCAAAGGCTGCCACGGTGCCCTCACCCCAGCCCATGTGCTCCCA 1041 TAAGGGCTGGTTCCTAGAGGCAGGGGTTGTGGGGCACTCCCAGCCACGGCACTGTTACCTTGGTGGTGGGACTTGGAACC 1121 CAACCCTGAGCTCCCGATAAAGCTAAAGTCCATCATCTGGCAAATTCAGTAAATTGGAGAGTACTTGCTTCTGTTTGTAT 1201 CTGAGAGGAATTTTTAACTGACGGCTTCTGTCTCCATGAATCATTATCAGCATGATGAAAGGTGTGTCTAAAAAACAATT 1281 CAGAATACCAGCAGCATTGTACAGCAAGGGGTAAATAAGCTTAATTTATTAATTTACCAGGCTTAATTAAGATCCCATGG 1361 AGTGTTTAGCCCTTGTGGGAGACAGAAGCCATCAGTTAAATGAGGTTAGGCCTCTCCTCCTAATATACTGATTGACAATG 1441 CATATTAGCCAGGTAATGCACTTTAGCTACCCTGGACAATGCTATCAAGTGTGCTGGGAAGGGAGGAAGGCCTCTCTACA 1521 TATGGAAAAGCCCATGCGTGGAGTTCCCCTCCTTTCAACATTGCAACAACAGTAACAACAAGACAACCGCAACATGTGGG 1601 CGTAGTCAGGCAATGCTGTGTGCGAAGTAAACTACCTCAAGGTATGAAGTTACCTCAGCAATTATTTTCCTTTTTGTTCC 1681 CCCCAACCCCATTAAAAAAATTTTTTTTTGATTTTTGTTTTTTTGCAGCTTGCTGATATTTTATATAAAAAAGAAAAGCA 1761 AAGCAAAAGAGAAGCTGATAGTCTTGAATATTTTATTTTTTTAATGAAAAGAAAAAACAAGAAAGTTATGTTTCATAATT 1841 TCTTACAACATGAGCCAGTAACCCTTTAGGAACTCTCTATGGAGAACAGGCCTGGTGGGAAAGGCTTTGGGGGCTGCCCC 1921 CTTAGGAGGAGGCTAGTGCTAAGAGGGAAGGCCCAGGTTTGAGAGAGCCCAGAGGGGCAGAGCCCAGAGCCTTGTTTGGC 2001 CCTGATCTCTGACTTCTAGAGCCCCAGCTGCTGGCGGCTGCTGGAATATCCTACCTGATAGGATTAAAAGGCCTAGTGGA 2081 GCTGGGGGCTCTCAGTGGTTAAACAATGCCCAACAACCAACCAGCTGGCCCTTGGTCTCCTCTCTTTCCTCCTTTGGTTA 2161 AAGAGCATCTCAGCCAGCTTTTCCCACCAGTGGTGCTGTTGAGATATTTTAAAATATTGCCTCCGTTTTATCGAGGAGAG 2241 AAATAATAACTAAAAAATATACCCTTTAAAAAAACCTATATTTCTCTGTCTAAAAATATGGGAGCTGAGATTCCGTTCGT 2321 GGAAAAAAGACAAGGCCACCCTCTCGCCCTCAGAGAGGTCCACCTGGTTTGTCATTGCAATGCTTTTCATTTTTTTTTTT 2401 TGTTATTGTTTCATTTCAGTTCCGTCTTGCTATTCTTCCTAATCTATATCCATAGATCTAAGGGGCAAACAGATACTAGT 2481 TAACTGCCCCCACCTCTGTCTCCCTGTCTTCTTTAGATCGGTCTGATTGATTTTAAAAGTGGACCCAAACTTAGGGAATT 2561 CTTGATTTAGGGTGGCTGGTGGCAAGGAGGGGCAGGGGATATGGGGACGTGACTGGGACAGGTTCCTGCCTTATCATTTT 2641 CTCCCTAGGACATTCCCTTGTAGCCCCCAGAATTGTCTGGCCCAAATTGAATAGAAGCAGAAAAACATTTAGGGATAACA 2721 TCAGGCCAGTAGAATTAAGCCTCTCCACCTGTCCCAACCATAAAAAGGGTCTCCCAGCTTTCCATCTCTGGCTCTATATG 2801 CTTTATCCCAAAACAAAGCAGATAACGTTCAGACGTCGGCCATTTAGTAATTTAAAGCGAATTTCCAGCAGCAAGCATGC 2881 TTTGATATCTGGTTCAGACTATCATCAGGAAGAAAAAAAAATCCCACAGTACCTGAAATGTGATTGTTGCAGTGTTCAGT 2961 TTCCTTGGGGGCCTGCTCCCTTCACACCTTGAGCCCAAGTCCTTTTCCGTTGGCTGATTCAGCTCCCAGAAGAGACGAGG 3041 AAGTGTGTGGCAAGGGACTGGAAAACTTCACTTGCTTGGATTAGGCAAGGCTCCACTCATTGTTGATATTTGCCCAGCAG 3121 GAAAATCATGTAAGTTATACCACCAGAAAGCAAAAGGAGCATGGTTTGGTGGTTAAGGTTTAGTGGGATGAAGGACCTGT 3201 CTTGGTGGGCCGGGCCCTCTTGTGCCCCGTAGGCTAGGTCTTAGGGCAACTCCTTGCCCTCCTGCTCAGCACCTCCATTT 3281 CCCCATCCTTGGTGAGATAACAAGCTATCGCGAAAAGCACTTGGGAGATTTGGATGATTTGAGAAGAGTGACTTAAAAAA 3361 AATGCTTCTGTGCTCTAAGATATATATGTGTGTGTGTGTGCTACATATATATTTTTAAGAAAGGACCATCTCTTTAGGAT 3441 ATATTTTTAAATTCTTTGAAACACATAACCAAAATGGTTTGATTCACTGACTGACTTTGAAGCTGCATCTGCCAGTTACA 3521 CCCCAAATGGCTTTAATCCCCTCTCGGGTCTGGTTGCCTTTTGCAGTTTGGGTTGTGGACTCAGCTCCTGTGAGGGGTCT 3601 GGTTAGGAGAGAGCCATTTTTAAGGACAGGGAGTTTTATAGCCCTTTTCTACTTTCCTCCCCTCCTCCCAGTCCTTATCA 3681 ATCTTTTTTCCTTTTTCCTGACCCCCTCCTTCTGGAGGCAGTTGGGAGCTATCCTTGTTTATGCCTCACTATTGGCAGAA 3761 AAGACCCCATTTAAAACCCAGAGAACACTGGAGGGGGATGCTCTAGTTGGTTCTGTGTCCATTTTCCTCTGTGCCAAAGA 3841 CAGACAGACAGAGGCTGAGAGAGGCTGTTCCTGAATCAAAGCAATAGCCAGCTTTCGACACATACCTGGCTGTCTGAGGA 3921 GGAAGGCCTCCTGGAAACTGGGAGCTAAGGGCGAGGCCCTTCCCTTCAGAGGCTCCTGGGGGATTAGGGTGTGGTGTTTG 4001 CCAAGCCAAGGGGTAGGGAGCCGAGAAATTGGTCTGTCGGCTCCTGGTTGCACTTTGGGGAAGGAGAGGAAGTTTGGGGC 4081 TCCAGGTAGCTCCCTGTTGTGGGACTGCTCTGTCCCCTGCCCCTACTGCAGAGATAGCACTGCCGAGTTCCCTTCAGGCC 4161 TGGCAGACGGGCAGTGAGGAGGGGCCTCAGTTAGCTCTCAAGGGTGCCTTCCCCTCCTCCCAACCCAGACATACCCTCTG 4241 CCAAACTGGGAACCAGCAGTGCTAGTAACTACCTCACAGAGCCCCAGAGGGCCTGCTTGAGCCTTCTTGCTCCACAGGAG 4321 AAGCTGGTGCCTCTAGGCAACCCCTTCCTCCCACCTCTCATCAGGGGTGGGGGTTCTCCTTTCTTTCCCCTGAAGTGTTT 4401 ATGGGGAGATCCTAGTGGCTTTGCCATTCAAACCACTCGACTGTTTGCCTGTTTCTTGAAAACCAGTAGAAGGGAAACAG 4481 CACAGCCTGTCACAGTAATTGCAGGAAGATTGAAGAAAAATCCTCATCAATGCCAGGGGACATAAAAGCCATTTCCCTTC 4561 CAAATACTCGACAATTTAGATGCAGAACATTTCTCTGTATTCAGACTTAGAGTAACACCAGCTGAAAACTGCAGTTTCTT 4641 TCCTTTGGATACATAAGGCTTCTCTATCGGGGTACGGGACAGGGAGGAGGCCTCATGTCTGAAGGGGGATTTAGGGGCGA 4721 GAGCCCCAGCCCTGACCCTCGGTCCTGTGCACCGCTTTGGGGCACAGTCTGATGGCGCCTTTGCTGGCGCCTTAGTATGG 4801 TTGACTCCGGATGGACAAAAGAAAAAAAATTTTTTTTCTTGAATGAAATAGCAGGAAGCTCCTCGGGAGCATGTGTTTTG 4881 ATTAACCGCAGGTGATGGATGCTACGAGTATAAATGGATTAACTACCTCAATCCTTACAGTAAGATTGGAACTAAGGGCA 4961 GGGACTCATGCATAAGGGTATGAATCCCAGCCAGGACAAGTGAGTTGAGGCTTGTGCCACAAAAGGTTTGTCCTTGGGGA 5041 ACAGGCAGGCCTGCCAGGATCCCCCCCATATCGATTGGGCTGGGAGGGCTGGCCATGAGGTCCCCACTTTCTGCTTTCCT 5121 TGCCCATGTGTCACCCCTTTGGCCTCCAGCTTGTCCCTCTCTCACTTTCTATAGCTTTGTTGGACCAGATGGTGAGGAAA 5201 GGAATGGCCTCTTCCCTTCTAGAGGGGGCTGGCTGGAGTGAGACCTGGGGCTTGGCCTGGAACCCACCACACAGCCCCAA 5281 AGTCAGGAAGCCTGGGGAAACCAGAGCTGAGACCTCTTCAACAGGGTTTCTTTGAGATCCTACACCTCCATTGGGCCCTT 5361 TTTCAGTCTTCAATGGGGGCCCAGTTGGCTCTAGAAGGAGAAGAGGTGAAGCAGGATCCTTTGCCCTGGGGGAGTCTGAG 5441 GGCGCGGTCCTTGGACTCATTCAGGCCGTCTTTGTAGTTGGGGGAGTTCCACTGGGCGATCCCAGCCCCTCCCCACCCAC 5521 CCTCTAATGGACCTCCTCATAGAAGCCCCATTTCACTTTTGTTTTATCTACCTCTTAGCAAAACAATAGATAAATTAGGT 5601 AGTGGCAGCTCCACTTGCTTAGGTTAGGGGGGGAAAAAGATTTCTTTTTCCAAAGGAAAAAAATATTACCTTGAGAATAC 5681 TTTCCAAAAAATAAAATTAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAAATTTTTTTTTAAAAGGGAGACATTTTCCAGTGACCAC 5761 TGGATTGTTTTAATTTCCCAAGCTTTTTTTTCCCCCATAAATAAGTTTCACTCTTTGGCGATTTTCTTCACTTGTTTAAG 5841 ATAACGTGCTAGCTATTCCAACAGGTAACAGCTTTCACAGTCTGCCCCTGGCCTGTCTCACCCCATCCCCCACCCTATTC 5921 CTGCCAGTGAGTCCTTCCTGTGCTTCTCTCCCTTCTCCCCTCCCAGCCAGCTGACTTCAGTCACCCCTGTCCCCCCTCCC 6001 CTGCCAATAAGCTCCCCCAGGAATAAAGGCTTTGTTTTGGGGATGCTTAAATCTTGACTGGCACTTCCCGGCTGTGGGGG 6081 CTGGGGAGCCACTTGTAACATTTCTGTGCAGATTTTATGTTAGCCACTGCTATGTAAAAGCACGTTCAAAATGAATTTCA 6161 GCAGATTATGTGTTACCATAATGAATAAACGTCCTCTATCACCATTTGGAGTCTCCCTTTTCTCCAGGATCTTGATCCTG 6241 GTCCCCAAAACCAGAGTGAATCAAAAGAGCTTCCTCCCCTGAGGCAAAGTGGATTTGTAAGCAGTTCTGAAACATCACTT 6321 ACTCAGAAGAGGGAACGATGTATTTTGATGAGTGCAAATTGGGAAGAGCTGGAGGCCTACTGCTTGGGACAGTTTTTTTT 6401 TTTTTTTTTTTTTTAAATATGAGTGCTAGCTTATTCTGTAATTGCGGCAACTTTGAAAATTGTATTTTACTGGAAATCTG 6481 CCAGCCATCACCACCCGATTTTGATTGTATCCTTCCTCCCATCCTTTAATCTGTTCATTGCTTTGGGGGAGGTGGGGCAG 6561 CTGGCTCACACGTTGGAGTTTGTTCTTTGATGGATGAACGAACACTCCAGTTTTCTTTCCCGTGAAGGTTGTTTCAGCCA 6641 CAAACCACTTCATTTTGCTGTTTCAATTTCAAAATAAAAGGAAACTTATATTGAAAGACAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |||||||
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miRNA:Target | ---- | ||||||
Validation Method |
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Conditions | HEK293 | ||||||
Disease | 10642.0 | ||||||
Location of target site | 3'UTR | ||||||
Tools used in this research | TargetScan , miRTarCLIP , Piranha | ||||||
Original Description (Extracted from the article) |
...
"HITS-CLIP data was present in GSM714642. RNA binding protein: AGO2. Condition:completeT1
... - Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al., 2011, Nature methods. |
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miRNA-target interactions (Provided by authors) |
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Article |
- Kishore S; Jaskiewicz L; Burger L; Hausser et al. - Nature methods, 2011
Cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) is increasingly used to map transcriptome-wide binding sites of RNA-binding proteins. We developed a method for CLIP data analysis, and applied it to compare CLIP with photoactivatable ribonucleoside-enhanced CLIP (PAR-CLIP) and to uncover how differences in cross-linking and ribonuclease digestion affect the identified sites. We found only small differences in accuracies of these methods in identifying binding sites of HuR, which binds low-complexity sequences, and Argonaute 2, which has a complex binding specificity. We found that cross-link-induced mutations led to single-nucleotide resolution for both PAR-CLIP and CLIP. Our results confirm the expectation from original CLIP publications that RNA-binding proteins do not protect their binding sites sufficiently under the denaturing conditions used during the CLIP procedure, and we show that extensive digestion with sequence-specific RNases strongly biases the recovered binding sites. This bias can be substantially reduced by milder nuclease digestion conditions.
LinkOut: [PMID: 21572407]
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CLIP-seq Support 1 for dataset GSM4903833 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / CTL_TD_21_a |
Location of target site | NM_001160423 | 3UTR | AGGAAGCCUGGGGAAACCAGAGCUGAGACCUCUUCAACAGGGUUUCUUUGAGAUCCUACACCUCCAUUGGGCCCU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 2 for dataset GSM4903834 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / CTL_TD_21_b |
Location of target site | NM_006546 | 3UTR | AACCCACCACACAGCCCCAAAGUCAGGAAGCCUGGGGAAACCAGAGCUGAGACCUCUUCAACAGGGUUUCUUUGAGAUCCUACACCUCCAUUGGGCCCU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 3 for dataset GSM4903835 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / CTL_TD_21_c |
Location of target site | NM_001160423 | 3UTR | AGGACAAGUGAGUUGAGGCUUGUGCCACAAAAGGUUUGUCCUUGGGGAACAGGCAGGCCUGCCAGGAUCCCCCCCAUAUCGAUUGGGCUGGGAGGGCUGGCCAUGAGGUCCCCACUUUCUGCUUUCCUUGCCCAU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 4 for dataset GSM4903838 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO |
Cell line / Condition | Dermal fibroblasts / 124_TD_21_c |
Location of target site | NM_006546 | 3UTR | CCUGGGGAAACCAGAGCUGAGACCUCUUCAACAGGGUUUCUUUGAGAUCCUACACCUCCAUUGGGCCCU |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Accession Series | GSE161239 |
CLIP-seq Viewer | Link |
CLIP-seq Support 5 for dataset GSM714642 | |
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Method / RBP | HITS-CLIP / AGO2 |
Cell line / Condition | HEK293 / completeT1, repA |
Location of target site | ENST00000290341.3 | 3UTR | CAAAAGGUUUGUCCUUGGGGAACAG |
Tools used in this analysis | TargetScan, miRTarCLIP, and Piranha |
Article / Accession Series | PMID: 21572407 / GSE28865 |
CLIP-seq Viewer | Link |
MiRNA-Target Expression Profile | |||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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164 hsa-miR-2355-5p Target Genes:
Functional analysis:
ID![]() |
Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT190653 | PABPN1 | poly(A) binding protein nuclear 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT286477 | TAOK1 | TAO kinase 1 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT318993 | GIGYF1 | GRB10 interacting GYF protein 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT345622 | DCAF7 | DDB1 and CUL4 associated factor 7 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT442513 | SYT7 | synaptotagmin 7 | ![]() |
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2 | 4 | ||||||
MIRT444247 | CTNND1 | catenin delta 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT444780 | ECE1 | endothelin converting enzyme 1 | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT456525 | TMEM63A | transmembrane protein 63A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT468960 | RPRD2 | regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT469834 | R3HDM4 | R3H domain containing 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT470027 | PTP4A1 | protein tyrosine phosphatase type IVA, member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT471167 | PHB2 | prohibitin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT475819 | HDGF | heparin binding growth factor | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT479389 | CDKN1B | cyclin dependent kinase inhibitor 1B | ![]() |
![]() |
2 | 6 | ||||||
MIRT481747 | APH1A | aph-1 homolog A, gamma-secretase subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT485220 | PRICKLE1 | prickle planar cell polarity protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT487259 | CCNF | cyclin F | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT489971 | MCC | mutated in colorectal cancers | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT491399 | C1D | C1D nuclear receptor corepressor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT494959 | CCDC144A | coiled-coil domain containing 144A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT494979 | PPP5D1 | PPP5 tetratricopeptide repeat domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT495225 | CHST14 | carbohydrate sulfotransferase 14 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT496550 | TBX15 | T-box 15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT501612 | PISD | phosphatidylserine decarboxylase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT509393 | TRIM24 | tripartite motif containing 24 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT519616 | ZNF788 | zinc finger family member 788 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT519738 | ZNF394 | zinc finger protein 394 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT521230 | SAR1A | secretion associated Ras related GTPase 1A | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT521801 | POM121C | POM121 transmembrane nucleoporin C | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526233 | C2orf15 | chromosome 2 open reading frame 15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT526932 | CMSS1 | cms1 ribosomal small subunit homolog (yeast) | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529189 | ACBD7 | acyl-CoA binding domain containing 7 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529329 | ZNF649 | zinc finger protein 649 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529698 | MRPL30 | mitochondrial ribosomal protein L30 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT529921 | TOP1MT | DNA topoisomerase I mitochondrial | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530032 | SMC1A | structural maintenance of chromosomes 1A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT530898 | C9orf3 | chromosome 9 open reading frame 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT531621 | TM4SF5 | transmembrane 4 L six family member 5 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT533132 | XIAP | X-linked inhibitor of apoptosis | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT533210 | WAPAL | WAPL cohesin release factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT534058 | ST6GALNAC3 | ST6 N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT535487 | PARVB | parvin beta | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT536749 | HOXD9 | homeobox D9 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT551456 | CARKD | NAD(P)HX dehydratase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT551858 | ASB6 | ankyrin repeat and SOCS box containing 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT552095 | FAM8A1 | family with sequence similarity 8 member A1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT552332 | ZNF704 | zinc finger protein 704 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT552549 | ZFP36L2 | ZFP36 ring finger protein like 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT561505 | SRSF2 | serine and arginine rich splicing factor 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT562702 | ZNF415 | zinc finger protein 415 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT563052 | ZNF138 | zinc finger protein 138 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT564592 | ZNF791 | zinc finger protein 791 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT566422 | PIGA | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570176 | RCBTB1 | RCC1 and BTB domain containing protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570866 | ZNF525 | zinc finger protein 525 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT570875 | ZFP1 | ZFP1 zinc finger protein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT571517 | ZNF625 | zinc finger protein 625 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT572551 | DKK3 | dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT610894 | HINFP | histone H4 transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT611037 | PTGES | prostaglandin E synthase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT611479 | HSPA4 | heat shock protein family A (Hsp70) member 4 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT612419 | SP1 | Sp1 transcription factor | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT614478 | FRMPD3 | FERM and PDZ domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT616318 | CACNA1A | calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT616929 | ZNF638 | zinc finger protein 638 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618131 | GABARAPL3 | GABA type A receptor associated protein like 3 pseudogene | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT618452 | ZFP30 | ZFP30 zinc finger protein | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT620671 | BBS5 | Bardet-Biedl syndrome 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT620713 | ASB16 | ankyrin repeat and SOCS box containing 16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT621126 | EMC7 | ER membrane protein complex subunit 7 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT621443 | TOMM22 | translocase of outer mitochondrial membrane 22 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623491 | KCTD11 | potassium channel tetramerization domain containing 11 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623783 | GOSR1 | golgi SNAP receptor complex member 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT623918 | FNBP1L | formin binding protein 1 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625723 | CXorf38 | chromosome X open reading frame 38 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT625778 | GCNT1 | glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT626940 | TTR | transthyretin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT627357 | TSC22D2 | TSC22 domain family member 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT632078 | ALDH1A2 | aldehyde dehydrogenase 1 family member A2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT633361 | FAM71F2 | family with sequence similarity 71 member F2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT639793 | MVK | mevalonate kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT643761 | NAGK | N-acetylglucosamine kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT644358 | NDUFAF6 | NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT645558 | ZMYM1 | zinc finger MYM-type containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646588 | ANKRD36 | ankyrin repeat domain 36 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT646631 | SLC25A46 | solute carrier family 25 member 46 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648066 | HSPA6 | heat shock protein family A (Hsp70) member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648142 | SUCLG2 | succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT648416 | MYOZ3 | myozenin 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649218 | AMMECR1L | AMMECR1 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT649772 | MRPS27 | mitochondrial ribosomal protein S27 | ![]() |
![]() |
2 | 4 | ||||||
MIRT650510 | UFM1 | ubiquitin fold modifier 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT651007 | ZNF740 | zinc finger protein 740 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT651524 | WNT2B | Wnt family member 2B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652014 | TTYH3 | tweety family member 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652513 | TMEM109 | transmembrane protein 109 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652686 | THUMPD3 | THUMP domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT652772 | TENM3 | teneurin transmembrane protein 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT653160 | SPRY4 | sprouty RTK signaling antagonist 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT653765 | SIX5 | SIX homeobox 5 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT653792 | SIRPA | signal regulatory protein alpha | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT655649 | OAZ2 | ornithine decarboxylase antizyme 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT656263 | MEX3A | mex-3 RNA binding family member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657044 | KCNH6 | potassium voltage-gated channel subfamily H member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657375 | HMGA1 | high mobility group AT-hook 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657532 | GTDC1 | glycosyltransferase like domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657542 | GSTO2 | glutathione S-transferase omega 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT657828 | GJD3 | gap junction protein delta 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT658946 | DOK6 | docking protein 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660363 | BACH2 | BTB domain and CNC homolog 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660406 | ATXN7L3 | ataxin 7 like 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT660948 | ABL2 | ABL proto-oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT661031 | AAK1 | AP2 associated kinase 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT662435 | RALGAPA1 | Ral GTPase activating protein catalytic alpha subunit 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT668419 | FAM217B | family with sequence similarity 217 member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT669332 | BSND | barttin CLCNK type accessory beta subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT676105 | CLUAP1 | clusterin associated protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT677084 | SMIM15 | small integral membrane protein 15 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT677127 | OGFOD3 | 2-oxoglutarate and iron dependent oxygenase domain containing 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678001 | CPM | carboxypeptidase M | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT678531 | TMEM78 | transmembrane protein 78 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT680000 | ZNF860 | zinc finger protein 860 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT680098 | PXMP4 | peroxisomal membrane protein 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT686795 | SOX12 | SRY-box 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT698887 | SPTBN2 | spectrin beta, non-erythrocytic 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT699371 | SLC30A6 | solute carrier family 30 member 6 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT702005 | MIDN | midnolin | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT708101 | IGF2BP1 | insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT709563 | GYG2 | glycogenin 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT710559 | PPP2R5E | protein phosphatase 2 regulatory subunit B'epsilon | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT710585 | CDCA4 | cell division cycle associated 4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT710873 | NT5DC1 | 5'-nucleotidase domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT711876 | VASP | vasodilator stimulated phosphoprotein | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT712226 | RIMS3 | regulating synaptic membrane exocytosis 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713211 | FAM13A | family with sequence similarity 13 member A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713261 | GPR55 | G protein-coupled receptor 55 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713327 | DNAJC28 | DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C28 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT713889 | RNF19B | ring finger protein 19B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714015 | UBAP2L | ubiquitin associated protein 2 like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714202 | NLRP12 | NLR family pyrin domain containing 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714717 | VPS8 | VPS8, CORVET complex subunit | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714748 | ZNF385D | zinc finger protein 385D | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714806 | ARHGEF19 | Rho guanine nucleotide exchange factor 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT714852 | ADAMTS17 | ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT715717 | MRPL4 | mitochondrial ribosomal protein L4 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT715852 | GRIN2A | glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT716853 | MFSD12 | major facilitator superfamily domain containing 12 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717134 | EBPL | emopamil binding protein like | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717248 | TMEM246 | transmembrane protein 246 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT717997 | ZNF79 | zinc finger protein 79 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT718341 | PURA | purine rich element binding protein A | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT719587 | TFCP2L1 | transcription factor CP2 like 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720520 | PTGR2 | prostaglandin reductase 2 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT720671 | SLC39A13 | solute carrier family 39 member 13 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721213 | DCLK3 | doublecortin like kinase 3 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721757 | INF2 | inverted formin, FH2 and WH2 domain containing | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT721826 | POU6F1 | POU class 6 homeobox 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722091 | SUSD1 | sushi domain containing 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722275 | LURAP1 | leucine rich adaptor protein 1 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722802 | ARHGAP19 | Rho GTPase activating protein 19 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT722866 | FAM212B | family with sequence similarity 212 member B | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT723113 | ZSCAN16 | zinc finger and SCAN domain containing 16 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT724378 | NEK8 | NIMA related kinase 8 | ![]() |
![]() |
2 | 2 | ||||||
MIRT732775 | PYCR1 | pyrroline-5-carboxylate reductase 1 | ![]() |
![]() |
![]() |
3 | 0 |
miRNA-Drug Resistance Associations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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