Gene Symbol |
SMAD2
|
Synonyms |
JV18, JV18-1, MADH2, MADR2, hMAD-2, hSMAD2 |
Description |
SMAD family member 2 |
Transcript |
NM_001003652
|
Other Transcripts |
NM_001135937
,
NM_005901
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on SMAD2 |
|
3'UTR of SMAD2 (miRNA target sites are highlighted) |
>SMAD2|NM_001003652|3'UTR
1 AGCTTCACCAATCAAGTCCCATGAAAAGACTTAATGTAACAACTCTTCTGTCATAGCATTGTGTGTGGTCCCTATGGACT
81 GTTTACTATCCAAAAGTTCAAGAGAGAAAACAGCACTTGAGGTCTCATCAATTAAAGCACCTTGTGGAATCTGTTTCCTA
161 TATTTGAATATTAGATGGGAAAATTAGTGTCTAGAAATACTCTCCCATTAAAGAGGAAGAGAAGATTTTAAAGACTTAAT
241 GATGTCTTATTGGGCATAAAACTGAGTGTCCCAAAGGTTTATTAATAACAGTAGTAGTTATGTGTACAGGTAATGTATCA
321 TGATCCAGTATCACAGTATTGTGCTGTTTATATACATTTTTAGTTTGCATAGATGAGGTGTGTGTGTGCGCTGCTTCTTG
401 ATCTAGGCAAACCTTTATAAAGTTGCAGTACCTAATCTGTTATTCCCACTTCTCTGTTATTTTTGTGTGTCTTTTTTAAT
481 ATATAATATATATCAAGATTTTCAAATTATTTAGAAGCAGATTTTCCTGTAGAAAAACTAATTTTTCTGCCTTTTACCAA
561 AAATAAACTCTTGGGGGAAGAAAAGTGGATTAACTTTTGAAATCCTTGACCTTAATGTGTTCAGTGGGGCTTAAACAGTC
641 ATTCTTTTTGTGGTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAACTGCTAAATCTTATTATAAGGAAACCATACTGAAAAC
721 CTTTCCAAGCCTCTTTTTTCCATTCCCATTTTTGTCCTCATAATCAAAACAGCATAACATGACATCATCACCAGTAATAG
801 TTGCATTGATACTGCTGGCACCAGTTAATTCTGGGATACAGTAAGAATTCATATGGAGAAAGTCCCTTTGTCTTATGCCC
881 AAATTTCAACAGGAATAATTGGCTTGTATAATCTAGCAGTCTGTTGATTTATCCTTCCACCTCATAAAAAATGCATAGGT
961 GGCAGTATAATTATTTTCAGGGATATGCTAGAATTACTTCCACATATTTATCCCTTTTTAAAAAAGCTAATCTATAAATA
1041 CCGTTTTTCCAAAGGTATTTTACAATATTTCAACAGCAGACCTTCTGCTCTTCGAGTAGTTTGATTTGGTTTAGTAACCA
1121 GATTGCATTATGAAATGGGCCTTTTGTAAATGTAATTGTTTCTGCAAAATACCTAGAAAAGTGATGCTGAGGTAGGATCA
1201 GCAGATATGGGCCATCTGTTTTTAAAGTATGTTGTATTCAGTTTATAAATTGATTGTTATTCTACACATAATTATGAATT
1281 CAGAATTTTAAAAATTGGGGGAAAAGCCATTTATTTAGCAAGTTTTTTAGCTTATAAGTTACCTGCAGTCTGAGCTGTTC
1361 TTAACTGATCCTGGTTTTGTGATTGACAATATTTCATGCTCTGTAGTGAGAGGAGATTTCCGAAACTCTGTTGCTAGTTC
1441 ATTCTGCAGCAAATAATTATTATGTCTGATGTTGACTCATTGCAGTTTAAACATTTCTTCTTGTTTGCATCTTAGTAGAA
1521 ATGGAAAATAACCACTCCTGGTCGTCTTTTCATAAATTTTCATATTTTTGAAGCTGTCTTTGGTACTTGTTCTTTGAAAT
1601 CATATCCACCTGTCTCTATAGGTATCATTTTCAATACTTTCAACATTTGGTGGTTTTCTATTGGGTACTCCCCATTTTCC
1681 TATATTTGTGTGTATATGTATGTGTTCATGTAAATTTGGTATAGTAATTTTTTATTCATTCAACAAATATTTATTGTTCA
1761 CCTGTTTGTACCAGGAACTTTTCTTAGTCTTTGGGTAAAGGTGAACAAGACAACTACAGTTCCTGCCTTTGCTGAGACAG
1841 CAGTTACACTAACCCTTAATTATCTTACTTGTCTATGAAGGAGATAAACAGGGTACTGTACTGGAGAATAACAGATGGGA
1921 TGCTTCAGGTAGGACATCAAGGAAAGCCTCTAAGGAAAGGATGCATGAGCTAACACCTGACATTAAAGAAGCAAGCCAAG
2001 TGAGGAGCCAGGGGAGATAAGCATTCCTGGCAAAGAGAATAGCATCAAATGCAAAAAGGTTCACACTAAAGGAAACTCCT
2081 GATTAGGTATTAATGCTTTATACAGAAACCTCTATACAAATCCAAACTTGAAGATCAGAATGGTTCTACAGTTCATAACA
2161 TTTTGAAGGTGGCCTTATTTTGTGATAGTCTGCTTCATGTGATTCTCACTAACATATCTCCTTCCTCAACCTTTGCTGTA
2241 AAAATTTCATTTGCACCACATCAGTACTACTTAATTTAACAAGCTTTTGTTGTGTAAGCTCTCACTGTTTTAGTGCCCTG
2321 CTGCTTGCTTCCAGACTTTGTGCTGTCCAGTAATTATGTCTTCCACTACCCATCTTGTGAGCAGAGTAAATGTCCTAGGT
2401 AATACCACTATCAGGCCTGTAGGAGATACTCAGTGGAGCCTCTGCCCTTCTTTTTCTTACTTGAGAACTTGTAATGGTGT
2481 TAGGGAACAGTTGTAGGGGCAGAAAACAACTCTGAAAGTGGTAGAAGGTCCTGATCTTGGTGGTTACTCTTGCATTACTG
2561 TGTTAGGTCAAGCAGTGCCTACTATGCTGTTTCAGTAGTGGAGCGCATCTCTACAGTTCTGATGCGATTTTTCTGTACAG
2641 TATGAAATTGGGACTCAACTCTTTGAAAACACCTATTGAGCAGTTATACCTGTTGAGCAGTTTACTTCCTGGTTGTAATT
2721 ACATTTGTGTGAATGTGTTTGATGCTTTTTAACGAGATGATGTTTTTTGTATTTTATCTACTGTGGCCTGATTTTTTTTT
2801 TGTTTTCTGCCCCTCCCCCCATTTATAGGTGTGGTTTTCATTTTTCTAAGTGATAGAATCCCCTCTTTGTTGAATTTTTG
2881 TCTTTATTTAAATTAGCAACATTACTTAGGATTTATTCTTCACAATACTGTTAATTTTCTAGGAATGATGACCTGAGAAC
2961 CGAATGGCCATGCTTTCTATCACATTTCTAAGATGAGTAATATTTTTTCCAGTAGGTTCCACAGAGACACCTTGGGGGCT
3041 GGCTTAGGGGAGGCTGTTGGAGTTCTCACTGACTTAGTGGCATATTTATTCTGTACTGAAGAACTGCATGGGGTTTCTTT
3121 TGGAAAGAGTTTCATTGCTTTAAAAAGAAGCTCAGAAAGTCTTTATAACCACTGGTCAACGATTAGAAAAATATAACTGG
3201 ATTTAGGCCTACCTTCTGGAATACCGCTGATTGTGCTCTTTTTATCCTACTTTAAAGAAGCTTTCATGATTAGATTTGAG
3281 CTATATCAGTTATACCGATTATACCTTATAATACACATTCAGTTAGTAAACATTTATTGATGCCTGTTGTTTGCCCAGCC
3361 ACTGTGATGGATATTGAATAATAAAAAGATGACTAGGACGGGGCCCTGACCCTTGAGCTGTGCTTGGTCTTGTAGAGGTT
3441 GTGTTTTTTTTCCTCAGGACCTGTCACTTTGGCAGAAGGAAATCTGCCTAATTTTTCTTGAAAGCTAAATTTTCTTTGTA
3521 AGTTTTTACAAATTGTTTAATACCTAGTTGTATTTTTTACCTTAAGCCACATTGAGTTTTGCTTGATTTGTCTGTCTTTT
3601 AAACACTGTCAAATGCTTTCCCTTTTGTTAAAATTATTTTAATTTCACTTTTTTTGTGCCCTTGTCAATTTAAGACTAAG
3681 ACTTTGAAGGTAAAACAAACAAACAAACATCAGTCTTAGTCTCTTGCTAGTTGAAATCAAATAAAAGAAAATATATACCC
3761 AGTTGGTTTCTCTACCTCTTAAAAGCTTCCCATATATACCTTTAAGATCCTTCTCTTTTTTCTTTAACTACTAAATAGGT
3841 TCAGCATTTATTCAGTGTTAGATACCCTCTTCGTCTGAGGGTGGCGTAGGTTTATGTTGGGATATAAAGTAACACAAGAC
3921 AATCTTCACTGTACATAAAATATGTCTTCATGTACAGTCTTTACTTTAAAAGCTGAACATTCCAATTTGCGCCTTCCCTC
4001 CCAAGCCCCTGCCCACCAAGTATCTCTTTAGATATCTAGTCTGTGGACATGAACAATGAATACTTTTTTCTTACTCTGAT
4081 CGAAGGCATTGATACTTAGACATATCAAACATTTCTTCCTTTCATATGCTTTACTTTGCTAAATCTATTATATTCATTGC
4161 CTGAATTTTATTCTTCCTTTCTACCTGACAACACACATCCAGGTGGTACTTGCTGGTTATCCTCTTTCTTGTTAGCCTTG
4241 TTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAACCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGTT
4321 CACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATGCTTCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCACCA
4401 CCACACTCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTGTTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACC
4481 TCGTGATCTGTCCACCTCGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCCAGCCTAGCCATATTTTTA
4561 TCTGCATATATCAGAATGTTTCTCTCCTTTGAACTTATTAACAAAAAAGGAACATGCTTTTCATACCTAGAGTCCTAATT
4641 TCTTCATCATGAAGGTTGCTATTCAAATTGATCAATCATTTTAATTTTACAAATGGCTCAAAAATTCTGTTCAGTAAATG
4721 TCTTTGTGACTGGCAAATGGCATAAATTATGTTTAAGATTATGAACTTTTCTGACAGTTGCAGCCAATGTTTTCCCTACG
4801 ATACCAGATTTCCATCTTGGGGCATATTGGATTGTTGTATTTAAGACAGTCAGAATAATGATAGTGTGTGGTCTCCAGAG
4881 GTAGTCAGAATCCTGCTATTGAGTTCTTTTTATATCTTCCTTTTCAATTTTTTATTACCATTTTGTTTGTTTAGACTACA
4961 CTTTGTAGGGATTGAGGGGCAAATTATCTCTTGGAGTGGAATTCCTGTGTTTTGAGCCTTACAACCAGGAAATATGAGCT
5041 ATACTAGATAGCCTCATGATAGCATTTACGATAAGAACTTATCTCGTGTGTTCATGTAATTTTTTGAGTAGGAACTGTTT
5121 TATCTTGAATATTGTAGCTAACTATATATAGCAGAACTGCCTCAGTCTTTTTAAGAAGGAAATAAATAATATATGTGTAT
5201 GAATTTATATATACATATACACTCATAGACAAACTTAACAGTTGGGGTCATTCTAACAGTTAAAACAATTGTTCCATTGT
5281 TTAAATCTCAGATCCTGGTAAAATGTTCTTAATTTGTCTGTGTACATTTTCCTTTCATGGACAGACCATTGGAGTACATT
5361 AATTTTCTTAATCTGCCATTTGGCAGTTCATTTAATATACCATTTTTTGGCAACTTGGTAACTAAGAATCACAGCCAAAA
5441 TTTGTTAACATCAAAGAAAGCTCTGCCATATACCCCGTTACTAAATTATTATACATCCAGCAGATTCTGGGATGTACTAA
5521 CTTAGGGTTAACTTTGTTGTTGTTGATAATACTAGATTGCTCCCTCTTTAATTCTTCTTCTGGTGCAAGGTTGCTGCTTA
5601 AGTTACCCTGGGAAATACTACTACAAGGTCAAATTTTCTAGTATCTTACAGCCTGATTGAAGGTGATTCAGATCTTTGCT
5681 CAATATAAATGGATTTTCCAAGATTCTCTGGGCCATCCTTGACCCACAGGTGATCTCGCTGGAGTATATTAACTTAACTT
5761 CAGTGCCAGTTGGTTTGGTGCCATGAGATCCATAATGAATCCAGAACTTCACCATTGCTTAGATATAAGAGTCCCTTGGA
5841 AGAATAATGCCACTGATGATGGGGGTCAGAAGGTGTATTAACTCAACATAGAGGGCTTTTAGATTTTTCTTCAAAAAAAT
5921 TTCGAGAAAAGTATTCTTTTACCCTCCAAACAGTTAACAGCTCTTAGTTTCTCCAAATATGCTCTTTGATTTACTTATTT
6001 TTAATTAAAGATGGTAATTTATTGAACAATGAAATCCGTAATATATTGATTTAAGGACAAAAGTGAAGTTTTAGAATTAT
6081 AAAAGTACTTAAATATTATATATTTTCCATTTCATAATTGTTTTCCTTTCTCTGTGGCTTTAAAGTTTTTGACTATTTTA
6161 CAATGTTAATCACTAGGTAACTTGCCATATTTCTGGTTCTATATTAAGTTCTATCCTTTATAATGCTGTTATTATAAAGC
6241 TGGTTTTTAGCATTTGTCTGTAGCAATAGAAATTTTACTAAGTCTCTGTTCTCCCAGTAAGTTTTTTCTTTTCTCAGTAA
6321 GTCCCTAAGAAAACATTTGTTTGCCACTCTTACTATTCCCAATCTTGGATTGTTCGAGCTGAAAAAAAATTTGATGAGAA
6401 ACAGGAGGATCCTTTTCTGGTGAATATAGGTTCCTGCTTTAAGAATGTGGAAATCCATTGCTTTATATAACTAATATACA
6481 CACAGATTAATTAAAATTGTGAGAAATAATTCACACATGACAAGTAGGTAACATGCATGAGTTTTGAATTTTTTTAAAAA
6561 CCCAACTGTTTGACAAAATATAGAACCCAAATTGGTACTTTCTTAGACCAGTGTAACCTCACACCTCAGTTTTGCTTTTC
6641 CAACCCTGACTTGAAAGGCATATTTGTATCTTTTTATTAGTGATAGTGAAGCTGTGACACTAACCTTTTATACAAAAGAG
6721 TAAAGAAAGAAAAACTACAGCGATTAAGATGAGAACAGTTCTGCAGTTGTTGAACTAGATCACAGCATTGTAGGCAGAAT
6801 AAAAAATGTTCATATCTGAGAATATTCCTTTCGCCATCTTTTCCCAAGGCCAGACCTCCTGGTGGAGCACAGTTAAAAGT
6881 AACATTCTGGGCCTTTGTAATCGGAGGGCTGTGTCTCCAGCTGGCAGCCTTTGTTTTAATATATAATGCAGGACTGTGGA
6961 AAACAGTTGGCATAGAATATTTTCACCTAAAAAAGAAAGAAAAGACATACAAAACTGGATTAATTGCAAAAAGAGAATAC
7041 AGTAAAATACCATATAACTGGACAAAGCTAGAAGAACCTTTAGAAGATTTGTCTGAAAACAGATTTCAAGAGTGAGCTTT
7121 TATACACTGCTCACTAATTTGCTTGATTACTACCAACTCTTCTTAAAGTTAACACGTTTAAGGTATTTCTGGACTTCCTA
7201 GCCTTTTAGCAAGCTTAGAGGAACTAGCCATTAGCTAGTGATGTAAAAATATTTTGGGGACTGATGCCCTTAAAGGTTAT
7281 GCCCTTGAAAGTTCTTACCTTTTCTCTAGTGATATTAAGGAACGAGTGGGTAGTGTTCTCAGGGTGACCAGCTGCCCTAA
7361 AGTGCCTGGGATTGAGGGTTTCCCTGGATGCGGGACTTTCCCTGGATACAAAACTTTTAGCAGAGTTTTGTATATATGTG
7441 GATTTTTCTGATAAGTAGCACATCAGAGGCCTTAACCACTGCCCAAAAGCGATTCTCCATTGAGAGTACATATCTTGAAC
7521 TTAAGAAATTCATTTGCTCTGATTTTTAATCTTGTAAAGTTTTTGCTAAACTCAAAACAAGTCCCAGGCACACCAGAAGG
7601 AGCTGACCACCTTAGGTGTTCTTGTGATTTATCCTTACTTCCCTATGTTGTCATAGTTGCTTCTAAACTCAGCTGCACTA
7681 TGGCTGTCAACATTTCTGATACTTATTGGGATATGTGCCATCCAGTCATTTAGTACTTTGAATGGAACATGAGATTTATA
7761 ACACAGGTAATAGCTGAAGGTACCAGTATGGTGGTGAGACTCACACTTAGTGATCCAGCTAAGGTAACTGATGTTATAAT
7841 GGAACAGAGAAGAGGCCAACTAGATAGCTAAGTTCTTCTGAACCTATGTGTATATGTAAGTACAAATCATGCGTCCTTAT
7921 GGGGTTAAACTTAATCTGAAATTTACATTTTTCATAGTAAAAGGAAACCAATTGTTGCAGATTTCTTTTCTTGTGAGGAA
8001 ATACATGGCCTTTGATGCTCTGGCGTCTACTGCATTTCCCAGTCTGTTCTGCTCGAGAAGCCAGAATGTGTTGTTAACAT
8081 TTTTCCGTGAATGTTGTGTTAAAATGATTAAATGCATCAGCCAATGGCAAGTGAAGGAATTGGGTGTCCTGATGCAGACT
8161 GAGCAGTTTCTCTCAATTGTAGCCTCATACTCATAAGGTGCTTACCAGCTAGAACATTGAGCACGTGAGGTGAGATTTTT
8241 TTTCTCTGATGGCATTAACTTTGTAATGCAATATGATGGATGCAGACCCTGTTCTTGTTTCCCTCTGGAAGTCCTTAGTG
8321 GCTGCATCCTTGGTGCACTGTGATGGAGATATTAAATGTGTTCTTTGTGAGCTTTCGTTCTATGATTGTCAAAAGTACGA
8401 TGTGGTTCCTTTTTTATTTTTATTAAACAATGAGCTGAGGCTTTATTACAGCTGGTTTTCAAGTTAAAATTGTTGAATAC
8481 TGATGTCTTTCTCCCACCTACACCAAATATTTTAGTCTATTTAAAGTACAAAAAAAGTTCTGCTTAAGAAAACATTGCTT
8561 ACATGTCCTGTGATTTCTGGTCAATTTTTATATATATTTGTGTGCATCATCTGTATGTGCTTTCACTTTTTACCTTGTTT
8641 GCTCTTACCTGTGTTAACAGCCCTGTCACCGTTGAAAGGTGGACAGTTTTCCTAGCATTAAAAGAAAGCCATTTGAGTTG
8721 TTTACCATGTTAAAAAAAAAAAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID |
Duplex structure |
Position |
Score |
MFE |
1
|
miRNA 3' agucggcgaCAGUGUGCGUGUc 5'
||| || |||||
Target 5' tcaaaacaaGTCCCAGGCACAc 3'
|
7572 - 7593
|
125.00 |
-11.10 |
2
|
miRNA 3' agucggcgACAG-UGUGCGUGUc 5'
|||| ||:|:|||
Target 5' ataaaataTGTCTTCATGTACAg 3'
|
3935 - 3957
|
122.00 |
-16.70 |
3
|
miRNA 3' agucggcGACAGUGUGCGUGUc 5'
||| || || ||||
Target 5' tttctacCTGACA-ACACACAt 3'
|
4178 - 4198
|
122.00 |
-7.90 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|