Gene Symbol |
GRIN2A
|
Synonyms |
EPND, FESD, GluN2A, LKS, NMDAR2A, NR2A |
Description |
glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A |
Transcript |
NM_001134408
|
Other Transcripts |
NM_001134407
,
NM_000833
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on GRIN2A |
|
3'UTR of GRIN2A (miRNA target sites are highlighted) |
>GRIN2A|NM_001134408|3'UTR
1 ATGACAGCTATCTTCGGTCGTCCTTGAGGTCAACGGCATCGTACTGTTCCAGGGACAGTCGGGGCCACAATGATGTGTAT
81 ATTTCGGAGCATGTTATGCCTTATGCTGCAAATAAGAATAATATGTACTCTACCCCCAGGGTTTTAAATTCCTGCAGCAA
161 TAGACGCGTGTACAAGAAAATGCCTAGTATCGAATCTGATGTTTAAAAATCTTCCATTAATGTTTTATCTATAGGGAAAT
241 ATACGTAATGGCCAATGTTCTGGAGGGTAAATGTTGGATGTCCAATAGTGCCCTGCTAAGAGGAAGAAGATGTAGGGAGG
321 TATTTTGTTGTTGTTGTTGTTGGCTCTTTTGCACACGGCTTCATGCCATAATCTTCCACTCAAGGAATCTTGTGAGGTGT
401 GTGCTGAGCATGGCAGACACCAGATAGGTGAGTCCTTAACCAAAAATAACTAACTACATAAGGGCAAGTCTCCGGGACAT
481 GCCTACTGGGTATGTTGGCAATAATGATGCATTGGATGCCAATGGTGATGTTATGATTTCCTATATTCCAAATTCCATTA
561 AGGTCAGCCCACCATGTAATTTTCTCATCAGAAATGCCTAATGGTTTCTCTAATACAGAATAAGCAATATGGTGTGCATG
641 TAAACCTGACACAGACAAAATAAAAACAGTTAAGAATGCATCTGCACTGTAGTGCGATTGACATGTGCAAGAGATTAGGA
721 AGTTTGGCTCGTAACAGTTTCAGCTTTCTTGTTATGCCTTCCATCACAGCCCAGGCTCACCCCAAGAACTCCAGGCTCCC
801 CTAAAGAATAGCAAATCAGTGTGTTCGTGATGACTGTGCTACCTTCATTATAGTTCATTTCCAAGACACATCTGGAGCCA
881 AAGGCCCGAGGGACCCTCAGGTGGGGAGAGCTACAGGAATCTCTTTGGATGTTGATGTGTGTTTCTCTCACCCTCGGCTT
961 CGATGGTCTTGTTCAGAGCTGCATAAACTAACACATTTATGTCTCCGAGATCTAAGTGTGGATCTTCTGTCTGTGACACA
1041 GTGGCCATTGTAGTTTATCCCGAAGACGCCTATGTACGTAAGTTTGCATTTCCTCCCTTCTGGTGATGACTCAGGGTTGT
1121 ATAGTATCTGTTACCCCTTCCCTCCCAGAGTAACCATAACTCGTTCCGTTTCCAAACAGCCATGGTGGTGTCCAATTAGC
1201 TGTGTATCGCTCTTCCCAGAGTTGTTAATGTGGTGACATGCACCAACAGCCGTATGTGTACTGTGATCTGTAAGAAGTAC
1281 AATGCCATCTGTCTGCCGAAGGCTAGCATGGTTTTAGGTTTATCTTCCTTCACATCCAGAAATTCTGTTGGACACTCACT
1361 TCCACCCCAAACTCCTCAAATCAAAAGCCTTCAAAACACGAGGCACTCTTGGATCTACCCTGAGTATCCTCCAAACTGTG
1441 GATACAGTTTAGTGAGACAAGCAATTTCTCCCTTCTGAGTTATTCTCTCTGTTGGTGGCAAACCACTTCATAGCACCAAC
1521 AGAGATGTAGGAAAAATTCCTCAAAGTATTTGTCATTTCTGAGTCGCCTGCATTATCCCATTCTTATTCTCCTCAAACCT
1601 GTGCATATATGACATGAAATGATATCCATTTTTTTTTTAAGTTAGAGACAGAGAGGGGAATACTTATGCATGGGGAGCCT
1681 GTTAGCACAGTGCCTGCCACAAAAACAAGTGCCCCCGACAAGATAGTTGCTATGTTATGACACTTTCTCAGATCAGGATT
1761 TTCTAGTTTAAAAATTAAATATCATAAAACCAGCAAATAATATTAACTAAACCTTTTATATAGTTCTACTCTGTTAATTA
1841 GTGTATTTCATGTACATGAATATTTTTGAAGTATTTGGGATAACTAGCCATCAGTGTTTGCAGAAGACCTCAGTCTGTTT
1921 TGGGCCATTACGGAAACACTAAGCTAATGTAGACTCGCCTGGCCATTTCCTGGTTTCCTCCTGCATTCTGCTTTACATTC
2001 TTGAAGAAAGGGATAAAGTGGCAGGTTGAAAAATTATCCCATTTCTTCTCCTCATGGTGTGCGTTCTGTTTTGTAAGTAT
2081 TATTTTCTTGCATGTGGGCAAGTGTCAGGGATGATTCCCTTAAAGCTCAAGGATGCATGGAATAGCTCCATCTTTGGGAA
2161 AGTACACCTGACCTACAGTGTTCCTATAATGAAAAGTGGTTGCAATAAATTTCAGGGTCAATCATAGGGAGACAGAGGGA
2241 GGCAGTGGGTGAGAGGAGCTTCCTTTCATTTTTGAAAGGCAGAAGGGGCTGACTAGGTGCTGGGGATGCATGTGCTTGAA
2321 AATGACATTTTATTTCCCGGATGCTGTACCTCTGCTGCCCCAAGACCCAGCCATGGAGAAGCCTGGATCGAAGGGCCCAG
2401 AATAGTCACCCCAACATCTGATCCTAAATCTGAATCTCCATGACTGTGTAGCCTTTTAGCCCTTTCTACCTTCTGCCCTT
2481 CCAGTGCATTCCAGACCTTAATCCACCCCAGCAAGGATCGCCTCCATTTCCTCATGAGTCTGGGATGTTTTGACATGAAT
2561 GAATTAAAAAGTCTTCCCAGAATACAGAAGAGTGATTTGTCGTCAAGCCAAAGAGGCTTTCTGTCTTCCTCTGGTGTCCT
2641 CTAAACCCAGGGGGCTGCCAAATGCCACAGAGACCTCCAGGGAGAGTGAGAGTTATACTTGGACTGACTTCATCGGTCAG
2721 AAAGCCTTCCCCTAACAGCAGCATTATTTCTGCTATTAACCCCATACATCTCTGGATAAAGAAACTGAAAACGTGGCCTT
2801 TGGAAGAATCAACAGTAATGTTGTGAAAAAAATATATATTCTTTTCACTGACCGAAGTGTTTTTTCAAATAAATAATCAG
2881 AAATGTTATGCTACACAAAGTTTATGGTATCCCTTCTCTACTAATTCAATGACTCTTCAATGTGATGATCCCAAGCAAAA
2961 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAACTACTGATCAGATGGTCAATTTCTAAGGAAAAGATGTAGAGTTATTCAAAGGTCAT
3041 CTAAGTCAGTTCAGTCTTTGCAAAAAGAATATCAGGAATGTAACGTCCAGTGGTAAATGGAACCCACAGTATGAGAAGTA
3121 ACAAGAATTAAATAGGAAGCCTGGAAGCCTGAGACTATAGATCTATCACAGAAGATTCCCGTAACATATCCCAGCTCTGA
3201 GTTCTTAGATTTGTTGATGTCAAGGAGCCCAAATTTCTGAACACAAATGCCTGAGTTTCAGCTGGCTTAAGTCAGAGCTG
3281 GCATCCATAATGATATTTTGTTAATTCTAATTGGTTTTCCCCACTTGAGAAGGACCCAACTAGTCCTCAGATAGGTACAC
3361 TTGAATGCAAACGGTTGGGTCTCTGTCCATGGGTAATAGCACGCACATGCAACCAATTTAAAATACTCTGGGTAAGAGAG
3441 TCTTCTAGAGCATAAACTGTACTTGAGAAACCTTTGTGCTTCTGGAAAATGGGTTTCATCATCCTTACATCTGCAGGTTC
3521 TTAGGCCACTTATGGTTTCAATGCTCTGAGCTGGCAAGTCCCTATAGGTCTATCTTTCTGCCAGAGAGACTTGCAGGATT
3601 ATAATCTCACAATCTCACCACTCATTACTGTTATGTCCTCTGCAAATCTCTCTGCGTTATTTTAGCCAGCACCATGACTG
3681 GGCATCCACGGATTACTCTTGATTTTCTCTTCCCTGATTCACAGGATGCCAGAGAGTCTGAGTATTTAGTTTTTCTGGTG
3761 AAAGCATTAAAATTCACACATTGCAGCAAAATCTGTCAAATCATTTCACGCTTATTTTCTGGGGAGAAAAATAGAAAATT
3841 ACACCTTGTTTACAAATGAAATAGTTTCACTTAAATGGGACTCTAGCCAAGGCAGTTAATTAGTCAAAAGATCCACAGCT
3921 GTCATATAGTCACACATTGTTTATTCTATTTGCTATGTCGACCACTGATGTGTATTTAATATTCTGCATCCTTCACAGGA
4001 AATGACAAATGCCCTGAATTATTTGCAAATAGAATTGCTAATGAAAAAGAAAAAAAATGTTGATGTTAATTAAATGGTGA
4081 TTAAAAATTTATCTCCTTTAAATCTAAAAAGTGCAGCTTTAATAATCAGTTGTCATATAAATAAGTACCTTGTACTGAAA
4161 TCCCTTGCGGTTTAAGACCTAAATAAACACTAATTTGAGAACTCTAAATACCTTACAGAGGAGCTGGATATATTCGTTAA
4241 CATTATGCACATTCCTGTACTGTTTCTTTGTGCATAGCTGTTGTGCATGAATCCTTGAAAAGGGGACATGCGTTGTTTCT
4321 GAAATGGAGCCTGTTTGTATTAACCATGGCTATAGTAGACATGATTGGACTCAAAGAAAAAGAAGTTTGAGTAGGTGGAA
4401 GCTAAATGTGTTGCTTGATATTTAATGAGTGAAGGGTTCTATGTAAAGGCAATTTTCCTTCCAAAAGTACTGTTTATTTT
4481 CACTGGAGACAAAATTAGACCTTTCCAGATACCCCATCTCTTTTTGGTGAACAGGGTTGAAAGTGCTGTGGGGTCTATAC
4561 TTGAAAAGTTCTCCCAATATGCAGTTACTGTTTCCCATTCAATCCCTATACATTGTACTGTGTTCATATCTAATTGTATC
4641 AGATGAGGTCAGCTTGCCACTTGATATAGATCAGAGATGATCAAATGCACTTATCCTGTGAATACAACTGCTTGTGTACA
4721 CATGTATATAATATACATGCTTGATTTCTACAATTCACACGTAAGTGTATTATCCAAATAAAATTGTACATATTGTAAAG
4801 TTTATGTTAAAAATTAAATGGTGATGATGGTATTAACACATGGAAAACCCATTCTGGTTATTTTTATGGGAGGATATTTC
4881 TGTAGAGAGGGCACTATATTTTTTTAATCTCAGTTGTAGGGAGGATGACAGAGCCTAAGTAGAATATGGGTGTTGGCGTT
4961 CTTGGCCCCTTCTTTAAAAAACAAAACTCTGGGATGAGGGGTATAGAATATATTCTGCTCGCATTTGCTTCTGAAGACAA
5041 TGCCGATATGGACTTGTGTGTGATTTCCTTAAACACATCAAAGGGCATAGATTTCCTATTTAAATTCCTTATCCTCTTTC
5121 CTCACCTGCACTCTTTCTGTGCCCAGCAGTACTTTCAGTATAGTATTAGCTAGAAGTGCCTGCCCAGAAGGGTCTTAGAA
5201 AAATAGAGTTCGTAGAACCACACCAAAAGTTAGGAGAAGGGGAGGAGAGATGAGAAAAATGAAGTTTACAAATGGGCAGT
5281 TGCCTGTTTAAGATCATCAAGTTAGAGAGTATCAGAGCGAGGATTAGATCCAAGACATGGTTCAATTTCTGGCTCGATTC
5361 TCTGACCGGGCTGACTTATTTCTAGGTTTCTTTCAAGGGGAAACTCCTGAGTAGCTCTGGAATAAGAGCCAGAGATCCCC
5441 ATAAGGCTGCCCTGGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTGCCACTTGCCCCAGAAAGACCTACCCATGCTTCTTTG
5521 AATTTGGTTTTCCTTTAAACTCCCTCACAATCCCTGTCTTAAAGTTCCTAGAAGAGAAAACTTTTCTCAGAGACCGTCTC
5601 CTTAGGAAAAATCAACAGGGATATTGTTTAAAACCTCAAACTGAAGATAAAAGGCTGGCAGTGACCATTGAAATAATTGA
5681 GGTCTATGTATCATGCATTGAGGAAGAACCAAGCACATTGACCAGCTAATAGGACTTCACTGAATGTCCACTTTATTTTG
5761 AAAGCCAGTTTGGGATTGTGGGGGAGGGGATGCAAAATAAATAGAAAATATAGTCTCTTCCCATAAGTAGCTTATGGTTT
5841 AGAAGTTCAGTTCTCTAATACAAAGGATAACCAAGGACCCATGCAATGCAAACAGAGACTAAACAGCAAAAATTAGAAAT
5921 GACAACTAAAGTTGTAGCCAGGAAAAAAAAAATAATCTGATTCTATGAGCATACCTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAGTCC
6001 TTCCCTAAACCTTTAAGTAACTCCGGAGAATAGAGTTAGTGGTCCCGGAAATGCAGTTGATTTATTTTAATCTTCAAATA
6081 ATGGACTTAGGAGACCCAGGAGCTGCTAACCAGGTGAACACACTCACACTCCTACATTTTTGCACAGGAAGGCTTTTGTC
6161 TGGTTCCAACCAGTTCTCCAGTCCTTGCCAAATCATGCCTCCTCCCAGCCTTGCATTATGACATGTGCCTCAAGAAAAGG
6241 TTGAAAAAATTCCCCAAAGGATTAGAAAATAGACCATGATGTAAAAAGACGAAGCATTTCCCTAAAGCTTTTTTGTTTGG
6321 TTTTGTTTTTGACATTTGAAGAACCCTTCTGATACACCAGGGTATGAATGTATCAGGGAAGCATAGAGGGAAAATTCTTT
6401 ATCAAGTTCCAAGTGCCTACTGCTGTGGCTGACAGAAAGCATCAGGTTCCCTAGAGAGAAAACGGGGCAAAGAGATGGCA
6481 AAAGGAATAGAGGTGTATTTCAGGAAGGATGGCGAGGTGGAGAGGGAGCTTTTGTCACTCTGTCTATCCCATTCTGTGCA
6561 TTCTTGGAATGTTACATTTTCTGCTTATCGCAAGTACTTGCCATGGATCTGCACCTGAATTTGAAAATATCAAAATATAT
6641 CTAAATTGAGTGTAGGCGATATTCTAGGCATATCCTAGAATGTGATCCTCAAAACAACCTTAAGATATAAATATGATTGC
6721 TCCCATTTTACAGATAAGGAAACTGAGGCTCAGGTTTTTCTCAACCTCGTCAGCAACTAGAATTAGCTAGTAAATCCCTA
6801 ACGTTAGACATATTTTCAAAGTGCCTGGTCTCCTCCAGGGAGGTCAGAATAGAAGTCAGAAAGAGAGGTGTGCTCTTTTG
6881 AGGTTCCTGGGCATATACCCTTGAGTATCAGCCTCTGTGACAGGGAAGTCTGTTAGGGTCTTACCCCTCATTGCCTGATC
6961 TGTGTGTATGGAGAACTTCTGGGGATCTCACCTCTGTTCATAGTTCCTTCTGAGACTTGAACACTGTTTGTGTCTCCCTT
7041 TCATATGCTTGCACTTAGCATTTAAAAAAATTTCTGGGGAGTTATTTTCTCTACTTAGCATGTGCCTAATCTTAAATATC
7121 TCTTTCCTAATGTCTCATCTTTTTATCAGTCAACATCAGGGCTAATTCCATTAAACATATATACATAGTACATGCTCTCA
7201 TGTGTGTGGGTATGCACACACACACACACAGCCATGTGACCCTCCATTAAAGTCCTCCTAAATATTGTGACCCATGTTCA
7281 AAGAGGTGATATTATTTGCAAGTTGACTATTCCTCCTATTTCATGTCTATGTTTGGTTATCTTTGCCAGGCAGATGGAAT
7361 GAGTTTCAGAGGTGGGACAGGGAATAGGAAATAGAGTTTCTGCATGAATGATGGAGAGCTTTGGTAGTCAGAATGATTGA
7441 GGACCAGCTATTAAAATGTTGTTGTTGTTTTCCTTCTTGGTCTGTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTCCAAATTGTCTTAGAG
7521 ATAATTCCCGGCTCACTTAGCATTAGGATAATGACGGTTATTCTGTCCCACTGAAGAGTGTTGAACTGGAACGCTTCCAC
7601 CGGGCTTTATAGGTACCCAGAATGGCCTAATGTTTAACATATCCTGCAGGCATGCCCCTGAGCACACACTGCCTTTCCTG
7681 CATTCCCCCCTCTCCATGGTCTAAGCCACATTTCTTTCCTGGCATTTATATTTACTGAGAGGTGAGGGGTGCATTAGGCC
7761 CATTTGATGGATGAGGACACTAGCGGGGATTTGAAGGAATGTCTTTCTGGGAGTCTCCATGAATTCTCTGGAGAGTTAGC
7841 TAACTTAATGCAAGTTAAGTGCTAGTCTATGAGAAAAATTTCTCAGCTGTTTTCATCTTTCAAGCTGGCAGTAAAAAGCC
7921 TTTTAAGACAGAAAGATTATTATTTGTTATTTGGAGATCCTGTTGTTGGGTCTACAAGTGCGTGACCATGTTCTCCTTGG
8001 AATGTTGAGCTATGCAGAAATGGAGCACTCCAAAGAACGATTTGACCAATAGCATTTCTTCTCTGGGGGTTGTATTTCAA
8081 AGCATGCAACTCTCCAGGGAACCAGAACTAAATTGCTTAAAATGAAGTCATTCCTCAGATTAACTTCCTCAGATAAAGTG
8161 TCAGCGGTCTGCAGAAACGAAGAAGACAAAACTGAGATTATCACTCATAATTCTCTTACTTACTATGTCAGTGAAACAAT
8241 GAGTTTGCATTTTTGCAATCCTAGAACATTCTTCATTAGCCCTGGGTCATGACCTCTTCCAGTTAATTCTCTTTCACACC
8321 TTTAGGAAAGATTTAAGATGAACCTTCAATAGGATATTAACATAACTCATAGCCAATACCACAGCTGCCTTTCAAATTAA
8401 TGAGGTTAATTGTTCTCCAGCAAACATGAGTTTGTCTTTGGCATTTTAAATGCTTCCCATTGATCTGACATTTTGCTGTT
8481 TCAAGTTTTAAAGGGCTCAAATCAAAGACTATTGATAACTGAGCAAAGAGCGAAGATCCAGAAATACGAAAACATTGTCT
8561 TTTTTTTTCCATGAAAAACAATCATAGCCTTTTGAATTCAATCGAAGTTTCTACATTAGCCATCTAAGACTTATTTAATT
8641 ATTTCTGTTCTCAGTCAAGCTAATTCAAGTGAATGAACAGTATTGACTTTTAAAATCTTTTTTAAATTTTTTTAAATCTT
8721 TAGTTTATTAAGTTTGTAGAAAAGCTCTGGGGCCATGACCACTTACGTAAATGTTTCAGTTTAAAAACAAAAGATTCAGG
8801 CCTCTAATTTGAGCCAAATCCAGGTGATCTTGTTTGAAATTTTTGATGAATTTGAAAAGATGAAAGTGGAACTTTTAACA
8881 TTCATGTTCCCCAAATTTTTCACTGGGAAGGGATGCTAATTGCCTACTTAAGATATAAGTTCAAGAATAACATTTTCATA
8961 GAAAATTCAGAAAACTGCTTGACACAGCAGTGACATAGTTAGATGTGGCTCAGATGCCTTCCAAACCTGAGGGTCCCCAA
9041 AGATTTCTTTACCAGTTGTTTTTAACTATGAATCTTAATCTTGTTCATTCCCCTGCCAAAACAAATTTAAAAGCATAAAC
9121 CTGCTGAATTAATTGGCAGAATTCACCATAGTTTATATCACCCCAGAATGTTTATGTGTATATGTTTATGTATAGTATAT
9201 ATATTTCAAGCTGAATGTTCAGAAAGAATAAGGTGAGTTTCTTGGTAGCTTGAATAAGAATTAGATCATAAAAATTATAA
9281 ATAATGGCCTTCTCAAAGAGGATAAATGATTCATTTTTCACTCACGTATTAATAATATGACTTGTTGCATAATACACAAG
9361 CTGGTCATTGCCTGCAAGAAAGTTATTGAATTAAGCAGCTATCCAGGTTTATGTCTGAGTCCATTTTTAACCCAACAAGG
9441 CTAGGATTGAACTCCATATGCAGAGGGTTTCTATTCACAGCTACATTCAAACAGAATCCAAAACCCACATCAGAACTGAC
9521 TTGATGTCTTGTATGGTGGAGCTGAAAGCAAGCTGTCTGCTCTAAGCAATGGTCTTCATTTGGGAATTAATGTTCACTGA
9601 TCAACTGCAGCAGTTTATATCTGTCATGTTTTAATCCACTGCATGAGGAAGTGCTAATAAGTGTATTAAATATTTCCAAG
9681 CATAGCTACAAAATTATATGTTTGCTTAACACCTTTCTATGATAGAGGAAGTATATACTATGGTTGTCTTCTTGTAGTAT
9761 GTCTTTTAATTTTGTTCAATGTGTTATCAACTGTTTTAAGGAATGGGGATTGAAATTCGTGTGCAAACTGATATGTATAT
9841 AACTCCTGAGGCAACAGAAGTGCCCGGTCATATGGTGTAAAAATGTAAATACAGGAAAATTTCATTTTTCTAATAAAGAT
9921 AATTTCTGCCAATTGATATGAAAATGAGAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' aaCAGGUAACAUAGACCCCUa 5'
| ::||| | ||||||||
Target 5' acGCTTATT-T-TCTGGGGAg 3'
|
3808 - 3826
|
153.00 |
-14.40 |
2
|
miRNA 3' aacAGGUA-ACAU---------AGACCCCUa 5'
||::| |||| ||||||||
Target 5' tgaTCTGTGTGTATGGAGAACTTCTGGGGAt 3'
|
6956 - 6986
|
150.00 |
-17.90 |
3
|
miRNA 3' aacaggUAACAUAGACCCCUa 5'
||| ||||||||
Target 5' aaaaaaATT---TCTGGGGAg 3'
|
7064 - 7081
|
148.00 |
-12.70 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|